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再生指向型エピゲノムに基づく歯周組織再生術前診断法と精密化療法の樹立

研究課題

研究課題/領域番号 23K24524
補助金の研究課題番号 22H03266 (2022-2023)
研究種目

基盤研究(B)

配分区分基金 (2024)
補助金 (2022-2023)
応募区分一般
審査区分 小区分57030:保存治療系歯学関連
研究機関東北大学

研究代表者

鈴木 茂樹  東北大学, 大学病院, 講師 (30549762)

研究分担者 根本 英二  東北大学, 歯学研究科, 准教授 (40292221)
山田 聡  東北大学, 歯学研究科, 教授 (40359849)
梶川 哲宏  東北大学, 大学病院, 講師 (90611252)
研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2024年度)
配分額 *注記
17,160千円 (直接経費: 13,200千円、間接経費: 3,960千円)
2024年度: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2023年度: 6,890千円 (直接経費: 5,300千円、間接経費: 1,590千円)
2022年度: 5,720千円 (直接経費: 4,400千円、間接経費: 1,320千円)
キーワード歯周病 / 歯周組織再生 / エピゲノム / エピジェネティクス / ATAC-seq / 微量RNA-seq / バイオインフォマティクス解析 / 歯周組織 / 再生
研究開始時の研究の概要

多様な後天的因子に長期に暴露される歯周組織では、患者別あるいは口腔内部位別に多様な環境応答性エピゲノムが形成されていると考えられる。本研究は、歯周組織再生療法手術時の患者由来不良肉芽組織を用いた歯周組織エピゲノム解析と、術後の歯槽骨再生率との大規模な相関分析を行う。さらに、実験的歯周組織再生モデルやin vitro 実験系におけるエピゲノム機能解析により、歯周組織再生療法の予知性を高める再生指向型エピゲノムを同定する。これら研究で得られる成果により、エピゲノムを指標とした歯周組織再生術前診断法の確立と、歯根膜細胞の再生指向型エピゲノム形成細胞への形質転換法開発を目指した基盤的研究を展開する。

研究実績の概要

局所環境や栄養状態などの全身状態により、歯周組織構成細胞内に形成される可逆的な遺伝子発現制御機構であるエピゲノムは、歯周炎の発症や歯周治療および歯周組織再生療法への反応性に影響をおよぼすと考えられる。そこで本研究は、歯周組織破壊期から歯周組織再生期にかけて歯周組織に構成される環境応答性エピゲノムをマウス実験的歯周炎モデルおよび歯周組織再生モデルを用いて明らかにし、再生指向型候補エピゲノムを抽出・同定することを目的としている。
本年度は、歯周組織破壊期から歯周組織再生期にかけてのエピゲノム変化がトランスクリプトームにおよぼす影響を解析することを目的として、免疫系細胞を除去した間葉系細胞に対するATAC-seqによるオープンクロマチンアクセシビリティと微量RNA-seqによるトランスクリプトームの統合解析を行った。さらに、これまでの研究成果から我々が着目している、エネルギー代謝とエピゲノム変化の視点から、歯根膜線維芽細胞がエネルギー代謝経路の中間代謝産物を硬組織形成分化能維持に利用する機序解明を行い、その結果としてメバロン酸経路に着目し、各種メバロン酸経路中間代謝産物の細胞分化制御機構の解明、歯周治療時に回収した臨床歯周組織サンプルにおける発現解析を行った。さらに、エネルギー代謝関連遺伝子の発現に寄与するPPARgの各アイソフォーム依存性の機能解析を行い、PPARgのアゴニスト局所投与が歯周炎の進展抑制や歯周組織再生に貢献できることを実験的マウスモデルで明らかにした。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

歯周組織再生療法手術時の患者由来不良肉芽組織の回収を進めることができた。今後、数サンプルの追加が得られたら、各サンプルを異なったインデックスプライマーで標識するATAC-seq ライブラリー作製を行い、次世代シーケンサー解析用にプーリングを行える段階まで進んでいる。

