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一過的・局所的に出現する小胞体還元環境の解明

研究課題

研究課題/領域番号 23K23885
補助金の研究課題番号 22H02622 (2022-2023)
研究種目

基盤研究(B)

配分区分基金 (2024)
補助金 (2022-2023)
応募区分一般
審査区分 小区分44010:細胞生物学関連
研究機関京都産業大学

研究代表者

潮田 亮  京都産業大学, 生命科学部, 准教授 (30553367)

研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2027-03-31
研究課題ステータス 交付 (2024年度)
配分額 *注記
17,160千円 (直接経費: 13,200千円、間接経費: 3,960千円)
2026年度: 3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円)
2025年度: 3,250千円 (直接経費: 2,500千円、間接経費: 750千円)
2024年度: 3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円)
2023年度: 3,640千円 (直接経費: 2,800千円、間接経費: 840千円)
2022年度: 3,510千円 (直接経費: 2,700千円、間接経費: 810千円)
キーワードタンパク質品質管理 / 小胞体 / 分子シャペロン / レドックス / フォールディング
研究開始時の研究の概要

小胞体の酸化的レドックス環境は通常、タンパク質の適切な折りたたみを促進するが、複雑なジスルフィド結合の正確な形成には、特定の条件下での還元反応も不可欠である。これを実現するため、小胞体内にはこれまでに想定されていなかった一過的かつ局所的な還元環境が存在する。本研究では、このような独特の環境を形成するメカニズムとその生物学的重要性を探る。発見された2つの特異的な還元環境がタンパク質処理における新たな役割を担っている可能性が示唆される。

研究実績の概要

グルタチオン輸送体に対して近接ビオチン化法を用いた結果、グルタチオン輸送体近傍でフォールディングする基質の同定に成功した。この成果は、輸送体と基質との関係を理解する上で重要なステップである。プロテオリポソームへの組み込みも完了したが、組み込み効率が低いため、さらなる改善が必要である。次に、液滴内のBiPの役割が明らかになり、BiPが主要なコンパートメントとして液滴に含まれることが確認された。これに加え、BiP内の液滴に組み込まれるための領域を同定したことは、液-液相分離の形成とその機能理解において重要な発見である。これらの進展は、研究計画に沿ったものであり、グルタチオン輸送体の構造や液-液相分離による小胞体内の環境構築に関する理解が着実に進んでいることを示している。
また、小胞体のタンパク質品質管理を理解するため、CHO細胞を用いたモノクローナル抗体(mAb)生産において、新たな高発現プロモーターの開発を目指した。従来のプロモーターは、培養期間の後半でその効果が低下することが多かったが、CHO細胞のトランスクリプトーム解析により、長期間にわたり発現が維持される「Hspa5」プロモーターを特定した。このプロモーターは、異なるIgGサブクラスにも適用可能で、未処理タンパク質応答(UPR)に関連し、内分泌ストレスの影響を受けることが示唆された。このプロモーターの活用により、細胞内のタンパク質の安定した発現と恒常性の維持に寄与することが期待される。この成果は、CHO細胞での抗体生産における新たな高発現プロモーターの利用法を示し、長期間の培養におけるタンパク質生産の安定性向上に寄与するものである。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

研究の進捗は順調である。まず、グルタチオン輸送体に対して近接ビオチン化法を用いた結果、グルタチオン輸送体近傍でフォールディングする基質の同定に成功した。この成果は、輸送体と基質との関係を理解する上で重要な一歩である。さらに、プロテオリポソームへの組み込みも完了しているが、組み込み効率の向上には改善が必要であるものの、ここまでの進展は計画通りである。

また、液滴内のBiPの役割が明らかになり、BiPが主要なコンパートメントとして液滴に含まれることが確認された。加えて、BiP内の液滴に組み込まれるための領域を同定することに成功し、これは液-液相分離の形成とその機能理解において重要な発見である。

これらの進展は、研究計画に沿ったものであり、グルタチオン輸送体の構造や液-液相分離による小胞体内の環境構築に関する理解が着実に進んでいることを示している。

今後の研究の推進方策

本研究は、小胞体での一過的・局所的な還元環境の構築に焦点を当て、グルタチオン輸送体周囲の一過的還元環境と、還元酵素を含む相分離による局所的還元環境の影響を観察することを目指している。グルタチオン環境は小胞体内腔のレドックス環境の基盤であり、その導入機構を解明することで酸化的レドックス環境の中での一過的還元環境を同定する。構造学的アプローチとして、クライオ電子顕微鏡(Cryo-EM)による構造解析を活用する。候補因子Xは多量体を形成し、これがグルタチオン輸送に重要であることが判明している。哺乳類細胞から多量体を精製する。これまで哺乳類細胞からタンパク質を得ていただが、大腸菌からの精製も検討する。また、リポソームへの組み込みについては膜挿入しやすい配列を因子に導入し、より効率的なプロテオリポソームの作製を実現したい。
次に、液-液相分離による新たな小胞体内コンパートメントに焦点を当てる。相分離による還元酵素ERdj5を含むコンパートメントの環境・構成因子を解明し、相分離が酸化的フォールディングやタンパク質品質管理にどのように貢献するかを調べる。

