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活性酸素種による緑藻の光走性調節分子機構とその生理的意義の解明

研究課題

研究課題/領域番号 23K23905
補助金の研究課題番号 22H02642 (2022-2023)
研究種目

基盤研究(B)

配分区分基金 (2024)
補助金 (2022-2023)
応募区分一般
審査区分 小区分44030:植物分子および生理科学関連
研究機関京都産業大学

研究代表者

若林 憲一  京都産業大学, 生命科学部, 教授 (80420248)

研究分担者 田中 寛  東京工業大学, 科学技術創成研究院, 教授 (60222113)
研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2024年度)
配分額 *注記
16,250千円 (直接経費: 12,500千円、間接経費: 3,750千円)
2024年度: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2023年度: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2022年度: 8,190千円 (直接経費: 6,300千円、間接経費: 1,890千円)
キーワード走光性 / 光合成 / 活性酸素種 / 藻類 / クラミドモナス / ROS / 緑藻 / 繊毛 / 光走性 / 光受容
研究開始時の研究の概要

多くの運動性の光合成微生物は光走性(光源方向へ(正)、あるいはその逆方向(負)へ移動する性質)を示す。光合成生物にとって光は重要なエネルギー源だが、強すぎる光は活性酸素種(Reactive oxygen species, ROS)の産生をはじめとする光障害を引き起こす毒でもある。本研究は、モデル緑藻クラミドモナスが正の光走性を示すのが細胞内ROS量が多いときであるという意外な発見を端緒に、その制御分子機構と生理的意義を明らかにすることを目的としている。

研究実績の概要

我々は緑藻クラミドモナスの光走性の正負が細胞質の活性酸素種(ROS)量に応じて調節されることを明らかにした。これを可能にする分子機構は何か?そして、この制御機構には光合成生物にとってどのような生理的意義があるのか?これらの問題を、解明することが本研究の目的である。本年度は以下の3つの実験を柱に研究を遂行した。
①2022年度に同定した、負の光走性を強く示す変異株の原因遺伝子はある種のキナーゼであるとわかった。そのターゲットの第一候補である光受容体のリン酸化状態を検証した。Phos-tagによるクラミドモナス全細胞タンパク質サンプルのリン酸化状態検証実験の条件検討を重ねた結果、この光受容体はターゲットではないことがわかった。今後リン酸化プロテオームなどを視野に入れたターゲット検証を行う。
②ROSシグナルの可視化を試みたが、いくつかのセンサータンパク質がどれも発現誘導できなかった。先行研究で開発されたものを購入したものだが、発現ベクターのDNA配列には問題がなく、いまのところ原因がはっきりしない。今後導入条件検討を重ねるとともに、別のセンサーを使うことを検討する。
③光走性が生残性に与える影響を、「野生株」「正の光走性しか示せない株」「負の光走性しか示せない株」「非運動性株」を用いて、致死的な強光下に日陰を設置して検証した。その結果、意外なことに株間で生残性の違いに大きな違いは見られなかった。今後光条件を再検討して、光走性の生理的意義を再検証する。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

ROSの可視化実験だけが多少滞っているが、他は当初予定していた実験がほぼ計画通りに、一部は計画より早く進行しており、総じて順調であると言える。

今後の研究の推進方策

ROSシグナルの可視化については、予定していた先行研究で開発されたセンサータンパク質だけでなく、別のセンサーの導入も検討する。そのほかは2023年度に行った実験の延長を行うことで計画が進むと期待できる。

報告書

(2件)
  • 2023 実績報告書
  • 2022 実績報告書
  • 研究成果

    (43件)

すべて 2024 2023 2022

すべて 雑誌論文 (10件) (うち国際共著 1件、 査読あり 10件、 オープンアクセス 8件) 学会発表 (31件) (うち国際学会 6件、 招待講演 1件) 図書 (2件)

  • [雑誌論文] Cells collectively migrate during ammonium chemotaxis in Chlamydomonas reinhardtii2023

    • 著者名/発表者名
      G. Nelson, A. Strain, A. Isu, A. Rahnama, K. Wakabayashi, A. T. Melvin, N. Kato
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 13 号: 1 ページ: 10781-10781

    • DOI

      10.1038/s41598-023-36818-6

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Mechanoresponses mediated by the TRP11 channel in cilia of Chlamydomonas reinhardtii2023

