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多様なロドプシンが紡ぐ非神経系生命機能の光操作技術

研究課題

研究課題/領域番号 23K27142
補助金の研究課題番号 23H02449 (2023)
研究種目

基盤研究(B)

配分区分基金 (2024)
補助金 (2023)
応募区分一般
審査区分 小区分43040:生物物理学関連
研究機関岡山大学

研究代表者

小島 慧一  岡山大学, 医歯薬学域, 講師 (60819267)

研究期間 (年度) 2023-04-01 – 2027-03-31
研究課題ステータス 交付 (2024年度)
配分額 *注記
18,720千円 (直接経費: 14,400千円、間接経費: 4,320千円)
2026年度: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2025年度: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2024年度: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2023年度: 6,370千円 (直接経費: 4,900千円、間接経費: 1,470千円)
キーワード光生物学 / ロドプシン / 光操作 / オプトジェネティクス / オプシン
研究開始時の研究の概要

光受容タンパク質・ロドプシンは、生物個体や細胞の生理応答を光で操作する技術「オプトジェネティクス(光遺伝学)」における応用研究で注目されている。現在、多種多様な生物種から万を超えるロドプシン遺伝子・分子が見出されており、様々な性質を示す分子が同定されている。しかし、ロドプシンの種類/性質には関係なく、神経活動の制御へとロドプシン分子を適用(=利用)する流れが主流であり、他の生理応答制御への適用は少ないのが現状である。本研究では、多様なロドプシン分子の性質を理解し、ロドプシンの分子機能に立脚した新しい光操作システムを構築する。これにより、神経活動以外の多様な生理現象を光で制御する。

研究実績の概要

本研究では、多様なロドプシン分子の性質を理解し、ロドプシンの分子機能に立脚した新しい光操作システムを構築する。そのため、交付申請書に記載した実験計画に沿って、(1)「新奇的なロドプシンの同定」、(2)「ロドプシンの作動原理の理解と新奇ロドプシンの開発」、(3)「生物個体・細胞への適用と光操作ツールの開発」の項目を進めてきた。
「新奇的なロドプシンの同定」に関しては、以下の①~②に取り組んだ。①甲殻類由来ロドプシンの分光学的・生化学的解析を行った。その結果、高いGiおよびGq活性化能を持つ分子の同定に成功した。加えて、双安定性を持つ紫外光感受性分子の同定にも成功した。②鋏角類由来ロドプシンの分光学的・生化学的解析を行った。その結果、高いGq活性化能を持つ可視光感受性分子の同定に成功した。
「ロドプシンの作動原理の理解と新奇ロドプシンの開発」に関しては、以下の①~②に取り組んだ。①視覚ロドプシンの生化学的・分光学的解析を行うことで、それらが示す低ノイズ性が、タンパク質の構造揺らぎの小ささに由来することを見出した。②ナトリウムポンプ型ロドプシンのカルボン酸残基に変異を導入することで、塩化物イオン依存性のナトリウムポンプ型分子の創成に成功した。
「生物個体・細胞への適用と光操作ツールの開発」に関しては、以下の①~②に取り組んだ。①外向きプロトンポンプロドプシンをがん由来細胞に導入し、in vitroレベルで細胞死を誘導できる手法を開発した。②外向きプロトンポンプロドプシンまたは内向きプロトンポンプロドプシンをバクテリアに導入することで、光でべん毛運動および遊泳を上昇/減少させるシステムを構築した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

動物および微生物由来の多様なロドプシン分子の機能発現系の構築に成功しており、分光学的・生化学的・細胞学的・電気生理学的手法を活用することで、40種類以上のロドプシン分子の性質・機能の解析を実現した。それにより、新しいタイプの分子の同定や機能発現メカニズムの理解が順調に進んでいる。
また、動物および微生物細胞を対象に、ロドプシンの性質を生かした新しいタイプの光操作技術を開発することにも成功している。
以上のように、全ての項目(1)「新奇的なロドプシンの同定」、(2)「ロドプシンの作動原理の理解と新奇ロドプシンの開発」、(3)「生物個体・細胞への適用と光操作ツールの開発」において順調に成果・業績をあげていると考えている。

今後の研究の推進方策

今後も継続して、(1)「新奇的なロドプシンの同定」、(2)「ロドプシンの作動原理の理解と新奇ロドプシンの開発」、(3)「生物個体・細胞への適用と光操作ツールの開発」を進めていきたい。
「新奇的なロドプシンの同定」に関しては、以下に取り組む:これまでにロドプシンの分子解析が進められていない動物種(例:線形動物、緩歩動物)の分子性質・機能を明らかにすることで、新しいタイプの分子の同定を目指す。
「ロドプシンの作動原理の理解と新奇ロドプシンの開発」に関しては、以下に取り組む:これまでに創成した塩化物イオン依存性のナトリウムポンプ型分子の機能発揮メカニズムを分光学的・構造学的解析を通じて明らかにする。メカニズムの理解に基づいてアミノ酸変異を導入し、他のイオン結合型分子や基質イオンを改変した新しいタイプの分子の創成を目指す。
「生物個体・細胞への適用と光操作ツールの開発」に関しては、以下に取り組む:これまでに同定した高活性型Gq共役型分子を活用し、細胞内Ca2+濃度上昇を介して、細胞遊走を制御できる光操作法を開発する。
以上のように、2023年度に得られた知見を活用することで、各項目を並行して進める予定である。

報告書

(1件)
  • 2023 実績報告書
  • 研究成果

    (17件)

すべて 2024 2023

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (13件) (うち招待講演 4件)

