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配向と配位の分子理論:新しい分子構造表現の探求

研究課題

研究課題/領域番号 23K26615
補助金の研究課題番号 23H01922 (2023)
研究種目

基盤研究(B)

配分区分基金 (2024)
補助金 (2023)
応募区分一般
審査区分 小区分32010:基礎物理化学関連
研究機関京都大学

研究代表者

佐藤 啓文  京都大学, 工学研究科, 教授 (70290905)

研究期間 (年度) 2023-04-01 – 2028-03-31
研究課題ステータス 交付 (2024年度)
配分額 *注記
17,420千円 (直接経費: 13,400千円、間接経費: 4,020千円)
2027年度: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2026年度: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2025年度: 2,730千円 (直接経費: 2,100千円、間接経費: 630千円)
2024年度: 2,990千円 (直接経費: 2,300千円、間接経費: 690千円)
2023年度: 3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円)
キーワード分子配向 / 分子配位 / 距離幾何 / 構造表現
研究開始時の研究の概要

本課題では多原子分子やこれらの間の相対的配置を表現する新しい分子構造の記述法を開発することで、現実の多原子分子系を取り扱い易い普遍性の高いプラットフォームを創出を目指す。具体的には距離幾何と呼ばれる理論群を活用することで、分子や分子同士の配位・配向を構成原子間の距離情報に直接結びつける。これによって分子とその集団の構造に関する基盤的・根源的な理解を深めることができる。

研究実績の概要

本年度の活動で得られた成果の一部は以下の通りである。
(1)2つの多原子分子の相対的な位置や配向について、それぞれの分子を構成する原子間の距離の組で構造を表現する距離座標の考え方に基づいて解析を行った。四原子以上が含まれる系においては、距離座標の表現は冗長となり、三次元以上の多次元の空間における図形になってしまう可能性がある。そのためCayley-Menger行列式を用いて構造が三次元空間に留まるよう制約しつつ、とりうる相対配置を代数的に表現し、安定構造・停留点を直接探索する方法の開発に取り組んだ。
(2)界面における電子状態変化は吸着や電極表面を考慮する上で重要である。安池らによるopen-boundary cluster model (OCM) では、着目するクラスター周囲の効果を外向波境界条件を制御することで、連続的な固体バンド構造を再現することができる。この境界条件制御にはcomplex absorbing potential (CAP)が用いられるが,適切なCAPを決定するにあたってはさまざまな問題点が指摘されていた。本研究ではこれらを克服できるCAP構成法を新たに提案し、その有効性を実証した。
(3)配位型錯体の自己集合過程に対して、我々はこれまでに、電子状態計算に基づきながら過程の局所的なエネルギー変化を調べるとともに、過程全体の時系列変化をNASAPと呼ばれる数理モデルで追跡・解析してきた。これらの成果を総括し、総説論文として上梓した。また前者に関連して量子化学計算の結果を、静電相互作用などで簡単にモデル化して解析する手法を開発した。
(4)俣野らが報告している2-フェニルベンゾ [b] ホスホニウム塩の蛍光挙動における対イオン効果について調べた。従来からの考えとは異なり、特異的な蛍光挙動は、電荷移動状態が溶媒和で変化することによって説明できることを見出した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

本課題で当初掲げていた課題については、概ね完了しており、成果についても学術論文として取りまとめ投稿を進めている。また新理論の検討も順調に進んでいる。

今後の研究の推進方策

これまでに検討してきた新しい理論の開発に引き続き取り組む。また具体的な化学過程を対象とした計算を進め、それぞれの現象の理解を深めるとともに、現行理論の抱える問題点を明らかにして、さらに発展した理論開発の可能性について検討する。具体的には
(A)距離座標系の利点・問題点が明らかになったことを踏まえ、「オイラー角+重心間距離」をはじめとする別の座標系とそれらの相互変換に関する理解を深める。また分子の変形・柔軟性を取り入れた構造の表現方法についても検討する。
(B)対イオンの効果を連続誘電体モデルを拡張することで考慮する方法の開発に取り組む。並行して、3D-RISM-SCF法に対して同様の検討を行い、理解の体系化を進める。

報告書

(1件)
  • 2023 実績報告書
  • 研究成果

    (19件)

すべて 2024 2023

すべて 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 1件、 査読あり 5件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (14件) (うち国際学会 3件、 招待講演 2件)

  • [雑誌論文] Open-boundary cluster model with a parameter-free complex absorbing potential2024

    • 著者名/発表者名
      Kosuke Imamura, Tomokazu Yasuike, Hirofumi Sato
    • 雑誌名

      The Journal of Chemical Physics

      巻: 160 号: 3 ページ: 034103-034103

    • DOI

      10.1063/5.0184571

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Recent developments and applications of reference interaction site model self-consistent field with constrained spatial electron density (RISM-SCF-cSED): A hybrid model of quantum chemistry and integral equation theory of molecular liquids2024

