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単一NVセンター配列を用いたタンパク質の1分子量子計測

研究課題

研究課題/領域番号 23K23189
補助金の研究課題番号 22H01921 (2022-2023)
研究種目

基盤研究(B)

配分区分基金 (2024)
補助金 (2022-2023)
応募区分一般
審査区分 小区分28040:ナノバイオサイエンス関連
研究機関早稲田大学

研究代表者

谷井 孝至  早稲田大学, 理工学術院, 教授 (20339708)

研究分担者 星野 忠次  千葉大学, 大学院薬学研究院, 准教授 (90257220)
研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2024年度)
配分額 *注記
17,290千円 (直接経費: 13,300千円、間接経費: 3,990千円)
2024年度: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2023年度: 7,670千円 (直接経費: 5,900千円、間接経費: 1,770千円)
2022年度: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円)
キーワードダイヤモンド / NVセンター / 量子計測 / 1分子計測 / 単一NVセンター / NVセンター
研究開始時の研究の概要

ダイヤモンド表面近傍に形成した浅い単一NVセンターの直上表面に、水溶液中で特定の立体構造を持つタンパク質1分子を近接配置することにより、単一NVセンターを中心とする座標系において、タンパク質を構成する原子核の位置を高精度で計測できる技術を構築することが本研究の目標である。そのために、量子計測系の試作と改良、所望のアミノ酸配列を持つタンパク質の合成(同位体標識)と量子計測系への統合、さらには、量子アルゴリズムの活用と改良による高感度・高精度のための現実的な方法論を構築する。

研究実績の概要

ダイヤモンド中の単一NVセンターの電子スピンをセンサとして活用する量子計測によりタンパク質1分子の構造解析法の実現に挑む。ダイヤモンド表面近傍に形成した浅い単一NVセンターの直上表面に、水溶液中で特定の立体構造を持つタンパク質1分子を近接配置することにより、単一NVセンターを中心とする座標系において、タンパク質を構成する原子の核スピンの位置を高精度で計測できる技術を構築することが最終目標である。このために、2022年度は下記の計測の実行可能性を実験的に評価した。
[1] 単一NVセンターを用いたNMR計測および検出範囲内の個々の標的核スピンの相対位置座標を計測するために、マイクロ波・レーザ光のパルス照射と単一光子検出を同期できるLab-madeの共焦点顕微鏡を改造して、安定で再現性の高い測定系の構築と高感度化を図る。
[2] 表面近傍に形成した浅いNVセンターMW波パルスシーケンス制御により、選択的にノイズを除去(量子ロックイン検出等)することでコヒーレンス時間を延長し、さらに標的核スピンからのNMRシグナルのみを選択的に抽出する。この手法を用いて、タンパク質の構造解析の前段階の段階的な取り組みを始める。具体的には、固相系NMRへの拡張として、ダイヤモンド表面上に形成したフッ素単分子膜中のフッ素核スピンの検出を達成する。
[3] 単一イオン注入の高い位置制御性を利用してダイヤモンド表面にナノ構造配列を形成するプロセスを構築し、個々のナノ構造中に単一NVセンターを形成するプロセスを構築する。ナノ構造の有する高感度化と量子ヘテロダイン法との統合により、NMR周波数分解能の向上を目指す。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

2022年度において達成した、ダイヤモンド表面に製膜した単分子膜中の1Hおよび19F核スピン計測、および、ナノピラー形成による量子ヘテロダイン計測のSN比向上の成功を受けて、2023年度には真空中液体窒素温度での量子計測系へとパルス光ODMR測定系を改造した。単一NVセンターを用いた各種パルス光磁気計測が真空中で実行可能となり、マイナス100℃付近までダイヤモンド基板を冷却できたが、コヒーレンス時間(T2)は室温時から大きく変化しなかった。液体窒素を真空チェンバ内に導入するための配管部分ではマイナス200℃付近まで冷却できていることから、サンプルホルダーの可動性を確保するための銅メッシュの熱伝導性に問題があることまで判明しており、2024年度にはこの不具合を解消して、核スピン計測のセンサとなる単一NVセンターが十分なコヒーレンス時間(T2)を持つように達成する。
以上は2023年度に抱えることになった課題であるが、他方では、2023年度に(1) 統計的手法による量子ヘテロダイン計測結果の推定、および、(2)安定ラジカル分子の二重電子共鳴計測を達成した。通常、単一NVセンターを用いる量子計測では、多数回(数時間以上の長時間計測)を実行した後でFFT等により分子構造同定のための周波数スペクトルを得る。(1)では、分解能は低いものの、リアルタイム(1秒以内)にスペクトルを得ることができることを実験的に示した。また、(2)では、安定ラジカルの分子構造(超微細相互作用)がNVセンターをプローブとする電子二重共鳴計測により取得できる手ごたえを得た。

