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クロマチンループ構造変換による組織特異的Shh発現制御システム

研究課題

研究課題/領域番号 24247002
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 遺伝・ゲノム動態
研究機関国立遺伝学研究所

研究代表者

城石 俊彦  国立遺伝学研究所, 系統生物研究センター, 教授 (90171058)

連携研究者 天野 孝紀  国立遺伝学研究所, 系統生物研究センター, 助教 (20419849)
研究協力者 嵯峨井 知子  国立遺伝学研究所, 系統生物研究センター, 特任研究員
研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
45,500千円 (直接経費: 35,000千円、間接経費: 10,500千円)
2014年度: 14,690千円 (直接経費: 11,300千円、間接経費: 3,390千円)
2013年度: 14,560千円 (直接経費: 11,200千円、間接経費: 3,360千円)
2012年度: 16,250千円 (直接経費: 12,500千円、間接経費: 3,750千円)
キーワード遺伝子発現制御 / 染色体高次構造 / エンハンサー / 発生生物学 / シジ制御配列の進化 / Shh / マウス / シス制御配列の進化 / 遺伝学 / ゲノム / 発現制御 / 発生・分化
研究成果の概要

Shh遺伝子座をモデルとして組織特異的エンハンサーによる発現制御機構の解析を行った。次世代シーケンサーによる解析では、染色体相互作用の土台となりうる分子の結合分布パターンを明らかにすることができ、さらに、Shh遺伝子と近傍の遺伝子で異なる相互作用パターンを示すことが明らかになった。
また、Shhの喉頭エンハンサーの脊椎動物種間の比較では、系統的な配列保存性の境界を見いだし、硬骨魚類の一群が、陸生動物とは異なる新たな内胚葉エンハンサーを進化させたことがわかった。

報告書

(4件)
  • 2014 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2013 実績報告書
  • 2012 実績報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2014 2013 2012

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 1件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (6件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] The Hand2 gene dosage effect in developmental defects and human congenital disorders2014

    • 著者名/発表者名
      Masaru Tamura, Takanori Amano and Toshihiko Shiroishi
    • 雑誌名

      Curr. Top. Dev. Biol.

      巻: 110 ページ: 129-152

    • DOI

      10.1016/b978-0-12-405943-6.00003-8

    • ISBN
      9780124059436
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [雑誌論文] A novel regulatory element for Shh expression in the lung and gut of mouse embryos2014

    • 著者名/発表者名
      Tsukiji Nagaharu, Takanori Amano and Toshihiko Shiroishi
    • 雑誌名

      Mech. Dev.

      巻: 131 ページ: 127-136

    • DOI

      10.1016/j.mod.2013.09.003

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書 2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Calpain 1 inhibitor BDA-410 ameliorates α-klotho-deficiency phenotypes resembling human aging-related syndromes.2014

    • 著者名/発表者名
      Nabeshima Y., Washida M., Tamura M., Maeno A., Ohnishi M., Shiroishi T., Imura A., Razzaque MS., Nabeshima Y.
    • 雑誌名

      Sci Rep.

      巻: 4 号: 1 ページ: 1-7

    • DOI

      10.1038/srep05847

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] マウスゲノムを読み解くための新しい文法書2013

    • 著者名/発表者名
      天野孝紀
    • 雑誌名

      生物の科学 遺伝

      巻: 67巻 ページ: 141-144

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [雑誌論文] Sonic hedgehog acts cell-autonomously on muscle precursor cells to generate limb muscle diversity.2012

    • 著者名/発表者名
      Anderson C
    • 雑誌名

      Genes Dev.

      巻: 26 号: 18 ページ: 2103-2117

    • DOI

      10.1101/gad.187807.112

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Regulatory elements for limb-specific expression of developmental genes in the coelacanth2014

    • 著者名/発表者名
      天野孝紀、城石俊彦
    • 学会等名
      日本進化学会 第16回大会
    • 発表場所
      大阪 (高槻現代劇場)
    • 年月日
      2014-08-21 – 2014-08-24
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Enhancer sharing and promoter insulation from enhancer activities: spatial and temporal organization of gene regulation around the mouse Shh locus2014

    • 著者名/発表者名
      Takanori Amano, Tomoko Sagai, Toshihiko Shiroishi
    • 学会等名
      第47回日本発生生物学会大会
    • 発表場所
      名古屋 (ウインク愛知)
    • 年月日
      2014-05-27 – 2014-05-30
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Elimination of an oral epithelia-specific Shh enhancer causes an extra premolar-like tooth in mouse2014

    • 著者名/発表者名
      Tomoko Sagai, Takanori Amano, Akiteru Maeno, Yoichi Mizushina, Toshihiko Shiroishi
    • 学会等名
      第47回日本発生生物学会大会
    • 発表場所
      名古屋 (ウインク愛知)
    • 年月日
      2014-05-27 – 2014-05-30
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Mouse Hammer toe (Hm) mutation affects a long-range Shh regulation2014

    • 著者名/発表者名
      Kousuke MourI, Tomoko Sagai, Takanori Amano, Toshihiko Shiroishi
    • 学会等名
      第47回日本発生生物学会大会
    • 発表場所
      名古屋 (ウインク愛知)
    • 年月日
      2014-05-27 – 2014-05-30
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Identification of a novel regulatory element for Shh expression in the mouse lung and gut2013

    • 著者名/発表者名
      Takanori Amano, Nagaharu Tsukiji, Toshihiko Shiroishi
    • 学会等名
      第46回日本発生生物学会大会(APDBN共催)
    • 発表場所
      松江
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Evolutionary divergence of an epithelial linings-specific Shh enhancer2013

    • 著者名/発表者名
      Tomoko Sagai1, Takanori Amano, Akiteru MKimura, Kiyoshi aeno, Tetsuaki Naruse
    • 学会等名
      第46回日本発生生物学会大会(APDBN共催)
    • 発表場所
      松江
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [図書] 生物の科学 遺伝 2014年5月号2014

    • 著者名/発表者名
      天野孝紀、城石俊彦
    • 総ページ数
      300
    • 出版者
      株式会社 エヌ・ティー・エス
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書

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公開日: 2013-05-15   更新日: 2019-07-29  

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