確率分割による個人ゲノム漏洩におけるリスク評価と秘匿の方法の確立

• 研究課題/領域番号: 24300109
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 一部基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 統計科学
• 研究機関: 統計数理研究所
• 研究代表者: 間野 修平 統計数理研究所, 数理・推論研究系, 准教授 (20372948)
• 研究分担者: 角田 達彦 理化学研究所, 統合生命医科学研究センター, 医科学数理研究グループリーダー (10273468) ; 太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)
• 連携研究者: 太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)
• 研究期間 (年度): 2012-04-01 – 2015-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2014年度)
• 配分額: 13,520千円 (直接経費: 10,400千円、間接経費: 3,120千円); 2014年度: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円); 2013年度: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円); 2012年度: 4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円)
• キーワード: 統計数学 / ゲノム

研究成果の概要

個人ゲノムが漏洩し，保有者が特定されると，個人情報が漏洩します．統計科学において議論されてきた個票開示リスクと相似の問題で，標本一意の秘匿済み個人ゲノムが母集団一意になる確率を抑える方法が必要です．基礎となる統計モデルは確率分割です．本研究では，これらのリスク評価と秘匿の方法の確立を目的としました．統計モデルの検討として，ゲノム上の相関を考慮したモデルの数値計算の手法を提案し，交換可能な確率分割の一般的なクラスであるGibbs分割について，漸近的な性質を調べました．また，個人ゲノムの取得と利用に関わる方々との意見交換を行いながら，漏洩リスクの評価と秘匿の方法を検討しました．

研究成果

• [雑誌論文] Correspondence: Human genetic research, race, ethnicity and the labeling of populations: recommendations based on an interdisciplinary workshop in Japan (2014)
  • 著者名/発表者名: Takezawa, Y., Kato, K., Oota. H., Caulfield, T., Fujimoto, A., Honda, F., Kamatani, N., Kawamura, S., Kawashima, K., Kimura, R., Matsumae, H., Saito, A., Savage, P. E., Seguchi, N., Shimizu, K., Terao, S., Yamaguchi-Kabata, Y., Yasukouchi, A., Yoneda, M. and Tokunaga, K.
  • 雑誌名: BMC Medical Ethics 巻: 15 号: 1 ページ: 33-33
  • DOI: 10.1186/1472-6939-15-33
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] がん研究におけるゲノムビッグデータ解析と臨床応用 (2014)
  • 著者名/発表者名: 角田達彦
  • 雑誌名: 実験医学 巻: 32 ページ: 2046-2051
• [雑誌論文] Asymptotics of Pitman random partition via combinatorics. (2013)
  • 著者名/発表者名: Shuhei Mano
  • 雑誌名: ISM Research Memorandum 巻: 1177 ページ: 1-30
• [雑誌論文] Ordered sizes in exchangeable random partitions and their asymptotics. (2013)
  • 著者名/発表者名: Shuhei Mano
  • 雑誌名: arXiv 巻: 1306.2056 ページ: 1-30
• [雑誌論文] Duality between the two-locus Wright-Fisher diffusion model and the ancestral process with recombination. (2013)
  • 著者名/発表者名: Shuhei Mano
  • 雑誌名: Journal of Applied Probability 巻: 50 号: 1 ページ: 256-271
  • DOI: 10.1239/jap/1363784437
  • 査読あり
• [学会発表] Approximate Bayesian Computation and its Applications (2015)
  • 著者名/発表者名: 間野修平
  • 学会等名: インシリコ・メガバンク研究会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2015-03-13
  • 招待講演
• [学会発表] Medical Science Mathematics for Cancer Genome Analysis (2014)
  • 著者名/発表者名: Tatsuhiko Tsunoda
  • 学会等名: The 73rd Annual Meeting of the Japanese Cancer Association
  • 発表場所: Yokohama
  • 年月日: 2014-09-26
  • 招待講演
• [学会発表] Ordered Sizes in the Gibbs-type Exchangeable Random Partitions (2014)
  • 著者名/発表者名: Shuhei Mano
  • 学会等名: 37th Conference on Stochastic Processes and Their Applications
  • 発表場所: Buenos Aires
  • 年月日: 2014-07-28 – 2014-08-01
• [学会発表] 全ゲノムビッグデータ解析によるオーダーメイド医療 (2014)
  • 著者名/発表者名: 角田達彦
  • 学会等名: 富士通知創薬コンソーシアム
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2014-04-07
  • 招待講演
• [学会発表] Extremes of Pitman's Random Partition and their Asymptotics (2013)
  • 著者名/発表者名: Mano Shuhei
  • 学会等名: Asymptotic Statistics and Related Topics: Theories and Methodologies.
  • 発表場所: University of Tokyo
• [学会発表] ピットマン分割の漸近論への解析的組み合わせ論による接近 (2013)
  • 著者名/発表者名: 間野修平
  • 学会等名: 統計関連学会連合大会
  • 発表場所: 大阪大学
• [学会発表] 人類学の立場からパーソナルゲノムプロジェクトを考える (2013)
  • 著者名/発表者名: 松前ひろみ，間野修平，太田博樹
  • 学会等名: 日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
• [学会発表] ピットマン分割における極値とその漸近的性質 (2012)
  • 著者名/発表者名: 関野修平
  • 学会等名: 研究集会「官庁統計データの公開における諸問題の研究と他分野への応用」
  • 発表場所: 統計数理研究所
  • 年月日: 2012-10-26
• [学会発表] 集団遺伝の確率モデルと統計的推測 (2012)
  • 著者名/発表者名: 間野修平
  • 学会等名: 日本遺伝学会ワークショップ「ゲノム時代における理論集団遺伝学」
  • 発表場所: 九州大学医学部
  • 年月日: 2012-09-24
• [学会発表] ピットマン分割における極値とその漸近的性質 (2012)
  • 著者名/発表者名: 間野修平
  • 学会等名: 日本統計学会
  • 発表場所: 北海道大学高等教育推進機構
  • 年月日: 2012-09-11
• [学会発表] Extremes of random partition and the asymptotics (2012)
  • 著者名/発表者名: Shuhei Mano
  • 学会等名: 研究集会'Stochastic Models and Computational Algorithms"
  • 発表場所: 統計数理研究所
  • 年月日: 2012-07-19
• [図書] 生命のビッグデータ利用の最前線「個人ゲノムデータの利用と倫理的課題」 (2014)
  • 著者名/発表者名: 松前ひろみ，間野修平，太田博樹（分担執筆の書籍の一部）
  • 総ページ数: 7
  • 出版者: CMC出版
• [備考]
  • URL: http://www.ism.ac.jp/~smano