    • 著者名/発表者名
      Kosuke Imamura, Daisuke Yokogawa, Hirofumi Sato
    • 雑誌名

      The Journal of Chemical Physics

      巻: 160 号: 5 ページ: 050901-050901

    • DOI

      10.1063/5.0190116

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Unique solvent effect of water in radical cyclization reaction2023

    • 著者名/発表者名
      Sara Suzuki, Soni Aman Govind, Kosuke Imamura, Hideki Yorimitsu, Hiroshi Shinokubo, Masahiro Higashi, Hirofumi Sato
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters

      巻: 826 ページ: 140641-140641

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2023.140641

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Theoretical and computational methodologies for understanding coordination self-assembly complexes2023

    • 著者名/発表者名
      Takahashi Satoshi、Iuchi Satoru、Hiraoka Shuichi、Sato Hirofumi
    • 雑誌名

      Physical Chemistry Chemical Physics

      巻: - 号: 21 ページ: 14659-14671

    • DOI

      10.1039/d3cp00082f

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Theoretical study on counter anion- and solvent-dependent fluorescence quenching mechanism of 2-phenylbenzo[b]phospholium salts2023

    • 著者名/発表者名
      Sara Suzuki, Kosuke Imamura, Kaori Fujii, Yoshifumi Kimura, Yoshihiro Matano, Masahiro Higashi, Hirofumi Sato
    • 雑誌名

      Journal of Molecular Liquids

      巻: 382 ページ: 121934-121934

    • DOI

      10.1016/j.molliq.2023.121934

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] カゴ状二核パラジウム錯体の自己集合に関する粗視化モデルの開発2024

    • 著者名/発表者名
      市川 雄大; 杉山佳奈美;東 雅大; 佐藤 啓文
    • 学会等名
      研究会「凝縮系の理論化学」
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] モデルハミルトニアンを用いた[Ni(phen)3]2+のポテンシャルエネルギー面の計算2024

    • 著者名/発表者名
      杉村 怜音; 井内哲; 佐藤啓文
    • 学会等名
      研究会「凝縮系の理論化学」
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Baxter の取り扱いに基づいた液体の積分方程式の数値計算に関する研究2024

    • 著者名/発表者名
      松澤 裕人; 佐藤啓文
    • 学会等名
      研究会「凝縮系の理論化学」
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 分子構造の熱揺らぎを考慮した電子状態の考察2024

    • 著者名/発表者名
      鈴木 さら;佐藤 啓文
    • 学会等名
      研究会「凝縮系の理論化学」
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 微視的溶媒効果を考慮したラジカル環化反応促進機構の解明2023

    • 著者名/発表者名
      鈴木さら; Soni Aman Govind; 今村洸輔; 依光英樹; 忍久保洋; 東雅大; 佐藤啓文
    • 学会等名
      第 45 回溶液化学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] カゴ状二核パラジウム錯体の自己集合過程における溶媒和効果2023

    • 著者名/発表者名
      市川 雄大; 東 雅大; 佐藤 啓文
    • 学会等名
      第 45 回溶液化学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] カゴ状二核パラジウム錯体の自己集合における反応経路の解析2023

    • 著者名/発表者名
      市川 雄大; 東 雅大; 佐藤 啓文
    • 学会等名
      第17回分子科学討論会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 距離座標を用いた分子配向の解析的最適化手法の検討2023

    • 著者名/発表者名
      杉山佳奈美;岡田成広史; 東雅大; 佐藤啓文
    • 学会等名
      第17回分子科学討論会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 凝縮化学系における協同性の分子理論2023

    • 著者名/発表者名
      佐藤啓文
    • 学会等名
      SRPS2023
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Open-boundary cluster model with a parameter-free complex absorbing potential2023

    • 著者名/発表者名
      Kosuke Imamura
    • 学会等名
      TACC2023
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Influence of microscopic solute-solvent interaction on the radical cyclization reaction2023

    • 著者名/発表者名
      Suzuki Sara、Govind Soni Aman、Imamura Kosuke、Yorimitsu Hideki、Shinokubo Hiroshi、Higashi Masahiro、Sato Hirofumi
    • 学会等名
      TACC2023
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] A multifaceted approach to various chemical processes in condensed phases2023

    • 著者名/発表者名
      Hirofumi Sato
    • 学会等名
      TACC2023
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Z-(allyloxycarbonyl)methylラジカル環化反応過程における微視的溶媒効果2023

    • 著者名/発表者名
      鈴木さら; Soni Aman Govind; 今村洸輔; 依光英樹; 忍久保洋; 東雅大; 佐藤啓文
    • 学会等名
      第25回理論化学討論会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 自己エネルギーに基づくパラメータフリーな複素吸収ポテンシャルの構成2023

    • 著者名/発表者名
      今村 洸輔;安池 智一;佐藤 啓文
    • 学会等名
      第25回理論化学討論会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書

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公開日: 2023-04-18   更新日: 2024-12-25  

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