• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

分子科学的アプローチによる遺伝子発現の制御と機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 24225005
研究種目

基盤研究(S)

配分区分補助金
研究分野 生体関連化学
研究機関京都大学

研究代表者

杉山 弘  京都大学, 理学研究科, 教授 (50183843)

研究分担者 板東 俊和  京都大学, 理学(系)研究科(研究院), 准教授 (20345284)
遠藤 政幸  京都大学, 学内共同利用施設等, 准教授 (70335389)
連携研究者 ARIVAZHAGAN RAJENDRAN  京都大学, 大学院理学研究科, 研究員 (90723122)
鈴木 勇輝  京都大学, 大学院理学研究科, 研究員 (50636066)
NAMASIVAYAN Ganesh Pandian  京都大学, 物質-細胞統合システム拠点, 特定研究員 (20625446)
佐藤 慎祐  京都大学, 大学院理学研究科, 特定職員
研究協力者 日高 久美  
江村 智子  
橋谷 かおり  
Taylor Rhys D.  
河本 佑介  
朝光 世煌  
谷口 純一  
研究期間 (年度) 2012-05-31 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
212,810千円 (直接経費: 163,700千円、間接経費: 49,110千円)
2016年度: 26,000千円 (直接経費: 20,000千円、間接経費: 6,000千円)
2015年度: 26,260千円 (直接経費: 20,200千円、間接経費: 6,060千円)
2014年度: 56,810千円 (直接経費: 43,700千円、間接経費: 13,110千円)
2013年度: 64,480千円 (直接経費: 49,600千円、間接経費: 14,880千円)
2012年度: 39,260千円 (直接経費: 30,200千円、間接経費: 9,060千円)
キーワード遺伝子発現制御 / エピジェネティックス / 細胞初期化 / Py-Imポリアミド / DNAナノ構造体 / 遺伝子発現 / 初期化 / エピジェネティクス
研究成果の概要

我々は、機能性Py-Imポリアミドを用いてエピジェネティックな遺伝子発現を制御する方法論を開発した。加えて、原子間力顕微鏡(AFM)を用いるDNAフレーム技術によって1分子レベルで分子の挙動を直接可視化することに成功した。これらのケミカルバイオロジー研究技術を組み合わせることによって、DNA構造と機能に基づく化学的なアプローチを通した特異的な遺伝子発現機構の解明に近づくだろう。

評価記号
検証結果 (区分)

A+

評価記号
評価結果 (区分)

A+: 当初目標を超える研究の進捗があり、期待以上の成果が見込まれる

報告書

(9件)
  • 2017 研究進捗評価(検証) ( PDF )
  • 2016 研究成果報告書 ( PDF )
  • 2015 実績報告書   研究概要(研究進捗評価) ( PDF )   研究進捗評価(評価結果) ( PDF )
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 2012 実績報告書
  • 研究成果発表報告書
  • 研究成果

    (81件)

すべて 2016 2015 2014 2013 2012 その他

すべて 雑誌論文 (62件) (うち国際共著 6件、 査読あり 62件、 オープンアクセス 9件、 謝辞記載あり 20件) 学会発表 (14件) (うち国際学会 3件、 招待講演 6件) 備考 (2件) 産業財産権 (3件) (うち外国 2件)

  • [雑誌論文] Lipid-bilayer-assisted two-dimensional self-assembly of DNA origami nanostructures2015

    • 著者名/発表者名
      Yuki Suzuki, Masayuki Endo, Hiroshi Sugiyama
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 6 号: 1 ページ: 8052-8052

    • DOI

      10.1038/ncomms9052

    • NAID

      120005649314

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Single-MolecSingle-Molecule Visualization of the Zn2+-Dependent DNAzyme Functions2015

    • 著者名/発表者名
      M. Endo Y. Takeuchi, Y. Suzuki, T. Emura, K. Hidaka, F. Wang, I. Willner, H. Sugiyama
    • 雑誌名

      Angewandte Chemie, International Edition

      巻: 54 号: 36 ページ: 10550-10554

    • DOI

      10.1002/anie.201504656

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Direct visualization of walking motions of a photo-controlled DNA nanomachine on the DNA nanostructure2015

    • 著者名/発表者名
      Y. Yang, M. Goetzfried, K. Hidaka, M. You, W. Tan, H. Sugiyama, M. Endo
    • 雑誌名

      Nano Letters

      巻: 15 号: 10 ページ: 6672-6676

    • DOI

      10.1021/acs.nanolett.5b02502

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Single-Molecule Manipulation of the Duplex Formation and Dissociation at the G-quadruplex/i-motif Site in the DNA Nanostructure2015

