| 研究課題/領域番号 |
23K21776
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| 補助金の研究課題番号 |
21H03654 (2021-2023)
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| 研究種目 |
基盤研究(B)
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| 配分区分 | 基金 (2024)
補助金 (2021-2023) |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 審査区分 |
小区分64040:自然共生システム関連
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| 研究機関 | 大阪大谷大学 |
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研究代表者 |
内井 喜美子 大阪大谷大学, 薬学部, 准教授 (90469619)
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| 研究分担者 |
見坂 武彦 摂南大学, 理工学部, 教授 (80397661)
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| 研究期間 (年度) |
2024-04-01 – 2025-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2024年度)
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| 配分額 *注記 |
17,160千円 (直接経費: 13,200千円、間接経費: 3,960千円)
2024年度: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2023年度: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2022年度: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2021年度: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
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| キーワード | 環境DNA / 核DNAマーカー / 長鎖配列解析 / 種内変異 / 長鎖塩基配列解析 |
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| 研究開始時の研究の概要 |
本研究では、個体群遺伝構造・遺伝的多様性を評価する手法としての環境DNA分析の機能拡張を目的とし、核rRNAをマーカーとする個体群遺伝構造・遺伝的多様性解析法の確立を行う。同時に、ナノポアシーケンサーを用いた長鎖塩基配列解析法を環境DNA分析に適用し、従来の環境DNA分析では困難であった遺伝的多様性が低い集団の個体群遺伝構造・遺伝的多様性解析を実現することを目指す。
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| 研究成果の概要 |
本研究は、環境DNA分析の高度化を目的とし、従来のミトコンドリアDNA (mtDNA) マーカーに代わり、核DNA上のrRNA遺伝子領域を標的とした新たなマーカーの有用性を検証すること、さらにナノポアシーケンサーを用いた長鎖配列解析法を確立することを目的とした。rRNA遺伝子ITS1領域に設計したマーカーを用いたコイ交雑個体群の遺伝構造解析からは、mtDNAマーカーとの組み合わせにより、より正確な遺伝構造の把握が可能となることが示された。長鎖配列解析においては、ｒRNA遺伝子の18Sから28Sにまたがる約1,500 bpの配列による魚類メタバーコーディングが有用なツールとなる可能性が示された。
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| 研究成果の学術的意義や社会的意義 |
本研究で得られた成果は、従来のmtDNAの短い配列の解析に依存した環境DNA分析の限界を克服し、より高解像度な分類群推定と個体群遺伝解析を可能とする新たな手法の確立への土台となるものである。核DNAマーカーや長鎖配列解析の導入により、環境DNAによる生物多様性評価の精度と応用範囲が飛躍的に向上し、保全生態学や生物資源管理に貢献することが期待される。
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