紫外共鳴ラマン分光法によるヘム蛋白質高次構造変化の検出と蛋白質機能制御機構の解明

• 研究課題/領域番号: 24350086
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 一部基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 生体関連化学
• 研究機関: 兵庫県立大学
• 研究代表者: 北川 禎三 兵庫県立大学, 生命理学研究科, 名誉教授 (40029955)
• 研究分担者: 小倉 尚志 兵庫県立大学, 生命理学研究科, 教授 (70183770) ; 長友 重紀 筑波大学, 数理物質科学研究科, 講師 (80373190)
• 研究期間 (年度): 2012-04-01 – 2015-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2014年度)
• 配分額: 18,330千円 (直接経費: 14,100千円、間接経費: 4,230千円); 2014年度: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円); 2013年度: 5,850千円 (直接経費: 4,500千円、間接経費: 1,350千円); 2012年度: 6,890千円 (直接経費: 5,300千円、間接経費: 1,590千円)
• キーワード: 生物物理 / 蛋白質 / シグナル伝達 / 生体分子 / 分子認識 / 振動分光 / 共鳴ラマン散乱

研究成果の概要

ヒトHbのα或はβサブユニットのみがFe-His結合を持たないが、O2分子を4個結合できる部位特異的変位体を作製し、その酸素平衡曲線を決めた。同時に、リガンド結合による高次構造変化を1H NMR, V- and UV-resonance Raman、nearUV CDスペクトルで調べた。分光学的測定はリガンド結合による高次構造変化は起こらない事を示し、αのFe-His結合の消失はHbをTに凍結させ、βのそれはαのO2親和性を高めた。NOセンサーのsGCのモデル蛋白として、バクテリアのH-NOX蛋白の共鳴ラマンを調べた。

研究成果

• [雑誌論文] Infrared and Raman spectroscopic investigation of the reaction mechanism of cytochrome c oxidase (2015)
  • 著者名/発表者名: Satoru Nakashima, Takashi Ogura, Teizo Kitagawa
  • 雑誌名: Biochimica et Biophysica Acta 巻: 1847 号: 1 ページ: 86-97
  • DOI: 10.1016/j.bbabio.2014.08.002
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Formation and Characterization of a Reactive Chromium(V)-Oxo Complex: A Mechanistic Insight into Hydrogen-Atom Transfer Reactions (2015)
  • 著者名/発表者名: H. Kotani, S. Kaida, T. Ishizuka, M. Sakaguchi, T. Ogura, Y. Shiota, K. Yoshizawa, T. Kojima
  • 雑誌名: Chemical Science 巻: 6 号: 2 ページ: 945-955
  • DOI: 10.1039/c4sc02285h
  • NAID: 120007130469
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Higdla is a oositive regulaator of cytochrome c oxidase (2015)
  • 著者名/発表者名: T. Hayashi, Y. Asano, Y. Shintani, H. Aoyama, H. Kioka, O. Tsukamoto, M. Hikita, K. Shinzawa-Itoh, K. Takajuji, S. Higo, H. Kato, S. Yamazaki, K. Matsuoka, A. Nakano, H. Asanuma, M. Asakura, T. Minamino, Y. Goto, T. Ogura, M. Kitakaze, I. Komuro, Y. Sakata, T. Tsukihara, S. Yoshikawa, S. Takashima
  • 雑誌名: Proc. Nat. Acad. Sci. U.S.A. 巻: 112 号: 5 ページ: 1553-1558
  • DOI: 10.1073/pnas.1419767112
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Resonance Raman spectroscopy with chemical state selectivity on histidine and acetamide using synchrotro radiation (2015)
  • 著者名/発表者名: M. Saito, F. D. Amico, G. Camisasca, F. Benchivonga, R. Cucini, A. Gossini, E. Principi, T. Ogura, and C. Masciovecchio
  • 雑誌名: Bu.. Chem. Soc. Jpn 巻: 88 号: 4 ページ: 591-596
  • DOI: 10.1246/bcsj.20140367
  • NAID: 130005064988
  • 査読あり
• [雑誌論文] Involvement of propionate side chians of the hee in circular dichroism of myoglobin: experimental and theoretical analyses (2015)
  • 著者名/発表者名: M. Nagai, C. Kobayashi, Y. Nagai, K. Imai, N. Mizusawa, H. Sakurai, S. Neya, M. Kayanuma, M. Shoji and S. Nagatomo
  • 雑誌名: J. Phys. Chem. B 巻: 119 ページ: 1275-1287
• [雑誌論文] Picobiology revealed by vibrational spectroscopy (2014)
  • 著者名/発表者名: Teizo Kitagawa
  • 雑誌名: Journal Spectroscopic Society of Japan 巻: 63 ページ: 49-61
  • NAID: 40020077942
  • 査読あり
• [雑誌論文] Highly Reactive Nonheme Iron(III)-Iodosylarene Complexes in Alkane Hydroxylation and Sulfoxidation Reactions (2014)
  • 著者名/発表者名: S. Hong, B. Wang, M. S. Seo, Y. M. Lee, M. J. Kim, H. Kim, T. Ogura, R. Garcia-Serres, M. Clemancey, J. M. Latour, W. Nam
  • 雑誌名: Angewant Chemie Intl. Edi. 巻: 53 号: 25 ページ: 6388-6392
  • DOI: 10.1002/anie.201402537
  • 査読あり
• [雑誌論文] Determination of damage-free crystal structure of an X-ray sensitive protein using an XFEL (2014)
  • 著者名/発表者名: Hirata K, Shinzawa-Itoh K, Yano N, Takemura S, Kato K, Hatanaka M, Muramoto K, Kawahara T, Tsukihara T, Yamashita E, Tono K, Ueno G, Hikima T, Murakami H, Inubushi Y, Yabashi M, Ishikawa T, Yamamoto M, Ogura T, Sugimoto H, Shen J-R, Yoshikawa S, Ago H
  • 雑誌名: Nature Methods 巻: 11 号: 7 ページ: 734-736
  • DOI: 10.1038/nmeth.2962
  • 査読あり
• [雑誌論文] Effect of the electron density of the heme Fe atom o the Fe-Histidine coordination bond in deoxy myoglobin (2014)
  • 著者名/発表者名: R. Nishimura, T. Shibata, H. Tai, I. Ishigami, S. Yanagisawa, T. Ogura, S. Neya, A. Suzuki, Y. Yamamoto
  • 雑誌名: Bull. Chem. Soc. Jpn. 巻: 87 号: 8 ページ: 905-911
  • DOI: 10.1246/bcsj.20130331
  • NAID: 130004153305
  • 査読あり
• [雑誌論文] Geometric control of nuclearity in copper(I)/dioxygen chemistry (2014)
  • 著者名/発表者名: T. Abe, Y. Morimoto, T. Tano, K. Mieda, H. Sugimotok N. Fujieda, T. Ogura, and S. Itoh
