研究課題/領域番号 |
23K28457
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研究種目 |
基盤研究(B)
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配分区分 | 基金 |
応募区分 | 一般 |
審査区分 |
小区分90130:医用システム関連
小区分90140:医療技術評価学関連
合同審査対象区分:小区分90130:医用システム関連、小区分90140:医療技術評価学関連
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研究機関 | 芝浦工業大学 |
研究代表者 |
二井 信行 芝浦工業大学, 工学部, 教授 (10508378)
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研究期間 (年度) |
2024-04-01 – 2026-03-31
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研究課題ステータス |
交付 (2024年度)
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配分額 *注記 |
7,930千円 (直接経費: 6,100千円、間接経費: 1,830千円)
2025年度: 3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円)
2024年度: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
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キーワード | urine cell-free DNA / liquid biopsy / isotachophoresis / fragmentomics |
研究開始時の研究の概要 |
ucfDNAの断片omics解析を目標として,過渡等速電気泳動(tITP)による短鎖で高収率のDNA抽出法,ならびに, 次世代シーケンシング(NGS)にてDNAの断片化状態を損なうことなく解読する方法を開発する.具体的には,申請者がこれまでに構築した過渡等速電気泳動(tITP)による体液からのcfDNA濃縮→分離→抽出技術をベースに,ucfDNAの高収率・短鎖選択的抽出(あるいは精製)技術を確立する.さらに,断片化の情報を残しうる複数のNGSライブラリ調製法を経て得られたucfDNAのシーケンシング結果を統合することで,感染症,とくに結核に特徴的なucfDNAの断片化状態を明らかにする.
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