    • 著者名/発表者名
      D. Oshima, M. Yoshida, K. Saga, N. Ito, M. Tsuji, A. Isu, N. Watanabe, K. Wakabayashi, K. Yoshimura
    • 雑誌名

      iScience

      巻: 26 号: 10 ページ: 107926-107926

    • DOI

      10.1016/j.isci.2023.107926

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Molecular bulkiness of a single amino acid in the F1 α subunit determines the robustness of cyanobacterial ATP synthase2023

    • 著者名/発表者名
      A. Machida, K. Kondo, K. Wakabayashi, K. Tanaka, T. Hisabori
    • 雑誌名

      Plant and Cell Physiology

      巻: 64 号: 12 ページ: 1590-1600

    • DOI

      10.1093/pcp/pcad109

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Changes in intracellular energetic and metabolite states due to increased galactolipid levels in Synechococcus elongatus PCC 79422023

    • 著者名/発表者名
      Kondo Kumiko、Yoshimi Rina、Apdila Egi Tritya、Wakabayashi Ken-ichi、Awai Koichiro、Hisabori Toru
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 13 号: 1 ページ: 259-259

    • DOI

      10.1038/s41598-022-26760-4

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Two specific domains of the γ subunit of chloroplast F <sub>o</sub> F <sub>1</sub> provide redox regulation of the ATP synthesis through conformational changes2023

    • 著者名/発表者名
      Akiyama Kentaro、Ozawa Shin-Ichiro、Takahashi Yuichiro、Yoshida Keisuke、Suzuki Toshiharu、Kondo Kumiko、Wakabayashi Ken-ichi、Hisabori Toru
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      巻: 120 号: 6

    • DOI

      10.1073/pnas.2218187120

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The Importance of the C-terminal Cys pair of Phosphoribulokinase in Phototrophs in Thioredoxin-Dependent Regulation2022

    • 著者名/発表者名
      Fukui K, Yoshida K, Yokochi Y, Sekiguchi T, Wakabayashi KI, Hisabori T, Mihara S.
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiol.

      巻: in press 号: 6 ページ: 855-868

    • DOI

      10.1093/pcp/pcac050

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Verification of the Relationship between Redox Regulation of Thioredoxin Target Proteins and Their Proximity to Thylakoid Membranes2022

    • 著者名/発表者名
      Fukushi Y, Yokochi Y, Wakabayashi KI, Yoshida K, Hisabori T.
    • 雑誌名

      Antioxidants

      巻: 11 号: 4 ページ: 773-773

    • DOI

      10.3390/antiox11040773

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Reactivation of Demembranated Cell Models in &lt;em&gt;Chlamydomonas reinhardtii&lt;/em&gt;2022

    • 著者名/発表者名
      Ueki Noriko、Isu Atsuko、Wakabayashi Ken-ichi
    • 雑誌名

      Journal of Visualized Experiments

      巻: 183 号: 183

    • DOI

      10.3791/63869

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Observation of Photobehavior in &lt;em&gt;Chlamydomonas reinhardtii&lt;/em&gt;2022

    • 著者名/発表者名
      Ueki Noriko、Isu Atsuko、Kyuji Ayaka、Asahina Yuma、So Satoaki、Takahashi Rina、Hisabori Toru、Wakabayashi Ken-ichi
    • 雑誌名

      Journal of Visualized Experiments

      巻: 183 号: 183

    • DOI

      10.3791/63961

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Dissipation of the proton electrochemical gradient in chloroplasts promotes the oxidation of ATP synthase by thioredoxin-like proteins2022

    • 著者名/発表者名
      Sekiguchi T., Yoshida K., Wakabayashi K-I., Hisabori T.*
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem.

      巻: 298 号: 11 ページ: 102541-102541

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2022.102541

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] ボルボックス目におけるレイノルズ数の増加に適応した光誘起繊毛反応の進化2024

    • 著者名/発表者名
      植木紀子、若林憲一
    • 学会等名
      生体運動研究合同班会議
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実績報告書
  • [学会発表] クラミドモナス走光性符号異常株から繊毛運動調節機構を紐解く2024

    • 著者名/発表者名
      坂本一馬、森下純、猪川玲夫、上野恵資、苗加彰、植木紀子、若林憲一
    • 学会等名
      生体運動研究合同班会議
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実績報告書
  • [学会発表] Isolation and analysis of non-phptotactic mutants that show alternate ciliary beatings in Chlamydomonas reinhardtii2023

