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全ゲノム解析基盤による機能・情報統合解析と新規心筋症遺伝子の同定および機序解明

研究課題

研究課題/領域番号 23K24328
補助金の研究課題番号 22H03067 (2022-2023)
研究種目

基盤研究(B)

配分区分基金 (2024)
補助金 (2022-2023)
応募区分一般
審査区分 小区分53020:循環器内科学関連
研究機関大阪大学

研究代表者

朝野 仁裕  大阪大学, 大学院医学系研究科, 特任准教授(常勤) (60527670)

研究分担者 四宮 春輝  大阪大学, キャンパスライフ健康支援・相談センター, 助教 (10908213)
藏本 勇希  大阪大学, 大学院医学系研究科, 特任助教(常勤) (50843794)
宮下 洋平  大阪大学, 大学院医学系研究科, 特任講師(常勤) (60816312)
高島 成二  大阪大学, 大学院生命機能研究科, 教授 (90379272)
研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2024年度)
配分額 *注記
17,420千円 (直接経費: 13,400千円、間接経費: 4,020千円)
2024年度: 5,460千円 (直接経費: 4,200千円、間接経費: 1,260千円)
2023年度: 5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円)
2022年度: 6,630千円 (直接経費: 5,100千円、間接経費: 1,530千円)
キーワード心筋症 / 全ゲノム解析 / 病原性バリアント / リスク因子 / 病態機序
研究開始時の研究の概要

継続課題のため、記入しない。

研究実績の概要

心筋症の原因遺伝子バリアントを同定するため下記の通り探索を行った。
1.該当する候補遺伝子の抽出(データベース更新後、追加2回、通算4回)
2.候補遺伝子内のレアバリアントの検出と病原性と重篤度に対する評価
3.検出したレアバリアントの心筋症発症に至る病原性と重篤度の各検証と解析 全エクソーム・全ゲノム解析による家系・集団解析
Effect Sizeが大きなバリアントを中心に病原性を有する候補バリアントを抽出した。バリアントポジション固有の病原性スコア・頻度情報を元に、コントロールに比し心筋症群で有意差を持つEffect Sizeの大きなバリアントを絞り込んだ。候補遺伝子リストのパネルを作成し、当該遺伝子上に検出される病原性候補バリアントをリスト化した。さらに、バリアントの病原性予測基準を利用し、集団内での検出頻度が有意であり、家系内共分離が確認でき、生物学的意義の証明がなされているものを優先して抽出した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

新型コロナウイルスの感染症拡大による影響に伴い、心筋症の患者の同意取得、検体採取症例回収がやや遅れたが、その後の解析により新規原因遺伝子を含む複数の心筋症原因候補バリアントのリスト化に成功しており、研究全体としては順調に進展している。

今後の研究の推進方策

今後疾患集団に重症度情報を加えたデータベースと突合し、病原性有無を判断する情報解析キュレーションを行い、病原性・重篤度があると示唆される遺伝子バリアントを同定する。最終的に同定した遺伝子バリアントの分子生物学的機能解析を実施し、疾患を引き起こす分子病態機序を明らかにする。

報告書

(1件)
  • 2022 実績報告書
  • 研究成果

    (13件)

すべて 2022

すべて 雑誌論文 (9件) (うち国際共著 1件、 査読あり 9件、 オープンアクセス 5件) 学会発表 (4件)

  • [雑誌論文] A Mild Clinical Phenotype with Myopathic and Hemolytic Forms of Phosphoglycerate Kinase Deficiency (PGK Osaka): A Case Report and Literature Review2022

    • 著者名/発表者名
      Baba K, Fukuda T, Furuta M, Tada S, Imai A, Asano Y, Sugie H, P Takahashi M, Mochizuki H
    • 雑誌名

      Internal Medicine

      巻: 61 号: 23 ページ: 3589-3594

    • DOI

      10.2169/internalmedicine.9221-21

    • ISSN
      0918-2918, 1349-7235
    • 年月日
      2022-12-01
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Refractory Ventricular Arrhythmias in a Patient With Dilated Cardiomyopathy Caused by a Nonsense Mutation in <i>BAG5</i>2022

    • 著者名/発表者名
      Hakui Hideyuki、Kioka Hidetaka、Sera Fusako、Nakamoto Kei、Ozu Kentaro、Kuramoto Yuki、Miyashita Yohei、Ohtani Tomohito、Hikoso Shungo、Asano Yoshihiro、Sakata Yasushi
    • 雑誌名

      Circulation Journal

      巻: 86 号: 12 ページ: 2043

    • DOI

      10.1253/circj.CJ-22-0329

    • ISSN
      1346-9843, 1347-4820
    • 年月日
      2022-11-25
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Phospholamban p.Arg14del Cardiomyopathy: A Japanese Case Series2022

