| 研究課題/領域番号 |
23K23865
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| 補助金の研究課題番号 |
22H02602 (2022-2023)
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| 研究種目 |
基盤研究(B)
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| 配分区分 | 基金 (2024)
補助金 (2022-2023) |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 審査区分 |
小区分43050:ゲノム生物学関連
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| 研究機関 | 群馬大学 (2023-2024)
大阪大学 (2022) |
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研究代表者 |
二村 圭祐 群馬大学, 未来先端研究機構, 教授 (00462713)
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| 研究期間 (年度) |
2024-04-01 – 2026-03-31
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| 研究課題ステータス |
交付 (2024年度)
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| 配分額 *注記 |
17,420千円 (直接経費: 13,400千円、間接経費: 4,020千円)
2024年度: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円)
2023年度: 5,850千円 (直接経費: 4,500千円、間接経費: 1,350千円)
2022年度: 6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
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| キーワード | 遺伝子発現制御 / 頭頸部腫瘍 / RNAスプライシング / 転写 / 癌 / 遺伝子発現 / 腫瘍 |
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| 研究開始時の研究の概要 |
複数の転写プロセスの精緻な制御によりmRNAは合成される。スプライシング因子の高発現によって異常なスプライシングバリアントが合成され、癌は高悪性化する。一方で、スプライシング因子の摂動がスプライシングパターンを著変せず、遺伝子発現プロファイルを大きく変換する例がある。しかし、スプライシング因子が転写を直接制御するかは不明である。本研究では、腫瘍増悪化過程におけるスプライシング因子による転写制御という新規な概念を確立する。本研究は、転写プロセスが連続反応ではなく、各反応が相互に調節することで遺伝子発現を一体的に制御することを提唱し、転写研究の新たな学術的基盤形成に資することを目的とする。
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| 研究実績の概要 |
複数の転写プロセスの精緻な制御によりmRNAは合成される。スプライシング因子の高発現によって異常なスプライシングバリアントが合成され、癌は高悪性化する。一方で、スプライシング因子の摂動がスプライシングパターンを著変せず、遺伝子発現プロファイルを大きく変換する例がある。しかし、スプライシング因子が転写を直接制御するかは不明である。本研究では、腫瘍増悪化過程におけるスプライシング因子による転写制御という新規な概念を確立することを目的とした。これまでに申請者らは去勢抵抗性前立腺癌においてアンドロゲン受容体ARのスプライシングを制御する因子としてSF３B2を同定していた。頭頸部腫瘍において、このSF3B2がクロマチンに結合し、RNAポリメラーゼIIの活性を制御することを本研究から見出した。SF3B2高発現によって頭頸部腫瘍のマウスでの増殖が亢進した。さらにSF3B2は標的mRNAの安定性制御にも関与することが示唆された。本研究から、転写プロセスが連続反応ではなく、各反応が相互に調節することで遺伝子発現を一体的に制御することを見出され、転写研究の新たな学術的基盤形成に資する成果を得ることができたと考える。
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| 現在までの達成度 |
現在までの達成度
3: やや遅れている
理由
研究を行う中で、新たな解析法を確立する必要が生じたため、その技術開発に取り組んでいる。そのため、当初の計画を修正したため、当初の予定よりもやや遅れが生じている。
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| 今後の研究の推進方策 |
最近、シングルセルレベルで、クロマチンを解析可能な手法の開発が世界的に非常に進んでいる。そのため、遺伝子発現制御機構を解析するためには、これらのシングルセルレベルでクロマチン構造制御を解析することが必須である。申請者らが取り組んでいるSPRITE法をベースにしたシングルセル解析とDNAバーコードを組み合わせた解析法は腫瘍増殖を制御する遺伝子発現制御機構を解明する上で、強力なツールとなり得ると考える。そのため、今後も本法の開発を進め、これらの方法を用いてSF3B2を主軸とした腫瘍増殖を制御する遺伝子発現制御機構の解明研究を遂行していく。
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