    • 著者名/発表者名
      M. Endo, X. Xing, X. Zhou, T. Emura, K. Hidaka, B. Tuesuwan, H. Sugiyama
    • 雑誌名

      ACS Nano

      巻: 9 号: 10 ページ: 9922-9929

    • DOI

      10.1021/acsnano.5b03413

    • NAID

      120006462492

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Linking Two DNA Duplexes with a Rigid Linker for DNA Nanotechnology2015

    • 著者名/発表者名
      R. Tashiro, M. Iwamoto, H. Morinaga, T. Emura, K. Hidaka, M. Endo, H. Sugiyama
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 43 号: 14 ページ: 6692-6700

    • DOI

      10.1093/nar/gkv662

    • NAID

      120005818257

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] A novel detection technique of polyamide binding sites by photo-induced electron transfer in BrU substituted DNA2015

    • 著者名/発表者名
      Saha, A., Hashiya, F., Kizaki, S., Asamitsu, S., Hashiya, K., Bando, T., Sugiyama, H.
    • 雑誌名

      Chem. Commun.

      巻: 51 号: 77 ページ: 14485-14488

    • DOI

      10.1039/c5cc05104e

    • NAID

      120006462491

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Selective Targeting of the KRAS Codon 12 Mutation Sequence by Pyrrole–Imidazole Polyamide seco-CBI Conjugates.2015

    • 著者名/発表者名
      Taylor RD, Chandran A, Kashiwazaki G, Hashiya K, Bando T, Nagase H and Sugiyama H.
    • 雑誌名

      Chemistry.

      巻: 21 号: 42 ページ: 14996-5003

    • DOI

      10.1002/chem.201501870

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] A synthetic transcriptional activator of genes associated with retina in human dermal fibroblasts2015

    • 著者名/発表者名
      J. Syed, C. Anandhakumar, Ganesh N. Pandian, J. Taniguchi, S. Sato, K. Hashiya, G. Kashiwazaki, T. Bando, and H. Sugiyama
    • 雑誌名

      ChemBioChem

      巻: In press 号: 10 ページ: 1497-1501

    • DOI

      10.1002/cbic.201500140

    • NAID

      120005670900

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Preclinical Study of Novel Gene Silencer Pyrrole-Imidazole Polyamide Targeting Human TGF-β1 Promoter for Hypertrophic Scars in a Common Marmoset Primate Model.2015

    • 著者名/発表者名
      Igarashi J, Fukuda N, Inoue T, Nakai S, Saito K, Fujiwara K, Matsuda H, Ueno T, Matsumoto Y, Watanabe T, Nagase H, Bando T Sugiyama H Itoh T Soma M.
    • 雑誌名

      PlosOne.

      巻: 10(5) 号: 5 ページ: e0125295-e0125295

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0125295

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Integrating epigenetic modulators into NanoScript for enhanced chondrogenesis of stem cells2015

    • 著者名/発表者名
      S. Patel, T. Pongkulapa, P. Yin, Ganesh N. Pandian, C. Rathnam, T. Bando, T. Vaijayanthi, H. Sugiyama and K-B. Lee.
    • 雑誌名

      Journal of the American Chemical Society (ACS Publications)

      巻: 137 号: 14 ページ: 4598-4601

    • DOI

      10.1021/ja511298n

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Tandem trimer pyrrole-imidazole polyamide probes targeting 18 base pairs in human telomere sequences2015

    • 著者名/発表者名
      Yusuke Kawamoto, Asuka Sasaki, Kaori Hashiya, Satoru Ide, Toshikazu Bando, Kazuhiro Maeshima, Hiroshi Sugiyama
    • 雑誌名

      Chemical Science

      巻: 6 号: 4 ページ: 2307-2312

    • DOI

      10.1039/c4sc03755c

    • NAID

      120005841416

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Rational design of specific binding hairpin Py-Im polyamides targeting human telomere sequences.2015

    • 著者名/発表者名
      Guo, C. X ., Kawamoto, Y., Asamitsu, S., Sawatani, Y., Hashiya, K., Bando, T., Sugiyama, H.
    • 雑誌名

      Bioorg. Med. Chem.

      巻: 23 号: 4 ページ: 855-860

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2014.12.025

    • NAID

      120005555482

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] A Synthetic DNA-binding Domain Guides Distinct Chromatin-modifying Small Molecules to Activate an Identical Gene Network.2015

    • 著者名/発表者名
      Han, L., Pandian, G, N., Chandran, A., Sato, S., Taniguchi, J., Kashiwazaki, G., Sawatani, Y., Hashiya, K., Bando, T., Xu, Y., Qian, X., Sugiyama, H.
    • 雑誌名

      Angew. Chem. Int. Ed.