報告書

(1件)
  • 2022 実績報告書
  • 研究成果

    (53件)

すべて 2024 2023 2022 その他

すべて 雑誌論文 (7件) (うち国際共著 1件、 査読あり 7件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (43件) (うち国際学会 2件、 招待講演 8件) 図書 (2件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Zn2+-dependent functional switching of ERp18, an ER-resident thioredoxin-like protein2024

    • 著者名/発表者名
      Tsutsumi Chika、Uegaki Kaiku、Yamashita Riyuji、Ushioda Ryo、Nagata Kazuhiro
    • 雑誌名

      Cell Reports

      巻: 43 号: 2 ページ: 113682-113682

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2024.113682

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] J-domain proteins: From molecular mechanisms to diseases2024

    • 著者名/発表者名
      Marszalek Jaroslaw、Ushioda Ryo、Kampinga Harm H. et al.
    • 雑誌名

      Cell Stress and Chaperones

      巻: 29 号: 1 ページ: 21-33

    • DOI

      10.1016/j.cstres.2023.12.002

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Tolerable glycometabolic stress boosts cancer cell resilience through altered N-glycosylation and Notch signaling activation2024

    • 著者名/発表者名
      Shungo Iwamoto、Takashi Kobayashi、Hisatoshi Hanamatsu、Ikuko Yokota、Yukiko Teranishi、Akiho Iwamoto、Miyu Kitagawa、Sawako Ashida、Ayane Sakurai、Suguru Matsuo、Yuma Myokan、Aiyu Sugimoto、Ryo Ushioda、Kazuhiro Nagata、Noriko Gotoh、Kazuki Nakajima、Takashi Nishikaze、Jun-ichi Furukawa、Naoki Itano
    • 雑誌名

      Cell Death & Disease

      巻: 15 ページ: 53-53

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mechanistic characterization of disulfide bond reduction of an ERAD substrate mediated by cooperation between ERdj5 and BiP2023

    • 著者名/発表者名
      Cai Xiaohan、Ito Shogo、Noi Kentaro、Inoue Michio、Ushioda Ryo、Kato Yukinari、Nagata Kazuhiro、Inaba Kenji
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 299 号: 11 ページ: 105274-105274

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2023.105274

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The oxidative folding of nascent polypeptides provides electrons for reductive reactions in the ER2023

    • 著者名/発表者名
      Uegaki Kaiku、Tokunaga Yuji、Inoue Michio、Takashima Seiji、Inaba Kenji、Takeuchi Koh、Ushioda Ryo、Nagata Kazuhiro
    • 雑誌名

      Cell Reports

      巻: 42 号: 7 ページ: 112742-112742

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2023.112742

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Redox states in the endoplasmic reticulum directly regulate the activity of calcium channel, inositol 1,4,5-trisphosphate receptors2023

    • 著者名/発表者名
      Fujii Shohei、Ushioda Ryo、Nagata Kazuhiro
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      巻: 120 号: 22 ページ: 1-9

    • DOI

      10.1073/pnas.2216857120

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Development of a stable antibody production system utilizing an Hspa5 promoter in CHO cells2022

    • 著者名/発表者名
      Tanemura Hiroki、Masuda Kenji、Okumura Takeshi、Takagi Eri、Kajihara Daisuke、Kakihara Hirofumi、Nonaka Koichi、Ushioda Ryo
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 12 号: 1 ページ: 7239-7239

    • DOI

      10.1038/s41598-022-11342-1

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] オルガネラ環境に応じたタンパク質フォールディング2024

    • 著者名/発表者名
      潮田 亮
    • 学会等名
      令和5年度AMED-CREST/PRIME「プロテオスタンシス」領域会議
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 液-液相分離によって形成される新たな小胞体タンパク質品質管理プラットフォーム2023

    • 著者名/発表者名
      杉澤 亜美、上田 汐莉、潮田 亮
    • 学会等名
      第46回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 硫黄修飾が織りなす新たな電子伝達とオルガネラ恒常性維持2023

    • 著者名/発表者名
      潮田 亮、上垣 日育、永田 和宏
    • 学会等名
      第46回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 小胞体レドックス環境を構築するグルタチオン輸送機構の解明2023