今後の研究の推進方策

昨年度には真空中液体窒素温度での量子計測系へとパルス光ODMR測定系を改造し、単一NVセンターを用いた各種パルス光磁気計測が真空中で実行可能となったが、冷却性能に課題を残した。冷却系の設計を見直し、2024年度にも継続して改良を施し、液体窒素温度に十分に冷却できるようにする。
昨年度に達成した統計的推定を用いた周波数スペクトルのリアルタイムモニタリング手法について、昨年度には量子ヘテロダイン法に適用して統計的推定を実行することの優位性を示すことができたが、単一NVセンターを用いる他の量子計測手法にもこれを拡張できることを実証して特許化を目指す。
核スピンでなく、安定ラジカル分子中の電子スピンとNVセンター電子スピンの電子二重共鳴の有効性を昨年度に示すことができた。上記の真空中液体窒素温度での量子計測系へのパルス光ODMR測定系の改良と合わせて、最終ゴールである1分子タンパク質の構造解析手法の構築を目指す。

報告書

(2件)
  • 2023 実績報告書
  • 2022 実績報告書
  • 研究成果

    (35件)

すべて 2024 2023 2022 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (7件) (うち国際共著 2件、 査読あり 7件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (26件)

  • [国際共同研究] CNR(イタリア)

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [国際共同研究] CNR(イタリア)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [雑誌論文] 安価な量子計測のための+<i>α</i> の研究技術:ローエンドFPGAを用いたダイヤモンド中 NVセンタの量子計測2024

    • 著者名/発表者名
      谷井 孝至
    • 雑誌名

      応用物理

      巻: 93 号: 1 ページ: 39-43

    • DOI

      10.11470/oubutsu.93.1_39

    • ISSN
      0369-8009, 2188-2290
    • 年月日
      2024-01-01
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Enhancing Room-temperature Photoluminescence from Erbium-doped Silicon by Fabricating Nanopillars in a Silicon-on-Insulator Layer2023

    • 著者名/発表者名
      Yuma Takahashi, Tomoki Ishii, Kaisei Uchida, Takumi Zushi, Lindsay Coe, Shin-ichiro Sato, Enrico Prati, Takahiro Shinada, Takashi Tanii
    • 雑誌名

      e-Journal of Surface Science and Nanotechnology

      巻: 21 号: 4 ページ: 262-266

    • DOI

      10.1380/ejssnt.2023-041

    • ISSN
      1348-0391
    • 年月日
      2023-05-04
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Detecting nuclear spins in an organosilane monolayer using nitrogen-vacancy centers for analysis of precursor self-assembly on diamond surface2023

    • 著者名/発表者名
      Ueda Yuki、Miyake Yuto、Chanuntranont Akirabha、Otani Kazuki、Tsugawa Masato、Saito Daiki、Usui Shuntaro、Teraji Tokuyuki、Onoda Shinobu、Shinada Takahiro、Kawarada Hiroshi、Tanii Takashi
    • 雑誌名

      Japanese Journal of Applied Physics

      巻: 62 号: SG ページ: SG1049-SG1049

    • DOI

      10.35848/1347-4065/accc91

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Enhancing photon collection from single shallow nitrogen-vacancy centers in diamond nanopillars for quantum heterodyne measurements2023

    • 著者名/発表者名
      Chanuntranont Akirabha、Otani Kazuki、Saito Daiki、Ueda Yuki、Tsugawa Masato、Usui Shuntaro、Miyake Yuto、Teraji Tokuyuki、Onoda Shinobu、Shinada Takahiro、Kawarada Hiroshi、Tanii Takashi
    • 雑誌名

