サンゴと褐虫藻の共生関係のゲノム科学的解析

• 研究課題/領域番号: 24241071
• 研究種目: 基盤研究(A)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 応用ゲノム科学
• 研究機関: 沖縄科学技術大学院大学
• 研究代表者: 佐藤 矩行 沖縄科学技術大学院大学, その他の研究科, 教授 (30025481)
• 連携研究者: 將口 栄一 沖縄科学技術大学院大学, マリンゲノミックユニット, グループリーダー ; 新里 宙也 沖縄科学技術大学院大学, マリンゲノミックユニット, グループリーダー
• 研究期間 (年度): 2012-10-31 – 2015-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2014年度)
• 配分額: 30,550千円 (直接経費: 23,500千円、間接経費: 7,050千円); 2014年度: 6,760千円 (直接経費: 5,200千円、間接経費: 1,560千円); 2013年度: 6,630千円 (直接経費: 5,100千円、間接経費: 1,530千円); 2012年度: 17,160千円 (直接経費: 13,200千円、間接経費: 3,960千円)
• キーワード: サンゴ / カッチュウソウ / 共生の成立と崩壊 / ゲノム / システイン / 自然免疫系 / 環境保全 / 集団遺伝学 / カッチュソウ / 共生 / ゲノム科学 / サンゴ礁再生 / 環境 / 遺伝子 / 進化 / 褐虫藻 / 成立 / 崩壊 / ゲノム解読 / ゲノム科学的解明

研究成果の概要

最近の地球規模での環境悪化により生物多様性の宝庫であるサンゴ礁が消滅しつつある。サンゴの生物学的理解は急務である。サンゴはカッチュウソウと共生関係を維持し生活している。これからのサンゴ礁生物学を進めるには両者のゲノム情報が必須であると考え、2011年にコユビミドリイシ（Acropora digitifera）のゲノムを、また2013年に共生カッチュウソウ（Symbiodinium minutum）のゲノムを世界に先駆けて解読した。現在、これらのゲノム情報を駆使して共生の成立と崩壊（カッチュウソウの離脱による白化）のメカニズムを、また沖縄島嶼におけるサンゴ礁の成り立ちについての解析を進めている。

研究成果

• [雑誌論文] Diversification of light harvesting complex gene family via intra- and intergenic duplications in the coral symbiotic alga Symbiodinium. (2015)
  • 著者名/発表者名: Maruyama, S., Shoguchi, E., Satoh, N., Minagawa, J.
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 10 号: 3 ページ: 1-15
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0119406
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Development of novel, cross-species microsatellite markers for Acropora corals using next-generation sequencing technology. (2014)
  • 著者名/発表者名: Shinzato, C., Yasuoka, Y., Mungpakdee, D., Arakaki, N., Fujie, M., Nakajima, Y., Satoh, N.
  • 雑誌名: Front. Mar. Sci., 巻: 2014 ページ: 1-14
  • DOI: 10.3389/fmars.2014.00011
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Massive gene transfer and extensive RNA editing of a symbiotic dinoflagellate plastid genome. (2014)
  • 著者名/発表者名: Mungpakdee, S., Shinzato, C., Takeuchi, T., Kawashima, T., Koyanagi, R., Hisata, K., Tanaka, M., Goto, H., Fujie, M., Lin, S., Satoh, N., and Shoguchi, E.
  • 雑誌名: Genome Biol Evol. 巻: 6 号: 6 ページ: 1408-1422
  • DOI: 10.1093/gbe/evu109
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A genomic approach to coral-dinoflagellate symbiosis: Studies of Acropora digitifera and Symbiodinium (2014)
  • 著者名/発表者名: Shinzato, C., Mungpakdee, S., Satoh, N., Shoguchi, E.
  • 雑誌名: Frontier in Microbiology 巻: 2014 ページ: 1-18
  • DOI: 10.3389/fmicb.2014.00336
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Draft assembly of the Symbiodinium minutum nuclear genome reveals dinoflagellate gene structure (2013)
  • 著者名/発表者名: Shoguchi1, E., Shinzato, C., Kawashima, T., Gyoja, F., et al.
  • 雑誌名: Current Biology 巻: 23 号: 15 ページ: 1399-1408
  • DOI: 10.1016/j.cub.2013.05.062
  • 査読あり
• [雑誌論文] The complex NOD-like receptor repertoire of the coral Acropora digitifera includes novel domain combinations. (2013)
  • 著者名/発表者名: Hamada, M., Shoguchi, E., Shinzato, C., Kawashima, T., Miller, D. J., Satoh, N.
  • 雑誌名: Mol Biol Evol 巻: 30 号: 1 ページ: 167-76
  • DOI: 10.1093/molbev/mss213
  • 査読あり
• [学会発表] Cross talk of coral and Symbiodinium genes during environmental changes (2014)
  • 著者名/発表者名: Satoh, N.
  • 学会等名: Gordon Research Conference
  • 発表場所: Hong Kong Univ. Sci $ Tech.
  • 年月日: 2014-08-11 – 2014-08-16
  • 招待講演
• [学会発表] Cross talk between corals and Symbiodinium (2013)
  • 著者名/発表者名: Satoh, N
  • 学会等名: Gordon Res, Conference
  • 発表場所: Hong Kong
  • 招待講演
• [備考] OIST Marine Genomics Unit
  • URL: http://marinegenomics.oist.jp
• [備考] Genome Sequencing / Annotation Projects
  • URL: http://marinegenomics.oist.jp/genomes/gallery
• [備考] http://marinegenomics.oist.jp/genomes/gallery
  • URL: http://marinegenomics.oist.jp