      巻: 54 号: 30 ページ: 8700-8703

    • DOI

      10.1002/anie.201503607

    • NAID

      120006460099

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Inhibition of KRAS codon 12 mutants using a novel DNA-alkylating pyrrole-imidazole polyamide conjugate.2014

    • 著者名/発表者名
      Hiraoka K, Inoue T, Taylor RD, Watanabe T, Koshikawa N, Yoda H, Shinohara K, Takatori A, Sugimoto H, Maru Y, Denda T, Fujiwara K, Balmain A, Ozaki T, Bando T, Sugiyama H, Nagase H.
    • 雑誌名

      Nat. Commun.

      巻: 6 号: 1 ページ: 6706-6706

    • DOI

      10.1038/ncomms7706

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Specific Alkylation of Human Telomere Repeat Sequences by a Tandem-Hairpin Motif of Pyrrole-Imidazole Polyamides with Indole-Seco-CBI2014

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto, M.; Bando, T.; Kawamoto, Y.; Taylor, R. D.; Hashiya, K.; Sugiyama, H.
    • 雑誌名

      Bioconjugate Chem.

      巻: 25 号: 3 ページ: 552-559

    • DOI

      10.1021/bc400567m

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Sequence-specific DNA Alkylation by Tandem Py-Im Polyamide Conjugates.2014

    • 著者名/発表者名
      Taylor, R, D.; Kawamoto, Y.; Hashiya, K.; Bando, T.; Sugiyama, H.
    • 雑誌名

      Chem. Asian J.

      巻: 9 号: 9 ページ: 2527-2533

    • DOI

      10.1002/asia.201402331

    • NAID

      120005647509

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Chemical Modification of a Synthetic Small Molecule Boosts its Biological Efficacy against Pluripotency Genes in Mouse Fibroblast.2014

    • 著者名/発表者名
      Saha, A.; Pandian, G. N.; Sato, S.; Taniguchi, J.; Kawamoto, Y.; Hashiya, K.; Bando, T.; Sugiyama, H.
    • 雑誌名

      ChemMedChem

      巻: 9 号: 10 ページ: 2374-2380

    • DOI

      10.1002/cmdc.201402117

    • NAID

      120005657928

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Sequence-Specific DNA Alkylation and Transcriptional Inhibition by Long-Chain Hairpin Pyrrole-Imidazole Polyamide-Chlorambucil Conjugates Targeting CAG/CTG Trinucleotide Repeats.2014

    • 著者名/発表者名
      Asamitsu, S.; Kawamoto, Y.; Hashiya, F.; Hashiya, K.; Yamamoto, M.; Kizaki, S.; Bando, T.; Sugiyama, H.
    • 雑誌名

      Bioorg. Med. Chem.

      巻: 22 号: 17 ページ: 4646-4657

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2014.07.019

    • NAID

      120005474526

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Targeted Suppression of EVI1 Oncogene Expression by Sequence-Specific Pyrrole-imidazole Polyamide2014

    • 著者名/発表者名
      Junetha, S.; Pandian, G, N.; Sato, S.; Taniguchi, J.; Anandhakumar, C.; Hashiya, K.; Bando, T.; Sugiyama, H.
    • 雑誌名

      Chem. Biol.

      巻: 23 号: 10 ページ: 1370-1380

    • DOI

      10.1016/j.chembiol.2014.07.019

    • NAID

      120005512270

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural Evaluation of Tandem Hairpin Pyrrole-Imidazole Polyamides Recognizing Human Telomeres.2014

    • 著者名/発表者名
      Akiyoshi Hirata, Kiyoshi Nokihara, Yusuke Kawamoto, Toshikazu Bando, Asuka Sasaki, Satoru Ide, Kazuhiro Maeshima, Takeshi Kasama, and Hiroshi Sugiyama
    • 雑誌名

      Journal of the American Chemical Society

      巻: 136 号: 32 ページ: 11546-11554

    • DOI

      10.1021/ja506058e

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] NanoScript: A Nanoparticle-Based Artificial Transcription Factor for Effective Gene Regulation.2014

    • 著者名/発表者名
      Patel, S.; Jung, D.; Yin, P.; Carlton, P.; Yamamoto, M.; Bando, T.; Sugiyama, H.; Lee, K, B.
    • 雑誌名

      ACS Nano.

