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ポテックスウイルスの複製複合体形成メカニズムの解明

研究課題

研究課題/領域番号 23K26904
補助金の研究課題番号 23H02211 (2023)
研究種目

基盤研究(B)

配分区分基金 (2024)
補助金 (2023)
応募区分一般
審査区分 小区分39040:植物保護科学関連
研究機関東京農工大学

研究代表者

小松 健  東京農工大学, (連合)農学研究科(研究院), 准教授 (60451837)

研究分担者 佐々木 信光  東京農工大学, (連合)農学研究科(研究院), 准教授 (70431971)
研究期間 (年度) 2023-04-01 – 2026-03-31
研究課題ステータス 交付 (2024年度)
配分額 *注記
18,850千円 (直接経費: 14,500千円、間接経費: 4,350千円)
2025年度: 4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円)
2024年度: 6,110千円 (直接経費: 4,700千円、間接経費: 1,410千円)
2023年度: 7,800千円 (直接経費: 6,000千円、間接経費: 1,800千円)
キーワード植物ウイルス / 複製酵素 / 近接依存性標識法 / 遺伝子コード型抗体プローブ / 一本鎖抗体 / proximity labeling / 複製複合体
研究開始時の研究の概要

RNAウイルスは宿主の細胞内膜系に形成される複製複合体で複製を行う。しかし、膜局在性を持つウイルスの複製酵素によって複製複合体が形成される過程の詳細な分子機構は不明である。本研究では、ポテックスウイルスの複製酵素の膜局在性を持つMETドメインに着目し、METの多量体化に関わる領域を変異解析で見出すとともに、近接依存性標識法と質量分析によりMETと相互作用する宿主因子を同定する。また遺伝子コード型抗体プローブを用いたイメージング技術により、活性を維持した全長複製酵素の細胞内局在・動態を解析し、複製酵素が多量体化・宿主因子と相互作用することで複製複合体が形成される経時的ダイナミクスを明らかにする。

研究実績の概要

本研究はユリに壊そ症状を引き起こし問題となっている機械的伝搬性のポテックスウイルス、オオバコモザイクウイルス(plantago asiatica mosaic virus: PlAMV)の複製酵素の膜局在に関与するメチルトランスフェラーゼドメイン(MET)が複製複合体の形成に関わる複製機構の解明を目指す。2023年度は、MET-GFPの免疫沈降と質量分析により見出した宿主タンパク質dynaminがMETと相互作用することを確認し、ノックダウンと阻害剤を与えたプロトプラストへの接種実験により、本因子がPlAMVの複製に寄与することを解明し論文発表した。
さらに遺伝子コード型抗体プローブによる全長複製酵素の動態解析の系の確立を進めた。PlAMVの複製酵素にHAタグを融合したウイルスを作出しこれが複製することを確認したのち、HAに対する蛍光タンパク質標識型抗体FB-mCherryをアグロバクテリウムで発現させて複製酵素の生細胞での局在観察を試みた。しかし、35Sプロモーター制御下で発現させたFB-mCherryは、HAタグ付加複製酵素を持つウイルスの複製時にも核細胞質局在を示しウイルス感染特異的な局在を観察できなかった。そこで、FB-mCherryをウイルス複製時に誘導的に発現させる二成分発現系を構築したところ、FB-mCherryはHA融合付加複製酵素を持つウイルス複製時に小胞体に近接した顆粒状構造を形成した。この顆粒は細胞間連絡と近接しており、これまでのポテックスウイルスの複製酵素の一過的発現での局在と一致していた。さらに、近接依存性標識法によるMET相互作用因子の同定も進め、タンパク質の捕捉と質量分析による同定系を確立した。現在、小胞体マーカータンパク質をコントロールとして、METに特異的な相互作用因子を同定すべく条件検討を行ない、複数のMET相互作用候補因子を見出している。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

免疫沈降と質量分析によりMETの相互作用因子であるdynaminを同定し、その一連の機能解析によりPlAMVの複製への関与を明確にできた。さらに、遺伝子コード型抗体プローブによる全長複製酵素の動態解析の系についても確立のめどが立ち学会発表を行うことができたとともに、近接依存性標識法による複製複合体の構成因子の同定についても系の確立に向けて順調に進捗が得られている。これらのことから、おおむね順調に進捗していると判断できる。

