ウンシュウミカン品種群成立におけるゲノム構造変異の解明

• 研究課題/領域番号: 23K26902
• 補助金の研究課題番号: 23H02209 (2023)
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 基金 (2024); 補助金 (2023)
• 応募区分: 一般
• 審査区分: 小区分39030:園芸科学関連
• 研究機関: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構
• 研究代表者: 遠藤 朋子 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 果樹茶業研究部門, グループ長 (50355400)
• 研究分担者: 藤井 浩 静岡大学, 農学部, 客員教授 (00355398) ; 島田 武彦 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 果樹茶業研究部門, 研究領域長 (10355399) ; 白澤 健太 公益財団法人かずさDNA研究所, 先端研究開発部, 室長 (60527026) ; 川原 善浩 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 高度分析研究センター, 上級研究員 (30546370)
• 研究期間 (年度): 2023-04-01 – 2026-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2024年度)
• 配分額: 18,850千円 (直接経費: 14,500千円、間接経費: 4,350千円); 2025年度: 5,720千円 (直接経費: 4,400千円、間接経費: 1,320千円); 2024年度: 5,720千円 (直接経費: 4,400千円、間接経費: 1,320千円); 2023年度: 7,410千円 (直接経費: 5,700千円、間接経費: 1,710千円)
• キーワード: カンキツ / 栄養繁殖 / ゲノム構造変異 / ウンシュウミカン

研究開始時の研究の概要

ウンシュウミカンでは、枝変わりに加え珠心由来の無性胚（珠心胚）を利用して、多様な形質を持つ 100 種類以上の品種が選抜されているが、どのようなゲノム構造変異が関与しているのか、珠心胚形成と枝変わりによる品種の成立メカニズムに違いがあるかなどは未解明である。
本研究では、ウンシュウミカンの高精度ゲノム配列を参照配列として品種群のゲノムを解析し、系譜情報を利用してゲノム構造変異を捉え、品種成立のメカニズムを解明する。これらは、栄養繁殖を主とする果樹等の作物における品種成立のモデルケースとして、変異体を利用した育種、品種識別技術、ゲノム編集等新たな育種技術の開発に資する。