      巻: 8 号: 9 ページ: 8959-8967

    • DOI

      10.1021/nn501589f

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Next-Generation Sequencing Studies Guide the Design of Pyrrole-Imidazole Polyamides with Improved Binding Specifictiy by the Addition of β-alanine.2014

    • 著者名/発表者名
      Anandhakumar, C.; Li, Y.; Kizaki, S.; Pandian, G. N.; Hashiya, K.; Bando, T.; Sugiyama, H.
    • 雑誌名

      ChemBioChem

      巻: 15 号: 18 ページ: 2647-2651

    • DOI

      10.1002/cbic.201402497

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of a Small Molecule that Turns `ON` the Pluripotency Gene Circuitry in Human Fibroblasts.2014

    • 著者名/発表者名
      Pandian, G, N.; Sato, S.; Anandhakumar, C.; Taniguchi, J.; Takashima, K.; Syed, J; Han, L.; Saha, A.; Bando, T.; Nagase, H.; Sugiyama, H.
    • 雑誌名

      ACS Chem. Biol.

      巻: 9 号: 12 ページ: 2729-2736

    • DOI

      10.1021/cb500724t

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] DNA Origami Based Visualization System for Studying Site-Specific Recombination Events2014

    • 著者名/発表者名
      Y. Suzuki, M. Endo, Y. Katsuda, K. Ou, K. Hidaka, H. Sugiyama
    • 雑誌名

      Journal of the American Chemical Society

      巻: 136(1) 号: 1 ページ: 211-218

    • DOI

      10.1021/ja408656y

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書 2013 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Helical DNA origami tubular structures with various sizes and arrangements2014

    • 著者名/発表者名
      M. Endo, S. Yamamoto, T. Emura, K. Hidaka, N. Morone, J. E. Heuser, H. Sugiyama
    • 雑誌名

      Angewandte Chemie, International Edition

      巻: 53 号: 29 ページ: 7484-7490

    • DOI

      10.1002/anie.201402973

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Single-molecule mechanochemical sensing using DNA origami nanostructures2014

    • 著者名/発表者名
      D. Koirala, P. Shrestha, T. Emura, K. Hidaka, S. Mandal, M. Endo, H. Sugiyama, H. Mao
    • 雑誌名

      Angewandte Chemie, International Edition

      巻: 53 号: 31 ページ: 8137-8141

    • DOI

      10.1002/anie.201404043

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Direct and single-molecule visualization of the solution-state structures of G-hairpin and G-triplex intermediates2014

    • 著者名/発表者名
      A. Kajendran, M. Endo, K. Hidaka. H. Sugivama
    • 雑誌名

      Angew. Chem. Int. Ed.

      巻: 53 号: 16 ページ: 4107-4112

    • DOI

      10.1002/anie.201308903

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] State-of-the Art High Speed Atomic Force Microscopy for the Investigation of Single-Molecular Dynamics of Proteins2014

    • 著者名/発表者名
      A. Rajendran, M. Endo, H. Sugiyama
    • 雑誌名

      Chemical Reviews

      巻: 114(2) 号: 2 ページ: 1493-1520

    • DOI

      10.1021/cr300253x

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Construction and Characterization of Cy3- or Cy5-Conjugated Hairpin Pyrrole / Imidazole Polyamide Binding to DNA in the Nucleosome2014

    • 著者名/発表者名
      Han, Y-W.; Tsunaka, Y.; Yokota, H.; Matsumoto, T.; Kashiwazaki, G.; Morinaga, H.; Hashiya, K.; Bando, T.; Sugiyama, H.; Harada, Y.
    • 雑誌名

      Biomater. Sci.

      巻: 2 号: 3 ページ: 297-307

    • DOI

      10.1039/c3bm60202h

    • NAID

      120005587835

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Sequence-Specific DNA Recognition by Dimerized Cysteine Cyclic Pyrrole-Imidazole Polyamides2014

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto, M.; Bando, T.; Morinaga, N.; Kawamoto, Y.; Hashiya, K.; Sugiyama, H.
    • 雑誌名

      Chem. Eur. J.

      巻: 20 号: 3 ページ: 752-759

    • DOI

      10.1002/chem.201302482

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Controlling Electron Rebound Within Four-Base Pi-Stacks in Z-DNA by Changing Sugar Moiety from Deoxy- to Ribonucleotide2014

    • 著者名/発表者名
      Sannohe, Y.; Kizaki, S.; Kanesato, S.;Fujiwara, A.;Morinaga, H.; Tashiro, R.;Sugiyama, H.
    • 雑誌名

      Chem. Eur. J.

      巻: 20 号: 5 ページ: 1223-1225

    • DOI

      10.1002/chem.201303930

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Highly Emissive Deoxyguanine Analogue Capable of Direct Visualization of B-Z Transition2014

    • 著者名/発表者名
      Park, S.; Otomo, H.; Zheng, L.; Sugiyama, H.
    • 雑誌名

      Chem. Comm.