    • 著者名/発表者名
      堤 智香、永田 和宏、潮田 亮
    • 学会等名
      第46回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] レドックス制御に基づく小胞体恒常性維持機構~還元反応の場としての小胞体~2023

    • 著者名/発表者名
      潮田 亮
    • 学会等名
      第4回皮膚科基礎研究セミナー
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 病原性変異型SERPINB7の細胞外分泌不全が長島型掌蹠角化症を引き起こす2023

    • 著者名/発表者名
      杉山 誉人、佐々木 克仁、信田 理沙、梅澤 啓太郎、三浦 ゆり、潮田 亮、乃村 俊史
    • 学会等名
      第96回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] レドックス制御を介した小胞体ストレスセンサー活性化機構の解明2023

    • 著者名/発表者名
      和田 匠太、永田 和宏、潮田 亮
    • 学会等名
      第96回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 小胞体プロテオスタシスを支える環境基盤2023

    • 著者名/発表者名
      潮田 亮
    • 学会等名
      第96回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] YAP/TEADを介した負荷依存的なコラーゲン特異的分子シャペロンHsp47の発現調節機構の解明2023

    • 著者名/発表者名
      葛西 綾乃、伊藤 進也、潮田 亮、永田 和宏
    • 学会等名
      第96回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 小胞体レドックス環境を構築するグルタチオン輸送機構の解明2023

    • 著者名/発表者名
      堤 智香、永田 和宏、潮田 亮
    • 学会等名
      第16回小胞体ストレス研究会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 坂本 龍太、堤 智香、田原 諒佑、永田 和宏、潮田 亮2023

    • 著者名/発表者名
      酸化的フォールディング環境を創る
    • 学会等名
      細胞を創る会Ver16
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Reconstitution of ER glutathione transport system2023

    • 著者名/発表者名
      坂本 龍太、堤 智香、田原 諒佑、永田 和宏、潮田 亮
    • 学会等名
      第3回学術変革領域(A)「硫黄生物学」領域班会議
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Novel platform of Protein Quality Control formed by liquid-liquid phase separation in the ER2023

    • 著者名/発表者名
      杉澤 亜美、上田 汐莉、潮田 亮
    • 学会等名
      第3回学術変革領域(A)「硫黄生物学」領域班会議
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Super-sulfur as electron media for Protein Quality Control2023

    • 著者名/発表者名
      潮田 亮
    • 学会等名
      第3回学術変革領域(A)「硫黄生物学」領域班会議
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] レドックス制御に基づく小胞体恒常性維持機構~還元反応の場としての小胞体~2023

    • 著者名/発表者名
      潮田 亮
    • 学会等名
      Diabetes Forum 2023
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] レドックス制御を介した小胞体恒常性維持機構~そしてその破綻~2023

    • 著者名/発表者名
      潮田 亮
    • 学会等名
      金沢大学医学部 大学院セミナー
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] YAP/TEAD を介した負荷依存的なコラーゲン特異的分子シャペ ロン Hsp47 の発現調節機構の解明2023

    • 著者名/発表者名
      葛西 綾乃、伊藤 進也、潮田 亮、永田 和宏
    • 学会等名
      第 30 回次世代医工学研究会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 小胞体というオルガネラ環境は、どのように維持されるのか2023

    • 著者名/発表者名
      潮田 亮
    • 学会等名
      第 30 回次世代医工学研究会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] YAP/TEADを介した負荷依存的なコラーゲン特異的分子シャペロンHsp47の発現調節機構の解明2023

    • 著者名/発表者名
      葛西 綾乃、伊藤 進也、潮田 亮、永田 和宏
    • 学会等名
      第75回 日本細胞生物学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] カルシウムイオンチャネルIP3Rは小胞体レドックスによって自律的に制御される2023

    • 著者名/発表者名
      藤井 唱平、潮田 亮、永田 和宏
    • 学会等名
      第75回 日本細胞生物学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] A new platform formed by JDP-Hsp70 for protein quality control in the ER2023

    • 著者名/発表者名
      Ryo Ushioda
    • 学会等名
      J-domain proteins from molecular mechanisms to diseases International Workshop (CSSI)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] レドックス制御に基づく小胞体ホメオスタシスの理解2023

    • 著者名/発表者名
      潮田 亮
    • 学会等名
      第2回日本医学会連合Rising Starリトリート
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] レドックス制御を介した小胞体ストレスセンサー制御機構の解明2022

    • 著者名/発表者名
      和田 匠太、永田 和宏、潮田 亮
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 小胞体レドックス環境を構築するグルタチオン輸送機構の解明2022

