• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

大規模ゲノム情報と自殖F2集団を利用したナシ育種の効率化と新規優良品種の育成

研究課題

研究課題/領域番号 24380022
研究種目

基盤研究(B)

配分区分一部基金
応募区分一般
研究分野 園芸学・造園学
研究機関京都府立大学 (2016)
鳥取大学 (2012-2015)

研究代表者

板井 章浩  京都府立大学, 生命環境科学研究科(系), 教授 (10252876)

研究分担者 児玉 基一朗 (児玉 基一郎)  鳥取大学, 農学部, 教授 (00183343)
村山 秀樹  山形大学, 農学部, 教授 (40230015)
山本 俊哉  国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, その他部局等, その他 (60355360)
研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
19,110千円 (直接経費: 14,700千円、間接経費: 4,410千円)
2015年度: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2014年度: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2013年度: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2012年度: 6,240千円 (直接経費: 4,800千円、間接経費: 1,440千円)
キーワードナシ / 連鎖地図 / 病害罹病性 / QTL解析 / QTL解析 / 病害抵抗性育種 / 単為結実性 / マーカー育種 / 果実形質 / 病害抵抗性 / SSR / 単為結果 / 黒星病 / ショ糖蓄積 / 次世代シークエンサー / SNP / SSR
研究成果の概要

本研究は、ナシ自殖F2集団を材料にして、リンゴゲノム情報および次世代シーケンサーにより取得したニホンナシおよびセイヨウナシのESTおよびゲノム配列の大規模ゲノム情報を統合し、病害抵抗性、単為結果性、などの有用形質に関するマーカー開発を行い、育種現場で実際に適用し、新品種開発に役立てることを目的として実験を行った。 ‘おさ二十世紀’X‘マックスレッドバートレット’のF2集団においては、連鎖地図を作成し、ブラウンスポット病罹病性に関するQTL解析を行い、近傍のマーカーを得た。これらは育種に利用可能である。また単為結果性に関してはRNA-seq解析を駆使し、単為結果性に関連する転写因子群を同定した。

報告書

(6件)
  • 2016 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 2012 実績報告書
  • 研究成果

    (42件)

すべて 2016 2015 2014 2013 2012 その他

すべて 雑誌論文 (19件) (うち国際共著 1件、 査読あり 19件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (21件) (うち招待講演 2件) 図書 (2件)

  • [雑誌論文] alidation of molecular markers associated with fruit ripening day of Japanese pear (Pyrus pyrifolia Nakai) using variance components.2016

    • 著者名/発表者名
      Nishio, S.
    • 雑誌名

      Scientia Horticulturae

      巻: 199 ページ: 9-14

    • DOI

      10.1016/j.scienta.2015.12.032

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genomics of pear and other Rosaceae fruit trees2016

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto, T.
    • 雑誌名

      Breeding Science

      巻: 66 号: 1 ページ: 148-159

    • DOI

      10.1270/jsbbs.66.148

    • NAID

      130005141825

    • ISSN
      1344-7610, 1347-3735
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Fine mapping of the gene for susceptibility to black spot disease in Japanese pear (<i>Pyrus pyrifolia</i> Nakai)2016

    • 著者名/発表者名
      Terakami, S.
    • 雑誌名

      Breeding Science

      巻: 66 号: 2 ページ: 271-280

    • DOI

      10.1270/jsbbs.66.271

    • NAID

      130005144053

    • ISSN
      1344-7610, 1347-3735
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Comparison of the expression of chlorophyll-degradation-related genes during ripening between stay-green and yellow-pear cultivars2015

    • 著者名/発表者名
      Nongluk Charoenchongsuk, Kazuo Ikeda, Akihiro Itai, Akira Oikawa, Hideki Murayama
    • 雑誌名

      Scientia Horticulturae

      巻: 181 ページ: 89-94

    • DOI

      10.1016/j.scienta.2014.10.005

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genetic mapping and pyramiding of two new pear scab resistance QTLs2015

    • 著者名/発表者名
      Perchepied, L.
    • 雑誌名

      Molecular Breeding

      巻: 35 号: 10 ページ: 197-197

    • DOI

      10.1007/s11032-015-0391-5

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Transcriptome-based single nucleotide polymorphism markers for genome mapping in Japanese pear (Pyrus pyrifolia Nakai)2015