      巻: 50 号: 13 ページ: 1573-1575

    • DOI

      10.1039/c3cc48297a

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Distinct DNA-based epigenetic switches trigger differential transcriptional activation in human dermal fibroblasts2014

    • 著者名/発表者名
      Pandian GN, Nagase H
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 4 号: 1 ページ: 3843-3843

    • DOI

      10.1038/srep03843

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Long-Loop G-Quadruplexes are Misfolded Population Minorities with Fast Transition Kinetics in Human Telomeric Sequences2013

    • 著者名/発表者名
      Koirala, D.; Ghimire, C.; Bohrer, C.; Sannohe, Y.; Sugiyama, H.; Mao, H.
    • 雑誌名

      J. Am. Chem. Soc.

      巻: 135 号: 6 ページ: 2235-2241

    • DOI

      10.1021/ja309668t

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Sequence-specific electron injection into DNA from an intermolecular electron donor2013

    • 著者名/発表者名
      Morinaga H, Takenaka T, Hashiya F, Kizaki S, Hashiya K, Toshikazu B, Sugiyama H.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res.

      巻: (印刷中) 号: 8 ページ: 4724-4728

    • DOI

      10.1093/nar/gkt123

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Synthesis and Biological Evaluation of a Targeted DNA-Binding Transcriptional Activator with HDAC8 Inhibitory Activity2013

    • 著者名/発表者名
      Saha, A.; Pandian, G. N.; Sato, S.; Taniguchi, J.; Hashiya, K.; Bando, T.;Sugiyama, H.
    • 雑誌名

      Bioorg. Med. Chem.

      巻: 21 号: 14 ページ: 4201-4209

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2013.05.002

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Solid-Supported DNA for Asymmetric Synthesis: a Stepping-Stone toward Practical Applications2013

    • 著者名/発表者名
      Han, Y-W.; Kashiwazaki, G.; Morinaga, H.; Matsumoto, T.; Hashiya, K.; Bando, T.; Sugiyama, H.
    • 雑誌名

      Bioorg. Med. Chem.

      巻: 21 号: 17 ページ: 5436-5441

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2013.06.005

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Solid-Supported DNA for Asymmetric Synthesis: a Stepping-Stone toward Practical Applications2013

    • 著者名/発表者名
      Park, S.; Ikehata, K.;Sugiyama, H.
    • 雑誌名

      Biomater. Sci.

      巻: 1 号: 10 ページ: 1034-1036

    • DOI

      10.1039/c3bm60134j

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Controlling the Stoichiometry and Strand Polarity of a Tetramolecular G-quadruplex Structure by Using a DNA Origami Frame2013

    • 著者名/発表者名
      A. Rajendran, M. Endo, K. Hidaka, P. L. T. Tran, J-L. Mergny, H. Sugiyama
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 41(18) 号: 18 ページ: 8738-8747

    • DOI

      10.1093/nar/gkt592

    • NAID

      120005347132

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] A Synthetic Small Molecule Enforces Targeted Transcriptional Activation of Germ Cell Genes in a Human Somatic Cell.2013

    • 著者名/発表者名
      Han L, Pandian GN, Junetha S, Sato S, Anandhakumar C, Taniguchi J, Saha A, Bando T, Nagase H and Sugiyama H.
    • 雑誌名

      Angewandte Chemie

      巻: 52 号: 50 ページ: 13410-13413

    • DOI

      10.1002/anie.201306766

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural Evaluation of Tandem Hairpin Pyrrole-Imidazole Polyamides Recognizing Human Telomeres.2013

    • 著者名/発表者名
      Yusuke Kawamoto, Toshikazu Bando, Fukumi Kamada, Yue Li, Kaori Hashiya, Kazuhiro Maeshima, and Hiroshi Sugiyama
    • 雑誌名

      Journal of the American Chemical Society

      巻: 135 号: 44 ページ: 16468-77

    • DOI

      10.1021/ja406737n

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Clinical-Grade iPS Cells: Need For Versatile Small Molecules and Optimal Cell Sources2013

    • 著者名/発表者名
      Wu, Y-L.; Pandian, G. N.; Ding, Y-P.;Zhang, W.; Tanaka, Y.; Sugiyama, H.
    • 雑誌名

      Chem. Biol.

