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ヒト由来膜タンパク質のNMR構造解析に向けた基盤研究

研究課題

研究課題/領域番号 24370048
研究種目

基盤研究(B)

配分区分一部基金
応募区分一般
研究分野 構造生物化学
研究機関横浜市立大学

研究代表者

高橋 栄夫  横浜市立大学, 大学院生命医科学研究科, 教授 (60265717)

研究分担者 竹内 恒  産業技術総合研究所, 創薬分子プロファイリング研究センター, 主任研究員 (20581284)
連携研究者 坂倉 正義  横浜市立大学, 大学院生命医科学研究科, 助教 (20334336)
研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
17,810千円 (直接経費: 13,700千円、間接経費: 4,110千円)
2014年度: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2013年度: 5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円)
2012年度: 7,930千円 (直接経費: 6,100千円、間接経費: 1,830千円)
キーワードNMR / 膜タンパク質 / 酵母
研究成果の概要

酵母発現系を用いることで、大腸菌発現系では調製することが困難なヒト由来膜タンパク質について、NMRを用いた構造解析を行うための試料調製手法の開拓を行った。この結果、複数のヒト膜タンパク質を酵母の細胞膜中に発現させることに成功するとともに、様々なバリエーションの安定同位体ラベル手法を確立し、NMRを用いた膜タンパク質の構造解析に利用できることを示した。本研究により確立した酵母を用いた膜タンパク質の安定同位体ラベル手法は、様々な膜タンパク質に対して応用可能であり、汎用性が高いと考える。

報告書

(4件)
  • 2014 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2013 実績報告書
  • 2012 実績報告書
  • 研究成果

    (31件)

すべて 2015 2014 2013 2012 その他

すべて 雑誌論文 (8件) (うち査読あり 7件、 オープンアクセス 1件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (22件) (うち招待講演 5件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Dynamic multidrug recognition by multidrug transcriptional repressor LmrR2014

    • 著者名/発表者名
      Takeuchi K, Tokunaga Y, Imai M, Takahashi H, Shimada I.
    • 雑誌名

      Sci Rep

      巻: 4 号: 1 ページ: 6922-6922

    • DOI

      10.1038/srep06922

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Allosteric enhancement of MAP kinase p38α's activity and substrate selectivity by docking interactions2014

    • 著者名/発表者名
      Tokunaga Y, Takeuchi K, Takahashi H, Shimada I
    • 雑誌名

      Nat Struct Mol Biol

      巻: 21 号: 8 ページ: 704-711

    • DOI

      10.1038/nsmb.2861

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Structure-based approach to improve a small-molecule inhibitor by the use of a competitive peptide ligand.2014

    • 著者名/発表者名
      Ono K, Takeuchi K, Ueda H, Morita Y, Tanimura R, Shimada I, Takahashi H.
    • 雑誌名

      Angew Chem Int Ed Engl

      巻: 53 号: 10 ページ: 2597-2597

    • DOI

      10.1002/anie.201310749

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Perdeuteration and methyl-selective (1)H, (13)C-labeling by using a Kluyveromyces lactis expression system2013

    • 著者名/発表者名
      Miyazawa-Onami M, Takeuchi K, Takano T, Sugiki T, Shimada I, Takahashi H.
    • 雑誌名

      J Biomol NMR

      巻: 57 号: 3 ページ: 297-304

    • DOI

      10.1007/s10858-013-9789-8

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Rapid identification of ligand-binding sites by using an assignment-free NMR approach2013

    • 著者名/発表者名
      Kodama Y, Takeuchi K, Shimba N, Ishikawa K, Suzuki E, Shimada I, Takahashi H.
    • 雑誌名

      J Med Chem

      巻: 56 号: 22 ページ: 9342-9350

    • DOI

      10.1021/jm4014357

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] NMRでリガンド分子の活性部位を探索する2013

    • 著者名/発表者名
      高橋栄夫
    • 雑誌名

      化学

      巻: 68 ページ: 39-43

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [雑誌論文] NMR study of ligand release from asialoglycoprotein receptor under solution conditions in early endosomes2012

    • 著者名/発表者名
      Onizuka T, Shimizu H, Moriwaki Y, Nakano T, Kanai S, Shimada I, Takahashi H.
    • 雑誌名

      FEBS J

      巻: 279 号: 15 ページ: 2645-2656

    • DOI

      10.1111/j.1742-4658.2012.08643.x

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis for the Golgi association by the pleckstrin homology domain of the ceramide trafficking protein (CERT)2012

    • 著者名/発表者名
      Sugiki T, Takeuchi K, Yamaji T, Takano T, Tokunaga Y, Kumagai K, Hanada K, Takahashi H, and Shimada I
    • 雑誌名

      J Biol Chem

      巻: 287 号: 40 ページ: 33706-33718

    • DOI

      10.1074/jbc.m112.367730

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] NMR解析を指向した酵母発現系による安定同位体標識ヒト膜タンパク質試料の調製2015

    • 著者名/発表者名
      鈴木里佳、坂倉正義、伏見威俊、小池賢一郎、高橋栄夫
    • 学会等名
      日本薬学会第135年会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2015-03-25 – 2015-03-28
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 緩和現象を活用したNMRによる分子間相互作用解析2015

    • 著者名/発表者名
      高橋栄夫
    • 学会等名
      第23回ERATOタンパク質関連情報交換会
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2015-01-29
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 創薬とNMRと計算科学2015

    • 著者名/発表者名
      高橋栄夫
    • 学会等名
      第358回CBI学会講演会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2015-01-14
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] NMR構造解析に向けたヒト膜タンパク質の酵母発現系の構築2014

