• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

オルガネラ間コンタクトサイトに集積する新規タンパク質の機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 23K23832
補助金の研究課題番号 22H02568 (2022-2023)
研究種目

基盤研究(B)

配分区分基金 (2024)
補助金 (2022-2023)
応募区分一般
審査区分 小区分43030:機能生物化学関連
研究機関山形大学

研究代表者

田村 康  山形大学, 理学部, 教授 (50631876)

研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2024年度)
配分額 *注記
17,420千円 (直接経費: 13,400千円、間接経費: 4,020千円)
2024年度: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円)
2023年度: 5,850千円 (直接経費: 4,500千円、間接経費: 1,350千円)
2022年度: 6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
キーワードミトコンドリア / 小胞体 / 液胞 / オルガネラコンタクトサイト / リン脂質 / オルガネラ / オルガネラコンタクト / 核 / NVJ
研究開始時の研究の概要

我々は任意のオルガネラ間コンタクトサイトに集積するタンパク質を空間特異的にビオチン化修飾する方法,CsFiND法を独自に開発した。そこで本研究では,CsFiND法を用いて,出芽酵母やヒト培養細胞における様々なオルガネラ間コンタクトサイトに集積タンパク質を同定し,それらの因子の機能を解析することで,オルガネラ間コンタクトサイトの形成機構や生理的意義を明らかにするものである。このような研究の展開により,異なるオルガネラ同士が高度に連携しながら機能する仕組みの理解を目指す。

研究実績の概要

本研究ではオルガネラ膜間コンタクトサイト(Membrane Contact Site, MCS)に集積する因子を同定し,その機能解析を行うことで新たなMCSの機能を明らかにすることを目指した。これまでにMCSに集積するタンパク質を網羅的に同定する実験系を独自に開発し,この手法が実際にMCSタンパク質の同定に効果的であることを見出して論文として発表した(Fujimoto et al. Contact, 2023)。この独自の実験系を駆使することで,ヒト培養細胞の小胞体-ミトコンドリア間MCS,小胞体-リソソーム間MCSに加え,出芽酵母のミトコンドリア-液胞間,核膜-液胞間MCSに集積する因子を網羅的に同定した。現在,同定された因子の機能解析を現在進めているところであるが,これまでの顕著な成果として,出芽酵母の小胞体-ミトコンドリア間MCSを形成するERMES複合体が,ERストレスに応答して解離することで,ERからミトコンドリアへの脂質輸送を抑制し,その結果ER膜が拡大することでERストレス軽減に貢献することを見出した(Kakimoto et al., iScience, 2022)。また飢餓条件に応じて,出芽酵母の核膜-液胞間MCSが大きく拡大し,細胞内の代謝を調節することでストレスに応答することを示唆する興味深い研究結果が得られている。引き続き研究を進めることで,MCSの新しい生理機能の解明につながる研究成果が期待される。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

これまでにER-ミトコンドリア間コンタクトサイトを形成するERMES複合体がERストレス条件下で解離し,その結果,ERからミトコンドリアへの脂質輸送を抑制することで,ERストレス軽減に重要なER膜の拡大に貢献するという新しいERストレス応答機構の解明に成功した(iScience, 2023)。また,出芽酵母における核膜ー液胞膜間コンタクトサイト(Nuclear-Vacuole Junction, NVJ)に集積する新規タンパク質を3種類同定し,その機能解析を進めた結果,NVJがグルコース飢餓時に誘導される脂肪滴の分解に貢献するという新規知見を得ることに成功した。これらの研究成果は,MCS研究だけでなく細胞生物学分野にも大きなインパクトを持つ重要な発見である。このように,MCSが関与する新しい生命現象を順調に発見できていることから,研究が概ね順調に進展しているとした。

今後の研究の推進方策

今後は,ヒト培養細胞の小胞体-ミトコンドリア間MCS,小胞体-リソソーム間MCSに集積する因子の機能解析を更に進展させ,これらのMCSの形成機構や生理的意義の解明を目指す。また出芽酵母に関しては,グルコース飢餓時の脂肪滴の分解に,具体的にNVJのどのような機能が関与するのか,その分子メカニズムを明らかにする。さらに出芽酵母ミトコンドリア-液胞間MCSに集積する新規因子に関しても,飢餓条件でMCSへの集積が顕著になることを見出したため,引き続きこの因子の細胞ストレス応答への関係を解析していく。以上の研究により,通常状態のMCS形成機構の解明にとどまらず,ストレス条件に応答してダイナミックに変化するMCSの生理的役割を解析していくことで,ストレス条件下でさまざまなオルガネラがその機能をチューニングする分子機構の解明につなげる。

報告書

(2件)
  • 2023 実績報告書
  • 2022 実績報告書
  • 研究成果

    (21件)

すべて 2024 2023 2022 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (14件) (うち国際学会 1件、 招待講演 6件) 備考 (2件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] Chemical inhibition of phosphatidylcholine biogenesis reveals its role in mitochondrial division2024