      Applied Physics Express

      巻: 16 号: 8 ページ: 082006-082006

    • DOI

      10.35848/1882-0786/acede9

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Efficient Synthesis of a Schiff Base Copper(II) Complex Using a Microfluidic Device2023

    • 著者名/発表者名
      Masashi Kobayashi, Takashiro Akitsu, Masahiro Furuya, Tetsushi Sekiguchi, Shuichi Shoji, Takashi Tanii and Daiki Tanaka
    • 雑誌名

      Micromachines

      巻: 14 号: 4 ページ: 890-890

    • DOI

      10.3390/mi14040890

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Detecting nuclear spins in an organosilane monolayer using nitrogen-vacancy centers for analysis of precursor self-assembly on diamond surface2023

    • 著者名/発表者名
      Yuki Ueda, Yuto Miyake, Akirabha Chanuntranont, Kazuki Otani, Masato Tsugawa, Daiki Saito, Shuntaro Usui, Tokuyuki Teraji, Shinobu Onoda, Takahiro Shinada, Hiroshi Kawarada, Takashi Tanii
    • 雑誌名

      Jpn. J. Appl. Phys.

      巻: 未定

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Enhancing room-temperature photoluminescence from erbium-doped silicon by fabricating nanopillars in a silicon-on-insulator layer2023

    • 著者名/発表者名
      Yuma Takahashi, Tomoki Ishii, Kaisei Uchida, Takumi Zushi, Lindsay Coe, Shin-ichiro Sato, Enrico Prati, Takahiro Shinada, Takashi Tanii
    • 雑誌名

      e-Journal of surface science and nanotechnology

      巻: 未定

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] ナノダイヤモンド中の NV センタの溶液中における荷電状態制御2024

    • 著者名/発表者名
      圖師拓海, 山口陽大, 臼井俊太郎, 野村涼太, 谷井孝至
    • 学会等名
      第85回応用物理学会春季学術講演会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] NV センター電子スピンとダイヤモンド表面上の電子スピンの二重共鳴計測2024

    • 著者名/発表者名
      関口 顕,津川 雅人, 臼井 俊太郎, 齋藤 大樹,三宅 悠斗,寺地 徳之,小野田 忍,田中 学,品田 高宏,川原田 洋,谷井 孝至
    • 学会等名
      第85回応用物理学会春季学術講演会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] ダイヤモンド中の窒素-空孔中心を用いた量子センシングのモンテカルロシミュレーション2024

    • 著者名/発表者名
      太田 智基, 齋藤 大樹, Akirabha Chanuntranont, 津川 雅人, 三宅 悠斗, 黒木 辰哉, 関口 顕, 品田 高宏, 川原田 洋, 谷井 孝至
    • 学会等名
      第85回応用物理学会春季学術講演会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Mathematically enhancing signal-to-noise ratio of photonically enhanced Mathematically enhancing signal-to-noise ratio of photonically enhanced2024

    • 著者名/発表者名
      Akirabha Chanuntranont, Kazuki Otani, Daiki Saito, Tomoki Ota, Yuki Ueda, Masato Tsugawa1, Shuntaro Usui, Yuto Miyake, Tokuyuki Teraji, Shinobu, Onoda, Takahiro Shinada, Hiroshi Kawarada, Takashi Tanii
    • 学会等名
      Design & Engineering by Joint Inverse Innovation for Materials Architecture Workshop
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Enhancing the photodetection rate of silicon-vacancy centers in diamond by nanopillar fabrication2024

    • 著者名/発表者名
      Lindsay Coe, Tomoki Ishii, Masaya Omoto, Takashi Tanii
    • 学会等名
      Design & Engineering by Joint Inverse Innovation for Materials Architecture Workshop
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Dramatically enhancing SNR from single shallow NV centres in diamond nanopillars for qdyne measurements2024

