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運動器疾患のMulti disease GWAS 解析

研究課題

研究課題/領域番号 23K24466
補助金の研究課題番号 22H03207 (2022-2023)
研究種目

基盤研究(B)

配分区分基金 (2024)
補助金 (2022-2023)
応募区分一般
審査区分 小区分56020:整形外科学関連
研究機関国立研究開発法人理化学研究所

研究代表者

池川 志郎  国立研究開発法人理化学研究所, 生命医科学研究センター, 客員主管研究員 (30272496)

研究分担者 寺尾 知可史  国立研究開発法人理化学研究所, 生命医科学研究センター, チームリーダー (60610459)
郭 竜  国立研究開発法人理化学研究所, 生命医科学研究センター, 副チームリーダー (50784055)
王 錚  国立研究開発法人理化学研究所, 生命医科学研究センター, 研究員 (90794313)
研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2024年度)
配分額 *注記
17,550千円 (直接経費: 13,500千円、間接経費: 4,050千円)
2024年度: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円)
2023年度: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円)
2022年度: 7,410千円 (直接経費: 5,700千円、間接経費: 1,710千円)
キーワードGWAS / 運動器 / 骨関節 / ゲノム / 遺伝的相関 / 運動器疾患 / 骨関節疾患 / ゲノム解析 / 後縦靱帯骨化症 / 遺伝相関 / 思春期特発性側湾症 / 遺伝的関連 / コホート
研究開始時の研究の概要

運動器疾患の原因、病態には、疾患間で共通のものと、疾患固有のものが存在する。様々な運動器疾患のGWAS を統合したGWAS、運動器multi-disease GWAS (MD-GWAS)を行ない、運動器疾患の遺伝性、分子病態を包括的に解明することで、効率的にその病因・病態に迫る。これまでのゲノム研究では捉えることの難しかった、運動器疾患に共通する、もしくはその特定の組み合わせ(亜群)に固有の疾患感受性遺伝子、分子病態を明らかにする。それをもとに、新たな運動器疾患の病因、病態の理解、疾患観の形成を図り、運動器の多因子遺伝性疾患の革新的な治療法の開発に向けての突破口を探る。

研究実績の概要

様々な運動器疾患 ・運動器関連病態(胸椎後縦靱帯骨化症 (OPLL: ossification of the posterior longitudinal ligament of the spine)、サルコペニア、変性性脊椎側弯症、SLE (systemic lupus erythematosus)関連大腿骨頭壊死、特発性大腿骨頭壊死症、股関節脱臼/臼蓋形成不全、強直性脊椎炎 、下肢伸展筋力など)の臨床データ、ゲノムデータを収集し、全ゲノム相関解析/GWAS (Genome-Wide Association Study)を行なった。
これらのGWASにより得られた候補疾患関連遺伝子を、 in silico、in vitroのゲノム機能解析を併用したアプローチなどにより評価した結果、OPLLで、新たな疾患感受性遺伝子 CCDC91 (coiled-coil domain 91)を同定した。CCDC91の骨関節組織に特異的に発現する mRNA isoformが、骨形成のマスター転写遺伝子であるRUNX2 (Runt-related transcription factor 2)の制御を通じて、OPLLにおける異所性骨化の進行に関与することを発見した(Nakajima M, Terao C, Ikegawa S, et al. Am J Hum Genet 2023)。
更に、上記の 各種運動器疾患のGWASのデータについて、LD (linkage disequilibrium) score regression法を始めとする遺伝相関(genetic correlation)など各種の遺伝統計学的解析を行い、運動器疾患間、運動器疾患と他の 疾患・形質との原因(遺伝性)の共通性を評価した。その結果、OPLLと2型糖尿病、胸椎OPLLとbody mass indexの間の正の遺伝的相関、および思春期特発性側湾症とbody mass indexの間の負の遺伝的相関を発見した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

これまでに得られた研究成果をまとめて、計9報の英文原著論文(全て査読つき。American Journal of Human Genetics誌、Journal of Clinical Investigation誌など impact factorが10以上の雑誌を3報含む)として既に発表している。

今後の研究の推進方策

国際共同研究により、運動器疾患GWASのデータの増加を図ると共に、これまでの研究で既に確保している、思春期特発性側弯症、変形性関節症、脊椎椎間板変性症など7つの運動器疾患、計3万人の臨床情報、疾患関連情報、GWAS データと、GWAS解析を進行中の運動器疾患 ・運動器関連病態(胸椎OPLL、サルコペニア、変性性脊椎側弯症、SLE関連大腿骨頭壊死、特発性大腿骨頭壊死症、股関節脱臼/臼蓋形成不全、強直性脊椎炎 、下肢筋力など)のデータと統合し、Multi-disease GWASを行う。 得られたデータについて、LD score regression法による遺伝相関などにより、運動器疾患間、ならびに運動器疾患と他の 疾患・形質との原因(遺伝性)の共通性を評価し、その病因・病態に挑む。更に、遺伝統計学的により得られた候補遺伝子を、先にOPLLで成功した in silico、in vitroのゲノム解析を併用したアプローチ 等により評価し、疾患感受性遺伝子を同定し、その機能、病因性を明らかにする。