  • 雑誌名: Inorganic Chemistry 巻: 53 号: 16 ページ: 8786-8794
  • DOI: 10.1021/ic501461n
  • 査読あり
• [雑誌論文] Electronic control of ligand-binding preference of a myoglobin mutant (2014)
  • 著者名/発表者名: R. Nishimura, D. Matsumoto, T. Shibata, S. Yanagisawa, T. Ogura, H. Tai, T. Matsuo, S. Hirota, S. Neya, A. Suzuki, Y. Yamamoto
  • 雑誌名: Inorganic Chemistry 巻: 53 号: 17 ページ: 9156-9165
  • DOI: 10.1021/ic5011924
  • 査読あり
• [雑誌論文] Influence of ligand flexibility on the electronic structure of oxidized Ni(III)-phenoxide complexes (2014)
  • 著者名/発表者名: M. Kawai, T. Yamaguchi, S. Masaoka, F. Tani, T. Kohzuma, L. Chiang, T. Storr, K. Mieda, T. Ogura, r. K. Szilagyi, and Y. Shimazaki
  • 雑誌名: Inorganic Chemistry 巻: 53 号: 19 ページ: 10195-10202
  • DOI: 10.1021/ic501181k
  • 査読あり
• [雑誌論文] Effects of proton motive force on the structure and dynamics of bovine cytochrome c oxidase in phospholipid visicles (2014)
  • 著者名/発表者名: T. Nomura, S. Yanagisawa, K. Shinzawa-Itoh, S. Yoshikawa, and T. Ogura
  • 雑誌名: Biochemistry 巻: 53 号: 40 ページ: 6382-6391
  • DOI: 10.1021/bi501022j
  • 査読あり
• [雑誌論文] Interplay between phase transition of DPPC bilayer and photoisomerization of doped stilbene molecule (2014)
  • 著者名/発表者名: K. Nakazawa, M.Hishida, S. Nagatoo, Y. Yamamura, and K. Saito
  • 雑誌名: Chemistry Letters 巻: 43 ページ: 1352-1354
  • 査読あり
• [雑誌論文] Recentant nematic phase in 4-alkyl-4'-cyanobiphenyl(nCB) binary mixtures (2014)
  • 著者名/発表者名: S. Fujimura, Y. Yamamura, M. Hishida, S. Nagatomo, and K. Saito
  • 雑誌名: Liquid Crystals 巻: 41 ページ: 927-932
  • 査読あり
• [雑誌論文] Copper complexes supported by an N2S-tridentate ligand as active site models of copper monooxygenases (2014)
  • 著者名/発表者名: Shinobu Itoh, et al.
  • 雑誌名: Dalton Trans. 巻: 42 号: 12 ページ: 4871-4877
  • DOI: 10.1039/c3dt52952e
  • 査読あり
• [雑誌論文] Roles of Carboxylate Donors in O-O Bond Scission of Peroxodiiron(III) to High-Spin Oxodiiron(IV) with a New Carboxylate-Containing Dinucleating Ligand (2014)
  • 著者名/発表者名: M. Kodera, T. Tsuji, T. Yasunaga, Y. Kawahara, T. Hirano, Y. Hitomi, T. Nomura, T. Ogura, Y. Kobayashi, Sajith P. K., Y. Shiota, and K. Yoshizawa
  • 雑誌名: Chem. Sci. 巻: 5 号: 6 ページ: 2282-2292
  • DOI: 10.1039/c3sc51541a
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Effective Pumping Proton Collection Facilitated by a Copper Site (CuB) of Bovine Heart Cytochrome c Oxidase, Revealed by a Newly Developed Time-resolved Infrared System (2013)
  • 著者名/発表者名: Minoru Kubo, Satoru Nakashima, Satoru Yamaguchi, Takashi Ogura, Masao Mochizuki, Jiyoung Kang, Masaru Tateno, Kyoko Shinzawa-Itoh, Koji Kato and Shinya Yoshikawa
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 巻: 288 号: 42 ページ: 30259-30269
  • DOI: 10.1074/jbc.m113.473983
  • 査読あり
• [雑誌論文] Redox Properties of Mononuclear Copper(II)-Superoxide Complex (2013)
  • 著者名/発表者名: Shinobu Itoh
  • 雑誌名: Inorg. Chem. 巻: 52 号: 18 ページ: 10431-10437
  • DOI: 10.1021/ic401261z
  • 査読あり
• [雑誌論文] Near-UV Circular dichroism and UV resonance Raman spectra of tryptophan residues as a structural marker of proteins. (2013)
  • 著者名/発表者名: Biswajit Pal, Katsuhiro Tanaka, Shigeo Takenaka, and Teizo Kitagawa
  • 雑誌名: J. Porphyrins Phthalocyanines 巻: １７ 号: 03 ページ: 240-246
  • DOI: 10.1142/s1088424613500375
  • 査読あり
• [雑誌論文] Near-UV Circular dichroism and UV resonance Raman spectra of tryptophan residues as a structural marker of proteins. (2013)
  • 著者名/発表者名: Shigenori Nagatomo, Masako Nagai, Takashi Ogura, and Teizo Kitagawa
  • 雑誌名: J. Physical Chemistry B 巻: 117 号: 32 ページ: 9343-9363
  • DOI: 10.1021/jp404685x
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mononuclear manganese-peroxo and bis(μ-oxo)dimanganese complexes bearing a common N-methylated macrocyclic ligand (2013)
  • 著者名/発表者名: Hyeona Kang, Jaeheung Cho, Kyung-Bin Cho, Takashi Nomura, Takashi Ogura, Wonwoo Nam
  • 雑誌名: Chemistry 巻: 19 号: 42 ページ: 14119-14125
  • DOI: 10.1002/chem.201301641
  • 査読あり
• [雑誌論文] Electronic Control of Discrimination between O2 and CO in Myoglobin Lacking the Distal Histidine Residue (2013)
  • 著者名/発表者名: R. Nishimura, T. Shibata, I. Ishigami, T. Ogura, H. Tai, S. Nagao, T. Matsuo, S Hirota, O. Shoji, Y. Watanabe, K. Imai, S. Neya, A. Suzuki, Y. Yamamoto
  • 雑誌名: Inorg. Chem. 巻: 53 号: 2 ページ: 1091-1099
  • DOI: 10.1021/ic402625s
  • 査読あり
• [雑誌論文] Oxo-sulfido- and oxo-selenido-molybdenum(VI) complexes possessing dithiolene ligand related to the active sites of hydroxylases of molybdoenzymes: Low temperature preparation and characterisation (2013)
  • 著者名/発表者名: Shinobu Itoh, et al.