    • 著者名/発表者名
      Akirabha Chanuntranont, Kazuki Otani, Daiki Saito, Tomoki Ota, Yuki Ueda, Masato Tsugawa, Shuntaro Usui, Yuto Miyake, Tokuyuki Teraji, Shinobu Onoda, Takahiro Shinada, Hiroshi Kawarada, Takashi Tanii
    • 学会等名
      Hasselt Diamond Workshop 2024 - SBDD XXVIII
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Double electron-electron resonance between NV centers and free radicals2023

    • 著者名/発表者名
      Masato Tsugawa, Ken Sekiguchi, Shuntaro Usui, Daiki Saito, Yuto Miyake, Tokuyuki Teraji, Shinobu Onoda, Takahiro Shinada, Manabu Tanaka, Hiroshi Kawarada, Takashi Tanii
    • 学会等名
      36th International Microprocesses and Nanotechnology Conference
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Doble electron-electron resonance between NV centers and free radicals2023

    • 著者名/発表者名
      Masato Tsugawa, Ken Sekiguchi, Shuntaro Usui, Daiki Saito, Yuto Miyake, Tokuyuki Teraji, Shinobu Onoda, Takahiro Shinada, Manabu Tanaka, Hiroshi Kawarada, Takashi Tanii
    • 学会等名
      The 3rd International Symposium on Design & Engineering by Joint Inverse Innovation for Materials Architecture
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] ダイヤモンド中NVセンターとフリーラジカルのDEER計測2023

    • 著者名/発表者名
      関口 顕,津川 雅人,臼井 俊太郎,齋藤 大樹,三宅 悠斗,寺地 徳之,小野田 忍,田中 学,品田 高宏,川原田 洋,谷井 孝至
    • 学会等名
      第84回応用物理学会秋季学術講演会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Alternating magnetic field detection using a single shallow NV center in a nanopillar fabricated in the diamond surface2023

    • 著者名/発表者名
      Akirabha Chanuntranont, Daiki Saito, Kazuki Otani, Tomoki Ota, Masato Tsugawa, Yuto Miyake, Shuntaro Usui, Tokuyuki Teraji, Shinobu Onoda, Takahiro Shinada, Hiroshi Kawarada, Takashi Tanii
    • 学会等名
      量子生命科学会第5回大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] ダイヤモンド中のNVセンター電子スピンを用いた有機シラン単分子膜中の核スピン検出2023

    • 著者名/発表者名
      三宅悠斗、上田優樹、大谷和毅、津川雅人、齋藤大樹、臼井俊太郎、 品田高宏、寺地徳之、小野田忍、川原田洋、谷井孝至
    • 学会等名
      量子生命科学会第5回大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Direct delivery of functional cargoes into cellular cytosol by nanotube stamping2023

    • 著者名/発表者名
      Aya Fujiwara, Riku Shibata, Riko Kishida, Yuiko Mizuguci, Kazuhiro Oyama, Takeo Miyake, Takashi Tanii
    • 学会等名
      The 3rd International Symposium on Design & Engineering by Joint Inverse Innovation for Materials Architecture (DEJI2MA-3)
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Direct delivery of functional cargoes into cellular cytosol by nanotube stamping2023

    • 著者名/発表者名
      Aya Fujiwara, Riku Shibata, Riko Kishida, Yuiko Mizuguci, Kazuhiro Oyama, Takeo Miyake, Takashi Tanii
    • 学会等名
      36th International Microprocesses and Nanotechnology Conference (MNC2023)
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Contribution of AMPA and NMDA receptors to the synaptic weight of single neurons in an autaptic culture2023

    • 著者名/発表者名
      R. Onda, M. Yamazoe, S. Kishino, M. Ishida, H. Yamamoto, T. Tanii
    • 学会等名
      The 12th RIEC International Symposium on Brain Functions and Brain Computer
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Doubling acceleration of synthesis speed of metal complexes by scale effects in microdroplets2023

    • 著者名/発表者名
      Masashi Kobayashi, Tomoya Murashige, Takashiro Akitsu, Takashi Tanii, Masahiro Furuya, Tetsushi Sekiguchi, Hiroyuki Fujita, Shuichi Shoji and Daiki Tanaka
    • 学会等名
      MicroTAS 2023
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] ダイヤモンド表面ナノピラー中の浅い単一NVセンターからの 増強放出光子計測による核スピン検出2023

