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タイヌビエ多剤抵抗性発現の鍵となる除草剤代謝遺伝子群の一斉発現システムの解明

研究課題

研究課題/領域番号 23K23612
補助金の研究課題番号 22H02347 (2022-2023)
研究種目

基盤研究(B)

配分区分基金 (2024)
補助金 (2022-2023)
応募区分一般
審査区分 小区分39040:植物保護科学関連
研究機関東京農工大学 (2023-2024)
京都大学 (2022)

研究代表者

岩上 哲史  東京農工大学, (連合)農学研究科(研究院), 准教授 (00761107)

研究分担者 権藤 崇裕  宮崎大学, フロンティア科学総合研究センター, 助教 (10437949)
赤木 剛士  岡山大学, 環境生命自然科学学域, 教授 (50611919)
宮下 正弘  京都大学, 農学研究科, 准教授 (80324664)
研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2026-03-31
研究課題ステータス 交付 (2024年度)
配分額 *注記
17,160千円 (直接経費: 13,200千円、間接経費: 3,960千円)
2025年度: 3,120千円 (直接経費: 2,400千円、間接経費: 720千円)
2024年度: 3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円)
2023年度: 4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円)
2022年度: 5,720千円 (直接経費: 4,400千円、間接経費: 1,320千円)
キーワード除草剤 / 抵抗性 / 雑草 / P450 / ゲノム / タイヌビエ / 解毒代謝 / 形質転換
研究開始時の研究の概要

除草剤の解毒代謝能が向上した雑草は多様な除草剤に抵抗性を示すことが多く、食料生産の脅威となる。申請者は強害雑草タイヌビエの多剤抵抗性を解析し、多様な除草剤を解毒代謝する酵素遺伝子の一斉高発現が多剤抵抗性を引き起こすことを明らかにしている。本研究では、ゲノムの解読やタイヌビエにおける遺伝子組換え系の確立により、一斉高発現をもたらす原因因子を同定する。さらにこの遺伝子発現制御系の内生機能を明らかにして、多剤抵抗性発現の本質的な理解を目指す。

研究実績の概要

(1)米国の多剤抵抗性タイヌビエにおける抵抗性の原因遺伝子座について、解読したゲノムを用いて昨年度までに候補領域を1 Mbpの範囲に絞り込んだ。関連研究として進めていた国内多剤抵抗性タイヌビエの原因遺伝子座のマッピング解析でも同じ領域に原因遺伝子があると推定された。米国系統で推定された領域と国内系統で推定された領域にはオーバーラップがあった。

(2)P450の発現パターンと高い相関性を示す転写因子3種についてP450遺伝子のプロモーターへの結合能を評価するため、タバコによるアグロインフィルトレーション法を用いたdual luciferase assayを行った。現時点ではポジティブな結果は得られてない。しかし、全体にシグナルが低く、実験系の見直しも含めて検討する必要がある。また(3)のカルスに転写因子をパーティクルガンで導入し、導入後2日目のカルスについて、P450遺伝子の発現について調査したが、発現変動は認められなかった。しかし、導入遺伝子そのものの発現についても誘導が認められなかったことから、実験系そのものの見直しが必要であると考えられた。

(3)タイプ2カルスをタイヌビエ形質転換に供試し、GUS遺伝子およびビアラホス耐性遺伝子を導入した。約60日間ビアラホスによる選抜を行った結果、耐性カルスの増殖が認められ、それらのいくつかはGUS発現を示した。パーティクルガン処理した約140個のカルスから、12のGUS発現を示す形質転換カルスが得られ、そのほとんどから再分化植物体が得られた。また再分化植物体からもGUSの発現が認められた。
今後、次世代種子を採取し、導入遺伝子のコピー数などの調査を行う予定である。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

並行して進めていた国内タイヌビエにおける抵抗性メカニズム研究の成果と合わせることで、抵抗性の原因遺伝子座を大きく絞り込むことができた。またタイヌビエの形質転換系については、形質転換体の選抜についても順調に進み、改善の余地はあるものの形質転換系が確立された。

今後の研究の推進方策

タバコによるアグロインフィルトレーション法を用いたdual luciferase assayについては、より感度の高いnano lucを用いることにし、より高感度な系でプロモーターへの結合能を評価する。さらに、タイヌビエカルスや植物体を用いたパーティクルガンによるdual luciferase assayについても検討する。加えて、構築した形質転換系を用いて、形質転換系を作出し、遺伝子の機能を解析する。

報告書

(2件)
  • 2023 実績報告書
  • 2022 実績報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2024 2023

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (6件) (うち国際学会 3件、 招待講演 3件)

  • [雑誌論文] Transcriptionally linked simultaneous overexpression of P450 genes for broad-spectrum herbicide resistance2023

    • 著者名/発表者名
      Suda Hiroe、Kubo Tomomi、Yoshimoto Yusuke、Tanaka Keisuke、Tanaka Satoru、Uchino Akira、Azuma Satoshi、Hattori Makoto、Yamaguchi Takuya、Miyashita Masahiro、Tominaga Tohru、Iwakami Satoshi
    • 雑誌名

      Plant Physiology

      巻: 192 号: 4 ページ: 3017-3029

    • DOI

      10.1093/plphys/kiad286

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Syntenic analysis of loci and target‐site‐resistance mutations in cyhalofop‐butyl resistant Echinochloa crus‐galli var. crus‐galli in Japan2023

    • 著者名/発表者名
      Iwakami Satoshi、Ishizawa Hinata、Sugiura Kai、Kashiwagi Keisuke、Oga Toshiya、Niwayama Shota、Uchino Akira
    • 雑誌名

      Pest Management Science

      巻: 80 号: 2 ページ: 627-636

    • DOI

      10.1002/ps.7789

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Telomere-to-telomere genome assembly of an allotetraploid pernicious weed, <i>Echinochloa phyllopogon</i>2023

    • 著者名/発表者名
      Sato Mitsuhiko P、Iwakami Satoshi、Fukunishi Kanade、Sugiura Kai、Yasuda Kentaro、Isobe Sachiko、Shirasawa Kenta
    • 雑誌名

      DNA Research

      巻: 30 号: 5 ページ: 1-10

    • DOI

      10.1093/dnares/dsad023

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] タイヌビエの組織培養系および形質転換系の確立2024

    • 著者名/発表者名
      藤崇裕・菅原まなみ・保田謙太郎・岩上哲史
    • 学会等名
      日本雑草学会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] タイヌビエのカルスの性状と効率的な組織培養系の確立2023

    • 著者名/発表者名
      権藤崇裕・菅原まなみ・岩上哲史
    • 学会等名
      日本育種学会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] CYP81A cytochrome P450s and their characteristics: insights from a super weed late watergrass with multiple-herbicide resistance2023

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Iwakami
    • 学会等名
      15th International Symposium on Cytochrome P450 Biodiversity & Biotechnology
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Genomics of metabolic herbicide resistance vvolution in Echinochloa phyllopogon2023

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Iwakami
    • 学会等名
      PAG Australia
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Unveiling metabolism-based cross-resistance: insights from promiscuous P450s2023

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Iwakami
    • 学会等名
      5th Crop Protection Graduate Program International Seminar/UFPel
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] タイヌビエの高精度ゲノム解読からわかる日本国内の遺伝的多様性2023

    • 著者名/発表者名
      佐藤光彦・岩上哲史・福西詩奏・杉浦快・保田謙太郎・磯部 祥子・白澤健太
    • 学会等名
      日本雑草学会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書

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公開日: 2022-04-19   更新日: 2024-12-25  

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