    • 著者名/発表者名
      堤 智香、田原 諒佑、坂本 龍太、渡邊 弘樹、永田 和宏、潮田 亮
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 液-液相分離によって形成される新たなタンパク質品質管理プラットフォーム2022

    • 著者名/発表者名
      杉澤 亜美、潮田 亮
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 小胞体における新たなタンパク質品質管理プラットフォームの形成2022

    • 著者名/発表者名
      潮田 亮
    • 学会等名
      第95回日本生化学会大会 シンポジウム
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 液-液相分離によって形成される新たなタンパク質品質管理プラットフォーム2022

    • 著者名/発表者名
      杉澤 亜美、潮田 亮
    • 学会等名
      第95回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] ER Redox shift through the ribosome translation2022

    • 著者名/発表者名
      Ryo Ushioda
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 小胞体に形成される局所的な還元環境の同定2022

    • 著者名/発表者名
      渡邊 弘樹、堤 智香、永田 和宏、潮田 亮
    • 学会等名
      学術変革領域(A)「硫黄生物学」第2回領域班会議
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] レドックス制御を介した小胞体ストレスセンサーの新たな活性化機構2022

    • 著者名/発表者名
      和田 匠太、永田 和宏、潮田 亮
    • 学会等名
      学術変革領域(A)「硫黄生物学」第2回領域班会議
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] タンパク質品質管理を支える電子移動媒体としての超硫黄分子の役割2022

    • 著者名/発表者名
      潮田 亮
    • 学会等名
      学術変革領域(A)「硫黄生物学」第2回領域会議
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 近接依存性標識を用いた小胞体タンパク質品質管理機構の評価2022

    • 著者名/発表者名
      杉澤 亜美、岸本 哲拡、潮田 亮
    • 学会等名
      第15回小胞体ストレス研究会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] レドックス制御を介した小胞体ストレスセンサーATF6 制御機構の解明2022

    • 著者名/発表者名
      和田 匠太、永田 和宏、潮田 亮
    • 学会等名
      第15回小胞体ストレス研究会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 小胞体の機能を支えるオルガネラ環境の探求2022

    • 著者名/発表者名
      藤井 唱平、潮田 亮
    • 学会等名
      第15回小胞体ストレス研究会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] レドックス制御を介した小胞体恒常性維持機構2022

    • 著者名/発表者名
      潮田 亮
    • 学会等名
      第15回小胞体ストレス研究会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] コラーゲン特異的分子シャペロン Hsp47 の負荷に応答した転写調節機構 の解明2022

    • 著者名/発表者名
      葛西 綾乃, 潮田 亮
    • 学会等名
      第15回小胞体ストレス研究会 若手の会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] レドックス制御を介した小胞体ストレスセンサーATF6 制御機構の解明2022

    • 著者名/発表者名
      和田 匠太、永田 和宏、潮田 亮
    • 学会等名
      第15回小胞体ストレス研究会 若手の会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 近接依存性標識を用いた小胞体タンパク質品質管理機構の評価2022

    • 著者名/発表者名
      杉澤 亜美、岸本 哲拡、潮田 亮
    • 学会等名
      第74回日本細胞生物学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] レドックス制御を介した小胞体タンパク質品質管理2022

    • 著者名/発表者名
      潮田 亮
    • 学会等名
      第3回 日本結合組織学会若手セミナー
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Maintenance of Endoplasmic Reticulum Homeostasis through Redox Regulation2022

    • 著者名/発表者名
      Ryo Ushioda
    • 学会等名
      Cellular and Protein Homeostasis webinar
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 酸化反応の場としての小胞体から、還元反応の場としての小胞体へ2022

    • 著者名/発表者名
      潮田 亮
    • 学会等名
      微研セミナー
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 近接依存性標識を用いた小胞体タンパク質品質管理機構の評価2022

    • 著者名/発表者名
      杉澤 亜美、岸本 哲拡、潮田 亮
    • 学会等名
      第68回日本生化学会近畿支部例会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] レドックス制御を介した小胞体ストレスセンサーATF6 制御機構の解明2022

    • 著者名/発表者名
      和田 匠太、永田 和宏、潮田 亮
    • 学会等名
      第68回日本生化学会近畿支部例会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [図書] 総合学術研究所所報第17号2023

    • 著者名/発表者名
      潮田 亮
    • 総ページ数
      161
    • 出版者
      京都産業大学総合学術研究所
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [図書] 実験医学増刊 Vol.40 No.122022

    • 著者名/発表者名
      上垣 日育、永田 和宏、潮田 亮
    • 総ページ数
      264
    • 出版者
      羊土社
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [備考] 潮田研ホームページ

    • URL

      https://ushioda-lab.com/

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書

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公開日: 2022-04-19   更新日: 2024-12-25  

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