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核タンパク質リン酸化プロテオミクスを用いた新規抗癌剤効果予測因子と治療標的の探索

研究課題

研究課題/領域番号 23K21375
補助金の研究課題番号 21H02703 (2021-2023)
研究種目

基盤研究(B)

配分区分基金 (2024)
補助金 (2021-2023)
応募区分一般
審査区分 小区分49020:人体病理学関連
研究機関大分大学

研究代表者

塚本 善之  大分大学, 医学部, 助教 (00433053)

研究分担者 麓 祥一  大分大学, 医学部, 客員研究員 (00532631)
柴田 智隆  大分大学, 医学部, 講師 (20566905)
喜多 加納子  熊本大学, 大学院生命科学研究部(医), 助教 (30457600)
泥谷 直樹  大分大学, 医学部, 准教授 (80305036)
守山 正胤  大分大学, 医学部, 客員研究員 (90239707)
研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2024年度)
配分額 *注記
16,900千円 (直接経費: 13,000千円、間接経費: 3,900千円)
2024年度: 3,510千円 (直接経費: 2,700千円、間接経費: 810千円)
2023年度: 6,890千円 (直接経費: 5,300千円、間接経費: 1,590千円)
2022年度: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2021年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
キーワード癌オルガノイド / 薬剤感受性 / 抗癌剤 / がんオルガノイド / 患者由来 / 個別化医療 / プロテオミクス
研究開始時の研究の概要

抗癌剤の効果は個々の患者により異なる。本研究は患者由来の癌組織培養(癌オルガノイド)を用いた抗癌剤効果予測法の開発を目的とする。2019年度より保険適用が始まった「がんゲノム医療」では、癌組織のゲノムDNAを使って、100以上の癌関連遺伝子の異常をパネル検査により解析し、抗癌剤を選択する。この方法は現在、抗癌剤の選択法としてもっとも優れているが、「異常が検出されてもそれに対応する抗癌剤が開発されていない」、「遺伝子異常を標的としない抗癌剤の効果予測が難しい」、といった課題が残されている。本研究ではこのようながんゲノム医療とは全くことなるアプローチにより、患者に適した抗癌剤選択方法を開発する。

研究実績の概要

今年度は食道癌、胃癌、大腸癌オルガノイドの樹立を進めながら、薬剤感受性試験を実施し、それぞれの癌オルガノイドのIC50を解析した。抗癌剤の選択としてCOSMICデータベースよりafatinib, sapitinib, AZD5582, Oxyphenisatinがこれらの癌腫において効果が高いことがわかった。そこで、これらの抗癌剤について癌オルガノイドの感受性を解析した。中でもAZD5582およびOxyphenisatinは著しく効果の高い癌オルガノイドと低い癌オルガノイドが存在した。そこで、これらについて感受性予測のためのバイオマーカーを探索した。その結果、特定のリン酸化タンパク質やmRNAの変動が感受性と強く相関することを見出した。これらのデータをもとに、抗癌剤の効果予測法として特許出願に至った(特願2023-048755)。
また、これまで開発を続けていたシスプラチンの効果予測法について、成果をまとめて報告した(Lab Invest 2022)。シスプラチン効果予測法として、シスプラチン投与後のc-Jun活性化がバイオマーカーとして使えることを見出した。癌オルガノイドのIn vitroで強い相関を認め、さらに患者から樹立した癌オルガノイドで効果予測を行い、実際の患者治療効果との相関を解析したところ、有意性は見出されなかったものの、傾向が認められた。今後、症例数を増やすことで臨床応用が期待される。
さらに、将来的な個別化医療へ向けて、少量の検体からの癌オルガノイドの樹立を目指した。胆道癌患者で初診時に手術不能癌である患者は少なくない。そのような患者から癌オルガノイドを樹立するために、我々は検査で採取される胆汁に着目した。検査用胆汁に含まれる癌細胞から癌オルガノイドを樹立する方法を開発し、報告した(Lab Invest 2023)。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

今年度、主な成果として特許出願1件と責任著者である論文報告を2編報告した。また、新しい取り組みとして、患者間で効果のバラツキが多い、すなわち効果の高い患者の選別が必要な抗癌剤を見出した。そしてその抗癌剤について、感受性の高い患者のスクリーニングのためのバイオマーカーを発見した。
このように、これまでの成果をまとめ、報告しつつ、次につながる成果も得ることができたので、研究はおおむね順調に進んでいると判断した。

今後の研究の推進方策

論文報告した内容についてはまだまだ症例数が足りていないので、症例数を増やしての検証研究を実施する。シスプラチン効果予測法については特許出願済みなので、臨床応用へ向けてコラボレーションの可能性を探索する。胆汁由来癌オルガノイドについては、実際に効果予測法やその他の効果予測診断法に使えるかどうか、検証する。
また、新しく同定されたバイオマーカーについては臨床応用を目指した解析を進め、論文報告する。さらに、マウスを用いた個体レベルでの検証を行う。

報告書

(2件)
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実績報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2023 2022 2021 その他

すべて 雑誌論文 (8件) (うち査読あり 7件、 オープンアクセス 7件) 学会発表 (1件) 備考 (1件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] Efficient Establishment of Bile-Derived Organoids From Patients With Biliary Cancer.2023

    • 著者名/発表者名
      Kinoshita K, Tsukamoto Y, Hirashita Y, Fuchino T, Kurogi S, Uchida T, Nakada C, Matsumoto T, Okamoto K, Motomura M, Fukuchi S, Sagami R, Nagai T, Gotoh Y, Fukuda K, Ogawa R, Mizukami K, Okimoto T, Kodama M, Murakami K, Moriyama M, Hijiya N.
    • 雑誌名

      Lab Invest.