      巻: 20 号: 11 ページ: 1311-1322

    • DOI

      10.1016/j.chembiol.2013.09.016

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Regulation of B-Z Conformational Transition and Complex Formation with a Z-form-binding Protein by Introduction of Constraint to Double-stranded DNA using DNA Nanoscaffold2013

    • 著者名/発表者名
      M. Endo, M. Inoue, Y. Suzuki, C. Masui, H. Morinaga, K. Hidaka, H. Sugiyama
    • 雑誌名

      Chemistry A European Journal

      巻: 19(50) 号: 50 ページ: 16887-16890

    • DOI

      10.1002/chem.201303830

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] HIV-I nucleocapsid proteins as molecular chaperones for tetramolecular antiparallel G-quadruplex formation2013

    • 著者名/発表者名
      A. Rajendran, M. Endo, K. Hidaka, P. L. T. Tran. J. -L.
    • 雑誌名

      J. Am. Chem. Soc.

      巻: 135 号: 49 ページ: 18575-18585

    • DOI

      10.1021/ja409085j

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Sequence-Specific DNA Alkylation Targeting for Kras Codon 13 Mutation by Pyrrole-Imidazole Polyamide seco-CBI Conjugates2013

    • 著者名/発表者名
      Taylor RD, Asamitsu S, Takenaka T, Yamamoto M, Hashiya K, Kawamoto Y, Bando T, Nagase H, Sugiyama H
    • 雑誌名

      Chemistry

      巻: 20 号: 5 ページ: 1310-1317

    • DOI

      10.1002/chem.201303295

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] RNA-templated DNA origami structures2013

    • 著者名/発表者名
      M. Endo, S. Yamamoto, K. Tatsumi, T. Emura, K. Hidaka, H. Sugiyama
    • 雑誌名

      Chemical Communications

      巻: 49 号: 28 ページ: 2879-2881

    • DOI

      10.1039/c3cc38804b

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Direct and real-tine observation of rotary movement of a DNA nanomechanical device2013

    • 著者名/発表者名
      A. Rajendran, M. Endo, K. Hidaka, H. Sugiyama
    • 雑誌名

      J.Am, Chem. Soc.

      巻: 135 号: 3 ページ: 1117-1123

    • DOI

      10.1021/ja310454k

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Design of a New Fluorescent Probe: Pyrrole/Imidazole Hairpin Polyamides with Pyrene Conjugation at Their γ-Turn2013

    • 著者名/発表者名
      Vaijayanthi, T.; Bando, T.; Hashiya, K.; Pandian, G. N.; Sugiyama, H.
    • 雑誌名

      Bioorg. Med. Chem.

      巻: 21 号: 4 ページ: 852-855

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2012.12.018

    • NAID

      120005241442

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Control of the two-dimensional crystallization of DNA origami with various loop arrangements2013

    • 著者名/発表者名
      A. Rajendran, M. Endo, K. Hidaka, H. Sugiyaia
    • 雑誌名

      Chem. Commun.

      巻: 49 号: 7 ページ: 686-688

    • DOI

      10.1039/c2cc37257f

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] DNA origami technology for biomaterials application2013

    • 著者名/発表者名
      Endo, M., Yang, Y., Sugiyama, H.
    • 雑誌名

      Biomaterial Science

      巻: 1 号: 4 ページ: 347-360

    • DOI

      10.1039/c2bm00154c

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Strategies to Tinker with Heritable Epigenetic Defects in Cellular Machinery: Lessons from Nature2013

    • 著者名/発表者名
      Pandian, G. N.; Sugiyama, H.
    • 雑誌名

      Pharmaceuticals

      巻: 6 号: 1 ページ: 1-24

    • DOI

      10.3390/ph6010001

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Photoreactivities of 5-Bromouracil-containing RNAs2013

    • 著者名/発表者名
      Morinaga H, Kizaki S, Takenaka T, Kanesato S, Sannohe Y, Tashiro R, Sugiyama H.
    • 雑誌名

      Bioorg Med Chem

      巻: 21 号: 2 ページ: 466-469

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2012.11.010

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A synthetic small molecule for rapid induction of multiple pluripotency genes in mouse embryonic fibroblasts2012

    • 著者名/発表者名
      Pandian GN, Nakano Y, Sato S, Morinaga H, Bando T, Nagase H, Sugiyama H
    • 雑誌名

      Sci Rep

      巻: 2:544 号: 1 ページ: 544-544

    • DOI

      10.1038/srep00544

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Synthesis of Pyrrole-Imidazole Polyamide Seco-CBI Conjugates with a Vinyl Linker recognizing 7 bp DNA sequence.2012

    • 著者名/発表者名
      Takagaki, T.; Bando, T.; Sugiyama, H.
    • 雑誌名

      J. Am. Chem. Soc.

      巻: 135 号: 31 ページ: 13074-13081

    • DOI

      10.1021/ja3044294

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Photo-controllable DNA Origami Nanostructures Assembling into Predesigned Multiorientational Patterns2012

