Machine Learning of Disease Biomarkers from B and T cell Receptor Repertoires

• 研究課題/領域番号: 23K28188
• 補助金の研究課題番号: 23H03498 (2023)
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 基金 (2024); 補助金 (2023)
• 応募区分: 一般
• 審査区分: 小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
• 研究機関: 大阪大学
• 研究代表者: Standley Daron 大阪大学, 微生物病研究所, 教授 (00448028)
• 研究期間 (年度): 2023-04-01 – 2026-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2024年度)
• 配分額: 18,720千円 (直接経費: 14,400千円、間接経費: 4,320千円); 2025年度: 5,980千円 (直接経費: 4,600千円、間接経費: 1,380千円); 2024年度: 6,110千円 (直接経費: 4,700千円、間接経費: 1,410千円); 2023年度: 6,630千円 (直接経費: 5,100千円、間接経費: 1,530千円)
• キーワード: immunology / repertoire / machine learning / diagnosis / adaptive immune receptor

研究開始時の研究の概要

Our goal is to develop a novel liquid biopsy that can be applied to a wide range of diseases. The challenge addressed by our method is the fact that no two donors share more than approximately 6% of the BCRs or TCRs in a typical blood sample. With paratope network features we can double the sharing.