    • 著者名/発表者名
      Kazuma Sakamoto, Akira Noga, Keisuke Ueno, Toru Hisabori, Ken-ichi Wakabayashi
    • 学会等名
      The 20th International Conference on the Cell and Molecular Biology of Chlamydomonas
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Relationship between photoreaction patterns of cilia and size evolution in Vovocales2023

    • 著者名/発表者名
      Noriko Ueki, Ken-ichi Wakabayashi
    • 学会等名
      The 20th International Conference on the Cell and Molecular Biology of Chlamydomonas
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Transition of photoresponse styles in cilia as a function of Reynolds number in Volvocales2023

    • 著者名/発表者名
      Noriko Ueki, Ken-ichi Wakabayashi
    • 学会等名
      The 7th International Volvox Comference
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Reynolds-number-dependent ciliary regulation in the swimming green algae Volvocales2023

    • 著者名/発表者名
      Noriko Ueki, Ken-ichi Wakabayashi
    • 学会等名
      第61回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実績報告書
  • [学会発表] PSI 光防御における PGRL1 の機能解析2023

    • 著者名/発表者名
      高橋拓子 、_山健太、井須敦子、若林憲一、久堀徹、西山佳孝
    • 学会等名
      第17回クラミドモナス研究会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] クラミドモナス除膜細胞モデル運動再活性化実験のコツ2023

    • 著者名/発表者名
      若林憲一、植木紀子
    • 学会等名
      第17回クラミドモナス研究会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実績報告書
  • [学会発表] 緑藻クラミドモナスの 2 本の繊毛間における異種ダイニン間相互作用の相違2023

    • 著者名/発表者名
      猪川玲夫、高野和歌子、時田将嵩、若林憲一
    • 学会等名
      第17回クラミドモナス研究会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実績報告書
  • [学会発表] ボルボックス目の多細胞化に伴う流体環境の変化とそれに対する適応2023

    • 著者名/発表者名
      植木紀子、若林憲一
    • 学会等名
      第17回クラミドモナス研究会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実績報告書
  • [学会発表] クラミドモナスの過酸化水素に対する走化性の検証2023

    • 著者名/発表者名
      高野真由、前川優太、植木紀子、若林憲一
    • 学会等名
      第17回クラミドモナス研究会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実績報告書
  • [学会発表] ボルボックスからの繊毛の単離2023

    • 著者名/発表者名
      苗加彰、植木紀子、若林憲一
    • 学会等名
      第17回クラミドモナス研究会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実績報告書
  • [学会発表] 外腕ダイニン Ca2+結合軽鎖 LC4 欠損株の 2 本の繊毛の非同調運動2023

    • 著者名/発表者名
      上野恵資、久次史花、植木紀子、柴小菊、稲葉一男、若林憲一
    • 学会等名
      第17回クラミドモナス研究会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実績報告書
  • [学会発表] 軸糸外腕ダイニンのチオレドキシン様軽鎖の機能2023

    • 著者名/発表者名
      久次史花, 小板橋亮矩, 宋叡陽, 柳沢春明, 山野隆志, 吉川雅英, 福澤秀哉, 久堀徹, 若林憲一
    • 学会等名
      生体運動研究合同班会議
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] TRPチャネルの機械受容による繊毛運動の制御2023

    • 著者名/発表者名
      嵯峨康佑, 大島大地, 吉田愛美, 井須敦子, 若林憲一, 吉村建二郎
    • 学会等名
      生体運動研究合同班会議
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 緑藻クラミドモナスにおける_光性符号変動と_化性2023

    • 著者名/発表者名
      前川優太、朝比奈佑磨、高野真由、久堀徹、若林憲一
    • 学会等名
      第16回クラミドモナス研究会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 軸糸外腕ダイニンのチオレドキシン様軽鎖の機能2023

    • 著者名/発表者名
      久次史花, 小板橋亮矩, 宋叡陽, 柳沢春明, 山野隆志, 吉川雅英, 福澤秀哉, 久堀徹, 若林憲一
    • 学会等名
      第16回クラミドモナス研究会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] カルシウム依存性カリウムチャネル KCA1 による脱繊_の抑制2023

    • 著者名/発表者名
      高橋里奈、朝比奈佑磨、宇佐美曉俊、内山志織 、箕浦高子 、吉村建二郎、久堀徹 、若林憲一
    • 学会等名
      第16回クラミドモナス研究会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] クラミドモナスのグライディング開始に必要な TRP チャネル2023

    • 著者名/発表者名
      伊藤音緒, 井須敦子, 若林憲一, 吉村建二郎
    • 学会等名
      第16回クラミドモナス研究会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Involvement of Chloroplast-localized Trx-like proteins in the Regulation of Non-Photochemical Quenching inArabidopsis thaliana2023