  • 雑誌名: Chem. Commun. 巻: 49 号: 39 ページ: 4358-4360
  • DOI: 10.1039/c2cc35345h
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] A new series of bis(ene-1,2-dithiolato)tungsten(IV), -(V), -(VI) complexes as reaction centre models of tungsten enzymes: preparation, crystal structures and spectroscopic properties (2013)
  • 著者名/発表者名: Shinobu Itoh, et al.
  • 雑誌名: Dalton Trans. 巻: 42 号: 9 ページ: 3059-3070
  • DOI: 10.1039/c2dt32179c
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Resonance Raman spectral properties of FMN of bovine heart NADH:ubiquinoneoxidoreductase suggesting a mechanism for the prevention of spontaneous production of reactive oxygen species (2013)
  • 著者名/発表者名: Hikita M, Shinzawa-Itoh K, Moriyama M, Ogura T, Kihira K, Yoshikawa S
  • 雑誌名: Biochemistry 巻: 52(1) 号: 1 ページ: 98-104
  • DOI: 10.1021/bi3011972
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of Hydrogen-Bonded Oligomers in Associating Liquid by 'H NMR : 1-Phenyl-1-cyclohexanol (2013)
  • 著者名/発表者名: Shigenori Nagatomo, Megumi Nobuhira, Yasuhisa Yamamura, Masato Sumita, and Kazuya Saito
  • 雑誌名: Bull. Chem. Soc. Jpn. 巻: (印刷中) 号: 5 ページ: 569-576
  • DOI: 10.1246/bcsj.20120322
  • NAID: 10031167848
  • 査読あり
• [雑誌論文] Radical localization in a series of symmetric Ni^<II> complexes with oxidized salen ligands (2013)
  • 著者名/発表者名: Linus Chiang, Amelie Kochem, Olivier Jarjayes, Tim J. Dunn, Herve Vezin, Miyuki Sakaguchi, Takashi Ogura, Maylis Orio, Yuichi Shimazaki, Fabrice Thomas and Tim Storr
  • 雑誌名: Chemistry-A European Journal 巻: 18 号: 44 ページ: 14117-14127
  • DOI: 10.1002/chem.201201410
  • 査読あり
• [雑誌論文] Interaction of dimeric horse cytochrome c with cyanide ion (2013)
  • 著者名/発表者名: Ari Dwi Nugraheni, Satoshi Nagao, Sachiko Yanagisawa, Takashi Ogura and Shun Hirota
  • 雑誌名: J Biol Inorg Chem 巻: 18 号: 3 ページ: 383-390
  • DOI: 10.1007/s00775-013-0982-8
  • NAID: 120005716871
  • 査読あり
• [雑誌論文] Relationship between the Electron Density of the Heme Fe Atom and the Vibrational Frequencies of the Fe-Bound Carbon Monoxide in Myoglobin (2013)
  • 著者名/発表者名: R. Nishimura, T. Shibata, H. Tai, I. Ishigami, T. Ogura, S. Nagao, T. Matsuo, S. Hirota, K. Imai, S. Neya, A. Suzuki, and Y, Yamamoto
  • 雑誌名: Inorg. Chem. 巻: 52 号: 6 ページ: 3349-3355
  • DOI: 10.1021/ic3028447
  • 査読あり
• [雑誌論文] Resonance Raman Study on Indoleamine 2,3-Dioxygenase: Control of Reactivity by Substrate-Binding (2013)
  • 著者名/発表者名: Sachiko Yanagisawa, Masayuki Hara, Hiroshi Sugimoto, Yoshitsugu Shiro and Takashi Ogura
  • 雑誌名: Chem. Phys. 巻: in press ページ: 178-183
  • DOI: 10.1016/j.chemphys.2013.02.032
  • 査読あり
• [雑誌論文] Effects of the bHLH domain on axial coordination of heme in the PAS-A domain of neuronal PAS domain protein 2 (NPAS2) : Conversion from His119/Cys170 coordination to His119/His171 coordination (2012)
  • 著者名/発表者名: Takeshi Uchida, Ikuko Sagami, Toru Shimizu, Koichiro Ishimori, and Teizo Kitagawa
  • 雑誌名: J. Inorg. Biochem. 巻: 108 ページ: 188-195
  • DOI: 10.1016/j.jinorgbio.2011.12.005
  • 査読あり
• [雑誌論文] Near-UV circular dichroism and UV resonance Raman spectra of individual trytophan residues in human hemoglobin and their changes upon the quaternary structure transition (2012)
  • 著者名/発表者名: Masako Nagai, Shigenori Nagatomo, Yukifumi Nagai, Kenichi Ohkubo, Kiyohiro Imai, and Teizo Kitagawa
  • 雑誌名: Biochemistry 巻: 51 号: 30 ページ: 5932-5941
  • DOI: 10.1021/bi300347x
  • 査読あり
• [雑誌論文] An intermediate conformational state during ligand binding to cytochrome c oxidase detected by time-resolved resonance Raman analyses of heme peripheral groups (2012)
  • 著者名/発表者名: Izumi Ishigami, Takeshi Nishigaki, Kyoko Shinzawa-Itoh, Shinya Yoshikawa, Satoru Nakashima and Takashi Ogura
  • 雑誌名: Chem. Lett. 巻: 2 号: 2 ページ: 178-180
  • DOI: 10.1246/cl.2012.178
  • NAID: 130004426495
  • 査読あり
• [雑誌論文] Site-specific protein dynamics in communication pathway from sensor to signaling domain of oxygen sensor protein, HemAT-Bs : time-resolved ultraviolet resonance Raman study (2012)
  • 著者名/発表者名: S. El-Mashtoly, M. Kubo, Y. Gu, H. Sawai, S. Nakashima, T. Ogura, S. Aono, T. Kitagawa
  • 雑誌名: J. Biol. Chem 巻: 287 号: 24 ページ: 19973-19984
  • DOI: 10.1074/jbc.m112.357855
  • 査読あり
• [雑誌論文] Copper(I)-Dioxygen Reactivity in a Sterically Demanding Tripodal Tetradentate tren Ligand. Formation and Reactivity of a Mononuclear Copper(II) End-on Superoxo Complex (2012)
  • 著者名/発表者名: Shinobu Itoh, et al.
