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シャジクモ藻類の遺伝子機能解析から探る植物多細胞体制の初期進化

研究課題

研究課題/領域番号 23K27230
補助金の研究課題番号 23H02539 (2023)
研究種目

基盤研究(B)

配分区分基金 (2024)
補助金 (2023)
応募区分一般
審査区分 小区分45030:多様性生物学および分類学関連
研究機関神戸大学

研究代表者

坂山 英俊  神戸大学, 理学研究科, 准教授 (60391108)

研究分担者 西山 智明  金沢大学, 疾患モデル総合研究センター, 助教 (50390688)
加藤 将  新潟大学, 人文社会科学系, 特任准教授 (30624738)
池谷 仁里  神戸大学, 理学研究科, 学術研究員 (30531579)
研究期間 (年度) 2024-04-01 – 2027-03-31
研究課題ステータス 交付 (2024年度)
配分額 *注記
18,720千円 (直接経費: 14,400千円、間接経費: 4,320千円)
2026年度: 3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円)
2025年度: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
2024年度: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
2023年度: 7,800千円 (直接経費: 6,000千円、間接経費: 1,800千円)
キーワードシャジクモ藻類 / ストレプト植物 / 多細胞体制 / 遺伝子進化 / ゲノム
研究開始時の研究の概要

陸上植物および各シャジクモ藻類の多細胞体制の進化的関係や初期進化を明らかにするためには、陸上植物祖先のシャジクモ藻類の多細胞体制の発生を司る遺伝子系を明らかにし、陸上植物とシャジクモ藻類を形態と遺伝子のレベルで比較することが必須である。本研究では、シャジクモ類とアオミドロ類において、生殖器官/配偶子嚢の発生を司る遺伝子系に焦点を絞り、陸上植物とその祖先のシャジクモ藻類における発生システムの相同性と相違を順遺伝学と逆遺伝学の両方から解明する。

研究実績の概要

陸上植物および各シャジクモ藻類の多細胞体制の進化的関係や初期進化を明らかにするためには、陸上植物祖先のシャジクモ藻類の多細胞体制の発生を司る遺伝子系を明らかにし、陸上植物とシャジクモ藻類を形態と遺伝子のレベルで比較することが必須である。本研究では、シャジクモ類とアオミドロ類において、生殖器官/配偶子嚢の発生を司る遺伝子系に焦点を絞り、陸上植物とその祖先のシャジクモ藻類における発生システムの相同性と相違を順遺伝学と逆遺伝学の両方から解明する。
本年度は、前年度から引き続き遺伝学的アプローチの実験を進めるとともに、形質転換系の確立と遺伝子機能解析に関する実験を実施した。生体材料として、研究代表者らが概要ゲノムを決定したシャジクモ(Chara braunii)の生態型が異なる交配可能な2系統を用いた。シャジクモは約6週間でプロトネマから接合子形成までの生活環をほぼ同調的に全うする。シャジクモの培養方法は既に確立済みである。アオミドロ類については、独自に野外から採集し、培養株を確立した交配可能な2系統を用いた。アオミドロ類は有性生殖誘導が可能であり、生活環をほぼ同調的に全うする。アオミドロ類の培養方法は既に確立済みである。
シャジクモの幹細胞を標的として、アグロバクテリウム法、マイクロインジェクション法、パーティクルボンバートメント法、エレクトロポレーション法による遺伝子導入の条件と薬剤選抜を検討し、恒常的に外来遺伝子を発現させた形質転換系の確立に向けた条件検討を進めた。アオミドロ類でもシャジクモの場合とほぼ同様の形質転換法を検討した。また、形質転換の実験系の開発と並行して、植物における発生制御遺伝子のシャジクモにおけるホモログに関してクローニング、発現解析、機能解析に関する実験を進めた。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

シャジクモ類とアオミドロ類における突然変異原を用いた突然変異体の分離と交配実験などに関する順遺伝学の研究や形質転換系の確立に関する研究はほとんど報告例がなく、条件検討に多くの時間を要したため、解析が完了していない部分があるが、植物における発生制御遺伝子のシャジクモ藻類におけるホモログの機能解析に関する逆遺伝学の実験は順調に実施出来た。

今後の研究の推進方策

今後は順遺伝学の実験に関しては、条件検討を重ねて効率的な突然変異体の分離と交配、ゲノム解析などに関する実験を進める予定である。逆遺伝学の実験に関しては、アグロバクテリウム法、マイクロインジェクション法、パーティクルボンバートメント法、エレクトロポレーション法による形質転換系の確立および植物における発生制御遺伝子のシャジクモ藻類におけるホモログに関して機能解析に関する実験を進める予定である。

報告書

(2件)
  • 2024 実施状況報告書
  • 2023 実績報告書
  • 研究成果

    (16件)

すべて 2025 2024 2023 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (8件) (うち国際学会 1件、 招待講演 1件) 図書 (3件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Taxonomy, morphology and phylogenetic placement of a new species Nitella pluripapillifera sp. nov. (Charales, Charophyta) from Japan2024

    • 著者名/発表者名
      Sakayama Hidetoshi、Shimizu Misato、Higa Atsushi
    • 雑誌名

      Phycologia

      巻: 63 号: 5 ページ: 480-489

    • DOI

      10.1080/00318884.2024.2400036

    • 関連する報告書
      2024 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Taxonomy, new distribution, and DNA barcoding of the rare alga Chara altaica (Charales, Charophyceae) in Japan2024

    • 著者名/発表者名
      Sakayama Hidetoshi、Omori Yuji、Nozaki Hisayoshi、Kato Syou、Kamiya Kaname、Watanabe Makoto M.
    • 雑誌名

      Journal of Asia-Pacific Biodiversity

      巻: 17 号: 4 ページ: 712-721

    • DOI

      10.1016/j.japb.2024.04.018

    • 関連する報告書
      2024 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 鳥取県における絶滅危惧藻類シラタマモ(シャジクモ目,シャジクモ藻綱)の新産地とDNAバーコーディング2023

    • 著者名/発表者名
      Sakayama, H., Akai, N. and Kamiya, K.
    • 雑誌名

      植物研究雑誌

      巻: 98 号: 5 ページ: 247-253

    • DOI

      10.51033/jjapbot.ID0176

    • ISSN
      0022-2062, 2436-6730
    • 年月日
      2023-10-20
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] シャジクモ藻類の基礎生物学:形態進化とゲノム進化を中心に2023

    • 著者名/発表者名
      坂山英俊
    • 雑誌名

      Algal Resources

      巻: 16 ページ: 17-22

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] シャジクモ藻類シャジクモにおける卵胞子発芽に関する研究2025

    • 著者名/発表者名
      久保田空・坂山英俊
    • 学会等名
      日本藻類学会第49回大会.琉球大学(那覇).
    • 関連する報告書
      2024 実施状況報告書
  • [学会発表] 沖縄県から発見されたシャジクモ類の新種トゲマリフラスコモの形態,系統,分類2025

    • 著者名/発表者名
      坂山英俊・清水美里・比嘉敦
    • 学会等名
      日本藻類学会第49回大会.琉球大学(那覇).
    • 関連する報告書
      2024 実施状況報告書
  • [学会発表] 気生藻類スミレモ類の日本新産種Trentepohlia dialeptaの分類と系統2025

    • 著者名/発表者名
      山下早織・半田信司・溝渕綾・樋口里樹・中原-坪田美保・坪田博美・坂山英俊
    • 学会等名
      日本植物分類学会第24回大会.高知大学(高知).
    • 関連する報告書
      2024 実施状況報告書
  • [学会発表] シャジクモの形質転換系確立に向けての条件検討2024

    • 著者名/発表者名
      佐々木良太・坂山英俊・西山智明・榊原恵子
    • 学会等名
      日本植物学会第88回大会,宇都宮大学(宇都宮).
    • 関連する報告書
      2024 実施状況報告書
  • [学会発表] シャジクモ(Chara braunii)細胞膜Na+共役型リン酸輸送体分子の機能解析2024

    • 著者名/発表者名
      三村徹郎・藤原ひとみ・村西直樹・大西美輪・西山智明・菅野里美・石﨑公庸・深城英弘・坂山英俊・Reid Robert・且原真木
    • 学会等名
      日本植物生理学会第58回年会.神戸国際会議場(神戸)
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 日本における気生藻類スミレモ類の分類と系統に関する研究:日本新産種Trentepohlia dialeptaを中心に2024

    • 著者名/発表者名
      山下早織・半田信司・溝渕綾・坪田博美・坂山英俊
    • 学会等名
      日本藻類学会第48回大会.神戸大学(神戸)
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Structure and regulation of Arabidopsis Myosin XI, MYA22023

    • 著者名/発表者名
      Haraguchi, T., Tamanaha, M., Suzuki, K., Yoshimura, K., Imi, T., Morikawa, T., Shoji, N., Kimura, A., Tominaga, M., Sakayama, H., Nishiyama, T., Iwaki, M., Murata,T. and Ito, K.
    • 学会等名
      The 33rd International Conference on Arabidopsis Research
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ストレプト藻類研究の魅力:シャジクモ,アオミドロを中心に2023

    • 著者名/発表者名
      坂山英俊
    • 学会等名
      日本植物学会第87回大会.北海道大学(札幌)
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [図書] シャジクモ科. 第5次レッドデータブック:絶滅のおそれのある日本の野生生物 藻類 (環境省編).(分担執筆).2025

    • 著者名/発表者名
      坂山英俊
    • 総ページ数
      764
    • 出版者
      環境省
    • 関連する報告書
      2024 実施状況報告書
  • [図書] ストレプト植物における多細胞体制進化.原生生物学事典(矢崎裕規,新倉保,猪飼桂他編)2023

    • 著者名/発表者名
      坂山英俊
    • 総ページ数
      6
    • 出版者
      朝倉書店
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [図書] 車軸藻類.レッドデータブックとっとり第3版2022 -鳥取県の絶滅のおそれのある野生動植物-(松永大,鶴崎展巨他編)2023

    • 著者名/発表者名
      坂山英俊・赤井伸江・神谷要
    • 総ページ数
      6
    • 出版者
      鳥取県生活環境部緑豊かな自然課
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [備考] 生物多様性・進化系統研究室(坂山研)のホームページ

    • URL

      https://sites.google.com/view/sakayama-lab/home

    • 関連する報告書
      2024 実施状況報告書 2023 実績報告書

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公開日: 2023-04-18   更新日: 2025-12-26  

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