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脂質の生体組織内三次元分布を可視化する新規ケミカルバイオロジー手法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 23KJ1289
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分基金
応募区分国内
審査区分 小区分37010:生体関連化学
研究機関京都大学

研究代表者

美野 丈晴  京都大学, 工学研究科, 特別研究員(DC2)

研究期間 (年度) 2023-04-25 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
2,800千円 (直接経費: 2,800千円)
2024年度: 1,400千円 (直接経費: 1,400千円)
2023年度: 1,400千円 (直接経費: 1,400千円)
キーワードケミカルバイオロジー / in vivo / 近傍ラベル化 / プロテオミクス / シナプス
研究開始時の研究の概要

我々の身体は、脂質が形成する膜によって、さまざまな生体分子の配置が厳密に制御されることで、生命現象を維持しています。そのため、生命現象をより深く理解するためには、脂質の身体の中での分布を調べる方法が必要ですが、現状限られています。そこで本研究では、脂質の身体での分布をイメージングするための新しい手法を開発します。具体的には、組織透明化技術と、クリックケミストリーを組み合わせることで、身体中の脂質へ蛍光色素を修飾します。ライトシート顕微鏡でこの蛍光を検出することで、脂質分布をイメージング可能となります。採用期間中には、複雑な構造をもつマウス全脳の脂質イメージングを達成し、この手法を実証します。

研究実績の概要

生きたマウス脳内で利用可能なケミカルバイオロジーツールの開発をおこなっている。本研究で開発するツールは、研究代表者が過去に開発した小分子イメージング手法FixELをベースとしている。本年度はまず、FixELの詳細なプロトコルを解説した英語論文を研究代表者が筆頭著者として執筆した。本論文は査読つき国際学術論文誌STAR Protocolsに掲載された。またFixELの詳細な原理を説明した日本語解説文を、研究代表者が筆頭著者として執筆し「生体の科学」誌に掲載された。加えて国内外問わず学会でFixELに関する成果を口頭発表し、その知見を広めた。
当初は脂質に着目し、そのマウス脳内における脂質三次元分布を解析するツールの開発を予定していたが、最近所属研究室内で得られた知見から、より有用と思われるケミカルバイオロジーツールの開発を着想したため、本年度は主にその検討をおこなった。具体的には細菌由来の酵素チロシナーゼが、培養細胞系において近傍ラベル化に利用可能であることが所属研究室内で見出された。このチロシナーゼを生きたマウス脳内で利用し、特定のシナプスの空間プロテオミクスへ展開することを着想した。実際に、標的シナプスに豊富に発現する膜タンパク質に対する選択的リガンドを、チロシナーゼに化学修飾したプローブを用意した。この修飾チロシナーゼを生きたマウス脳内へ直接投与することで、標的シナプス上へチロシナーゼを局在させることに成功した。その後in vivoでの近傍ラベル化反応を生じさせ、質量分析を利用した解析によって、生きたマウス脳内における標的シナプスの空間プロテオームを得ることに成功した。本成果は研究代表者を共著として含む英語論文として、査読つき国際学術論文誌JACSに掲載された。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

本年度は、既存の近傍ラベル化酵素とは異なり、低毒性、迅速、低バックグラウンドの近傍ラベル化が可能な細菌由来のチロシナーゼを初めて、生きたマウス脳内へ適用した。実際に標的シナプスの空間プロテオームを得ることに成功し、国際学術論文誌への掲載にも至った。当初計画していた脂質に関するケミカルバイオロジーツールの開発は実施できていないが、結果的に、より有意義と思われる手法の開発が達成された。

今後の研究の推進方策

チロシナーゼによるin vivo近傍ラベル化のための検討中に確立した、タンパク質への化学修飾技術を応用して、新たなプローブの開発に着手している。具体的には、クライオ電子顕微鏡トモグラフィーを利用した、生体組織上でのタンパク質三次元構造解析に利用可能な、ナノボディ-金粒子複合体の合成をおこなっている。本研究は英国の研究グループとの共同で実施する予定である。

報告書

(1件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 研究成果

    (8件)

すべて 2024 2023

すべて 雑誌論文 (4件) (うち国際共著 1件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 2件)

  • [雑誌論文] 実験講座 組織内の小分子を可視化するFixEL2024

    • 著者名/発表者名
      美野 丈晴、野中 洋、浜地 格
    • 雑誌名

      生体の科学

      巻: 75 号: 1 ページ: 84-89

    • DOI

      10.11477/mf.2425201821

    • ISSN
      0370-9531, 1883-5503
    • 年月日
      2024-02-15
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] Tyrosinase-Based Proximity Labeling in Living Cells and <i>In Vivo</i>2024

    • 著者名/発表者名
      Zhu Hao、Oh Jae Hoon、Matsuda Yuna、Mino Takeharu、Ishikawa Mamoru、Nakamura Hideki、Tsujikawa Muneo、Nonaka Hiroshi、Hamachi Itaru
    • 雑誌名

      Journal of the American Chemical Society

      巻: 146 号: 11 ページ: 7515-7523

    • DOI

      10.1021/jacs.3c13183

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Molecular anchoring and fluorescent labeling in animals compatible with tissue clearing for 3D imaging2024

    • 著者名/発表者名
      Mino Takeharu、Nonaka Hiroshi、Hamachi Itaru
    • 雑誌名

      Current Opinion in Chemical Biology

      巻: -

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Protocol to visualize the distribution of exogenously administered small molecules in the mouse brain2023

    • 著者名/発表者名
      Mino Takeharu、Nonaka Hiroshi、Sakamoto Seiji、Oh Jae Hoon、Hamachi Itaru
    • 雑誌名

      STAR Protocols

      巻: 4 号: 3 ページ: 102555-102555

    • DOI

      10.1016/j.xpro.2023.102555

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Tyrosinase-based proximity labeling in the living mouse brain2024

    • 著者名/発表者名
      Takeharu Mino, Hao Zhu, Oh Jae Hoon, Yuna Matsuda, Itaru Hamachi
    • 学会等名
      ISBC2024
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] FixEL enables trapping small molecules in the brain to visualize their 3D distribution based on PFA-mediated tissue fixation chemistry2023

    • 著者名/発表者名
      Takeharu Mino
    • 学会等名
      Junior Scientist Workshop on Imaging Techniques and Molecular Tools for Biology
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] シナプスプロテオミクスを志向したチロシナーゼによるin vivo近傍タンパク質ラベル化法 Tyrosinase-based proximity labeling in the mouse brain2023

    • 著者名/発表者名
      美野 丈晴, Zhu Hao, Oh Jae, 浜地 格
    • 学会等名
      第17回バイオ関連化学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 組織内の小分子を可視化する FixEL2023

    • 著者名/発表者名
      美野 丈晴
    • 学会等名
      分子夾雑に挑む化学
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書

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公開日: 2023-04-26   更新日: 2024-12-25  

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