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ジアステレオ選択的酵素の合理的改変による天然化合物の骨格多様性拡張

研究課題

研究課題/領域番号 23K26843
補助金の研究課題番号 23H02150 (2023)
研究種目

基盤研究(B)

配分区分基金 (2024)
補助金 (2023)
応募区分一般
審査区分 小区分38040:生物有機化学関連
研究機関摂南大学

研究代表者

加藤 直樹  摂南大学, 農学部, 教授 (90442946)

研究分担者 永野 真吾  鳥取大学, 工学研究科, 教授 (60286440)
研究期間 (年度) 2023-04-01 – 2026-03-31
研究課題ステータス 交付 (2024年度)
配分額 *注記
19,110千円 (直接経費: 14,700千円、間接経費: 4,410千円)
2025年度: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2024年度: 3,640千円 (直接経費: 2,800千円、間接経費: 840千円)
2023年度: 10,920千円 (直接経費: 8,400千円、間接経費: 2,520千円)
キーワードDiels-Alderase / デカリン合成酵素 / デカリン / 酵素機能改変 / 糸状菌二次代謝
研究開始時の研究の概要

天然物は不斉炭素に富んだ複雑な構造とそれにより生じる構造多様性が特徴である。その生合成経路における多様性創出の鍵酵素のひとつが、Diels-Alderaseと呼ばれる環化酵素群である。近年発見が相次ぐ本酵素群の中で、高いジアステレオ選択性を示す点で特徴的であるFsa2ファミリーデカリン合成酵素に焦点を絞り、酵素の構造と機能(産物の立体化学)の相関を解き明かし、酵素の合理的なデザインによる反応の立体選択性の自在改変を目指す。さらには、改変酵素を本来の生合成経路に組み込むことで、非天然型骨格を有する天然物誘導体の創製に挑戦する。

研究実績の概要

天然物生合成経路における構造多様性創出の鍵酵素のひとつが、Diels-Alderaseと呼ばれる環化酵素群である。近年発見が相次ぐ本酵素群の中で、高いジアステレオ選択性を示す点で特徴的であるFsa2ファミリーデカリン合成酵素に焦点を絞り、酵素の構造と機能(産物の立体化学)の相関を解き明かし、酵素の合理的なデザインによる反応の立体選択性の自在改変を目指している。今年度の成果は以下の通りである。
(1)in vitroアッセイ系の拡張;in vitroアッセイ系において基質供給を担うPKS-NRPSハイブリッド遺伝子改変糸状菌の作製を行った。cisデカリン化合物の生合成経路より担当遺伝子を取得し、対応する遺伝子と置換した改変株を作製するとともに、より精密な基質供給を可能とするためのドメインスワッピング実験に着手した。また、化学合成基質による酵素機能評価を目指し、Fsa2本来の基質であるテトラエノイルテトラミン酸のジアステレオ選択的合成に取り組んだ。さらには、テトラミン酸部位の立体化学制御を目指し、フォマセチンおよびエキセチン生合成酵素Phm1、Fsa1の担当ドメインの機能解析にも着手した。
(2)新規に取得したFsa2ホモログ酵素についてAlphaFold2を用いた立体構造予測を行うとともに、これまでに取得したホモログ酵素との比較を行った。
(3)より精密な酵素・基質結合モデル構築に向け、Fsa2およびPhm7のプロダクト結合型結晶構造解析に取り組み、Fsa2について、その立体構造決定に成功した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

4つの立体化学の異なるデカリン骨格に対応する酵素の取得が完了し、その機能解析を行うための準備は順調に進展している。また、プロダクト結合型酵素の結晶構造決定に成功し、酵素機能改変に向けた、より精細な基質結合モデルの構築が可能となった。

今後の研究の推進方策

構築する機能評価基盤を活用し、立体構造に基づく機能予測とその検証、基質結合モデルに基づいた変異酵素作製のその機能評価に研究の重点を移すことで、さらなる研究推進を図りたい。

報告書

(1件)
  • 2023 実績報告書
  • 研究成果

    (8件)

すべて 2024 2023 その他

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 1件、 招待講演 1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Elucidation of the stereocontrol mechanisms of the chemical and biosynthetic intramolecular Diels?Alder cycloaddition for the formation of bioactive decalins2023

    • 著者名/発表者名
      Kariya Takumi、Hasegawa Hayato、Udagawa Taro、Inada Yusaku、Nishiyama Kyoko、Tsuji Mieko、Hirayama Tasuku、Suzutani Tatsuo、Kato Naoki、Nagano Shingo、Nagasawa Hideko
    • 雑誌名

      RSC Advances

      巻: 13 号: 40 ページ: 27828-27838

    • DOI

      10.1039/d3ra04406h

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] cis-Decalin-containing tetramic acids as inhibitors of insect steroidogenic glutathione S-transferase Noppera-bo2023

    • 著者名/発表者名
      Kato Naoki、Ebihara Kana、Nogawa Toshihiko、Futamura Yushi、Inaba Kazue、Okano Akiko、Aono Harumi、Fujikawa Yuuta、Inoue Hideshi、Matsuda Kazuhiko、Osada Hiroyuki、Niwa Ryusuke、Takahashi Shunji
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 18 号: 8 ページ: e0290851-e0290851

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0290851

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Wakodecaline C, new tetrahydrofuran-fused decalin metabolite isolated from fungus Pyrenochaetopsis sp. RK10-F0582023

    • 著者名/発表者名
      Nogawa Toshihiko、Kato Naoki、Shimizu Takeshi、Okano Akiko、Futamura Yushi、Takahashi Shunji、Koshino Hiroyuki、Osada Hiroyuki
    • 雑誌名

      The Journal of Antibiotics

      巻: 76 号: 6 ページ: 346-350

    • DOI

      10.1038/s41429-023-00613-2

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 生理活性作用を有するデカリン生成のための化学的および酵素的分子内Diels-Alder環化付加反応の立体制御機構の解明2024

    • 著者名/発表者名
      狩谷 拓実, 長谷川 颯人, 宇田川 太郎, 辻 美恵子, 伊奈田 悠作, 永野 真吾, 加藤 直樹, 錫谷 達夫, 平山 祐, 永澤 秀子
    • 学会等名
      日本薬学会第144年会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 二次代謝物生合成酵素阻害剤を用いた新規化合物の探索系の構築2024

    • 著者名/発表者名
      髙村郁実, 野川俊彦, 岡野亜紀子, 越野広雪, 沼本穂, 和田大, 加藤直樹
    • 学会等名
      日本農芸化学会2024年度大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] cis-デカリン含有テトラミン酸は昆虫エクジステロイド生合成に関わるグルタチオンS-転移酵素Noppera-boを阻害する2023

    • 著者名/発表者名
      加藤直樹,海老原佳奈,野川俊彦,二村友史,松田一彦,長田裕之,丹羽隆介,高橋俊二
    • 学会等名
      第22回糸状菌分子生物学コンファレンス
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Structure-activity relationship of decalin-containing tetramic acids collected from genetically engineered fungi2023

    • 著者名/発表者名
      Naoki Kato
    • 学会等名
      5th KRIBB-RIKEN Chemical Biology Joint Symposium
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [備考] 応用微生物学研究室・摂南大学農学部

    • URL

      https://www.setsunan.ac.jp/~amblab_k/index.html

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書

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公開日: 2023-04-18   更新日: 2024-12-25  

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