今後の研究の推進方策

2023年度までの進捗状況を踏まえ、2024年度には、引き続き遺伝子コード型抗体プローブによる全長複製酵素の動態解析の系の確立を目指す。遺伝子コード型抗体プローブFB-mCherryの発現がウイルス複製に影響を及ぼすかどうかを確認するとともに、RNAウイルスの複製中間体であるdsRNAの局在を観察できるB2:GFP植物を利用し、FB-mCherryにより標識される顆粒とウイルス感染時に形成されるdsRNA顆粒の共局在が生じるかを解析する。これらの結果を合わせ、生細胞で複製時のウイルス複製酵素の局在について知見を得て、論文発表を目指す。
また、METドメインの多量体化についての研究も本格的に進め、Blue-Native PAGEの系を確立し、高分子量のバンドが検出されるかを調べる。多量体化を示す高分子量のバンドが検出されたら、すでに複製に影響することがわかっているMETの変異体を用いて、多量体化形成と複製能との関連についての知見を得る。
さらに、近接依存性標識法による複製複合体の構成因子の同定については、小胞体の内腔と膜に局在するコントロールにより標識される因子を網羅的に同定し、これらと有意に異なるMETの近接因子を見出す。これらについてベンサミアナタバコでノックダウンを行い、PlAMVの複製への関与を検討する。見出した複製関与因子に、遺伝子コード型抗体プローブによる複製酵素局在解析系を適用し、複製複合体の形成に宿主タンパク質がどのように関与するかについての知見を得る。

報告書

(1件)
  • 2023 実績報告書
  • 研究成果

    (22件)

すべて 2024 2023

すべて 雑誌論文 (8件) (うち国際共著 3件、 査読あり 8件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (14件) (うち国際学会 2件、 招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Temporal changes in colonization levels of Ustilago esculenta in different parts of Zizania latifolia plants competent and incompetent for stem gall formation2024

    • 著者名/発表者名
      Shohei Yamato, Nobumitsu Sasaki, Ken Komatsu, Kouji Mashimo, Takashi Motobayashi
    • 雑誌名

      Journal of General Plant Pathology

      巻: 90 号: 1 ページ: 14-22

    • DOI

      10.1007/s10327-023-01152-2

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Local Application of Acibenzolar-S-Methyl Treatment Induces Antiviral Responses in Distal Leaves of Arabidopsis thaliana2024

    • 著者名/発表者名
      Seiya Ito, Kagari Sakugawa, Fawzia Novianti, Tsutomu Arie, Ken Komatsu
    • 雑誌名

      International Journal of Molecular Sciences

      巻: 25 号: 3 ページ: 1808-1808

    • DOI

      10.3390/ijms25031808

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Phylogenetic and population genetic analyses of plantago asiatica mosaic virus isolates reveal intraspecific diversification2023

    • 著者名/発表者名
      Furuya Minako、Tanai Shino、Hamim Islam、Yamamoto Yuna、Abe Haruki、Imai Kazuho、Saito Hiroki、Yamashita Kazuo、Uehara-Ichiki Tamaki、Hanada Kaoru、Kon Tatsuya、Inoue Maki N.、Minato Nami、Fuji Shin-ichi、Komatsu Ken
    • 雑誌名

      Journal of General Plant Pathology

      巻: 89 号: 4 ページ: 224-237

    • DOI

      10.1007/s10327-023-01129-1

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Dynamin-related protein 2 interacts with the membrane-associated methyltransferase domain of plantago asiatica mosaic virus replicase and promotes viral replication2023

    • 著者名/発表者名
      Shinji Haruka, Sasaki Nobumitsu, Hamim Islam, Itoh yoshiyuki, Taku Kazuo, Hayashi Yuho, Minato Nami, Moriyama Hiromitsu, Arie Tsutomu, Komatsu Ken
    • 雑誌名

      Virus Research

      巻: in press ページ: 199128-199128

    • DOI

      10.1016/j.virusres.2023.199128

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Emergence of a deletion mutant of GFP-expressing plantago asiatica mosaic virus that has overcome acibenzolar-S-methyl-induced defense response against its long-distance movement2023

    • 著者名/発表者名
      Sakugawa Kagari、Novianti Fawzia、Hamim Islam、Arie Tsutomu、Komatsu Ken
    • 雑誌名

      Journal of General Plant Pathology

      巻: 89 号: 5 ページ: 266-276

    • DOI

      10.1007/s10327-023-01131-7

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Successful full-length genomic cloning and characterization of site-specific nick structures of Phytophthora endornaviruses 2 and 3 in yeast, Saccharomyces cerevisiae2023

    • 著者名/発表者名
      Sakuta Kohei、Uchida Keiko、Fukuhara Toshiyuki、Komatsu Ken、Okada Ryo、Moriyama Hiromitsu
    • 雑誌名

      Frontiers in Microbiology

      巻: 14 ページ: 1-1

    • DOI

      10.3389/fmicb.2023.1243068

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] First report of southern blight on showy rattlepod (Crotalaria spectabilis) caused by Athelia rolfsii2023

    • 著者名/発表者名
      Chen Sarina、Kotera Shunsuke、Saito Hiroki、Komatsu Ken、Arie Tsutomu
    • 雑誌名

      Journal of General Plant Pathology

      巻: 89 号: 6 ページ: 322-327

    • DOI

      10.1007/s10327-023-01142-4

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Long-term passages of Plantago asiatica mosaic virus alter virulence and multiplication in Nicotiana benthamiana plants2023

    • 著者名/発表者名
      Nakamura Daisuke、Minato Nami、Furuya Minako、Komatsu Ken、Fuji Shin-ichi
    • 雑誌名