    • 著者名/発表者名
      Y. Yang, M. Endo, K. Hidaka, H. Sugiyama
    • 雑誌名

      Journal of the American Chemical Society

      巻: 134 号: 51 ページ: 20645-20653

    • DOI

      10.1021/ja307785r

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Binding of hairpin pyrrole and imidazole polyamides to DNA : relationship between torsion angle and association rate constants2012

    • 著者名/発表者名
      Han YW, Matsumoto T, Yokota H, Kashiwazaki G, Morinaga H, Hashiya K, Bando T, Harada Y, Sugiyama H.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res

      巻: 40 号: 22 ページ: 11510-11517

    • DOI

      10.1093/nar/gks897

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Progress and Prospects of Pyrrole-Imidazole Polyamide-Fluorophore Conjugate as Sequence-Selective DNA Probes2012

    • 著者名/発表者名
      Vaijayanthi, T.; Bando, T.; Pandian, G. N.; Sugiyama, H.
    • 雑誌名

      ChemBioChem

      巻: 13 号: 15 ページ: 2170-2185

    • DOI

      10.1002/cbic.201200451

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Direct Visualization of the Movement of a Single T7 RNA Polymerase and Transcription on a DNA Nanostructure2012

    • 著者名/発表者名
      M. Endo, K. Tatsumi, K. Terushima, Y. Katsuda, K. Hidaka, Y. Harada, H. Sugiyama
    • 雑誌名

      Angewandte Chemie, International Edition

      巻: 51 号: 35 ページ: 8778-8782

    • DOI

      10.1002/anie.201201890

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Single-Molecule Visualization of the Hybridization and Dissociation of Photoresponsive Oligonucleotides and Their Reversible Switching Behavior in a DNA Nanostructure2012

    • 著者名/発表者名
      M. Endo, Y. Yang, Y. Suzuki, K. Hidaka, H. Sugiyama
    • 雑誌名

      Angewandte Chemie, International Edition

      巻: 51 号: 42 ページ: 10518-10522

    • DOI

      10.1002/anie.201205247

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Programmable Genetic Switiches to Control Transcrpitional Machinery of Pluripotency2012

    • 著者名/発表者名
      Pandian, G. N.; Sugiyama, H.
    • 雑誌名

      Biotechnol. J.

      巻: 7 号: 6 ページ: 798-809

    • DOI

      10.1002/biot.201100361

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure and Functional Analysis of Proteins by High-Speed Atomic Force Microscopy2012

    • 著者名/発表者名
      A. Rajendran, M. Endo, H. Sugiyama
    • 雑誌名

      Advances in Protein Chemistry and Structural Biology

      巻: 87 ページ: 5-55

    • DOI

      10.1016/b978-0-12-398312-1.00002-0

    • ISBN
      9780123983121
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Development of Programmable Small DNA-Binding Molecules with Epigenetic Activity for Induction of Core Pluripotency Genes2012

    • 著者名/発表者名
      Pandian, G. N.; Ohtsuki, A.; Bando, T.; Sato, S.; Hashiya, K.; Sugiyama, H.
    • 雑誌名

      Bioorg. Med. Chem.

      巻: 20 号: 8 ページ: 2656-2660

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2012.02.032

    • NAID

      120004025596

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Identification of genomic targets of DNA binding small molecules using next generation sequencing2015

    • 著者名/発表者名
      Anandhakumar Chandran, Rhys Taylor, Junetha Syed Jabarulla, Shinsuke Sato, Gengo Kashiwazaki, Toshikazu Bando, Hiroshi Sugiyama
    • 学会等名
      The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies 2015 (PACIFICHEM 2015)
    • 発表場所
      Honolulu, Hawaii, USA
    • 年月日
      2015-12-18
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Synthetic transcriptional activator of genes associated with retina in human dermal fibroblasts2015

    • 著者名/発表者名
      Junetha Syed Jabarulla, Anadhakumar Chandran, Ganesh Namasivayam Pandian, Junichi Taniguchi, Shinsuke Sato, Kaori Hashiya, Gengo Kashiwazaki, Toshikazu Bando, Hirosi Sugiyama
    • 学会等名
      The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies 2015 (PACIFICHEM 2015)
    • 発表場所
      Honolulu, Hawaii, USA
    • 年月日
      2015-12-18
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 小分子化合物によるOct3/4遺伝子発現の活性化2015

    • 著者名/発表者名
      佐藤慎祐、朝光世煌、Thangavel Vaijayanthi, Namasivayam Ganesh Pandian、谷口純一、Junetha Syed Jabarulla, Anandhakumar Chandran, Tingting Zou, Yulei Wei、橋谷かおり、板東俊和、杉山弘
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会・第88回日本生化学会大会合同大会(BMB2015)
    • 発表場所
      神戸市
    • 年月日
      2015-12-03
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Sequence selective electron injection into the DNA using pyrrole imidazole polyamide: a novel approach for determining sequence selectivity2014