    • 著者名/発表者名
      坂倉正義、伏見威俊、小池賢一郎、鈴木里佳、山田有紗、高橋栄夫
    • 学会等名
      第37回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2014-11-25 – 2014-11-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 高難度タンパク質のNMR解析に向けた酵母発現系の活用2014

    • 著者名/発表者名
      高橋栄夫、大浪真由美、杉木俊彦、坂倉正義、竹内恒、嶋田一夫
    • 学会等名
      第53回NMR討論会
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2014-11-04 – 2014-11-06
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 緩和現象を活用したNMR相互作用解析技術2014

    • 著者名/発表者名
      高橋栄夫
    • 学会等名
      若手NMR研究会
    • 発表場所
      千葉
    • 年月日
      2014-07-12
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Drug Discovery and Design by NMR2014

    • 著者名/発表者名
      高橋栄夫
    • 学会等名
      よこはまNMR研究会 第50回記念公開ワークショップ
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2014-07-09
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] NMR解析を指向したヒト膜タンパク質の酵母発現系の構築2014

    • 著者名/発表者名
      坂倉正義、伏見威俊、小池賢一郎、高橋栄夫
    • 学会等名
      第14回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2014-06-25 – 2014-06-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] NMRによるタンパク質被認識部位の同定法2014

    • 著者名/発表者名
      高橋栄夫
    • 学会等名
      第1回蛋白質工学研究会ワークショップ
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2014-05-24
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] NMRによるタンパク質相互作用とそのアロステリック阻害機構の解明2012

    • 著者名/発表者名
      高橋栄夫
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会年会・ワークショップ「NMRで見るタンパク質の機能発現」
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡)
    • 年月日
      2012-12-12
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Pharmaceutical NMR techniques: NMR approach for ligand-based drug discovery2012

    • 著者名/発表者名
      H. Takahashi
    • 学会等名
      Pharmaceutical NMR lecture series in Osaka
    • 発表場所
      大阪大学(大阪)
    • 年月日
      2012-10-25
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] NMR approach for ligand-based drug discovery: DIRECTION approach for the pharmacophore mapping of drug candidates2012

    • 著者名/発表者名
      H. Takahashi
    • 学会等名
      The 3rd International Symposium on Drug Discovery and Design by NMR
    • 発表場所
      理研横浜研究所(横浜)
    • 年月日
      2012-10-12
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] A pharmacophore mapping by DIRECTION apaproach2012

    • 著者名/発表者名
      H. Takahashi
    • 学会等名
      25th International Conference of Magnetic Resonance in Biological Systems
    • 発表場所
      Lyon Convention Center (Lyon)
    • 年月日
      2012-08-23
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Rapid identification of protein-protein interfaces for the construction of a complex model based on multiple unassigned signals by using time-sharing NMR measurements2012

    • 著者名/発表者名
      Y. Kodama
    • 学会等名
      25th International Conference of Magnetic Resonance in Biological Systems
    • 発表場所
      Lyon Convention Center (Lyon)
    • 年月日
      2012-08-23
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 天然物リガンドの「鍵」構造を探索するNMR相互作用解析技術2012

    • 著者名/発表者名
      高橋栄夫
    • 学会等名
      新学術領域研究天然物ケミカルバイオロジー~分子標的と活性制御~第2回公開シンポジウム
    • 発表場所
      東京大学「東京」
    • 年月日
      2012-06-17
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 酵母K.lactis発現系を用いた高分子量蛋白質の重水素化およびメチル選択標識2012

    • 著者名/発表者名
      竹内怛
    • 学会等名
      第51回NMR討論会
    • 発表場所
      ウインクあいち(名古屋)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 部位特異的アミノ酸選択標識とタンパク質立体構造を活用した相互作用界面の同定2012

    • 著者名/発表者名
      小玉優哉
    • 学会等名
      第51回NMR討論会
    • 発表場所
      ウインクあいち(名古屋)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] MAPキナーゼp38aの活性および基質選択性のアロステリックな調節機構の解明2012

    • 著者名/発表者名
      徳永裕二
    • 学会等名
      第51回NMR討論会
    • 発表場所
      ウインクあいち(名古屋)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] NMR for Drug Discovery

    • 著者名/発表者名
      H. Takahashi
    • 学会等名
      RRR Workshop 2014
    • 発表場所
      京都・立命館大学朱雀キャンパス
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] NMRによる高分子量タンパク質を標的としたリガンドエピトープ解析

    • 著者名/発表者名
      五百磐徹、坂倉正義、高橋栄夫
    • 学会等名
      日本薬学会第134年会
    • 発表場所
      熊本大学工学部百周年記念館
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] NMR構造解析を指向したヒト膜タンパク質の酵母発現系の構築

    • 著者名/発表者名
      坂倉正義、白石佑太、伏見威俊、小池賢一郎、高橋栄夫
    • 学会等名
      日本薬学会第134年会
    • 発表場所
      熊本市総合体育館
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] NMRを用いたAMPA型グルタミン酸受容体リガンド結合ドメインとそのリガンドの相互作用解析

    • 著者名/発表者名
      伊東優拡、坂倉正義、高橋栄夫
    • 学会等名
      日本薬学会第134年会
    • 発表場所
      熊本市総合体育館
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [図書] 生体有機化学(橋本祐一, 村田道雄編著)「第7章タンパク質と生体小分子の相互作用2」2012

    • 著者名/発表者名
      高橋栄夫, 嶋田一夫
    • 総ページ数
      220
    • 出版者
      東京化学同人
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書

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公開日: 2012-04-24   更新日: 2019-07-29  

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