  • 雑誌名: Eur. J. Inorg. Chem. 巻: 2012 号: 29 ページ: 4574-4578
  • DOI: 10.1002/ejic.201200177
  • 査読あり
• [雑誌論文] Non-innocent ligand behaviour of a bimetallic Cu complex employing a bridging catecholate (2012)
  • 著者名/発表者名: Tim J. Dunn, Linus Chiang, Caterina F. Ramogida, Mike I. Webb, Didier Savard, Miyuki Sakaguchi, Takashi Ogura, Yuichi Shimazaki and Tim Storr
  • 雑誌名: Dalton Transactions 巻: 41 号: 26 ページ: 7905-7914
  • DOI: 10.1039/c2dt30444a
  • 査読あり
• [雑誌論文] [Fe^<IV>=O(TBC)(CH3CN)]^<2+> : Comparative Reactivity of Iron(IV)-Oxo Species with Constrained Equatorial Cyclam Ligation (2012)
  • 著者名/発表者名: Samuel A. Wilson, Junying Chen, Seungwoo Hong, Yong-Min Lee, Martin Clemancey, Ricardo Garcia-Serres, Takashi Nomura, Takashi Ogura, Jean-Marc Latour, Britt Hedman, Keith O. Hodgson, Wonwoo Nam, and Edward I. Solomon
  • 雑誌名: J. Am. Chem. Soc. 巻: 134 号: 28 ページ: 11791-11806
  • DOI: 10.1021/ja3046298
  • 査読あり
• [雑誌論文] Tuning the geometries of a de novo blue copper protein by axial interactions (2012)
  • 著者名/発表者名: Daigo Shiga, Yusuke Hamano, Misato Kamei, Yasuhiro Funahashi, Hideki Masuda, Miyuki Sakaguchi, Takashi Ogura and Toshiki Tanaka
  • 雑誌名: Journal of Biological Inorganic Chemistry 巻: 17 号: 7 ページ: 1025-1031
  • DOI: 10.1007/s00775-012-0916-x
  • 査読あり
• [雑誌論文] Effect of the Axial Ligand on the Reactivity of the Oxoiron(IV) Porphyrin p-Cation Radical Complex: Higher Stabilization of the Product State Relative to the Reactant State (2012)
  • 著者名/発表者名: A. Takahashi, D. Yamaki, K. Ikemuma, T. Kurahashi, T. Ogura, M. Hada, and H. Fujii
  • 雑誌名: Inorg. Chem. 巻: 51(13) 号: 13 ページ: 7296-7305
  • DOI: 10.1021/ic3006597
  • 査読あり
• [雑誌論文] Reversible O-O Bond Scission of Peroxodiiron(III) to High-Spin Oxodiiron(IV) in Dioxygen Activation of a Diiron Center with a Bis-tpa Dinucleating Ligand as a Soluble Methane Monooxygenase Model (2012)
  • 著者名/発表者名: Masahito Kodera, Yuka Kawahara, Yutaka Hitomi, Takashi Nomura, Takashi Ogura, and Yoshio Kobayashi
  • 雑誌名: J. Am. Chem. Soc. 巻: 134 号: 32 ページ: 13236-13239
  • DOI: 10.1021/ja306089q
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mechanistic insights into catalytic oxidations of organic compounds by ruthenium (IV)-oxo complexes with pyridylamine ligands (2012)
  • 著者名/発表者名: Shingo Ohzu, Tomoya Ishizuka, Yuichiro Hirai, Hua Jiang, Miyuki Sakaguchi, Takashi Ogura, Shunichi Fukuzumi, Takahiko Koj ima
  • 雑誌名: Chemical Science 巻: 3 号: 12 ページ: 3421-3431
  • DOI: 10.1039/c2sc21195e
  • 査読あり
• [雑誌論文] Chromium(IV)-peroxo complex formation and its nitric oxide dioxygenase reactivity (2012)
  • 著者名/発表者名: Yokoyama, A., Han, J. E., Cho, J., Kubo, M., Ogura, T., Siegler, M. A., Karlin, K. D., Nam, W
  • 雑誌名: J. Am. Chem. Soc 巻: Vol. 134 号: 37 ページ: 15269-15272
  • DOI: 10.1021/ja307384e
  • 査読あり
• [雑誌論文] Synthesis, Characterization, and Reactivity of Hypochlorito-Iron(III) Porphyrin Complexe (2012)
  • 著者名/発表者名: Zhiqi Cong, Sachiko Yanagisawa, Takuya Kurahashi, Takashi Ogura, Satoru Nakashima, and Hiroshi Fujii
  • 雑誌名: J. Am. Chem. Soc 巻: 134 号: 51 ページ: 20617-20620
  • DOI: 10.1021/ja3108774
  • 査読あり
• [雑誌論文] Resonance Raman Application in Investigations of Cytochrome c Oxidase (2012)
  • 著者名/発表者名: Takashi Ogura
  • 雑誌名: Biochim. Biophys. Acta 巻: 1817 号: 4 ページ: 575-578
  • DOI: 10.1016/j.bbabio.2011.11.016
  • 査読あり
• [学会発表] 金属中心－タンパク質間の情報伝達ダイナミクス：赤外分光法による検出 (2015)
  • 著者名/発表者名: 小倉尚志
  • 学会等名: 分子研研究会「生物無機化学の最先端の今後の展望」
  • 発表場所: 岡崎コンファレンスセンター（愛知県岡崎市）
  • 年月日: 2015-01-06 – 2015-01-07
  • 招待講演
• [学会発表] Different roles of the fe-His bonds of the a and b subunits toward the quaternary structure change of human hemoglobin; Oxygen binding properties, resonance Raman, 1H NMR, and near-UV CD studies of cavity mutants (2014)
  • 著者名/発表者名: Teizo Kitagawa
  • 学会等名: 7th Asian Biological Inorganic Chemistry Conference
  • 発表場所: Gold Coast, Australia
  • 年月日: 2014-11-30 – 2014-12-05
