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単一細胞内DNA分子数の新規デジタルカウンティング手法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 24360344
研究種目

基盤研究(B)

配分区分一部基金
応募区分一般
研究分野 生物機能・バイオプロセス
研究機関早稲田大学

研究代表者

竹山 春子  早稲田大学, 理工学術院, 教授 (60262234)

研究分担者 横田 恭子  国立感染症研究所, 免疫部, 室長 (20182701)
細川 正人  早稲田大学, ナノ・ライフ創新研究機構, 次席研究員(研究院助教) (60722981)
研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
18,980千円 (直接経費: 14,600千円、間接経費: 4,380千円)
2014年度: 6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
2013年度: 6,370千円 (直接経費: 4,900千円、間接経費: 1,470千円)
2012年度: 6,110千円 (直接経費: 4,700千円、間接経費: 1,410千円)
キーワードDNA / HIV / デジタルカウント / 一分子PCR / 単一細胞 / デジタルカウンティング / 1分子PCR / マイクロ流体デバイス
研究成果の概要

本研究では、細胞中に含まれる低コピーのウイルスDNAをデジタル精密計測する技術を開発することを目的とした。このために、マイクロ流体デバイスで形成したピコリットル容量のマイクロドロップレットを用いてDNA分子を増幅・検出するシステムを開発した。本システムの応用として、HIV-1を模倣したレンチウイルス感染細胞をサンプルとし、感染後の細胞内でのウイルスDNAの動態を経時追跡した。

報告書

(4件)
  • 2014 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2013 実績報告書
  • 2012 実績報告書
  • 研究成果

    (26件)

すべて 2015 2014 2013 2012 その他

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (20件) (うち招待講演 2件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Humanized mice dually challenged with R5 and X4 HIV-1 show preferential R5 viremia and restricted X4 infection of CCR5+CD4+ T cells.2015

    • 著者名/発表者名
      Terahara, K., Ishige, M., Ikeno, S., Okada, S., Kobayashi-Ishihara, M., Ato, M., and Tsunetsugu-Yokota, Y
    • 雑誌名

      Microbes and Infection

      巻: 10.1016/j.micinf.2015.02.002 号: 5 ページ: 378-386

    • DOI

      10.1016/j.micinf.2015.02.002

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Droplet-Based Microfluidics for High-Throughput Screening of a Metagenomic Library for Isolation of Microbial Enzymes2014

    • 著者名/発表者名
      M. Hosokawa, Y. Hoshino, Y. Nishikawa, T. Hirose, D.H. Yoon, T. Mori, T. Sekiguchi, S. Shoji, H. Takeyama
    • 雑誌名

      Biosensors and Bioelectronics

      巻: なし ページ: 379-385

    • DOI

      10.1016/j.bios.2014.08.059

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Sensitive detection of measles virus infection in the blood and tissues of humanized mouse by one-step quantitative RT-PCR2013

    • 著者名/発表者名
      Shota Ikeno, Moto-omi Suzuki, Mahmod Muhsen, Masayuki Ishige, Mie Kobayashi, Shinji Ohno, Makoto Takeda, Tetsuo Nakayama, Yuko Morikawa, Kazutaka Terahara, Seiji Okada, Haruko Takeyama, Yasuko Tsunetsugu-Yokota
    • 雑誌名

      Frontiers in Microbiology

      巻: 4 ページ: 298-298

    • DOI

      10.3389/fmicb.2013.00298

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Expansion of activated memory CD4+ T cells affects infectivity of CCR5-tropic HIV-1 in humanized NOD/SCID/JAK3null mice2013

    • 著者名/発表者名
      Kazutaka Terahara, Masayuki Ishige, Shota Ikeno, Yu-ya Mitsuki, Seiji Okada, Kazuo Kobayashi, Yasuko Tsunetsugu-Yokota
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 8(1) 号: 1 ページ: 8-8

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0053495

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] HIV-1 infection ex vivoaccelerates measles virus infection by upregulating signaling lymphocytic activation molecule (SLAM) in CD4+T cells2012

