| 研究課題/領域番号 |
24310147
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| 研究種目 |
基盤研究(B)
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| 配分区分 | 一部基金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 研究分野 |
システムゲノム科学
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| 研究機関 | 千葉工業大学 |
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研究代表者 |
河合 剛太 千葉工業大学, 工学部, 教授 (70211860)
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| 研究分担者 |
清澤 秀孔 高知大学, 医学部, 特任准教授 (30295422)
牛田 千里 弘前大学, 農学生命科学部, 准教授 (50250593)
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| 研究期間 (年度) |
2012-04-01 – 2015-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2014年度)
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| 配分額 *注記 |
19,760千円 (直接経費: 15,200千円、間接経費: 4,560千円)
2014年度: 6,110千円 (直接経費: 4,700千円、間接経費: 1,410千円)
2013年度: 5,980千円 (直接経費: 4,600千円、間接経費: 1,380千円)
2012年度: 7,670千円 (直接経費: 5,900千円、間接経費: 1,770千円)
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| キーワード | 機能性RNA / NMR / 立体構造解析 / トランスクリプトーム / トランスクリプト―ム / トランスリプトーム |
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| 研究成果の概要 |
マウスの脳に由来するRNAについて次世代シーケンサーによる配列解析等を行い，約１億配列を得た．二次構造予測とその結果に基づくクラスタリングを行うシステムを開発し，解析を行った結果， 16個の新規低分子RNA候補，MsncR（mouse structured non-coding RNA）を見出した．ノーザン解析による発現評価を行い，予想よりも小さいRNAの存在を示唆するものがあった．
MsncR-11は，ミトコンドリアtRNA遺伝子の裏鎖に相当するRNAである．NMR法による解析により，MsncR-11は，tRNAのアクセプタステムとTステムに相当する二次構造を形成していることが示唆された．
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