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中分子ペプチド系天然物の全合成創薬研究

研究課題

研究課題/領域番号 23K24003
補助金の研究課題番号 22H02740 (2022-2023)
研究種目

基盤研究(B)

配分区分基金 (2024)
補助金 (2022-2023)
応募区分一般
審査区分 小区分47010:薬系化学および創薬科学関連
研究機関東北大学

研究代表者

土井 隆行  東北大学, 薬学研究科, 教授 (90212076)

研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2024年度)
配分額 *注記
17,290千円 (直接経費: 13,300千円、間接経費: 3,990千円)
2024年度: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2023年度: 5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円)
2022年度: 7,410千円 (直接経費: 5,700千円、間接経費: 1,710千円)
キーワードペプチド / 中分子 / 天然物合成 / 環状デプシペプチド / 全合成 / 細胞毒性 / 環状デプチペプチド
研究開始時の研究の概要

中分子ペプチド系天然化合物は、なぜ細胞内の標的分子に作用できるのか。天然型のアミノ酸からなるペプチド化合物は、大きな極性表面積をもち、またペプチダーゼにより容易に分解される。一方、非天然型の構成成分を有するペプチド系天然物は、高い細胞膜透過性をもち、加水分解を受けにくいため細胞内の標的に作用し、強力な生物活性を示す。高活性を示すためには、非天然型構成成分のどのような特性が重要なのか、合成化学―三次元構造解析―物性―生物活性の関係について、多面的な視点を有機的に結びつけることにより明らかにし、新たな創薬モダリティとして期待される中分子ペプチド系医薬品開発に不可欠な情報を入手する。

研究実績の概要

細胞内で膜貫通型タンパク質を形成するトランスロコンチャネルに結合して阻害する環状デプシペプチド天然物デカトランシンの全合成を行なった。生合成遺伝子クラスターの情報からすべてのアミノ酸はL-体と予想し、ヒドロキシカルボン酸部位はD-, およびL-体の両方を用いて全合成を計画した。まず、特殊なアミノ酸であるN-メチルホモロイシン、ピペコリン酸、N-メチルトレオニンなどのN-アルキルアミノ酸が4つ連続するペンタペプチドの構築を検討した。3+2および2+3でペンタペプチドの合成を試みたが、いずれも縮合条件においてもエピメリ化が観測された。さらにカルボキシ末端をt-Buエステルとしていると、酸による脱保護条件でN-メチルアミド結合が加水分解されることがわかった。そこで、カルボキシ末端を2-トリメチルシリルエチルエステルとして縮合の検討を行なった。この際は、ジペプチドのアミノ末端を遊離させると分子内でラクタム化してジケトピペラジン形成が起こることがわかった。条件検討の結果、アミノ末端を塩酸塩としておき、縮合条件において塩基をゆっくり滴下することで、ジケトピペラジンの形成を回避できることを見出した。マクロラクトン構築においては、椎名法、山口法はうまく進行しなかったが、光延反応による環化に成功した。生成物の両ジアステレオマーについてNMRスペクトルの比較、細胞毒性試験(HCT-116細胞)を行った結果、(1αR)-体が天然物とよく一致したことからデカトランシンの全合成に成功し、その立体配置を決定した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

デカトランシンの全合成を達成し、その立体配置を絶対立体配置とともに決定することができたから。

今後の研究の推進方策

共同研究者と共に、合成した化合物を用いてトランスロコンチャネルSec61阻害の詳細な作用機序を明らかにして、他のSec61阻害薬との違いを検討し、抗がん薬としての適正を調査する。デカトランシンとSec61複合体の構造がクライオ電顕により明らかにされたことから、その三次元構造を基に高活性な化合物の設計・合成を進める。

報告書

(1件)
  • 2022 実績報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2023 2022 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち国際共著 1件、 査読あり 4件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (6件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] The Concise Synthesis of a <i>tert</i>-Butoxycarbonyl Derivative of (3<i>R</i>,4<i>S</i>)-4-Amino-3-hydroxy-7-(<i>N</i>-nitrosohydroxyamino)-2,2-dimethylheptanoate, a Component of JBIR-1412022

    • 著者名/発表者名
      Yasoshima Kotaro、Yoshida Masahito、Doi Takayuki
    • 雑誌名

      Bulletin of the Chemical Society of Japan

      巻: 95 号: 5 ページ: 830-832

    • DOI

      10.1246/bcsj.20220035

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Synthetic studies for destruxins and biological evaluation for osteoclast-like multinucleated cells: a review2022

    • 著者名/発表者名
      Yoshida Masahito、Nakagawa Hiroshi、Doi Takayuki
    • 雑誌名

      The Journal of Antibiotics

      巻: 75 号: 8 ページ: 420-431

    • DOI

      10.1038/s41429-022-00540-8

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Total Synthesis and Structural Determination of Cyclodepsipeptide Decatransin2022

    • 著者名/発表者名
      Ohsawa Kosuke、Fukaya Sakiko、Doi Takayuki
    • 雑誌名

      Organic Letters

      巻: 24 号: 30 ページ: 5552-5556

    • DOI

      10.1021/acs.orglett.2c02085

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Photocatalyzed Oxidative Decarboxylation Forming Aminovinylcysteine Containing Peptides2022

    • 著者名/発表者名
      Kumashiro Masaya、Ohsawa Kosuke、Doi Takayuki
    • 雑誌名

      Catalysts

      巻: 12 号: 12 ページ: 1615-1615

    • DOI

      10.3390/catal12121615

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] 分枝ペプチド抗生物質Stalobacin Iに含まれるシクロプロパン含有α-ヒドロキシカルボン酸の立体選択的合成2023

    • 著者名/発表者名
      大澤 宏祐、稲垣 達也、土井 隆行
    • 学会等名
      日本薬学会第143年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] オキサゾリン・N-ニトロソヒドロキシルアミン・3-アシルテトラミン酸を含有するJBIR-141の全合成研究2022

    • 著者名/発表者名
      八十島浩太郎、吉田将人、河原哲平、橋本拓哉、新家一男、土井隆行
    • 学会等名
      第64回天然有機化合物討論会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Total synthesis and structural determination of cyclodepsipeptide decatransin2022

    • 著者名/発表者名
      Kosuke Ohsawa, Sakiko Fukaya, Takayuki Doi
    • 学会等名
      The 59th Japanese Peptide Symposium
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] フォトレドックス反応を用いた新規AviMeCys構築法の開発2022

    • 著者名/発表者名
      神代格也、大澤宏祐、土井隆行
    • 学会等名
      第121回有機合成シンポジウム
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] シデロフォア構造をもつ環状ペプチド ASP2397 の全合成研究2022

    • 著者名/発表者名
      大澤宏祐, 杜雨桐, 八十島浩太郎, 土井隆行
    • 学会等名
      第39回メディシナルケミストリーシンポジウム
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 三次元構造に基づいたα-ヘリックス Apratoxin A ミメティクスの創製研究2022

    • 著者名/発表者名
      大澤 宏祐, 菅原勇真, 福士和希, 道上雅孝, 藤井郁雄, 広川貴次, 土井隆行
    • 学会等名
      第61回日本薬学会東北支部大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [備考] 東北大学薬学部・ 大学院薬学研究科 反応制御化学分野論文リスト

    • URL

      http://www.pharm.tohoku.ac.jp/~hannou/ja/publication.html

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [備考] 東北大学薬学部・ 大学院薬学研究科 反応制御化学分野学会発表リスト

    • URL

      http://www.pharm.tohoku.ac.jp/~hannou/ja/presentation.html

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書

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公開日: 2022-04-19   更新日: 2024-12-25  

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