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精密構造と計算の連携によるマクロファージ遊走阻止因子の炎症シグナル活性機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 23KJ0224
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分基金
応募区分国内
審査区分 小区分43020:構造生物化学関連
研究機関秋田大学

研究代表者

江澤 理徳  秋田大学, 理工学研究科, 特別研究員(DC2)

研究期間 (年度) 2023-04-25 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
1,800千円 (直接経費: 1,800千円)
2024年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
2023年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
キーワードマクロファージ遊走阻止因子 / 炎症性サイトカイン / 中性子結晶構造解析
研究開始時の研究の概要

マクロファージ遊走阻止因子(MIF)は、受容体CD74と結合し炎症反応を惹起するサイトカインであり、関節リウマチ等の自己免疫疾患の増悪に関与することから、潜在的な治療標的となっている。しかし、MIFによるCD74の活性化機構及びMIF阻害剤の作用機構は未解明であることから、それらの機構解明による合理的薬剤設計法の確立が望まれている。本研究では、野生型MIF、MIF変異体及び阻害剤-MIF複合体の中性子結晶構造解析を行う。さらに、得られた中性子結晶構造を用いて、分子動力学シミュレーションによりダイナミクス解析を行うことで、MIFによるCD74の活性化機構及びMIF阻害剤の作用機構の解明を目指す。

研究実績の概要

マクロファージ遊走阻止因子(MIF)は、受容体CD74を活性化することで炎症反応を惹起する炎症性サイトカインであり、関節リウマチ等の自己免疫疾患の増悪に関与することから、潜在的な治療標的となっている。しかし、MIFによるCD74の活性化機構及びMIF阻害剤の作用機序は未解明であることから、MIFを標的とした薬剤の合理的な設計法は確立されていない。本研究では、MIFの水素原子を含む精密構造やダイナミクスに注目して、CD74の活性化機構及びMIF阻害剤の阻害機序の解明を目指している。我々はこれまでに、MIF単体の中性子結晶構造解析により、CD74の活性化に重要と考えられる、MIFの水素結合を介した構造ネットワークの観測に成功している。本年度は、MIF阻害剤によるCD74活性化の阻害機序解明のため、代表的なMIF阻害剤であるISO-1とMIFの複合体の中性子結晶構造解析を行った。MIF単体の結晶を作成した後、ISO-1溶液にソーキングすることでISO-1-MIF複合体の結晶を作成した。得られた結晶を用いて、iBIX BL-03 (J-PARC)において中性子回折測定を行った。さらに、同結晶を用いてPhoton Factory BL-5A (KEK)にてX線回折データを取得した。得られた中性子及びX線回折データを複合解析することで、ISO-1-MIF複合体の水素原子を含む精密構造を決定した。MIF単体とISO-1-MIF複合体の精密構造を比較したところ、ISO-1がMIFに結合すると、MIFの構造ネットワークの変化が起こり、その結果、CD74の活性化が阻害されることが示された。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

ISO-1-MIF複合体の結晶を作成した。得られた結晶のX線及び中性子回折データを収集し、複合解析を行うことで、ISO-1-MIF複合体の精密構造を取得した。MIF単体とISO-1-MIF複合体の精密構造を比較したところ、ISO-1がMIFに結合すると、MIFの構造ネットワークの変化が起こり、その結果、CD74の活性化が阻害されることが示された。MIF及びISO-1-MIF複合体の精密構造を基に、MIFのサイトカイン活性に重要と考えられる残基に対して変異を導入したところ、MIFのサイトカイン活性が変化することを確認した。

今後の研究の推進方策

野生型MIFの結晶化条件を基に、MIF変異体の結晶を作成し、中性子結晶構造解析を行う。得られた野生型MIF、MIF変異体、ISO-1-MIF複合体の中性子結晶構造を用いてMDシミュレーションを行い、MIF構造のダイナミクスやMIF構造内の原子間相関について解析する。

報告書

(1件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 研究成果

    (3件)

すべて 2024 2023

すべて 学会発表 (3件)

  • [学会発表] マクロファージ遊走阻止因子のサイトカイン活性の制御機構解明に向けた中性子結晶構造解析2024

    • 著者名/発表者名
      江澤理徳、刈屋佑美、平野優、日下勝弘、玉田太郎、涌井秀樹、尾髙雅文、松村洋寿
    • 学会等名
      2023年度量子ビームサイエンスフェスタ
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 中性子結晶構造に基づくマクロファージ遊走阻止因子のサイトカイン活性の制御機構解明2023

    • 著者名/発表者名
      江澤理徳、刈屋佑美、平野優、日下勝弘、玉田太郎、涌井秀樹、尾髙雅文、松村洋寿
    • 学会等名
      第49回生体分子科学討論会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 中性子結晶構造に基づく小分子阻害剤によるマクロファージ遊走阻止因子のサイトカイン活性の阻害機構の解明2023

    • 著者名/発表者名
      江澤理徳、刈屋佑美、平野優、日下勝弘、玉田太郎、涌井秀樹、尾髙雅文、松村洋寿
    • 学会等名
      第75回日本生物工学会大会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書

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公開日: 2023-04-26   更新日: 2024-12-25  

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