| 研究課題/領域番号 |
23K27139
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| 補助金の研究課題番号 |
23H02446 (2023)
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| 研究種目 |
基盤研究(B)
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| 配分区分 | 基金 (2024)
補助金 (2023) |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 審査区分 |
小区分43040:生物物理学関連
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| 研究機関 | 名古屋大学 |
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研究代表者 |
野口 巧 名古屋大学, 理学研究科, 教授 (60241246)
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| 研究期間 (年度) |
2023-04-01 – 2028-03-31
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| 研究課題ステータス |
交付 (2024年度)
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| 配分額 *注記 |
18,590千円 (直接経費: 14,300千円、間接経費: 4,290千円)
2027年度: 3,640千円 (直接経費: 2,800千円、間接経費: 840千円)
2026年度: 3,640千円 (直接経費: 2,800千円、間接経費: 840千円)
2025年度: 3,640千円 (直接経費: 2,800千円、間接経費: 840千円)
2024年度: 3,640千円 (直接経費: 2,800千円、間接経費: 840千円)
2023年度: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
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| キーワード | 光合成 / 光化学系Ⅱ / 酸素発生 / 水分解 / 赤外分光 / プロトン移動 / 量子化学計算 |
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| 研究開始時の研究の概要 |
光合成水分解・酸素発生反応は、エネルギー源および酸素源として地球上の生命の生存を支える重要な生命反応である。本研究では、光化学系Ⅱにおける光合成水分解反応の分子機構、およびその触媒中心であるマンガンクラスターの構築機構を解明する。そのため、赤外分光測定を中心として、部位特異的変異や量子化学計算を併用して研究を行う。水分解反応における基質水分子の反応や、アミノ酸配位子の役割、水・プロトン移動経路を明らかにし、マンガンクラスター構築の際のMn2+イオンの光酸化と暗再配置過程、その結果生成する中間体の構造を解明する。
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| 研究実績の概要 |
（１）水分解・酸素発生反応の分子機構の解明：光化学系Ⅱタンパク質における水分解・酸素発生反応におけるプロトン移動機構を明らかにするため、量子力学／分子力学（QM/MM）計算を用いて、プロトン移動経路の有力候補であるCl-1チャネル中の水素結合ネットワークの安定構造および準安定構造を計算した。その結果、Cl-1チャネル上に存在するD1-E65とD2-E312のグルタミン酸ペアがプロトン移動のゲートとして働き、「閉型」から「開型」へ構造変化することにより、グロッタス機構によるプロトン移動が駆動されることが示された。また、Cl-1チャネルの基準振動解析から、このチャネルを形成する水分子およびカルボキシル基のＯＨ伸縮振動のプロトン移動への関与を示した。
（２）Mn4CaO5クラスターの構築機構の解明：シアノバクテリアの光化学系Ⅱタンパク質からMn4CaO5クラスターを除去したアポ光化学系Ⅱを用いて、Mn4CaO5クラスター構築の初期過程の分子機構をラピッドスキャン時間分解フーリエ変換赤外（FTIR）解析を用いて調べた。Mn2+存在下での閃光照射後の時間分解FTIRスペクトルにより、Mn3+への光酸化と、それに続くMn3+の移動とタンパク質コンフォメーション変化を観測した。Mnイオンへの配位子の候補である、D1-D170, D1-E189, D1-D342をAlaに改変した変異体、および、D170に特異的13C同位体置換を施した光化学系Ⅱを用いることにより、最初に光酸化されるMn2+には、D170とE189が配位していることが示された。これらの結果から、Mn4CaO5クラスター構築の初期過程のモデルを提唱した。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
光化学系Ⅱにおける光合成水分解の分子機構については、大きな問題であったプロトン移動経路、およびその具体的メカニズムを、量子化学計算を用いた結果から示すことができた。また、その触媒部位であるMn4CaO5クラスターの構築過程については、シアノバクテリアの変異体や同位体置換体を用いることにより、構築機構における各アミノ酸残基の役割を明らかにすることができた。また、これまで不明であったMn2＋の光酸化後の暗再配置過程が、Mn3＋の移動とタンパク質のコンフォメーション変化であることを、初めて実験的に示すことができた。
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| 今後の研究の推進方策 |
光合成水分解機構については、時間分解赤外分光法を用いて、酸素分子形成が起こるS3 -(S4)-> S0遷移の反応を調べ、カルボキシレート配位子の構造変化、タンパク質のコンフォメーション変化、およびプロトン放出反応を検出する予定である。CaをSrに置換、また、Cl-をNO3-に置換した試料を用いて、酸素発生反応におけるCaおよびClの関与、またCl-1チャネルにおけるプロトン移動機構を明らかにする。
また、Mn4CaO5クラスター構築機構については、以前筆者が開発した、高濃度Mes緩衝剤によるプロトントラップの赤外分光検出の手法を用いて、Mn2+の酸化過程におけるプロトン放出数を計測する。この情報を基に、量子化学計算により、最初の中間体である２核Mn2+Mn3+錯体の構造（μ-oxo架橋かμ-hydroxo架橋か）を明らかにし、カルボキシラート配位子による配位構造と水素結合構造を明らかにする。
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