    • 著者名/発表者名
      Mitsuki Y, Terahara K, Shibusawa K, Yamamoto T, Tsuchiya T, Ishige M, Kobayashi K, Morikawa Y, Nakayama T, Takeda M, Yanagi Y, Tsunetsugu-Yokota Y
    • 雑誌名

      J Virol

      巻: 86 号: 13 ページ: 7227-7234

    • DOI

      10.1128/jvi.06681-11

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] マイクロドロップレットを反応場とした1分子DNA増幅法の応用2015

    • 著者名/発表者名
      細川 正人,西川 洋平,川井 聡子,横田(恒次)恭子,竹山 春子
    • 学会等名
      電気化学学会第82回大会
    • 発表場所
      横浜国立大学(神奈川県)
    • 年月日
      2015-03-15
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 恒常的に培養維持されたCD4陽性T細胞へのHIV-1の感染とその転写制御機構の解明2014

    • 著者名/発表者名
      和田倭、小林(石原)美栄、寺原和孝、池野翔太、徳永研三、立川(川名)愛、山岸誠、竹山春子、横田(恒次)恭子
    • 学会等名
      第62回日本ウイルス学会学術集会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県)
    • 年月日
      2014-11-12
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ヒト化マウスの麻疹ウイルスベクター評価系への応用(3)2014

    • 著者名/発表者名
      池野 翔太、寺原 和孝、 駒瀬 勝啓、竹田 誠、 森川 裕子、 竹山 春子、横田(恒次)恭子
    • 学会等名
      第62回日本ウイルス学会学術集会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県)
    • 年月日
      2014-11-11
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] R5・X4 HIV-1混在感染ヒト化マウスの感染早期にみられるR5ウイルス優位性とその要因について2014

    • 著者名/発表者名
      寺原和孝、石毛真行、池野翔太、小林(石原)美栄、岡田誠治、横田(恒次)恭子
    • 学会等名
      第62回日本ウイルス学会学術集会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県)
    • 年月日
      2014-11-10
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 海洋無脊椎動物共在微生物の遺伝子情報の解析と利活用2014

    • 著者名/発表者名
      竹山春子
    • 学会等名
      2014年生物工学フォーラム「先端技術による新たなバイオテクノロジー」
    • 発表場所
      理化学研究所 大河内記念ホール(埼玉県)
    • 年月日
      2014-07-25
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 海洋遺伝子資源利用と解析ツール開発2014

    • 著者名/発表者名
      竹山春子
    • 学会等名
      「生合成マシナリー:生物活性物質構造多様性創出システムの解明と制御」第7回公開シンポジウム
    • 発表場所
      東工大蔵前会館 くらまえホール(東京都)
    • 年月日
      2014-06-21
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Development of Capillary-Plate-Based Digital PCR System for Analysis of HIV in Single-Cells2012

    • 著者名/発表者名
      Motoomi Suzuki, Tetsushi Mori, Kazutaka Terahara, Yasuko Yokota-Tsunetsugu, Haruko Takeyama
    • 学会等名
      International Joint Symposium on Single-Cell Analysis (The 6th International Workshop on Approaches to Single-Cell Analysis & The 8th International Forum on Post-Genome Technologies)
    • 発表場所
      京都市、京都
    • 年月日
      2012-11-27
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Development of a high-throughput microfluidic system for screening of single bacterial cells2012

    • 著者名/発表者名
      Yuri Hoshino, Tomotada Hirose, Donghyun Yoon, Tetsushi Mori, Tetsushi Sekiguchi, Shuichi Shoji, Haruko Takeyama
    • 学会等名
      International Joint Symposium on Single-Cell Analysis (The 6th International Workshop on Approaches to Single-Cell Analysis & The 8th International Forum on Post-Genome Technologies)
    • 発表場所
      京都市、京都
    • 年月日
      2012-11-27
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 海洋遺伝子資源の有効活用とシングルセル解析研究について2012

    • 著者名/発表者名
      竹山春子
    • 学会等名
      第50回ワーキンググループ会議
    • 発表場所
      新宿、東京
    • 年月日
      2012-11-21
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] キャピラリープレートを用いた単一細胞解析のためのデジタルPCR法の開発とHIV研究へのアプローチ2012