今後の研究の推進方策

2024年度は、これまで回収した臨床サンプルにおけるクロマチンアクセシビリティ解析の次世代シーケンサーによる結果を年度早期に得たのちに、マウス実験的歯周組織再生モデルで得られた再生指向型エピゲノムの候補となるエピゲノム変化との比較を行いながら、再生指向型エピゲノムを選定し、局所エピゲノム改変技術を用いてin vitroで機能評価を行い、歯周組織再生効果を予測するための標的となるゲノム領域を決定していく。

報告書

(2件)
  • 2023 実績報告書
  • 2022 実績報告書
  • 研究成果

    (17件)

すべて 2024 2023 2022

すべて 雑誌論文 (9件) (うち国際共著 3件、 査読あり 8件、 オープンアクセス 8件) 学会発表 (8件) (うち国際学会 4件、 招待講演 2件)

  • [雑誌論文] Cementocyte-derived extracellular vesicles regulate osteoclastogenesis and osteoblastogenesis2024

    • 著者名/発表者名
      Li Jiajun、Sakisaka Yukihiko、Nemoto Eiji、Maruyama Kentaro、Suzuki Shigeki、Xiong Kaixin、Tada Hiroyuki、Tenkumo Taichi、Yamada Satoru
    • 雑誌名

      Journal of Dental Sciences

      巻: ‐ 号: 4 ページ: 2236-2246

    • DOI

      10.1016/j.jds.2024.02.025

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The histone deacetylase inhibitor MS-275 enhances the matrix mineralization of dental pulp stem cells by inducing fibronectin expression2023

    • 著者名/発表者名
      Suzuki Shigeki、Sasaki Kento、Fahreza Rahmad Rifqi、Nemoto Eiji、Yamada Satoru
    • 雑誌名

      Journal of Dental Sciences

      巻: - 号: 3 ページ: 1680-1690

    • DOI

      10.1016/j.jds.2023.11.019

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Mice Lacking PLAP-1/Asporin Show Alteration of Periodontal Ligament Structures and Acceleration of Bone Loss in Periodontitis2023

    • 著者名/発表者名
      Kinoshita Masaki、Yamada Satoru、Sasaki Junichi、Suzuki Shigeki、Kajikawa Tetsuhiro、Iwayama Tomoaki、Fujihara Chiharu、Imazato Satoshi、Murakami Shinya
    • 雑誌名

      International Journal of Molecular Sciences

      巻: 24 号: 21 ページ: 15989-15989

    • DOI

      10.3390/ijms242115989

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Dynamic changes in chromatin accessibility during the differentiation of dental pulp stem cells reveal that induction of odontogenic gene expression is linked with specific enhancer construction2023

    • 著者名/発表者名
      Sasaki Kento、Suzuki Shigeki、Fahreza Rahmad Rifqi、Nemoto Eiji、Yamada Satoru
    • 雑誌名

      Journal of Dental Sciences

      巻: - 号: 3 ページ: 1705-1713

    • DOI

      10.1016/j.jds.2023.10.022

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Procyanidin B2 enhances anti-inflammatory responses of periodontal ligament cells by inhibiting the dominant negative pro-inflammatory isoforms of peroxisome proliferator-activated receptor γ2023

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto Tadahiro、Yuan Hang、Suzuki Shigeki、Nemoto Eiji、Saito Masahiro、Yamada Satoru
    • 雑誌名

      Journal of Dental Sciences

      巻: - 号: 3 ページ: 1801-1810

    • DOI

      10.1016/j.jds.2023.09.027

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Public RNA-seq data-based identification and functional analyses reveal that MXRA5 retains proliferative and migratory abilities of dental pulp stem cells2023

    • 著者名/発表者名
      Yoshida Kazuma、Suzuki Shigeki、Yuan Hang、Sato Akiko、Hirata-Tsuchiya Shizu、Saito Masahiro、Yamada Satoru、Shiba Hideki
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 13 号: 1 ページ: 1-16