  • 招待講演
• [学会発表] Vibrational spectroscopic investigation of molecular mechanisms of aerobic respiration (2014)
  • 著者名/発表者名: T. Ogura
  • 学会等名: Advances in Live Single-cell Thermal Imaging and Manipulation
  • 発表場所: 沖縄科学技術大学院大学シーサイドハウス（沖縄県国頭郡恩納村）
  • 年月日: 2014-11-10 – 2014-11-12
  • 招待講演
• [学会発表] Function and structure of mutant hemoglobins with proximal histidine replaced by glycine in either a or b subunits (2014)
  • 著者名/発表者名: S. Nagatomo, Y. Nagai, Y. Aki, H. Sakurai, N. Maruyama, K. Imai, N. Mizusawa, T. Ogura, T. Kitagawa and m. Nagai
  • 学会等名: 日本生物物理学会第５２回年会
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター（北海道札幌市）
  • 年月日: 2014-09-25 – 2014-09-27
• [学会発表] Resonance Raman investigation of structural changes of heme of sGC caused by substrate, ligand and effectors (2014)
  • 著者名/発表者名: Teizo Kitagawa
  • 学会等名: 8th International Conference on Porphyrins and Phthalocyanines
  • 発表場所: istanbul, Turkey
  • 年月日: 2014-06-22 – 2014-06-27
  • 招待講演
• [学会発表] Cooperative structural dynamics of proton pumping elements in cytochrome c oxidase as studied by onnovative infrared spectroscopy (2014)
  • 著者名/発表者名: T. Ogura, S. Nakashima, M. Kubo, S.Yamaguchi, M. Mochizuki, K. Shinzawa-itoh, S. Yoshikawa
  • 学会等名: 8th International Conference on Porphyrins and Phthalocyanines (ICPP-8)
  • 発表場所: Istanbul, Turkey
  • 年月日: 2014-06-22 – 2014-06-27
  • 招待講演
• [学会発表] Visible and UV resonance Raman study on indoleamine 2,3-dioxygenase (2014)
  • 著者名/発表者名: S. Yanagasawa, M. Hara, K. E. Kayama, H. Sugimoto, Y. Shiro, and T. Ogura
  • 学会等名: 8th International Conference on Porphyrins and Phthalocyanines (ICPP-8)
  • 発表場所: Istanbul, Turkey
  • 年月日: 2014-06-22 – 2014-06-27
  • 招待講演
• [学会発表] チトクロムc酸化酵素の酸化還元反応の時間分解赤外吸収測定を目的とした酸素肺フローシステムの開発 (2014)
  • 著者名/発表者名: 西口達人, 引田理英, 新澤-伊藤恭子, 吉川信也, 中島 聡, 小倉尚志
  • 学会等名: 日本化学会第94春季年会
  • 発表場所: 名古屋大学 東山キャンパス（愛知県）
• [学会発表] 時間分解振動分光法によるチトクローム酸化酵素の反応初期過程 (2014)
  • 著者名/発表者名: 中島 聡, 久保 稔, 石上 泉, 新澤-伊藤恭子, 吉川信也, 小倉尚志
  • 学会等名: 日本化学会第94春季年会
  • 発表場所: 名古屋大学 東山キャンパス（愛知県）
• [学会発表] Peroxide-reactivity of copper complexes supported by tridentate ligands having cyclic-diamine frameworks (2014)
  • 著者名/発表者名: Tsukasa Abe, Takashi Ogura, Yuma Morimoto, Hideki Sugimoto, Nobutaka Fujieda, and Shinobu Itoh
  • 学会等名: 日本化学会第94春季年会
  • 発表場所: 名古屋大学 東山キャンパス（愛知県）
• [学会発表] ヘム鉄の電子密度の変化がデオキシミオグロビンのFe-His配位結合に及ぼす影響 (2014)
  • 著者名/発表者名: 西村 龍, 柴田友和, 太 虎林, 石上 泉, 柳澤幸子, 小倉尚志, 根矢三郎, 鈴木秋弘, 山本泰彦
  • 学会等名: 日本化学会第94春季年会
  • 発表場所: 名古屋大学 東山キャンパス（愛知県）
• [学会発表] Resonance Raman Study on Cytochrome c Oxidase Reconstituted in the Phospholipids Vesicles (2013)
  • 著者名/発表者名: Takashi Nomura, Sachiko Yanagisawa, Kyoko Shinzawa-Itoh, Shinya Yoshikawa, and Takashi Ogura
  • 学会等名: The 4th Georgian Bay International Conference on Bioinorganic Chemistry (CanBIC-4)
  • 発表場所: Parry Sound, Canada
• [学会発表] Interaction Between Heme and Heme-Cu Binuclear center in Cytochrome c oxidase (2013)
  • 著者名/発表者名: Miyuki Sakaguchi, Kyoko Shinzawa-Itoh, Shinya Yoshikawa, and Takashi Ogura
  • 学会等名: The 4th Georgian Bay International Conference on Bioinorganic Chemistry (CanBIC-4)
  • 発表場所: Parry Sound, Canada
• [学会発表] Detection of tryptophan as bound substrate in indoleamine 2,3-dioxygenase (2013)
  • 著者名/発表者名: Sachiko Yanagisawa, Masayuki Hara, Hiroshi Sugimoto, Yoshitsugu Shiro, and Takashi Ogura
  • 学会等名: The 4th Georgian Bay International Conference on Bioinorganic Chemistry (CanBIC-4)
  • 発表場所: Parry Sound, Canada
• [学会発表] Identification of functionally important conformational changes in cytochrome c oxidase (2013)
  • 著者名/発表者名: Takashi Ogura
  • 学会等名: The 4th Georgian Bay International Conference on Bioinorganic Chemistry (CanBIC-4)（招待講演）
  • 発表場所: Parry Sound, Canada
  • 招待講演
• [学会発表] ドメインスワップしたシトクロムc多量体の形成および安定性に影響を及ぼす因子 (2013)
  • 著者名/発表者名: 廣田 俊, Ari Dwi Nugraheni, 山城信裕, 安藤勇輝, 長尾 聡, Zhonghua Wang, 柳澤幸子, 小倉尚志
  • 学会等名: 第40回生体分子科学討論会
