動的な微生物活性の評価技術開発：安定同位体基質のRNAへの取り込み定量化

• 研究課題/領域番号: 23K28223
• 補助金の研究課題番号: 23H03533 (2023)
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 基金 (2024); 補助金 (2023)
• 応募区分: 一般
• 審査区分: 小区分63010:環境動態解析関連
• 研究機関: 国立研究開発法人産業技術総合研究所
• 研究代表者: 青柳 智 国立研究開発法人産業技術総合研究所, エネルギー・環境領域, 主任研究員 (10812761)
• 研究分担者: 堀 知行 国立研究開発法人産業技術総合研究所, エネルギー・環境領域, 上級主任研究員 (20509533)
• 研究期間 (年度): 2023-04-01 – 2026-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2024年度)
• 配分額: 18,850千円 (直接経費: 14,500千円、間接経費: 4,350千円); 2025年度: 5,460千円 (直接経費: 4,200千円、間接経費: 1,260千円); 2024年度: 6,370千円 (直接経費: 4,900千円、間接経費: 1,470千円); 2023年度: 7,020千円 (直接経費: 5,400千円、間接経費: 1,620千円)
• キーワード: RNA-SIP / 微生物生態系 / 安定同位体追跡 / 代謝フラックス / 定量Stable Isotope Probing

研究開始時の研究の概要

本研究は研究代表者がこれまで実施してきた環境中の未培養微生物の機能同定技術であるRNA-SIP の安定同位体標識rRNA検出感度を向上させる研究の中で見出した、RNAの同位体標識レベルの差が微生物代謝活性量の違いを反映し得る、という発見に基づき、定量RNA-SIPを開発・適用することで、「微生物生態系の機能や代謝活性を定量的に捉える」ことを可能にするものである。本研究は、これまで環境中の物質の蓄積や存在量の大小でしか評価できていなかったものを、代謝活性の強さや動態（生態系の動的代謝フラックス）からの評価を可能にし、生態系の根本理解や制御に向けたブレークスルーのポイントとなる。