研究課題/領域番号 |
23K23970
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研究種目 |
基盤研究(B)
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配分区分 | 基金 |
応募区分 | 一般 |
審査区分 |
小区分45050:自然人類学関連
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研究機関 | 北海道大学 |
研究代表者 |
長田 直樹 北海道大学, 情報科学研究院, 准教授 (70416270)
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研究分担者 |
河合 洋介 国立研究開発法人国立国際医療研究センター, その他部局等, 副プロジェクト長 (30435515)
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研究期間 (年度) |
2024-04-01 – 2026-03-31
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研究課題ステータス |
交付 (2024年度)
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配分額 *注記 |
9,100千円 (直接経費: 7,000千円、間接経費: 2,100千円)
2025年度: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2024年度: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
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キーワード | ゲノム / 進化 / ヒトゲノム / 内在性レトロウイルス |
研究開始時の研究の概要 |
ヒトゲノムの多くはウイルス様配列によって占められている.本研究計画では,膨大な量のヒトゲノム短鎖配列から,内在性レトロウイルス(ERV)を含む多様なウイルス様配列を探索し,ウイルスゲノムの挿入からみた人類の多様性を明らかにする.これまで一般的に行われてきた配列相同性だけを用いた探索ではなく,機械学習を用いた新たなウイルス様配列探索手法を開発し利用する.人類の移住の歴史を明らかにする新たなマーカーの発見,特定のウイルスと地域集団とのかかわり,ウイルス様配列の挿入に関わる自然選択の検出などを行い,20万年前以降の人類とウイルスの歴史的なかかわりを明らかにする.
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