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イメージングマススペクトロメトリーのための統計解析法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 24300110
研究種目

基盤研究(B)

配分区分一部基金
応募区分一般
研究分野 統計科学
研究機関帝京大学 (2014)
公益財団法人がん研究会 (2012-2013)

研究代表者

松浦 正明  帝京大学, 大学院公衆衛生学研究科, 教授 (40173794)

研究分担者 江口 真透  統計数理研究所, 数理推論研究系, 教授 (10168776)
瀬藤 光利  浜松医科大学, 医学部, 教授 (20302664)
牛嶋 大  公益財団法人がん研究会, ゲノムセンター, 研究員 (60328565)
宮田 敏  東北大学, 医学系研究科, 准教授 (60360343)
矢尾 育子  浜松医科大学, メディカルフォトニクス研究センター, 准教授 (60399681)
星川 裕  公益財団法人がん研究会, がん研究所, 研究員 (80280626)
涌井 昌俊  慶應義塾大学, 医学部, 講師 (90240465)
森 誠一  公益財団法人がん研究会, がん研究会 がんゲノム研究部, 主任研究員 (10334814)
連携研究者 梶原 茂樹  島津製作所, 基盤技術研究所, 主任研究員 (10395246)
研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
17,420千円 (直接経費: 13,400千円、間接経費: 4,020千円)
2014年度: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2013年度: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2012年度: 8,450千円 (直接経費: 6,500千円、間接経費: 1,950千円)
キーワード質量分析 / 統計 / 画像 / 画像処理 / 顕微質量装置 / イメージ / 質量顕微鏡法
研究成果の概要

イメージングマススペクトロメトリーでは、病理標本など顕微鏡下でがん部や正常部のスポットごとにレーザーを照射し質量分析を行うことができる。照射レーザーごとに低分子発現ピークを有する膨大なスペクトルが出力され、発現ピークごとにスポット座標情報を基にした画像データが得られる。これらのデータから重要ながん部で類似して発現するピークの同定が可能と統計学的アルゴリズムと関連ソフトウェアを開発した。

報告書

(4件)
  • 2014 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2013 実績報告書
  • 2012 実績報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2015 2014 2013 2012

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (6件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Identification of nitrated tyrosine residues of protein kinase G-Ia by mass spectrometry.2014

    • 著者名/発表者名
      Lu J, Yao I, Shimojo M, Katano T, Uchida H, Setou M, Ito S
    • 雑誌名

      Analytical and bioanalytical chemistry

      巻: 406 号: 5 ページ: 1387-1396

    • DOI

      10.1007/s00216-013-7535-4

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Development of imaging mass spectrometry2012

    • 著者名/発表者名
      Saito Y, Waki M, Hameed S, Hayasaka T, Setou M.
    • 雑誌名

      Biol Pharm Bull.

      巻: 35 ページ: 1417-1424

    • NAID

      130001872090

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Visualization of acetylcholine distribution in central nervous system tissue sections by tandem imaging mass spectrometry.2012

    • 著者名/発表者名
      Sugiura Y, Zaima N, Setou M, Ito S, Yao I.
    • 雑誌名

      Anal Bioanal Chem.

      巻: 403 号: 7 ページ: 1851-1861

    • DOI

      10.1007/s00216-012-5988-5

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Development of Imaging Mass Spectrometry2012

    • 著者名/発表者名
      Yamazaki H, Chijiwa T, Inoue Y, Abe Y, Suemizu H, Kawai K, Wakui M, Furukawa D, Mukai M, Kuwao S, Saegusa M, Nakamura M.
    • 雑誌名

      Biological & Pharmaceutical Bulletin

      巻: 35 号: 9 ページ: 1417-1424

    • DOI

      10.1248/bpb.b212007

    • NAID

      130001872090

    • ISSN
      0918-6158, 1347-5215
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Similarity index for image patterns from imaging mass spectrometry.2015

    • 著者名/発表者名
      Matsuura M, Ushijima M, Kajihara S
    • 学会等名
      Pacific Symposium on Biocomputing 2015
    • 発表場所
      Hawaii (USA)
    • 年月日
      2015-01-04 – 2015-01-08
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Classification of breast cancer subtypes using lasso clustering methods2013

    • 著者名/発表者名
      Ushijima M, Eguchi S, Komori S, Miki Y, Matsuura M
    • 学会等名
      9th Japan America Joint International Mass Spectrometry Conference
    • 発表場所
      Hawaii, America
    • 年月日
      2013-02-23
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 質量分析イメージングによる脳情報の可視化-医学への貢献を目指して2013

    • 著者名/発表者名
      矢尾育子
    • 学会等名
      第38回医用マススペクトル学会
    • 発表場所
      神戸
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Optimization of conditions for acetylcholine detection in the nerve tissue sections by imaging mass spectrometry2012

    • 著者名/発表者名
      Yao I, Sugiura Y, Zaima N, Setou M, Ito S
    • 学会等名
      9th Joint Conference of the American Association for Cancer Research and the Japanese Cancer Association
    • 発表場所
      京都国際会議場
    • 年月日
      2012-09-17
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Analysis of imaging pattern for Imaging mass spectrometry data2012

    • 著者名/発表者名
      Ushijima M, Eguchi S, Kajihara S, Matsuura M.
    • 学会等名
      International Biometrics Conference 2012
    • 発表場所
      神戸国際会議場
    • 年月日
      2012-08-30
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Visualization of acetylcholine distribution in the brain by imaging mass spectrometry2012

    • 著者名/発表者名
      Yao I, Sugiura Y, Zaima N, Setou M, Ito S
    • 学会等名
      60th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics
    • 発表場所
      Vancouver, Canada
    • 年月日
      2012-05-21
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [図書] Imaging Mass Spectrometry (IMS) for Biological Application Mass Spectrometry Handbook, pp41-842012

    • 著者名/発表者名
      Sugiura Y, Yao I, Setou M
    • 総ページ数
      44
    • 出版者
      Wiley
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書

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公開日: 2012-04-24   更新日: 2019-07-29  

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