    • 著者名/発表者名
      鈴木基臣、モリテツシ、寺原和孝、横田(恒次)恭子、竹山春子
    • 学会等名
      第6回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      札幌市、北海道
    • 年月日
      2012-09-06
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Development of High-throughput Screening System using Microfluidic Device2012

    • 著者名/発表者名
      Yuri Hoshino, Tomotada Hirose, Donghyun Yoon, Tetsushi Mori, Tetsushi Sekiguchi, Shuichi Shoji, Haruko Takeyama
    • 学会等名
      The 9th Asia-Pacific Marine Biotechnology Conference
    • 発表場所
      高知市、高知
    • 年月日
      2012-07-13
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Humanized mice as animal model for Human-tropic virus infection2012

    • 著者名/発表者名
      Tsunetsugu-Yokota, Y., Ishige, M., Ikeno, S., and Terahara, K.
    • 学会等名
      Immunological Mechanisms of Vaccination, Keystone Symposium
    • 発表場所
      Ottawa, Canada
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Development of Droplet-Based Single-Cell Analysis System for Enzyme Screening from Metagenome Library

    • 著者名/発表者名
      Masahito Hosokawa, Yuri Hoshino, Tomotada Hirose, Donghyun Yoon, Tetsushi Mori, Tetsushi Sekiguchi, Shuichi Shoji, Haruko Takeyama
    • 学会等名
      Fronties of Single Cell Analysis
    • 発表場所
      Stanford University (米国)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 単一細胞封入ドロップレットを用いた微生物の薬剤感受性評価

    • 著者名/発表者名
      西川洋平、細川正人、星野友梨、廣瀬智渉、尹棟鉉、モリテツシ、関口哲志、庄子習一、竹山春子
    • 学会等名
      電気化学会第81回大会
    • 発表場所
      関西大学
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] HIVの初期感染過程の解析のためのドロップレットデジタルPCR 法の確立

    • 著者名/発表者名
      和田倭、細川正人、小林(石原)美栄 、モリテツシ、関口哲志、庄子習一、横田(恒次)恭子 、竹山春子
    • 学会等名
      日本化学会第94春季年会
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] マイクロドロップレットを利用した難培養微生物からの遺伝子獲得

    • 著者名/発表者名
      細川正人、星野友梨、廣瀬智渉、尹棟鉉、モリテツシ、関口哲志、庄子習一、竹山春子
    • 学会等名
      第23回インテリジェント材料・システムシンポジウム
    • 発表場所
      早稲田大学
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] マイクロ流体デバイスを用いた酵素遺伝子のハイスループットスクリーニング法の開発

    • 著者名/発表者名
      星野友梨、細川正人、廣瀬智渉、ユンドンヒョン、モリテツシ、関口哲志、庄子習一、竹山春子
    • 学会等名
      第3回 CSJ化学フェスタ
    • 発表場所
      タワーホール船堀
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] マイクロ流体デバイスを用いた遺伝子スクリーニング法の開発

    • 著者名/発表者名
      星野友梨、細川正人、廣瀬智渉、ユンドンヒョン、モリテツシ、関口哲志、庄子習一、竹山春子
    • 学会等名
      第7回 バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] マイクロ流体デバイスを用いた微生物スクリーニングシステムの開発

    • 著者名/発表者名
      細川正人、星野友梨、廣瀬智渉、ユン ドン ヒョン、モリテツシ、関口哲志、庄子習一、竹山春子
    • 学会等名
      2013年電気化学秋季大会
    • 発表場所
      東京工業大学
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ヒト化マウスの麻疹ウイルスベクター評価系への応用

    • 著者名/発表者名
      池野翔太、鈴木基臣、寺原和孝、石毛真行、駒瀬勝啓、竹田誠、森川裕子、中山哲夫、柳雄介、竹山春子、横田恭子
    • 学会等名
      第61回日本ウイルス学会学術集会
    • 発表場所
      神戸国際会議場
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [図書] 遺伝子工学(近藤昭彦・芝崎誠司編著)2012

    • 著者名/発表者名
      竹山春子
    • 総ページ数
      4
    • 出版者
      化学同人(分担執筆:第11章 バイオ計測の項)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書

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公開日: 2012-04-24   更新日: 2019-07-29  

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