    • 著者名/発表者名
      Yuka Fukushi, Yuichi Yokochi, Ken-ichi Wakabayashi, Keisuke Yoshida, Toru Hisabori
    • 学会等名
      第64回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] PSI 光防御における PGRL1 の機能解析2023

    • 著者名/発表者名
      高橋拓子 、高山健太、井須敦子、若林憲一、久堀徹、西山佳孝
    • 学会等名
      第17回クラミドモナス研究会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Photobehavior in the Volvocales green algae with different cell numbers: Chlamydomonas, Tetrabaena, and Volvox2022

    • 著者名/発表者名
      Ken-ichi Wakabayashi
    • 学会等名
      One-day workshop on the cellular level ethological dynamics towards “proto-intelligence”
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] The four-celled Volvocales green alga_Tetrabaena socialis_exhibits weak photobehavior and high-photoprotection ability2022

    • 著者名/発表者名
      Asuka Tanno, Yoko Arakaki, Noriko Ueki, Ryutaro Tokutsu, Jun Minagawa, Kenjiro Yoshimura, Toru Hisabori, Hisayoshi Nozaki and Ken-ichi Wakabayashi
    • 学会等名
      International Symposium on Photosynthesis and Chloroplast Regulation
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Oxidative regulation of chloroplast ATP synthase by thioredoxin-like proteins2022

    • 著者名/発表者名
      Takatoshi Sekiguchi, Keisuke Yoshida, Ken-ichi Wakabayashi, Toru Hisabori
    • 学会等名
      International Symposium on Photosynthesis and Chloroplast Regulation
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] TrxおよびTrx様タンパク質による葉緑体タンパク質の酸化制御2022

    • 著者名/発表者名
      福士結香, 横地佑一, 吉田啓亮, 若林憲一, 久堀徹
    • 学会等名
      第12回日本光合成学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] シアノバクテリアATP合成酵素αサブユニットのY252C変異2022

    • 著者名/発表者名
      町田亮人,近藤久益子,若林憲一,久堀徹
    • 学会等名
      第12回日本光合成学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] シアノバクテリアSynechococcus elongatus PCC 7942のチラコイド膜脂質合成経路の改変による細胞内の変化2022

    • 著者名/発表者名
      近藤久益子,吉見里奈, Egi Tritya Apdila, 若林憲一,粟井光一郎, 久堀徹
    • 学会等名
      第12回日本光合成学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] クラミドモナス繊毛交互打ち変異株の単離と解析2022

    • 著者名/発表者名
      坂本一馬, 井須敦子, 久堀徹, 若林憲一
    • 学会等名
      日本動物学会第93回大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Analysis of a Chlamydomonas mutant showing alternate ciliary beatings2022

    • 著者名/発表者名
      坂本一馬, 井須敦子, 久堀徹, 若林憲一
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Trx様タンパク質による葉緑体ATP合成酵素の不活性化制御2022

    • 著者名/発表者名
      関口敬俊, 吉田啓亮, 若林憲一, 久堀徹
    • 学会等名
      第95回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 葉緑体ATP合成酵素のレドックス制御機構:γサブユニットのβ-hairpin構造とRedox loop構造の協調と活性調節2022

    • 著者名/発表者名
      秋山健太郎、小澤真一郎、高橋裕一郎、若林憲一、久堀徹
    • 学会等名
      第48回日本生体エネルギー研究会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [図書] 分子細胞生物学 第9版2023

    • 著者名/発表者名
      Lodish,Berk,Kaiser,Krieger,Bretscher, Ploegh, Martin, Yaffe, Amon著,堅田利明,須藤和夫,山本啓一監訳, 岩井佳子,上村慎治,北川大樹,齋藤康太,坪井貴司,富田泰輔,名黒功,仁科博史,宮澤恵二,山本啓一,若林憲一訳
    • 総ページ数
      1112
    • 出版者
      東京化学同人
    • ISBN
      9784807920518
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実績報告書
  • [図書] he Chlamydomonas Sourcebook 3rd ed., Vol. 3, Chap. 162023

    • 著者名/発表者名
      Dieckmann, C., Wakabayashi, K., Hegemann, P., Kreimer, G.
    • 総ページ数
      470
    • 出版者
      Elsevier
    • ISBN
      9780128225080
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書

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公開日: 2022-04-19   更新日: 2024-12-25  

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