検出誤差に対して頑健な環境DNAメタバーコーディングの進展

• 研究課題/領域番号: 23K26933
• 補助金の研究課題番号: 23H02240 (2023)
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 基金 (2024); 補助金 (2023)
• 応募区分: 一般
• 審査区分: 小区分39060:生物資源保全学関連; 小区分39070:ランドスケープ科学関連; 合同審査対象区分:小区分39060:生物資源保全学関連、小区分39070:ランドスケープ科学関連
• 研究機関: 国立研究開発法人国立環境研究所
• 研究代表者: 深谷 肇一 国立研究開発法人国立環境研究所, 生物多様性領域, 主任研究員 (30708798)
• 研究分担者: 鈴木 健大 国立研究開発法人理化学研究所, バイオリソース研究センター, 開発研究員 (00748999) ; 今藤 夏子 国立研究開発法人国立環境研究所, 生物多様性領域, 室長 (10414369) ; 角谷 拓 国立研究開発法人国立環境研究所, 生物多様性領域, 室長 (40451843) ; 松崎 慎一郎 国立研究開発法人国立環境研究所, 生物多様性領域, 室長 (40548773) ; 辻 冴月 京都大学, 情報学研究科, 助教 (80867656)
• 研究期間 (年度): 2023-04-01 – 2027-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2024年度)
• 配分額: 18,590千円 (直接経費: 14,300千円、間接経費: 4,290千円); 2026年度: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円); 2025年度: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円); 2024年度: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円); 2023年度: 4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円)
• キーワード: 環境DNAメタバーコーディング / サイト占有モデル / 群集動態 / 遺伝的多様性

研究開始時の研究の概要

環境DNAメタバーコーディングの実践では手法に固有の検出誤差に対処することが求められる。この問題に対して近年、偽陰性誤差を補正する新たな統計モデルとそれに基づくデータ解析法が提案された。本研究では、方法論と応用の2つの側面からこの解析手法を発展させる。具体的には、時系列データと偽陽性誤差のモデル化に取り組むことで既存の方法を高度化し、群集安定性解析と遺伝的多様性評価の問題に応用する。提案手法をRパッケージとして実装・公開することで検出誤差に対して頑健な環境DNAメタバーコーディング手法の普及に貢献する。