Accurate analysis of PTM enzymes with an mRNA display/deep learning platform

• 研究課題/領域番号: 23K23485
• 補助金の研究課題番号: 22H02218 (2022-2023)
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 基金 (2024); 補助金 (2022-2023)
• 応募区分: 一般
• 審査区分: 小区分37030:ケミカルバイオロジー関連
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: VINOGRADOV Alexander 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 特任助教 (90845819)
• 研究期間 (年度): 2022-04-01 – 2025-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2024年度)
• 配分額: 17,290千円 (直接経費: 13,300千円、間接経費: 3,990千円); 2024年度: 4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円); 2023年度: 7,800千円 (直接経費: 6,000千円、間接経費: 1,800千円); 2022年度: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
• キーワード: mRNA display / Deep learning / Lysine labelling / enzyme PTM / PTM / Enzymes / Machine learning

研究開始時の研究の概要

In 2024, different components of the proposed platform (genetic code reprogramming, selective lysine labeling, and the mRNA display profiling pipeline) will be integrated to establish the proposed workflow. Deep learning approaches developed over the past two years will be integrated as well.