報告書

(2件)
  • 2023 実績報告書
  • 2022 実績報告書
  • 研究成果

    (10件)

すべて 2023 2022

すべて 雑誌論文 (6件) (うち国際共著 4件、 査読あり 6件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 2件、 招待講演 4件)

  • [雑誌論文] A novel CCDC91 isoform associated with ossification of the posterior longitudinal ligament of the spine works as a non-coding RNA to regulate osteogenic genes2023

    • 著者名/発表者名
      Nakajima Masahiro、Koido Masaru、Guo Long、Terao Chikashi、Ikegawa Shiro
    • 雑誌名

      The American Journal of Human Genetics

      巻: 110 号: 4 ページ: 638-647

    • DOI

      10.1016/j.ajhg.2023.03.004

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Improved genetic prediction of the risk of knee osteoarthritis using the risk factor-based polygenic score2023

    • 著者名/発表者名
      Morita Yugo、Kamatani Yoichiro、Ito Hiromu、Ikegawa Shiro、Kawaguchi Takahisa、Kawaguchi Shuji、Takahashi Meiko、Terao Chikashi、Ito Shuji、Nishitani Kohei、Nakamura Shinichiro、Kuriyama Shinichi、Tabara Yasuharu、Matsuda Fumihiko、Matsuda Shuichi、on behalf of the Nagahama study group
    • 雑誌名

      Arthritis Research & Therapy

      巻: 25 号: 1 ページ: 103-103

    • DOI

      10.1186/s13075-023-03082-y

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Evidence of causality of low body mass index on risk of adolescent idiopathic scoliosis: a Mendelian randomization study.2023

    • 著者名/発表者名
      Otomo N, Khanshour AM, Koido M, et al., Ikegawa S, Watanabe K, Terao C.
    • 雑誌名

      Front Endocrinol (Lausanne)

      巻: 14 ページ: 1089414-1089414

    • DOI

      10.3389/fendo.2023.1089414

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Genetic insights into ossification of the posterior longitudinal ligament of the spine2023

    • 著者名/発表者名
      Koike Yoshinao、Inose Hiroyuki, et al.
    • 雑誌名

      eLife

      巻: 12 ページ: 86514-86514

    • DOI

      10.7554/elife.86514

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Impaired glycine neurotransmission causes adolescent idiopathic scoliosis.2023

    • 著者名/発表者名
      Wang X, Yue M, Cheung JPY, Cheung PWH, Fan Y, Wu M, Wang X, Zhao S, Khanshour AM, Rios JJ, Chen Z, Wang X, Tu W, Chan D, Yuan Q, Qin D, Qiu G, Wu Z, Zhang J, Ikegawa S, Wu N, Wise CA, Hu Y, Luk KDK, Song YQ, Gao B.
    • 雑誌名

      J Clin Invest

      巻: 134 号: 2

    • DOI

      10.1172/jci168783

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Association of genetic variation in COL11A1 with adolescent idiopathic scoliosis.2023

    • 著者名/発表者名
      Yu H, Khanshour AM, Ushiki A, Otomo N, Koike Y, Einarsdottir E, Fan Y, Antunes L, Kidane YH, Cornelia R, Sheng RR, Zhang Y, Pei J, Grishin NV, Evers BM, Cheung JPY, Herring JA, Terao C, Song YQ, Gurnett CA, Gerdhem P, Ikegawa S, Rios JJ, Ahituv N, Wise CA.
    • 雑誌名

      Elife

      巻: 12

    • DOI

      10.7554/elife.89762

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] 運動器疾患のゲノム解析2023

    • 著者名/発表者名
      池川 志郎
    • 学会等名
      第41回日本骨代謝学会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Genomic Study of Bone and Joint Diseases2022

    • 著者名/発表者名
      池川志郎
    • 学会等名
      Foreign Expert Seminar, Institute of Basic Medical Sciences, Chinese Academy of Medical Sciences, School of Basic Medicine, Peking Union Medical College
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 側彎症の現状と今後の発展2022

    • 著者名/発表者名
      池川志郎
    • 学会等名
      第95回日本整形外科学会学術総会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 基礎からの運動器ゲノム学2022

    • 著者名/発表者名
      池川志郎
    • 学会等名
      JOSKAS2022
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演

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公開日: 2022-04-19   更新日: 2024-12-25  

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