  • [雑誌論文] Convergent mechanism underlying the acquisition of vertebrate scotopic vision2024

    • 著者名/発表者名
      Kojima Keiichi、Yanagawa Masataka、Imamoto Yasushi、Yamano Yumiko、Wada Akimori、Shichida Yoshinori、Yamashita Takahiro
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 300 号: 4 ページ: 107175-107175

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2024.107175

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Demonstration of iodide-dependent UVA-triggered growth inhibition in Saccharomyces cerevisiae cells and identification of its suppressive molecules2023

    • 著者名/発表者名
      Ono Ryota、Saeki Nozomu、Kojima Keiichi、Moriya Hisao、Sudo Yuki
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      巻: 677 ページ: 1-5

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2023.07.048

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Nuclear Magnetic Resonance Detection of Hydrogen Bond Network in a Proton Pump Rhodopsin RxR and Its Alteration during the Cyclic Photoreaction2023

    • 著者名/発表者名
      Rika Suzuki, Toshio Nagashima, Keiichi Kojima, Reika Hironishi, Masafumi Hirohata, Tetsuya Ueta, Takeshi Murata, Toshio Yamazaki, Yuki Sudo and Hideo Takahashi
    • 雑誌名

      Journal of the American Chemical Society

      巻: 145 号: 28 ページ: 15295-15302

    • DOI

      10.1021/jacs.3c02833

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Development of light-induced disruptive liposomes (LiDL) as a photoswitchable carrier for intracellular substance delivery2023

    • 著者名/発表者名
      Tsuneishi Taichi、Kojima Keiichi、Kubota Fumika、Harashima Hideyoshi、Yamada Yuma、Sudo Yuki
    • 雑誌名

      Chemical Communications

      巻: 59 号: 49 ページ: 7591-7594

    • DOI

      10.1039/d3cc02056h

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 光受容タンパク質ロドプシンの分光解析と光遺伝学ツール開発2024

    • 著者名/発表者名
      小島慧一
    • 学会等名
      日本薬学会第144年会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 光受容タンパク質・ロドプシンを用いた光操作研究の新展開2024

    • 著者名/発表者名
      小島慧一
    • 学会等名
      日本薬学会第144年会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 光駆動型プロトンポンプロドプシンを用いた光細胞死誘導法による抗腫瘍効果の実証2024

    • 著者名/発表者名
      中尾新, 小島慧一, 劒持直也, 冨樫庸介, 須藤雄気
    • 学会等名
      日本薬学会第144年会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] カエルとヤモリが夜でも色が分かるのはなぜ?2023

    • 著者名/発表者名
      小島慧一
    • 学会等名
      日本比較生理生化学会 第45回大阪大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Optical control of apoptotic cell death by a proton pump rhodopsin2023

    • 著者名/発表者名
      Kojima K, Sudo Y
    • 学会等名
      第 61回日本生物物理学会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 深海熱水噴出孔に棲むツノナシオハラエビ類Rimicaris hybisaeが持つ光受容タンパク質・オプシン類の分子特性解析2023

    • 著者名/発表者名
      小島慧一,長田祐也, 宮本教生, 佐藤恵太, 山中悠嗣, 西村陽介, 吉澤晋, 高井研, 大内淑代, 山下高廣, 須藤雄気
    • 学会等名
      日本動物学会第94回大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Roles of the conserved arginine residue in a proton pumping rhodopsin RxR revealed by solution NMR spectroscopy2023

    • 著者名/発表者名
      Hironishi R, Suzuki R, Hirohata M, Kojima K, Nagashima T, Yamazaki T, Sudo Y, Takahashi H
    • 学会等名
      第 61回日本生物物理学会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Role of Tetramer of Rod Visual Arrestin in the Interaction with Phosphorylated Rhodopsin2023

    • 著者名/発表者名
      Imamoto Y, Kojima K, Oka T, Maeda R, Shichida Y
    • 学会等名
      第 61回日本生物物理学会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Analysis of the physical properties, structure and function of proton-pumped rhodopsin RxR under different membrane-mimetic environments2023

    • 著者名/発表者名
      Kikuma C, Suzuki R, Kojima K, Tokunaga Y, Takeuchi K, Sudo Y, Takahashi H
    • 学会等名
      第 61回日本生物物理学会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Repertoire of visible light-sensitive opsins in the deep-sea hydrothermal vent shrimp Rimicaris hybisae2023

    • 著者名/発表者名
      Nagata Y, Miyamoto N, Sato K, Yamanaka Y, Nishimura Y, Yoshizawa S, Takai K, Ohuchi H, Yamashita T, Sudo Y, Kojima K
    • 学会等名
      第 61回日本生物物理学会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Development of an optical method to control bacterial motility using light-driven proton pumping rhodopsins2023

    • 著者名/発表者名
      Nakanishi K, Kojima K, Sowa Y, Sudo Y
    • 学会等名
      第 61回日本生物物理学会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 単細胞藻類・Vitrella brassicaformisが持つ青色感受性アニオンチャネル(VbACR2)の分子機能解析2023

    • 著者名/発表者名
      小島慧一, 川西志歩, 西村陽介, 長谷川万純, 中尾新, 長田祐也, 吉澤晋, 須藤雄気
    • 学会等名
      第14回 日本生物物理学会中国四国支部大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 光駆動Na+ポンプ型ロドプシンの機能変換と分子進化2023

    • 著者名/発表者名
      栗原眞理恵, 小島慧一, 須藤雄気
    • 学会等名
      第14回 日本生物物理学会中国四国支部大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書

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公開日: 2023-04-18   更新日: 2024-12-25  

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