    • 著者名/発表者名
      Shiino Hiroya、Tashiro Shinya、Hashimoto Michiko、Sakata Yuki、Hosoya Takamitsu、Endo Toshiya、Kojima Hirotatsu、Tamura Yasushi
    • 雑誌名

      iScience

      巻: 27 号: 3 ページ: 109189-109189

    • DOI

      10.1016/j.isci.2024.109189

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] LRRK1 functions as a scaffold for PTP1B-mediated EGFR sorting into ILVs at the ER-endosome contact site2023

    • 著者名/発表者名
      Hanafusa Hiroshi、Fujita Keitaro、Kamio Misa、Iida Shiori、Tamura Yasushi、Hisamoto Naoki、Matsumoto Kunihiro
    • 雑誌名

      Journal of Cell Science

      巻: 136 号: 6 ページ: 260566-260566

    • DOI

      10.1242/jcs.260566

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Complementation Assay Using Fusion of Split-GFP and TurboID (CsFiND) Enables Simultaneous Visualization and Proximity Labeling of Organelle Contact Sites in Yeast2023

    • 著者名/発表者名
      Fujimoto Shintaro、Tashiro Shinya、Tamura Yasushi
    • 雑誌名

      Contact

      巻: 6 ページ: 1-10

    • DOI

      10.1177/25152564231153621

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Dissociation of ERMES clusters plays a key role in attenuating the endoplasmic reticulum stress2022

    • 著者名/発表者名
      Kakimoto-Takeda Yuriko、Kojima Rieko、Shiino Hiroya、Shinmyo Manatsu、Kurokawa Kazuo、Nakano Akihiko、Endo Toshiya、Tamura Yasushi
    • 雑誌名

      iScience

      巻: 25 号: 11 ページ: 105362-105362

    • DOI

      10.1016/j.isci.2022.105362

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 脂質輸送制御によるオルガネラ量の調節機構2023

    • 著者名/発表者名
      田村康
    • 学会等名
      第96回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] オルガネラ膜脂質恒常性維持機構に関する研究2023

    • 著者名/発表者名
      田村康
    • 学会等名
      第89回日本生化学会東北支部例会・シンポジウム
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ホスファチジルコリン合成阻害剤PCiBの単離とミトコンドリア分裂への影響2023

    • 著者名/発表者名
      椎野浩也,橋本美智子,細谷孝充,遠藤斗志也,小島宏達,田村康
    • 学会等名
      第31回山形分子生物学セミナー
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 出芽酵母の核-液胞間コンタクトサイトに局在する新規タンパク質の解析 口頭発表2023

    • 著者名/発表者名
      藤本慎太郎,田村康
    • 学会等名
      第31回山形分子生物学セミナー
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] CsFiND による小胞体-リソソーム間コンタクトサイト局在タンパク質の同定2023

    • 著者名/発表者名
      田代晋也,高橋賢司, 新田莉彩子, 尾野雅哉, 吉丸哲郎, 片桐豊雅, 田村康
    • 学会等名
      第31回山形分子生物学セミナー
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 出芽酵母におけるミトコンドリア-脂肪滴間コンタクトサイト集積タンパク質の探索2023

    • 著者名/発表者名
      川上航平,藤本慎太郎,田村康
    • 学会等名
      第46回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Ups1非依存的なカルジオリピン合成経路の解明2023

    • 著者名/発表者名
      鈴木ひかり,田村康
    • 学会等名
      第46回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 核-液胞間コンタクトサイトの新規因子の同定と機能解析2023

    • 著者名/発表者名
      藤本慎太郎,田村康
    • 学会等名
      第75回日本細胞生物学会大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 新規ヒト小胞体-リソソーム間コンタクトサイト局在タンパク質の同定と機能解析2023

    • 著者名/発表者名
      田代晋也,高橋賢司, 尾野雅哉, 吉丸哲郎, 片桐豊雅, 田村康
    • 学会等名
      第75回日本細胞生物学会大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 核-液胞間コンタクトサイトに集積する新規因子の同定と機能解析2023

    • 著者名/発表者名
      藤本慎太郎,田村康
    • 学会等名
      第89回日本生化学会東北支部例会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Regulation of phospholipid transport between the ER and mitochondria2022

    • 著者名/発表者名
      Yasushi Tamura
    • 学会等名
      Yeast Lipid Conference 2022
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] オルガネラ間コンタクトを介した リン脂質輸送機構2022

    • 著者名/発表者名
      田村康
    • 学会等名
      レドックスR&D戦略委員会 第1回 夏のシンポジウム
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 細胞内オルガネラ量の調節メカニズム2022

    • 著者名/発表者名
      田村康
    • 学会等名
      第95回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] オルガネラ間コンタクトサイトに局在するタンパク質の同定2022

    • 著者名/発表者名
      田村康
    • 学会等名
      第45回分子生物学会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [備考] 田村研究室

    • URL

      https://www.tamuralab.com/home-2

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [備考] 田村研究室

    • URL

      https://www.tamuralab.com/

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [産業財産権] 特願2023-1843242023

    • 発明者名
      田村康,椎野浩也
    • 権利者名
      山形大学
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2023-184324
    • 出願年月日
      2023
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書

URL: 

公開日: 2022-04-19   更新日: 2024-12-25  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi