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過飽和蛋白質科学の開拓

研究課題

研究課題/領域番号 23K23848
補助金の研究課題番号 22H02584 (2022-2023)
研究種目

基盤研究(B)

配分区分基金 (2024)
補助金 (2022-2023)
応募区分一般
審査区分 小区分43040:生物物理学関連
研究機関大阪大学

研究代表者

後藤 祐児  大阪大学, 大学院工学研究科, 特任研究員 (40153770)

研究分担者 山本 卓  新潟大学, 医歯学総合病院, 准教授 (70444156)
山口 圭一  大阪大学, 大学院工学研究科, 特任准教授(常勤) (90432187)
研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2026-03-31
研究課題ステータス 交付 (2024年度)
配分額 *注記
17,420千円 (直接経費: 13,400千円、間接経費: 4,020千円)
2025年度: 3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円)
2024年度: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
2023年度: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
2022年度: 6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
キーワード蛋白質 / 生体分子 / 老化 / 蛋白質凝集 / アミロイド線維 / 過飽和 / 溶解度 / フォールディング / 脳神経変性疾患 / 凝集 / 変性 / 相転移
研究開始時の研究の概要

代表者は蛋白質フォールディングとミスフォールディング(アミロイド線維形成)の研究を行い、水に溶けた蛋白質の基本的性質である『溶解度』と『過飽和』が、これらを包括的に理解するために重要であることを示した。つまり、フォールディングは過飽和条件下で成り立つものであり、過飽和が解消すると、フォールディングとアミロイド線維形成が結合した統一原理が成り立つ。
本研究では、透析アミロイドーシスをはじめとするアミロイド病の発症機構が、『溶解度』と『過飽和』によって理解できることを示す。さらに溶解度と過飽和が様々な生命現象において重要な役割を果たしていることを実証し、『過飽和蛋白質科学』を開拓する。

研究実績の概要

蛋白質の構造物性の基盤は『アンフィンゼンのドグマ』であり、蛋白質がフォールディングして形成する機能的構造はアミノ酸配列によって決まる熱力学的最安定状態とみなす。他方、高齢化に伴う疾患の多くにおいては、蛋白質がミスフォールディングして形成するアミロイド線維が関わる。今日のアミロイド研究ではアミロイドの原子構造解析が大きく進展したことにより、アミロイドーシスの発症機構も構造に基づいて議論されることが多い。他方、アミロイド形成を左右する極めて重要な概念である過飽和についてはあまり注目されていない。本研究では『溶解度』や『過飽和』といった溶質の基本的特性に基づき、生体におけるアミロイド線維形成の実体を明らかにし、その制御を目指す。
今年度は『溶解度』と『過飽和』の役割に関する総合的な検討を行い、溶解度や過飽和に基づいてアミロイド線維形成を理解することの重要性を国内外に提唱した。次に、昨年度までに透析アミロイドーシスに関わるβ2ミクログロブリンの研究から、血液中の血清アルブミン濃度の減少がアミロイドーシス発症の新たなリスク因子(プロテオミクス因子)であることを明らかにしたが、今年度はプロテオミクスの視点から、生体内因子の役割を検証した。また、アミロイド線維形成に対する液液相分離の効果に関する研究を進め、溶質の枯渇効果の役割を示すと共に、従来から進めているアミロイド凝集誘導検出装置HANABIの研究開発を加速した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

①過飽和と溶解度の重要性:過飽和は溶質の結晶生成の必須条件であり、アミロイド線維も過飽和を経て形成する。一旦、アミロイド形成が開始すると、それを止めること(消火)は困難であり、アミロイドーシスの対策としては、核形成を抑止すること(防火)が重要である。そこで、「消火は防火に如かずアミロイド」というコンセプトが重要であることを、論文発表や学会発表を通じて国内外に提唱した。
②アミロイド線維の形成とプロテオスタシス:既に血液中の血清アルブミン濃度の減少が透析アミロイドーシスの新たな危険因子であることを前年度までに明らかにした。このことの一般性を検証するために、抗体L鎖が原因となって発症するALアミロイドーシスの発症機構をプロテオスタシスの観点から検討した。
③液液相分離:ポリエチレングリコール・デキストランが形成するドロップレットは、アミロイド線維の形成を促進するだけでなく、抑制する場合のあることを明らかにした。
④HANABIの開発:HANABIの研究開発を進め、超音波に依存したアミロイド形成反応をさらに同期化させることができた。

今後の研究の推進方策

「溶解度」と「過飽和」に依存した「晶析」は、アミロイド線維だけではなく、機能性アミロイド、尿路結石や痛風などの結石症、アクチンやミオシンの重合など、生体や生命現象に関わるさまざまな場面、プロテオスタシスの維持において重要な役割を担っている。今後は特に、「生体における過飽和解消のトリガー」に注目して研究を展開し、「過飽和生命科学の開拓」を進めたい。

報告書

(2件)
  • 2023 実績報告書
  • 2022 実績報告書
  • 研究成果

    (22件)

すべて 2024 2023 2022 その他

すべて 国際共同研究 (5件) 雑誌論文 (10件) (うち国際共著 4件、 査読あり 10件、 オープンアクセス 9件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 3件、 招待講演 5件) 図書 (1件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] ミュンヘン工科大学(ドイツ)

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [国際共同研究] エトバッシュ・ローランド大学(ハンガリー)

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [国際共同研究] エトバッシュ・ローランド大学(ハンガリー)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [国際共同研究] ミュンヘン工科大学(ドイツ)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [国際共同研究] ウーロンゴン大学(オーストラリア)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [雑誌論文] Supersaturation, a Critical Factor Underlying Proteostasis of Amyloid Fibril Formation2024

    • 著者名/発表者名
      Goto Yuji、Nakajima Kichitaro、Yamamoto Suguru、Yamaguchi Keiichi
    • 雑誌名

      Journal of Molecular Biology

      巻: - 号: 14 ページ: 168475-168475

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2024.168475

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Mass spectrometry-based proteomic analysis of proteins adsorbed by hexadecyl-immobilized cellulose bead column for the treatment of dialysis-related amyloidosis2024

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto Suguru、Yamamoto Keiko、Hirao Yoshitoshi、Yamaguchi Keiichi、Nakajima Kichitaro、Sato Mami、Kawachi Miho、Domon Mio、Goto Kei、Omori Kentaro、Iino Noriaki、Shimada Hisaki、Aoyagi Ryuzi、Ei Isei、Goto Shin、Goto Yuji、Gejyo Fumitake、Yamamoto Tadashi、Narita Ichiei
    • 雑誌名

      Amyloid

      巻: - 号: 2 ページ: 1-11

    • DOI

      10.1080/13506129.2024.2315148

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Surface Modification of Ultrasonic Cavitation by Surfactants Improves Detection Sensitivity of α-Synuclein Amyloid Seeds2024

    • 著者名/発表者名
      Nakajima Kichitaro、Ota Tomoki、Toda Hajime、Yamaguchi Keiichi、Goto Yuji、Ogi Hirotsugu
    • 雑誌名

      ACS Chemical Neuroscience

      巻: 15 号: 8 ページ: 1643-1651

    • DOI

      10.1021/acschemneuro.4c00071

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate interacts with alpha-synuclein and initiates its aggregation and formation of Parkinson’s disease-related fibril polymorphism2023

    • 著者名/発表者名
      Choong Chi-Jing、Aguirre Cesar、Kakuda Keita、Beck Goichi、Nakanishi Hiroki、Kimura Yasuyoshi、Shimma Shuichi、Nabekura Kei、Hideshima Makoto、Doi Junko、Yamaguchi Keiichi、et al.
    • 雑誌名

      Acta Neuropathologica

      巻: 145 号: 5 ページ: 573-595

    • DOI

      10.1007/s00401-023-02555-3

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Ultrastiff Amyloid-Fibril Network of α-Synuclein Formed by Surface Seeding Reaction Confirmed by Multichannel Electrodeless Quartz-Crystal-Microbalance Biosensor2023