      Archives of Virology

      巻: 169 号: 1 ページ: 9-9

    • DOI

      10.1007/s00705-023-05934-z

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] オオバコへの長期感染によるオオバコモザイクウイルスの遺伝的多様性の推移2024

    • 著者名/発表者名
      山本優菜, 作川かがり, 有江 力, 小松 健
    • 学会等名
      令和 6 年度日本植物病理学会大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] マコモの菌えい形成と黒穂菌寄生量の関係に関する解析2024

    • 著者名/発表者名
      大和昌平, 佐々木信光, 小松 健, 眞下孝治, 本林 隆
    • 学会等名
      令和 6 年度日本植物病理学会大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 非病原性 Fusarium commune W5 を保持する保水ゲル粒子を用いたトマト萎凋病生物的防除効果2024

    • 著者名/発表者名
      中川 翠, 小寺俊丞, 尾澤一葉, 小松 健, 有江 力
    • 学会等名
      令和 6 年度日本植物病理学会大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Colletotrichum associated partitivirus 1感染はハリシバ炭疽病菌Colletotrichum zoysiaeの菌糸生育と病原性に負の影響を与える2024

    • 著者名/発表者名
      三部悠介, 作田康平, 浦山俊一, Hamim Islam, 田中明美, 根津 修, 森山裕充, 有江 力, 小松 健
    • 学会等名
      令和 6 年度日本植物病理学会大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] シロイヌナズナにおける抗ウイルス全身獲得抵抗性の誘導にはN-hydoroxypipecolic acid が関与する2024

    • 著者名/発表者名
      作川かがり, 伊藤晴弥, ノビアンティ ファウジア, 有江 力, 小松 健
    • 学会等名
      令和 6 年度日本植物病理学会大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] ペルーセルバ地域におけるバナナパナマ病の発生現況2024

    • 著者名/発表者名
      谷地中未来, 高橋園香, 横井智希, 中川 翠, 戸畑幸治, 児玉基 一朗, 柏毅, Liliana Aragon Caballero, Rosa Maria Cabrera Pintado, Oscar Cabezas, 小松 健, 有江 力
    • 学会等名
      令和 6 年度日本植物病理学会大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] バナナパナマ病菌のアクセサリー染色体欠失株における病原性の低下2024

    • 著者名/発表者名
      芦川春華, 谷地中未来, 松井美樹, 戸畑幸治, 浅井秀太, 小松 健, 有江 力
    • 学会等名
      令和 6 年度日本植物病理学会大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] トマト萎凋病菌の 3 つの系統分岐群に属する菌株を用いた宿主感染時のRNA-seq 解析2024

    • 著者名/発表者名
      齊藤大幹, 石原千有沙, 戸畑幸治, 宮島俊介, 小松 健, 有江 力
    • 学会等名
      令和 6 年度日本植物病理学会大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] ミツバ株枯病菌Fusarium oxysporum f. sp. cryptiの病原性を司るアクセサリー染色体2024

    • 著者名/発表者名
      戸畑幸治, 小寺俊丞, 齊藤大幹, 加藤有紀子, 山崎真也, 浅井秀太, 荒添貴之, 鎌倉高志, 小松 健, 有江 力
    • 学会等名
      令和 6 年度日本植物病理学会大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 遺伝子コード型抗体プローブを用いたオオバコモザイクウイルス複製酵素の複製時ライブイメージング2024

    • 著者名/発表者名
      石原千有沙, 佐々木信光, 松下保彦, 有江 力, 小松 健
    • 学会等名
      令和 6 年度日本植物病理学会大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] オオバコモザイクウイルス(PlAMV)タチツボスミレ分離株由来感染性クローンはごく一部のシロイヌナズナ野生系統に全身感染する2024

    • 著者名/発表者名
      中村奈輔, 湊 菜未, 古屋実那子, 小松 健, 藤 晋一
    • 学会等名
      令和 6 年度日本植物病理学会大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Local application of acibenzolar-S-methyl induces antiviral responses in distal leaves2023

    • 著者名/発表者名
      Komatsu Ken, Ito Seiya, Sakugawa Kagari, Novianti Fawzia, Arie Tsutomu
    • 学会等名
      IS-MPMI 2023
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Emergence of a deletion mutant of GFP-expressing plantago asiatica mosaic virus overcoming acibenzolar-S-methyl induced defense responses specifically during its long-distance movement2023

    • 著者名/発表者名
      Sakugawa Kagari, Novianti Fawzia, Hamim Islam, Arie Tsutomu, Komatsu Ken
    • 学会等名
      IS-MPMI 2023
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Insight into the evolution of positive-strand RNA viruses through the identification of the membrane-associated domain of a replicase.2023

    • 著者名/発表者名
      Ken Komatsu, Nobumitsu Sasaki, Richard S Nelson, Tsutomu Arie
    • 学会等名
      第70回日本ウイルス学会学術集会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演

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公開日: 2023-04-18   更新日: 2024-12-25  

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