    • DOI

      10.1038/s41598-023-42684-z

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Pharmacological Activation of YAP/TAZ by Targeting LATS1/2 Enhances Periodontal Tissue Regeneration in a Murine Mode2023

    • 著者名/発表者名
      Akiko Sato,Shigeki Suzuki,Hang Yuan,Rahmad Rifqi Fahreza,Xiuting Wang,Eiji Nemoto,Masahiro Saito and Satoru Yamada
    • 雑誌名

      International Journal of Molecular Sciences

      巻: 24 号: 2 ページ: 970-970

    • DOI

      10.3390/ijms24020970

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Epigenetics in susceptibility, progression, and diagnosis of periodontitis2022

    • 著者名/発表者名
      Suzuki Shigeki、Yamada Satoru
    • 雑誌名

      Japanese Dental Science Review

      巻: 58 ページ: 183-192

    • DOI

      10.1016/j.jdsr.2022.06.001

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [雑誌論文] Loss of IκBζ Drives Dentin Formation via Altered H3K4me3 Status2022

    • 著者名/発表者名
      Yuan H.、Suzuki S.、Terui H.、Hirata-Tsuchiya S.、Nemoto E.、Yamasaki K.、Saito M.、Shiba H.、Aiba S.、Yamada S.
    • 雑誌名

      Journal of Dental Research

      巻: Online ahead of print 号: 8 ページ: 951-961

    • DOI

      10.1177/00220345221075968

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Integrative epigenomic and transcriptomic analysis reveals that transcriptional factor competition at the distal enhancers of the Samd9l gene locus regulates osteoblast survival and activity in an inflammatory environment.2023

    • 著者名/発表者名
      Suzuki S
    • 学会等名
      The 71st Annual Meeting of Japanese Association of Dental Research
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Establishment of pulp revascularization in the mouse model.2023

    • 著者名/発表者名
      Wang X, Suzuki S, Yamada S.
    • 学会等名
      The 71st Annual Meeting of Japanese Association for Dental Research
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] RMND5A involvement in periodontal tissue homeostasis.2023

    • 著者名/発表者名
      Fahreza RR, Suzuki S, Nemoto E, Yamada S.
    • 学会等名
      The 71st Annual Meeting of Japanese Association for Dental Research
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] The role of Piezo1 pathway on cementocyte functions.2023

    • 著者名/発表者名
      Xiong K, Chen L, Sakisaka Y, Suzuki S, Tenkumo T, Nemoto E, Yamada S.
    • 学会等名
      The 71st Annual Meeting of Japanese Association for Dental Research
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 歯髄幹細胞分化過程におけるクロマチンアクセシビリティ解析.2023

    • 著者名/発表者名
      鈴木茂樹,佐藤瞭子,大道寺美乃,長﨑果林,長谷川 龍,根本英二,山田 聡.
    • 学会等名
      日本歯科保存学会2023年度春季学術大会(第158回)
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 実験的歯周炎-歯周組織再生モデルにおける歯周組織エピゲノム変化の解析.2023

    • 著者名/発表者名
      大道寺美乃,鈴木茂樹,佐藤瞭子,山本真豊,佐々木健人,Wang X,長﨑果林,Rahmad Rifqi Fahreza,長谷川 龍,根本英二,山田 聡.
    • 学会等名
      第66回春季日本歯周病学会学術大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Functional Roles of RMND5A in Periodontal Tissue Homeostasis.2023

    • 著者名/発表者名
      Fahreza RR, Suzuki S, Sato A, Yamamoto T, Sasaki K, Wang X, Daidoji Y, Nagasaki K, Hasegawa R, Nemoto E, Yamada S.
    • 学会等名
      第66回春季日本歯周病学会学術大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] エピゲノムから捉える炎症と再生の交差点2022

    • 著者名/発表者名
      鈴木茂樹
    • 学会等名
      第65回秋季日本歯周病学会学術大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演

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公開日: 2022-04-19   更新日: 2024-12-25  

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