    • 著者名/発表者名
      Tabata Tomoka、Kuramoto Yuki、Ohtani Tomohito、Miyawaki Hiroshi、Miyashita Yohei、Sera Fusako、Kioka Hidetaka、Higo Shuichiro、Asano Yoshihiro、Hikoso Shungo、Sakata Yasushi
    • 雑誌名

      Internal Medicine

      巻: 61 号: 13 ページ: 1987-1993

    • DOI

      10.2169/internalmedicine.8594-21

    • NAID

      130008130223

    • ISSN
      0918-2918, 1349-7235
    • 年月日
      2022-07-01
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Compound heterozygous variants of the NARS2 gene in siblings with developmental delay, epilepsy, and neonatal diabetes syndrome2022

    • 著者名/発表者名
      Yagasaki Hideaki、Sano Fumikazu、Narusawa Hiromune、Watanabe Daisuke、Kaga Yoshimi、Kobayashi Koji、Asano Yoshihiro、Nagata Miho、Yonei Ayumi、Inukai Takeshi
    • 雑誌名

      American Journal of Medical Genetics Part A

      巻: 188 号: 8 ページ: 2466-2471

    • DOI

      10.1002/ajmg.a.62873

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Whole-exome Sequencing Analysis of a Japanese Patient With Hyperinsulinemia and Liver Dysfunction2022

    • 著者名/発表者名
      Fujita Shingo、Horitani Emi、Miyashita Yohei、Fujita Yukari、Fukui Kenji、Kamada Yoshihiro、Mineo Ikuo、Asano Yoshihiro、Iwahashi Hiromi、Kozawa Junji、Shimomura Iichiro
    • 雑誌名

      Journal of the Endocrine Society

      巻: 6 号: 3

    • DOI

      10.1210/jendso/bvac008

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Genetic assessment using whole-exome sequencing for a young hypertriglyceridemic patient with repeated acute pancreatitis2022

    • 著者名/発表者名
      Fujita Shingo、Nishizawa Hitoshi、Miyashita Yohei、Imada Tasuku、Yamaguchi Takashi、Murano Takeyoshi、Bujo Hideaki、Asano Yoshihiro、Kozawa Junji、Maeda Norikazu、Shimomura Iichiro
    • 雑誌名

      Endocrine Journal

      巻: 69 号: 9 ページ: 1101-1108

    • DOI

      10.1507/endocrj.EJ22-0024

    • ISSN
      0918-8959, 1348-4540
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A novel nonsense variant in ARID1B causing simultaneous RNA decay and exon skipping is associated with Coffin-Siris syndrome2022

    • 著者名/発表者名
      Sofronova Viktoriia、Fukushima Yu、Masuno Mitsuo、Naka Mami、Nagata Miho、Ishihara Yasuki、Miyashita Yohei、Asano Yoshihiro、Moriwaki Takahito、Iwata Rina、Terawaki Seigo、Yamanouchi Yasuko、Otomo Takanobu
    • 雑誌名

      Human Genome Variation

      巻: 9 号: 1 ページ: 1-6

    • DOI

      10.1038/s41439-022-00203-y

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Novel BCL11B truncation variant in a patient with developmental delay, distinctive features, epilepsy, and early craniosynostosis2022

    • 著者名/発表者名
      Eto K, Machida O, Yanagishita T, Yamamoto Shimojima K, Chiba K, Aihara Y, Nagata M, Isihara Y, Miyashita Y, Asano Y, Nagata S, Toshiyuki Yamamoto T
    • 雑誌名

      Human Genome Variation

      巻: 9 号: 1 ページ: 43-43

    • DOI

      10.1038/s41439-022-00220-x

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy complicating hypertrophic cardiomyopathy2022

    • 著者名/発表者名
      Kagawa Y, Okamoto R, Asano Y, Sakata Y, Dohi K
    • 雑誌名

      Eur Heart J Cardiovasc Imaging

      巻: 23 号: 5 ページ: 635-642

    • DOI

      10.1093/ehjci/jeac136

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 心筋症のゲノム解析 ~診療につなげる実践的解析に必要なもの~2022

    • 著者名/発表者名
      朝野仁裕
    • 学会等名
      第8回日本心筋症研究会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 心筋症の遺伝子診断の標準化とAAVベクターによる遺伝子治療戦略2022

    • 著者名/発表者名
      朝野仁裕
    • 学会等名
      第70回日本心臓病学会学術集会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 心臓疾患に対するAAVベクターを用いた遺伝子治療開発2022

    • 著者名/発表者名
      朝野仁裕
    • 学会等名
      ACTjapanフォーラム
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 第26回日本心不全学会2022

    • 著者名/発表者名
      朝野仁裕
    • 学会等名
      ゲノム情報を活かした心筋症医療
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書

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公開日: 2022-04-19   更新日: 2024-12-25  

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