  • 発表場所: 大阪大学吹田キャンパス（大阪府）
• [学会発表] 基質結合型インドールアミン2,3 ジオキシゲナーゼの基質の検出-紫外共鳴ラマン分光法 (2013)
  • 著者名/発表者名: 柳澤幸子, 原 雅行, 杉本 宏, 城 宜嗣, 小倉尚志
  • 学会等名: 第40回生体分子科学討論会
  • 発表場所: 大阪大学吹田キャンパス（大阪府）
• [学会発表] 休止酸化型チトクロムc酸化酵素の酸化還元部位の化学構造 (2013)
  • 著者名/発表者名: 坂口美幸, 新澤-伊藤恭子, 吉川信也, 小倉尚志
  • 学会等名: 感応性化学種が拓く新物質科学第２回公開シンポジウム
  • 発表場所: 九州大学医学部百年記念講堂（福岡県）
• [学会発表] 酵素反応中に見られる感応性化学種の振動分光法による補足と精密構造解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 小倉尚志
  • 学会等名: 感応性化学種が拓く新物質科学第２回公開シンポジウム
  • 発表場所: 九州大学医学部百年記念講堂（福岡県）
• [学会発表] チトクロムc酸化酵素の高効率プロトンポンプを可能にするタンパク質構造ダイナミクス: 振動分光法 (2013)
  • 著者名/発表者名: 小倉尚志
  • 学会等名: 第13回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: とりぎん文化会館（鳥取県）
  • 招待講演
• [学会発表] Real time observation of water-channel closure controlled by CuB in bovine cytochrome c oxidase using a novel high-sensitivity infrared system (2013)
  • 著者名/発表者名: Minoru Kubo, Satoru Nakashima, Satoru Yamaguchi, Takashi Ogura, Masao Mochizuki, Jiyoung Kang, Masaru Tateno, Kyoko Shinzawa-Itoh, Koji Kato, and Shinya Yoshikawa
  • 学会等名: International Conference on BioInorganic Chemistry ICBIC-16
  • 発表場所: Grenoble, France
• [学会発表] Mechanism for ligand discrimination in myoglobin (2013)
  • 著者名/発表者名: Yasuhiko Yamamoto, Ryu Nishimura, Tomokazu Shibata, Hulin Tai, Izumi Ishigami, Takashi Ogura, Satoshi Nagao, Takashi Matsuo, Shun Hirota, Kiyohiro Imai, Saburo Neya, and Akihiro Suzuki
  • 学会等名: International Conference on BioInorganic Chemistry ICBIC-16
  • 発表場所: Grenoble, France
• [学会発表] High-resolution femtosecond crystallography at SACLA, a challenge of reducing the X-ray radiation damage on super molecular assemblies (2013)
  • 著者名/発表者名: Hideo Ago, Kunio Hirata, Go Ueno, Hironori Murakami, Takehiko Tosha, Tamao Hisano, Minoru Kubo, Hiroshi Sugimoto, Yoshitsugu Shiro, Masaki Yamamoto, Eiki Yamashita, Jian-Ren Shen, Kyoko Shinzawa-Ito, Koji Kato, Miki Hatanaka, Shuhei Takemura, Naomine Yano, Takashi Ogura, Shinya Yoshikawa, and Tomitake Tsukihara
  • 学会等名: 11th International Conference on Biology and Synchrotron Radiation (BSR)
  • 発表場所: Grand Elysee Hotel Hamburg, Germany
• [学会発表] 完全酸化型チトクロム c 酸化酵素の酸化還元活性金属中心とアザイドの相互作用の分光学的研究 (2013)
  • 著者名/発表者名: Masahide Hikita, Akima Yamamoto, Tomoko Maeda, Kyoko Shinzawa-Itoh, Takashi Ogura, and Shinya Yoshikawa
  • 学会等名: 第51回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 京都国際会館（京都府）
• [学会発表] 発 表 標 題 チトクロムc 酸化酵素の酸素還元反応における赤外吸収測定を目的とした酸素肺フローシステムの開発 (2013)
  • 著者名/発表者名: Tatsuhito Nishiguchi, Masahide Hikita, Kyoko Shinzawa-Itoh, Shinya Yoshikawa, Satoru Nakashima, and Takashi Ogura
  • 学会等名: 第51回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 京都国際会館（京都府）
• [学会発表] インドールアミン2,3 ジオキシゲナーゼの基質トリプトファンの検出-紫外共鳴ラマン分光法 (2013)
  • 著者名/発表者名: achiko Yanagisawa, Masayuki Hara, Hiroshi Sugimoto, Yoshitsugu Shiro, and Takashi Oguara
  • 学会等名: 第51回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 京都国際会館（京都府）
• [学会発表] タンパク質中のトリプトファン残基の近紫外円二色性と紫外共鳴ラマンスペクトルの特性 (2013)
  • 著者名/発表者名: higenori Nagatomo, Masako Nagai, Takashi Ogura, and Teizo Kitagawa
  • 学会等名: 第51回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 京都国際会館（京都府）
• [学会発表] Interaction Between Heme and Heme-Cu Binuclear Center in Cytochrome c Oxidase (2013)
  • 著者名/発表者名: Miyuki Sakaguchi, Kyoko Shinzawa-Itoh, Shinya Yoshikawa, and Takashi Ogura
  • 学会等名: 第51回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 京都国際会館（京都府）
• [学会発表] 生体高分子の機能制御におけるゆらぎの役割 (2013)
  • 著者名/発表者名: 長友重紀
  • 学会等名: つくばソフトマター研究会2013
  • 発表場所: 筑波大学（茨城県）
  • 招待講演
• [学会発表] ヘモグロビンの機能制御における四次構造変化、α鎖，β鎖の役割：共鳴ラマン分光による研究 (2013)
  • 著者名/発表者名: 長友重紀
  • 学会等名: 第26回生物無機化学夏季セミナー（生物無機化学研究会）
  • 発表場所: 茨城県、阿字ケ浦クラブ
  • 招待講演
• [学会発表] Thermodynamic Study of Cyclic Oligomers via Hydrogen Bonds in Organic Liquids (2013)
  • 著者名/発表者名: higenori Nagatomo, Yasuhisa Yamamura, Kazuya Saito
  • 学会等名: The Fifth International Symposium on the New Frontiers of Thermal Studies of Materials.