    • 著者名/発表者名
      齋藤 大樹, 大谷 和毅, Akirabha Chanuntranont, 上田 優樹, 津川 雅人, 三宅 悠斗, 臼井 俊太郎, 寺地 徳之, 小野田 忍, 品田 高宏, 川原田 洋, 谷井 孝至
    • 学会等名
      第70回応用物理学会春季学術講演会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] NVセンターを用いたパルスODMR長時間計測のための ダイヤモンド上オンチップマイクロ波アンテナの作製2023

    • 著者名/発表者名
      臼井 俊太郎, 上田 優樹, 大谷 和毅, 津川 雅人, 齋藤 大樹, 三宅 悠斗, 品田 高宏, 谷井孝至
    • 学会等名
      第70回応用物理学会春季学術講演会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 不純物を注入した水素終端ナノダイヤモンド中NVセンターの 荷電状態制御2023

    • 著者名/発表者名
      山口陽大, 朴相みん, 圖師拓海, 大島武, 小野田忍, 谷井孝至
    • 学会等名
      第70回応用物理学会春季学術講演会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] ナノダイヤモンド中のNVセンターの荷電状態を活用した 水溶液中での電位計測2022

    • 著者名/発表者名
      朴相みん,山口陽大, 大島武, 小野田忍, 品田高宏, 谷井孝至
    • 学会等名
      量子生命科学会第4回大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] ダイヤモンド上マイクロ波照射用銅めっき導波路の作製による 単一NVセンターを用いたODMR計測の時間安定性向上2022

    • 著者名/発表者名
      津川 雅人, 上田 優樹, 大谷 和毅, 齋藤 大樹, 三宅 悠斗, 臼井 俊太郎, 齋藤 美紀子, 品田 高宏, 谷井孝至
    • 学会等名
      量子生命科学会第4回大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] NVセンターを用いた有機シラン単分子膜中の核スピン検出2022

    • 著者名/発表者名
      三宅 悠斗、上田 優樹、大谷 和毅、津川 雅人、斎藤 大樹、臼井 俊太郎、品田 高宏、谷井 孝至
    • 学会等名
      第83回応用物理学会秋季学術講演会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] ナノダイヤモンド中のNVセンターの荷電状態を活用した 水溶液中での電位計測2022

    • 著者名/発表者名
      朴 相みん、山口 陽大、大島 武、小野田 忍、谷井 孝至
    • 学会等名
      第83回応用物理学会秋季学術講演会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 超高濃度窒素ドープCVDダイヤモンドに作製したNVアンサンブルのスピン特性評価2022

    • 著者名/発表者名
      淺野 雄大、上田 真由、早坂 京祐、金久 京太郎、蔭浦 泰資、谷井 孝至、小野田 忍、榎本 心平、河野 省三、川原田 洋
    • 学会等名
      第83回応用物理学会秋季学術講演会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Er:O共添加Siナノピラーからの室温フォトルミネッセンス計測2022

    • 著者名/発表者名
      石井 智己、高橋 勇磨、内田 海成、圖師 拓海、佐藤 真一郎、プラティ エンリコ、品田 高宏、谷井 孝至
    • 学会等名
      第83回応用物理学会秋季学術講演会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Enhancing room-temperature photoemission from Er:O-doped silicon by fabricating nanopillars on a silicon-on-insulator wafer2022

    • 著者名/発表者名
      Yuma Takahashi, Tomoki Ishii, Kaisei Uchida, Takumi Zushi, Shin-ichiro Sato, Enrico Prati, Takahiro Shinada and Takashi Tanii
    • 学会等名
      14th International Symposium on Atomic Level Characterizations for New Materials and Devices '22
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Detecting nuclear spins in an organosilane monolayer using NV centers for analysis of precursor self-assembly2022

    • 著者名/発表者名
      Yuki Ueda, Yuto Miyake, Kazuki Otani, Masato Tsugawa, Daiki Saito, Shuntaro Usui, Tokuyuki Teraji, Shinobu Onoda, Takahiro Shinada, Hiroshi Kawarada, Takashi Tanii
    • 学会等名
      35th International Microprocesses and Nanotechnology Conference
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書

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公開日: 2022-04-19   更新日: 2024-12-25  

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