    • 著者名/発表者名
      Zhou Lianjie、Hajiri Touko、Nakajima Kichitaro、Aguirre Cesar、Ikenaka Kensuke、Mochizuki Hideki、Yamaguchi Keiichi、Goto Yuji、Ogi Hirotsugu
    • 雑誌名

      ACS Sensors

      巻: 8 号: 7 ページ: 2598-2608

    • DOI

      10.1021/acssensors.3c00331

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Mechanisms of polyphosphate-induced amyloid fibril formation triggered by breakdown of supersaturation2023

    • 著者名/発表者名
      Yamaguchi Keiichi、Nakajima Kichitaro、Goto Yuji
    • 雑誌名

      Biophysics and Physicobiology

      巻: 20 号: 1 ページ: n/a

    • DOI

      10.2142/biophysico.bppb-v20.0013

    • ISSN
      2189-4779
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Macromolecular crowding and supersaturation protect hemodialysis patients from the onset of dialysis-related amyloidosis2022

    • 著者名/発表者名
      Nakajima Kichitaro、Yamaguchi Keiichi、Noji Masahiro、Aguirre Cesar、Ikenaka Kensuke、Mochizuki Hideki、Zhou Lianjie、Ogi Hirotsugu、Ito Toru、Narita Ichiei、Gejyo Fumitake、Naiki Hironobu、Yamamoto Suguru、Goto Yuji
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 13 号: 1 ページ: 5689-5689

    • DOI

      10.1038/s41467-022-33247-3

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] BeStSel: webserver for secondary structure and fold prediction for protein CD spectroscopy2022

    • 著者名/発表者名
      Micsonai Andras、Moussong Eva、Wien Frank、Boros Eszter、Vadszi Henrietta、Murvai Nikoletta、Lee Young-Ho、Molnar Tamas、Rafragiers Matthieu、Goto Yuji、Tantos Agnes、Kardos Jozsef
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 50 号: W1 ページ: W90-W98

    • DOI

      10.1093/nar/gkac345

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Competitive inhibition of the classical complement pathway using exogenous single-chain C1q recognition proteins2022

    • 著者名/発表者名
      Vadaszi Henrietta、Kiss Bence、Micsonai Andras、Schlosser Gitta、Szaniszla Tamas、Kovacs Reka 、Gyorffy Balazs A.、Kakesi Katalin A.、Goto Yuji、Uzonyi Barbara、Liliom Karoly、Kardos Jozsef
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 298 号: 7 ページ: 102113-102113

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2022.102113

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Supersaturation-Dependent Formation of Amyloid Fibrils2022

    • 著者名/発表者名
      Goto Yuji、Noji Masahiro、Nakajima Kichitaro、Yamaguchi Keiichi
    • 雑誌名

      Molecules

      巻: 27 号: 14 ページ: 4588-4588

    • DOI

      10.3390/molecules27144588

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 蛋白質フォールディングとアミロイド形成の統合2023

    • 著者名/発表者名
      後藤祐児
    • 学会等名
      第112回日本病理学会総会シンポジウム
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Breakdown of supersaturation barrier links protein folding to amyloid formation2023

    • 著者名/発表者名
      Yuji GOTO
    • 学会等名
      Amyloid Symposium Munich 2023
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 蛋白質フォールディングとミスフォールディングの統合2022

    • 著者名/発表者名
      後藤祐児
    • 学会等名
      第5回LLPS研究会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Linking protein folding and misfolding2022

    • 著者名/発表者名
      Yuji GOTO
    • 学会等名
      ABA, APPA & TBS Joint Congress,
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Linking protein folding and misfolding under macromolecular crowding2022

    • 著者名/発表者名
      Yuji GOTO
    • 学会等名
      Proteostasis & Disease Symposium 2022
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [図書] 生体分子環境の化学2023

    • 著者名/発表者名
      日本化学会
    • 総ページ数
      208
    • 出版者
      化学同人
    • ISBN
      9784759814057
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [備考] 大阪大学・工学研究科・マイクロソノケミストリー共同研究講座・後藤グループ

    • URL

      https://supersaturation.sakura.ne.jp/

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実績報告書

URL: 

公開日: 2022-04-19   更新日: 2025-11-21  

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