    • 著者名/発表者名
      Abhijit Saha、橋谷 文貴、木崎 誠一朗、Yue Li、板東 俊和、杉山 弘
    • 学会等名
      第36回日本光医学・光生物学会
    • 発表場所
      豊中市、大阪大学
    • 年月日
      2014-07-26
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] エピジェネティック活性を有する小分子化合物を用いた遺伝子発現制御2014

    • 著者名/発表者名
      谷口純一、Namasivayam Ganesh Pandian、Junetha Syed、佐藤慎祐、Le Han、板東俊和、杉山弘
    • 学会等名
      日本ケミカルバイオロジー学会第9回年会
    • 発表場所
      豊中市、大阪大学
    • 年月日
      2014-06-13
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Dynamic Assembly/Disassembly Processes of Photoresponsive DNA Origami Nanostructures Directly Visualized on a Lipid Membrane Surface2014

    • 著者名/発表者名
      Yuki Suzuki, Masayuki Endo, Yangyang Yang, Hiroshi Sugiyama
    • 学会等名
      Foundations of Nanoscience Meeting (FNANO14)
    • 発表場所
      Snowbird, Utah, USA
    • 年月日
      2014-04-17
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Chemical Biology that Controls Structure and Function of DNA2013

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Sugiyama
    • 学会等名
      A3RONA 2013 Japan
    • 発表場所
      神戸
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Chemical Biology that Controls Structure and Function:DNA Origami and Artifitial Genetic Switch2013

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Sugiyama
    • 学会等名
      The 8th National Conference on Chemical Biology of China
    • 発表場所
      Shanghai, China
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Chemical Biology that Controls Structure and Function:DNA Origami and Artifitial Genetic Switch2013

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Sugiyama
    • 学会等名
      第51回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      京都
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Chemical Biology that Controls DNA Structure and Function : DNA Origami and Artificial Genetic Switch2013

    • 著者名/発表者名
      Sugiyama, H.
    • 学会等名
      International Symposium on Challenges in Chemical Biology, CSIR-Indian Institute of Chemical Biology
    • 発表場所
      Kolkata, India
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] DNA Origami and Artificial Genetic Switch2012

    • 著者名/発表者名
      Sugiyama, H.
    • 学会等名
      TSRC(Telluride Science Research Center) Workshops, Nucleic Acid Topics, Telluride, USA
    • 発表場所
      Telluride, CO, USA
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Cell Reprogramming by SAHA-Polyamide Conjugate2012

    • 著者名/発表者名
      Sugiyama, H.
    • 学会等名
      The 39th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
    • 発表場所
      Nagoya, Japan
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Chemical Biology of Nucleic Acids2012

    • 著者名/発表者名
      Sugiyama, H
    • 学会等名
      4th EuCheMS Chemistry Congress
    • 発表場所
      Prague, Czech
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Chemical Biology that Controls DNA Structure and Function2012

    • 著者名/発表者名
      Sugiyama, H.
    • 学会等名
      17th Malaysian Chemical Congress(17MCC)
    • 発表場所
      Kuala Lumpure, Malaysia
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [備考] 京都大学大学院理学研究科 化学専攻 生物化学分科

    • URL

      http://kuchem.kyoto-u.ac.jp/chembio/

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書 2014 実績報告書
  • [備考] 京都大学大学院理学研究科 化学専攻、生物化学分科

    • URL

      http://kuchem.kyoto-u.ac.jp/chembio

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [産業財産権] ドライバーオンコジーンの遺伝子変異を標的にアルキル化する新規アルキル化剤2016

    • 発明者名
      永瀬浩喜, 杉山弘, 板東俊和
    • 権利者名
      千葉県, 国立大学法人京都大学
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2016-05-10
    • 関連する報告書
      研究成果発表報告書
    • 外国
  • [産業財産権] ドライバーオンコジーンの遺伝子変異を標的にアルキル化する新規アルキル化剤2016

    • 発明者名
      永瀬浩喜, 杉山弘, 板東俊和
    • 権利者名
      千葉県, 国立大学法人京都大学
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2016-04-07
    • 関連する報告書
      研究成果発表報告書
    • 外国
  • [産業財産権] 特定遺伝子の発現を活性化するCTB-PIポリアミドコンジュゲート2015

    • 発明者名
      杉山 弘 板東俊和
    • 権利者名
      京都大学
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2015-025715
    • 出願年月日
      2015-02-12
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書

URL: 

公開日: 2012-11-27   更新日: 2019-07-29  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi