| 研究課題/領域番号 |
23K27238
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| 補助金の研究課題番号 |
23H02547 (2023)
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| 研究種目 |
基盤研究(B)
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| 配分区分 | 基金 (2024)
補助金 (2023) |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 審査区分 |
小区分45040:生態学および環境学関連
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| 研究機関 | 東京大学 |
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研究代表者 |
池田 紘士 東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 准教授 (00508880)
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| 研究分担者 |
久保田 耕平 東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 教授 (30272438)
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| 研究期間 (年度) |
2023-04-01 – 2027-03-31
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| 研究課題ステータス |
交付 (2024年度)
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| 配分額 *注記 |
18,460千円 (直接経費: 14,200千円、間接経費: 4,260千円)
2026年度: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2025年度: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2024年度: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円)
2023年度: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
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| キーワード | 昆虫 / 進化 / 飛翔能力 / ゲノム / 遺伝子発現 |
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| 研究開始時の研究の概要 |
飛翔能力の退化は、昆虫全体で広く生じた収れん進化の代表例である。本研究では、種内に飛翔筋の有る個体と無い個体が存在するオオヒラタシデムシをモデルとし、甲虫目における飛翔筋退化の遺伝基盤を明らかにする。飛翔筋の有る個体と無い個体の間でゲノム及び遺伝子発現の比較を行い、飛翔筋退化の遺伝基盤を解明する。さらに、この結果をもとに他の種でも同様の解析を行って種間で比較し、遺伝基盤の共通性を検証する。これにより、甲虫目の多様な系統で生じた飛翔筋の退化は共通の遺伝基盤によってもたらされたのか、を明らかにする。
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| 研究実績の概要 |
本年度は、オオヒラタシデムシを主な調査対象として研究を行った。まず飛翔筋の有る個体と無い個体の両方が生息している千葉県の地点で採集を行い、ゲノム解析に必要なサンプルをピットフォールトラップで採集した。その結果数百個体が得られ、得られたサンプルのうちの10個体程度についてゲノム解析用にDNA抽出を行い、最も多くのDNAが採れたサンプルについてシークエンスを外注した。その結果得られたゲノムデータは良好であったため、これを用いてその後の解析を進めていくこととした。
また、遺伝子発現解析に用いるサンプルを採集するため、まず飛翔筋が有筋もしくは無筋のいずれかに固定されている地点の探索を行った。過去に採集記録があり、いずれかに固定されているという記録のある地点(北海道、宮城県、山形県)を候補としてピットフォールトラップによる採集を行った。その結果、北海道は有筋集団、宮城県は無筋集団であり、山形県は無筋個体が大半を占めるが有筋個体もやや多く現れた。そのため、これらの地点を調査地とすることとした。各地点で採集された幼虫個体を飼育し、まずは遺伝子発現解析に用いるサンプルを得るのに適切なサンプリング間隔を探索するため、終齢幼虫、前蛹、蛹の期間を計測した。この結果から、サンプリングのタイミングを前蛹の2、5日目、蛹の1、3、7、10日目とすることとした。これにもとづいてその後サンプリングを行い、遺伝子発現解析に用いるサンプルを得た。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
野外でのサンプリングは順調に進んでおり、良好なデータも得られつつある。遺伝子発現解析もサンプリングが順調に進んでいる。以上のことから、充分な結果が得られたと考えられる。
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| 今後の研究の推進方策 |
これまでに、当初予定していたサンプルの多くが得られたため、今後は不足している地域の野外調査を行い、採集を進める。得られたゲノムデータについて解析を進める。また、これまでに得られたサンプル、および新たに得られるサンプルに関して遺伝子発現解析を行う。
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