      巻: 103 号: 6 ページ: 100105-100105

    • DOI

      10.1016/j.labinv.2023.100105

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Involvement of clusterin expression in the refractory response of pancreatic cancer cells to a MEK inhibitor.2023

    • 著者名/発表者名
      Amada K, Hijiya N, Ikarimoto S, Yanagihara K, Hanada T, Hidano S, Kurogi S, Tsukamoto Y, Nakada C, Kinoshita K, Hirashita Y, Uchida T, Shin T, Yada K, Hirashita T, Kobayashi T, Murakami K, Inomata M, Shirao K, Aoki M, Takekawa M, Moriyama M.
    • 雑誌名

      Cancer Sci.

      巻: 114 号: 5 ページ: 2189-2202

    • DOI

      10.1111/cas.15735

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 癌オルガノイドとバイオマーカーを組み合わせた抗癌剤効果予測法2023

    • 著者名/発表者名
      塚本善之、木下慶亮、柴田智隆
    • 雑誌名

      Medical Science Digest

      巻: 5月号 ページ: 36-39

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [雑誌論文] Enhanced phosphorylation of c-Jun by cisplatin treatment as a potential predictive biomarker for cisplatin response in combination with patient-derived tumor organoids.2022

    • 著者名/発表者名
      Tsukamoto Y, Kurogi S, Shibata T, Suzuki K, Hirashita Y, Fumoto S, Yano S, Yanagihara K, Nakada C, Mieno F, Kinoshita K, Fuchino T, Mizukami K, Ueda Y, Etoh T, Uchida T, Hanada T, Takekawa M, Daa T, Shirao K, Hironaka S, Murakami K, Inomata M, Hijiya N, Moriyama M.
    • 雑誌名

      Lab Invest.

      巻: 102 (12) 号: 12 ページ: 1355-1366

    • DOI

      10.1038/s41374-022-00827-2

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Potential association of eEF1A dimethylation at lysine 55 in the basal area of Helicobacter pylori-eradicated gastric mucosa with the risk of gastric cancer: a retrospective observational study2022

    • 著者名/発表者名
      Hirashita Yuka、Fukuda Masahide、Kodama Masaaki、Tsukamoto Yoshiyuki、Okimoto Tadayoshi、Mizukami Kazuhiro、Kawahara Yoshinari、Wada Yasuhiro、Ozaka Sotaro、Togo Kazumi、Kinoshita Keisuke、Fuchino Takafumi、Fukuda Kensuke、Okamoto Kazuhisa、Ogawa Ryo、Matsunari Osamu、Honda Koichi、Murakami Kazunari
    • 雑誌名

      BMC Gastroenterology

      巻: 22 号: 1 ページ: 490-490

    • DOI

      10.1186/s12876-022-02521-5

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] TAS‐116 (pimitespib), a heat shock protein 90 inhibitor, shows efficacy in preclinical models of adult T‐cell leukemia2021

    • 著者名/発表者名
      Ikebe Emi、Shimosaki Shunsuke、Hasegawa Hiroo、Iha Hidekatsu、Tsukamoto Yoshiyuki、Wang Yu、Sasaki Daisuke、Imaizumi Yoshitaka、Miyazaki Yasushi、Yanagihara Katsunori、Hamaguchi Isao、Morishita Kazuhiro
    • 雑誌名

      Cancer Science

      巻: 113 号: 2 ページ: 684-696

    • DOI

      10.1111/cas.15204

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Early response in phosphorylation of ribosomal protein S6 is associated with sensitivity to trametinib in colorectal cancer cells2021

    • 著者名/発表者名
      Hirashita Yuka、Tsukamoto Yoshiyuki、Kudo Y、Kakisako D、Kurogi S、Hijiya Naoki、Nakada C、Uchida T、Hirashita T、Hiratsuka T、Akagi T、Ueda Y、Shiroshita H、Etoh T、Mizukami K、Honda K、Okimoto T、Kodama M、Inomata M、Moriyama Masatsugu、Murakami K
    • 雑誌名

      Laboratory Investigation

      巻: - 号: 8 ページ: 1036-1047

    • DOI

      10.1038/s41374-021-00590-w

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Downregulation of ZNF395 Drives Progression of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma through Enhancement of Growth Potential.2021

    • 著者名/発表者名
      Kurogi S, Hijiya N, Hidano S, Sato S, Uchida T, Tsukamoto Y, Nakada C, Yada K, Hirashita T, Inomata M, Murakami K, Takahashi N, Kobayashi T, Moriyama M.
    • 雑誌名

      Pathobiology

      巻: 2021 号: 5 ページ: 1-9

    • DOI

      10.1159/000514593

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] シスプラチン処理後のc-Junリン酸化亢進をバイオマーカーとした食道癌術前化学療法の効果予測2023

    • 著者名/発表者名
      塚本善之、黒木秀作、柴田智隆、鈴木浩輔、藤島紀、麓祥一、平下有香、中田知里、泥谷直樹、守山正胤
    • 学会等名
      第112回 日本病理学会総会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [備考] 大分大学医学部分子病理学講座ホームページ

    • URL

      http://byori2.wp.med.oita-u.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [産業財産権] 抗癌剤の治療効果を予測するためのデータの取得方法、抗癌剤のスクリーニング方法、および、抗癌剤の効果予測バイオマーカーのスクリーニング方法2023

    • 発明者名
      塚本善之、平下有香、黒木秀作
    • 権利者名
      塚本善之、平下有香、黒木秀作
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2023-048755
    • 出願年月日
      2023
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書 2021 実績報告書

URL: 

公開日: 2021-04-28   更新日: 2024-08-08  

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