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AIを用い成人末梢血シングルセルデータを参照した小児SLEの免疫遺伝学的特性の解明

研究課題

研究課題/領域番号 23K27574
補助金の研究課題番号 23H02883 (2023)
研究種目

基盤研究(B)

配分区分基金 (2024)
補助金 (2023)
応募区分一般
審査区分 小区分52050:胎児医学および小児成育学関連
研究機関東京女子医科大学

研究代表者

宮前 多佳子  東京女子医科大学, 医学部, 准教授 (90322354)

研究分担者 井上 祐三朗  千葉大学, 大学院医学研究院, 特任准教授 (00456063)
川上 英良  千葉大学, 大学院医学研究院, 教授 (30725338)
藤尾 圭志  東京大学, 医学部附属病院, 教授 (70401114)
遠藤 裕介  公益財団法人かずさDNA研究所, 先端研究開発部, 室長 (80612192)
研究期間 (年度) 2023-04-01 – 2026-03-31
研究課題ステータス 交付 (2024年度)
配分額 *注記
18,720千円 (直接経費: 14,400千円、間接経費: 4,320千円)
2025年度: 5,850千円 (直接経費: 4,500千円、間接経費: 1,350千円)
2024年度: 6,370千円 (直接経費: 4,900千円、間接経費: 1,470千円)
2023年度: 6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
キーワード全身性エリテマトーデス / 小児 / AI / シングルセル / プロテオミクス
研究開始時の研究の概要

小児発症全身性エリテマトーデス(cSLE)の性成熟度別の特徴的表現型と関連する免疫遺伝学的特性を明らかにする.既存成人SLEシングルセルデータをAI次元圧縮した「成人SLE特異的免疫応答パターン」にcSLEデータを参照し「cSLE特異的免疫モジュールパターン」を創出する。cSLE末梢血シングルセルRNA-seq解析を行い、機能データベースImmuNexUTを参照し免疫担当細胞を分類する.eQTL解析を行い、遺伝的高リスク集団の同定を試みる.臨床情報,プロテオミクスデータと「cSLE特異的免疫モジュールパターン」の統合解析によりバイオマーカー候補タンパク質を探索する

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公開日: 2023-04-18   更新日: 2024-08-08  

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