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生体にみられる振動・らせん運動の統一的理解に向けたマルチモーダル計測と理論構築

研究課題

研究課題/領域番号 23K23844
補助金の研究課題番号 22H02580 (2022-2023)
研究種目

基盤研究(B)

配分区分基金 (2024)
補助金 (2022-2023)
応募区分一般
審査区分 小区分43040:生物物理学関連
研究機関東北大学 (2024)
東京大学 (2022-2023)

研究代表者

樋口 秀男  東北大学, 未来科学技術共同研究センター, 特任教授 (90165093)

研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2024年度)
配分額 *注記
15,860千円 (直接経費: 12,200千円、間接経費: 3,660千円)
2024年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
2023年度: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円)
2022年度: 8,320千円 (直接経費: 6,400千円、間接経費: 1,920千円)
キーワード振動 / モータータンパク質 / 細胞 / ダイニン / ナノ計測
研究開始時の研究の概要

細胞を損傷することによって、小胞の運動速度が遅くなることが知られている。損傷細胞において、らせん運動に変化がみられるかを測定する。
鞭毛振動や心筋振動において、逆反応速度とミオシンがアクチンから解離する時間と振動との関係および、振動の起こる閾値との関係を明らかにする。また、心筋は、振動数が数Hzとゆっくりなのに対して、鞭毛は数十Hzと高い。この差が、分子の反応時間によるものなのか、分子の弾性によるものであるかを明らかにする。

研究実績の概要

ダイニンは、真核生物の鞭毛において振動運動を生み出すマイナス末端指向性モーターである。細胞膜の最も重要な特徴である周期的な拍動は、ダイニンが微小管に沿って時空間的に制御することによって起こる。ダイニンは微小管に沿って時空間スライディングすることによって起こる。鞭毛振動におけるダイニンの振動の役割を明らかにするために、我々は3つの異なる軸索切断段階におけるダイニンの生化学的性質を調べた。無傷の9 + 2構造から出発して、相互作用するダブレットの数を減らし、各段階で発生する振動力の3つのパラメータ、すなわち結合割合、反応時間、ステップサイズを決定した。軸索、ダブレットバンドル、単一ダブレットの無傷のダイニン分子を用いて、光ピンセットで力を測定した。3つの軸糸の条件下で測定されたダイニン1個あたりの平均力は、以前に報告された軸糸ダイニンの停止力よりも小さかった。この現象は、結合割合が以前考えられていたよりも低いことを示唆している。この可能性は、精製ダイニンを用いたin vitro運動性アッセイによってさらに確かめられた。測定された力から推定された反応時間とステップサイズは同様であった。これらのパラメーターの類似性から、ダイニンの振動の本質的な性質は、分子に固有のものであり、軸糸の構造とは無関係であることが示唆される。
また、キネシンの幅広い荷重下での力の発生を理解するために、光学ピンセットを用いて20~42pNの荷重下でのキネシン分子のステップ運動を測定した。その結果、前進と後退のステップサイズはステップサイズは8.2 nmであった。ヒストグラム後方ステップと解離の反応時間のヒストグラムは、速い時定数(0.4 ms)と遅い時定数(>3 ms)を持つ2つの独立した指数関数式に従った。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

22年度の予定では、精子鞭毛ダイニン多分子の振動時の力・変位・弾性率・急速変位応答(反応速度や粘弾性率がわかる)を測定するために、レーザー トラップされたビーズ微粒子の像の位置を4分割センサーで測定することであった。この予定は達成され、精子鞭毛ダイニン多分子の振動時の特性と分子機構を示唆する原著論文を出版することができた。この論文の出版と並行して、振動がどのように起こるかをコンピューターシミュレーションを行い、振動の要素が集まりつつある。また細胞内振動に重要なキネシン1分子の新しい特性が明らかとなり、振動の理解に向けておおむね順調に研究が進んでいる。

今後の研究の推進方策

精子鞭毛ダイニン多分子の振動のシミュレーション研究は順調に進んでいるため,今後論文化に向けた追加シミュレーションを行う.さらにシミュレーションにおいて重要なパラメーターを実験的測定により得る予定である。さらに、細胞内のプロッセッシブモーターであっても振動が起こることをシミュレーションと実験の両面から研究を行う予定である。

報告書

(1件)
  • 2022 実績報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2023 2022

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 1件、 招待講演 2件)

  • [雑誌論文] Fast backward steps and detachment of single kinesin molecules measured under a wide range of loads.2023

    • 著者名/発表者名
      Yuichi Kondo, Kazuo Sasaki and Hideo Higuchi
    • 雑誌名

      Traffic

      巻: 24 号: 10 ページ: 463-474

    • DOI

      10.1111/tra.12909

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Versatile properties of dynein molecules underlying regulation in flagellar oscillation.2023

    • 著者名/発表者名
      Takashi Fujiwara, Chikako Shingyoji and Hideo Higuchi
    • 雑誌名

      Sci. Rep.

      巻: 13 号: 1 ページ: 1-15

    • DOI

      10.1038/s41598-023-37242-6

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Oscillatory movement of a dynein-microtubule complex crosslinked with DNA origami2022

    • 著者名/発表者名
      Abdellatef Shimaa A、Tadakuma Hisashi、Yan Kangmin、Fujiwara Takashi、Fukumoto Kodai、Kondo Yuichi、Takazaki Hiroko、Boudria Rofia、Yasunaga Takuo、Higuchi Hideo、Hirose Keiko
    • 雑誌名

      eLife

      巻: 11 ページ: 1-20

    • DOI

      10.7554/elife.76357

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Automation of detecting and tracking3D vesicle transport using dual-focus optics2022

    • 著者名/発表者名
      Seohyun Lee, Hyuno Kim, and Hideo Higuchi
    • 雑誌名

      SPIE Photonics West BiOS 2023

      巻: 123850E ページ: 1-4

    • DOI

      10.1117/12.2649474

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] An automatic detection and tracking method for the 3D reconstruction of vesicle movement in a living cell2022

    • 著者名/発表者名
      Seohyun Lee, Hyuno Kim, Hideo Higuchi.
    • 学会等名
      第 60 回日本生物物理学会.
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Quantitative evaluation of cell damages by motility of intercellular organelles.2022

    • 著者名/発表者名
      Hideaki Ota, M. Sakuma and H. Higuchi.
    • 学会等名
      Symposium on Internatinal Nanomedicine
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 細胞の元気さを測る2022

    • 著者名/発表者名
      樋口秀男 , 太田英暁
    • 学会等名
      遺伝子・ デリバリー研究会 第 21 回シンポジウム
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Quantitative evaluation of the decrease in intracellular mobility of cells in which ATP synthesis is inhibited2022

    • 著者名/発表者名
      Hideaki Ota, Hideo Higuchi
    • 学会等名
      第 60 回日本 生物物理学会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Understanding of robustness in cancer morphology in cold temperature2022

    • 著者名/発表者名
      Yuta Sekiguchi, Hideo Higuchi, Motoshi Kaya
    • 学会等名
      第 60 回日本 生物物理学会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書

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公開日: 2022-04-19   更新日: 2024-12-25  

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