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環境DNAで北極海の海氷下の魚を探る

研究課題

研究課題/領域番号 23K23680
補助金の研究課題番号 22H02415 (2022-2023)
研究種目

基盤研究(B)

配分区分基金 (2024)
補助金 (2022-2023)
応募区分一般
審査区分 小区分40030:水圏生産科学関連
研究機関北海道大学

研究代表者

笠井 亮秀  北海道大学, 水産科学研究院, 教授 (80263127)

研究分担者 野村 大樹  北海道大学, 北方生物圏フィールド科学センター, 准教授 (70550739)
研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2024年度)
配分額 *注記
17,420千円 (直接経費: 13,400千円、間接経費: 4,020千円)
2024年度: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2023年度: 5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円)
2022年度: 7,410千円 (直接経費: 5,700千円、間接経費: 1,710千円)
キーワード環境DNA / 海氷 / 魚類群集構造 / オホーツク海 / 北極海 / スケトウダラ / 魚類相 / 流氷
研究開始時の研究の概要

IPCC第6次報告書によれば,北極海の海氷は2019年の夏季には従来の40%も減少するなど,地球温暖化の影響は高緯度域ほど顕著に現れている。このような高温化と海氷の減少は,海洋生態系に大きな影響を与えていると予想される。しかし氷の張った海域では曳網できないため,海氷下に生息する魚類の情報は極めて限定的である。これに対し我々が開発した環境DNA手法は,環境水を採水してそれに含まれるDNAを分析することで魚類相を推定できるそこで本研究では,環境DNA手法を用いて海氷の下にどのような魚類がどれくらい生息しているのかを明らかにすることを目的とする。

研究実績の概要

環境DNA手法を用いて,季節海氷域であるオホーツク海を含む北海道周辺の魚類群集の時空間変化を明らかにするための調査と分析を行った。北海道周辺海域において2022年の調査では3~26分類群,2023年の調査では2~26分類群の魚種が検出された.両年の結果に対しNMDS解析を行ったところ,太平洋の魚類群集は年により非類似性を示した.北海道の太平洋側には津軽暖流と親潮が流入しており,両者の流量や影響範囲が年によって異なることが,太平洋の魚類群集構造に影響を与えた可能性がある.一方で,紋別の沿岸域では6~28分類群の魚類が検出された.沖合域では,沿岸域とは組成の異なる2~20分類群が検出された,また,海氷接岸期でも7~14分類群を検出することができた.間接傾度分析の結果、群集組成の変化に水温と岸からの距離が相関していることが示された.網走市鱒浦港では10~38分類群の魚類が検出された.オホーツクタワーの結果と合わせて解析したところ,水温と群集組成との間に有意な相関があった.
また、低温環境において,水温や海水の違いが環境DNAの分解速度に与える影響を調べることを目的とし,スケトウダラの飼育水を用いて分解実験を行った。その結果、急速に分解がおこる分解初期と比較的ゆっくりと分解が進む分解後期の2段階構造になっていることが分かった。これは,分解が進むにしたがってDNAの形態が変化し,分解速度に強く影響を与える要素が段階的に変化するためと考えられる。また,分解速度定数と水温の間には相関関係は見られなかった。一方,おしょろ丸の飼育水のeDNA分解は室蘭水族館飼育水のeDNAの分解より速く,分解速度は生息環境と海水の性質に依存することが示唆された。その要因として,海水中の微生物フローラや,対象種のバイオマス,DNAの鮮度の違いなどが推察される。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

海氷下の海水や湖水の氷の水から環境DNAを抽出、分析できることを確かめた。また年間を通じてモニタリングすることにより、氷の有無が魚類相に与える影響も推定することができた。さらに、同じように海氷が接岸する紋別と網走において、魚類相が異なることが分かった。これは、海底地形の差異により深層に生息する魚類を反映した結果であると推測され、興味深い。
また、調査は日本周辺にとどまらず、北極圏のケンブリッジベイ(カナダ)でも行い、海氷および海氷下の海水サンプルを得ることができた。
さらに、環境DNAを用いた生物相の推定をする際にしばしば問題となる水中でのDNAの挙動についても、分解実験を行うことにより、ある程度見通しを得ることができた。
このように、当初想定していた研究内容は概ね順調に進んでいるといえる。