  • 発表場所: Yokohama Media and Communications Center（神奈川県）
• [学会発表] チトクロムc酸化酵素によるプロトンポンプ反応の研究:時間分解赤外および共鳴ラマン分光法 (2013)
  • 著者名/発表者名: 小倉尚志
  • 学会等名: 分子研研究会「生物物質科学の展望」
  • 発表場所: 分子研明大寺地区(愛知県)(招待講演)
• [学会発表] 生体配位化学における高解像度の虫眼鏡:振動分光法 (2013)
  • 著者名/発表者名: 小倉尚志
  • 学会等名: 分子研研究会「生体配位化学の最前線と展望」
  • 発表場所: 分子研明大寺地区(愛知県)(招待講演)
• [学会発表] ミトコンドリア呼吸鎖電子伝達複合体Iに含まれるFMNの共鳴ラマンスペクトル (2013)
  • 著者名/発表者名: 引田理英、新澤伊藤恭子、森山昌和、小倉尚志、木平清人、吉川信也
  • 学会等名: 日本化学会第93春季年会
  • 発表場所: 立命館大学びわこ・くさつキャンパス(滋賀県)
• [学会発表] インドールアミン2, 3-ジオキシゲナーゼの共鳴ラマンスペクトル:基質結合による反応性の調節 (2013)
  • 著者名/発表者名: 柳澤幸子、原 雅之、杉本 宏、城宜嗣、小倉尚志
  • 学会等名: 日本化学会第93春季年会
  • 発表場所: 立命館大学びわこ・くさつキャンパス(滋賀県
• [学会発表] カルボン酸含有二核化配位子(BPG2E)を用いたパーオキソ二核鉄(III)錯体のO-O結合の開裂と基質酸化活性 (2013)
  • 著者名/発表者名: 平野智也、河原由佳、人見穣、小寺政人、小林義男、野村高志、小倉尚志
  • 学会等名: 日本化学会第93春季年会
  • 発表場所: 立命館大学びわこ・くさつキャンパス(滋賀県)
• [学会発表] Molecular Science of the Proteins in Organelles, Physiological Molecular Science of Membrane Proteins (2012)
  • 著者名/発表者名: Takashi Ogura
  • 学会等名: 分子高次系機能解明のための分子科学成果公開シンポジウム
  • 発表場所: 東京工業大学すずかけ台キャンパス(東京都)(招待講演)
• [学会発表] ヒト成人ヘモグロビンへのベザフィブラートの結合による酸素親和性低下に関連した三次構造変化の解明 (2012)
  • 著者名/発表者名: 長友重紀,濱田洋実,吉川裕之,斎藤一弥
  • 学会等名: 第39回生体分子科学討論会
  • 発表場所: 東北大学片平さくらホール(宮城県)
• [学会発表] トリプトファンの近紫外円二色性及び紫外共鳴ラマンに基づくヘモグロビンの四次構造変化の解明 (2012)
  • 著者名/発表者名: 長井雅子,長友重紀,長井幸史,大久保賢一,今井清博,北川禎三
  • 学会等名: 第39回生体分子科学討論会
  • 発表場所: 東北大学片平さくらホール(宮城県)
• [学会発表] 共鳴ラマン分光法によるインドールアミン2,3ジオキシゲナーゼの反応機構の研究 (2012)
  • 著者名/発表者名: 柳澤幸子,原雅行,杉本宏,城宜嗣,小倉尚志
  • 学会等名: 第39回生体分子科学討論会
  • 発表場所: 東北大学片平さくらホール(宮城県)
• [学会発表] Structural features in Functions of Heme Proteins Revealed by Resonance Raman Spectroscopy (2012)
  • 著者名/発表者名: Teizo Kitagawa
  • 学会等名: 国際プルフィリン・フタロシャニン学会
  • 発表場所: Jeju (Korea)(招待講演)
• [学会発表] Cooperative Dynamics of the Two Hemes in Cytochrome c Oxidase upon Ligand Binding Identified by Time-Resolved Resonance Raman Spectroscopy (2012)
  • 著者名/発表者名: Takashi Ogura, Izumi Ishigami, Takeshi Nishigaki, Satoru Nakashima, Kyoko Shinzawa-Itoha, and Shinya Yoshikawa
  • 学会等名: The 7th International Conference on Porphyrins and Phthalocyanines
  • 発表場所: Jeju (Korea)(招待講演)
• [学会発表] Dioxygenation reaction of indoleamine 2,3-dioxygenase as studied by resonance Raman spectroscopy (2012)
  • 著者名/発表者名: Sachiko Yanagisawa, Masayuki Hara, Hiroshi Sugimoto, Yoshitsugu Shiro, and Takashi Ogura
  • 学会等名: The 7th International Conference on Porphyrins and Phthalocyanines
  • 発表場所: Jeju (Korea)(招待講演)
• [学会発表] Proton Pump Mechanism of Cytochrome c Oxidase Elucidated by Highly Sensitive Time-Resolved IR Spectroscopy (2012)
  • 著者名/発表者名: Satoru Nakashima, Minoru Kubo, Satoru Yamaguchi, Takashi Ogura, Masao Mochizukia, Kyoko Shinzawa-Itoh, and Shinya Yoshikawa
  • 学会等名: The 7th International Conference on Porphyrins and Phthalocyanines
  • 発表場所: Jeju (Korea)(招待講演)
• [学会発表] Protein Dynamics of Cytochrome c Oxidase Studied by Time-Resolved Resonance Raman and Infrared Spectroscopy : Coupling between 0_2 Reduction and H^+-Pumping (2012)
  • 著者名/発表者名: Takashi Ogura
  • 学会等名: 国際ラマン分光学会
  • 発表場所: Bangalore (India)(招待講演)
• [学会発表] Effects of Heme Rotation around the Heme Normal by 90 °on Resonance Raman Spectra of Heme Proteins : Observation for Heme Oxygenase (2012)
  • 著者名/発表者名: Sachiko Yanagisawa, Hiroshi Fujii, Saburo Neya, Takashi Ogura, and Teizo Kitagawa
  • 学会等名: 国際ラマン分光学会