今後の研究の推進方策

昨年度までの成果の一つとして、研究開始時には予定していなかった、氷そのものに含まれるDNAの分析にも成功した。これは、氷が形成されたときの生物相に関する情報を保存しているものと思われる。そのため、今後は海水を凍らせて保管し、保管中にDNAがどのように変遷していくかを調べる実験を行う。
また、昨年度までにフィールド調査等で得られた成果を、順次論文として発表していく。

報告書

(2件)
  • 2023 実績報告書
  • 2022 実績報告書
  • 研究成果

    (10件)

すべて 2024 2023 2022

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (8件) (うち国際学会 3件、 招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Evaluating the sampling effort for the metabarcoding‐based detection of fish environmental DNA in the open ocean2023

    • 著者名/発表者名
      Kawakami Tatsuya、Yamazaki Aya、Asami Maki、Goto Yuko、Yamanaka Hiroki、Hyodo Susumu、Ueno Hiromichi、Kasai Akihide
    • 雑誌名

      Ecology and Evolution

      巻: 13 号: 3

    • DOI

      10.1002/ece3.9921

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Distribution and habitat preference of polar cod (Boreogadus saida) in the Bering and Chukchi Seas inferred from species-specific detection of environmental DNA2023

    • 著者名/発表者名
      Kawakami Tatsuya、Yamazaki Aya、Jiang Hai-Chao、Ueno Hiromichi、Kasai Akihide
    • 雑誌名

      Frontiers in Marine Science

      巻: 10

    • DOI

      10.3389/fmars.2023.1193083

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 環境DNAを用いたチュクチ海およびベーリング海におけるホッキョクダラとコマイの分布域推定2024

    • 著者名/発表者名
      三科陽大・川上達也・笠井亮秀
    • 学会等名
      令和5年度日本水産学会北海道支部大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 環境DNAを用いた函館湾における魚類群集構造解析2024

    • 著者名/発表者名
      園田龍平・川上達也・笠井亮秀
    • 学会等名
      令和5年度日本水産学会北海道支部大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Seasonal changes in fish communities in the coastal area of the Okhotsk Sea inferred from environmental DNA analysis2024

    • 著者名/発表者名
      Takuma Yonago, Tatsuya Kawakami, Hitomi Yoshida, Seiji Katakura, Tomoyasu Yamazaki, Takashi Kuwahara, Yoshizumi Nakagawa, Akihide Kasai
    • 学会等名
      The 38th International Symposium on the Okhotsk Sea & Polar Oceans
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Comparison between zooplankton production and polar cod distribution in the Pacific Arctic Ocean during October 2020: Combination approach of plankton net and environmental DNA2024

    • 著者名/発表者名
      Kohei Matsuno, Tatsuya Kawakami, Minami Ishihara, Shino Kumagai, Nanami Hosoda, Atsushi Yamaguchi, Hiromichi Ueno and Akihide Kasai
    • 学会等名
      ICES-PICES 7th International Zooplankton Production Symposium
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Distribution of Polar cod, Boreogadus saida, in the Chukchi Sea inferred from environmental DNA analysis2023

    • 著者名/発表者名
      Tatsuya Kawakami, Aya Yamazaki, H. Jiang, Hiromichi Ueno and Akihide Kasai
    • 学会等名
      Seventh International Symposium on Arctic Research
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 夏の知床半島周辺海域における魚類相2023

    • 著者名/発表者名
      櫻木雄太・川上達也・笠井亮秀・山村織生・三谷曜子
    • 学会等名
      2023年度日本水産学会ミニシンポジウム「知床周辺海域のホットスポット形成:海洋環境から高次捕食者まで」
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 環境DNAメタバーコーディングによる北極圏における魚類群集構造の解析2022

    • 著者名/発表者名
      川上哲也・山崎 彩・上野洋路・兵藤 晋・笠井亮秀
    • 学会等名
      JPGU
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 環境DNA解析 ~外洋域の生物多様性を探る~2022

    • 著者名/発表者名
      笠井亮秀
    • 学会等名
      日本郵船オンライン講演会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演

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公開日: 2022-04-19   更新日: 2024-12-25  

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