  • 発表場所: Bangalore (India)(招待講演)
• [学会発表] Essence in oxygen affinity regulation of human adult hemoglobin : Change of Fe-His bond length by quaternary or tertiary structure change (2012)
  • 著者名/発表者名: Shigenori Nagatomo, Yasuhisa Yamamura, and Kazuya Saito
  • 学会等名: The 50th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
  • 発表場所: Nagoya University (Aichi)
• [学会発表] Substitution effects of Gly for the proximal His of α subunits on the structure and oxygen binding function of human hemoglobin (2012)
  • 著者名/発表者名: Yayoi Aki, Yukifumi Nagai, Kiyohiro Imai, Shigenori Nagatomo, Takashi Ogura, Teizo Kitagawa, and Masako Nagai
  • 学会等名: The 50th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
  • 発表場所: Nagoya University (Aichi)
• [学会発表] An Intermediate Conformation of Cytochrome Oxidase in the Ligand-Free State Identified by Time-Resolved Resonance Raman Spectroscopy (2012)
  • 著者名/発表者名: Izumi Ishigami, Takeshi Nishigaki, Kyoko Shinzawa-Itoh, Shinya Yoshikawa, Satoru Nakashima, and Takashi Ogura
  • 学会等名: The 50th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
  • 発表場所: Nagoya University (Aichi)
• [学会発表] The assignment of the resonance Raman bands of heme a peripheral substituents in cytochrome c oxidase (2012)
  • 著者名/発表者名: Miyuki Sakaguchi, Yukie Katayama, Hiroshi Fujii, Hideo Shimada, and Takashi Ogura
  • 学会等名: The 50th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
  • 発表場所: Nagoya University (Aichi)
• [学会発表] Ultraviolet Resonance Raman Study on Indoleamine 2, 3-Dioxygenase (2012)
  • 著者名/発表者名: Masayuki Hara, Sachiko Yanagisawa, Hiroshi Sugimoto, Yoshitsugu Shiro, and Takashi Ogura
  • 学会等名: The 50th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
  • 発表場所: Nagoya University (Aichi)
• [学会発表] Effects of Heme Rotation around the Heme Normal by 90°on Resonance Raman Spectra of Heme Proteins; Observation for Heme Oxygenase (2012)
  • 著者名/発表者名: Sachiko Yanagisawa, Hiroshi Fujii, Saburo Neya, Takashi Ogura, and Teizo Kitagawa
  • 学会等名: The 50th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
  • 発表場所: Nagoya University (Aichi)
• [学会発表] Time-Resolved IR Analyses of Proteins Using a Novel Pulse Flow System Synchronized with Pump/Probe Lasers (2012)
  • 著者名/発表者名: Minoru Kubo, Satoru Nakashima, Masao Mochizuki, Kyoko Shinzawa-Itoh, Shinya Yoshikawa, Takashi Ogura, and Teizo Kitagawa
  • 学会等名: The 50th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
  • 発表場所: Nagoya University (Aichi)
• [学会発表] Structural Mechanism of Target Molecule Recognition by Gas Sensor Heme Proteins (2012)
  • 著者名/発表者名: Teizo. Kitagawa
  • 学会等名: アジア生物無機化学会
  • 発表場所: 香港(中国)(招待講演)
• [学会発表] 巨大タンパク質内での反応を観る:時間分解赤外および共鳴ラマン分光法 (2012)
  • 著者名/発表者名: 小倉尚志
  • 学会等名: 第1回分光イノベーションシンポジウム
  • 発表場所: 東京工業大学・百年記念館(東京都)(招待講演)
• [学会発表] Relation among Fe-His bond, fluctuations of helices and oxygen affinity of hemoglobin in T-state and R-state (2012)
  • 著者名/発表者名: Shigenori Nagatomo, Yukiko Ozeki, Yasuhisa Yamamura, and Kazuya Saito
  • 学会等名: Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions, 6th International Symposium
  • 発表場所: Kyoto University (Kyoto)
• [学会発表] ヒトヘモグロビンの酸素結合機能における近位ヒスチジンの役割 (2012)
  • 著者名/発表者名: 丸山夏未,安芸弥生,長井幸史,今井清博,長友重紀,小倉尚志,北川禎三,長井雅子
  • 学会等名: 第85回日本生化学会大会
  • 発表場所: 福岡国際会議場・マリンメッセ福岡(福岡県)