    • 著者名/発表者名
      Terakami S.
    • 雑誌名

      Tree Genetics & Genomes

      巻: 10 号: 4 ページ: 853-863

    • DOI

      10.1007/s11295-014-0726-0

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] セイヨウナシ果実の樹上完熟を阻害する要因2015

    • 著者名/発表者名
      Murayama H.
    • 雑誌名

      The Horticulture Journal

      巻: 84 号: 1 ページ: 14-20

    • DOI

      10.2503/hortj.MI-015

    • NAID

      130005065753

    • ISSN
      2189-0102, 2189-0110
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Identification of QTLs controlling harvest time and fruit skin color in Japanese pear (<i>Pyrus pyrifolia</i> Nakai)2014

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto T.
    • 雑誌名

      Breeding Science

      巻: 64 号: 4 ページ: 351-361

    • DOI

      10.1270/jsbbs.64.351

    • NAID

      130004888875

    • ISSN
      1344-7610, 1347-3735
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Microarray analysis of gene expression patterns during fruit development in European pear (Pyrus communis).2013

    • 著者名/発表者名
      奈島 賢児
    • 雑誌名

      Scientia Horticulturae

      巻: 164 ページ: 466-473

    • DOI

      10.1016/j.scienta.2013.09.054

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Transcriptome Analysis of Giant Pear Fruit with Fruit-specific DNA Reduplication on a Mutant Branch2013

    • 著者名/発表者名
      Nashima K
    • 雑誌名

      Journal of the Japanese Society for Horticultural Science

      巻: 82 ページ: 301-311

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] DNA markers developed from genome sequencing analysis in Japanese pear (Pyrus pyrifolia).2013

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto T.
    • 雑誌名

      Acta Horticulturae

      巻: 976 ページ: 477-483

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Agrobacterium-mediated genetic transformation using cotyledons in Japanese pear (Pyrus pyrifolia).2013

    • 著者名/発表者名
      Nakajima I.
    • 雑誌名

      Breeding Science

      巻: 66 ページ: 275-283

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genomic prediction of trait segregation in a progeny population: a case study of Japanese pear (Pyrus pyrifolia).2013

    • 著者名/発表者名
      Iwata H.
    • 雑誌名

      BMC Genetics

      巻: 14 号: 1 ページ: 81-81

    • DOI

      10.1186/1471-2156-14-81

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Potential assessment of genome-wide association study and genomic selection in Japanese pear Pyrus pyri瓦五a.2013

    • 著者名/発表者名
      Iwata, H.
    • 雑誌名

      Breeding Science

      巻: 63 ページ: 125-140

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Transcriptome analysis of Pyrus pyrifolia leaf buds during transition from endodormancy to ecodormancy2012

    • 著者名/発表者名
      Nishitani, C.
    • 雑誌名

      Scientia Horticulturae

      巻: 147 ページ: 49-55

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Analyses of early rough bark phenotype found in seedlings of a cross between the European pear'Bartlett' and the Chinese pear Yali2012

    • 著者名/発表者名
      Ogata, A.
    • 雑誌名

      Scientia Horticulturae

      巻: 148 ページ: 1-8

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 4塩基,5塩基モチーフSSRマーカーのニホンナシ品種識別への利用2012

    • 著者名/発表者名
      山本俊哉
    • 雑誌名

      DNA多型

      巻: 20 ページ: 58-61

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Complete sequence of the chloroplast genome from pear (Pyrus pyrifolia) : genome structure and comparative analysis.2012

    • 著者名/発表者名
      Terakami, S.
    • 雑誌名

      Tree Genetics & Genomes

      巻: 8 ページ: 841-854

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Redefinition of the map position and validation of a major quantitative trait locus for fire blight resistance of the pear cultivar 'Harrow Sweet' (Pyrus communis L.).2012

    • 著者名/発表者名
      Pierre-Marie, F.
    • 雑誌名

      Plant Breeding

      巻: 131 号: 5 ページ: 656-664

    • DOI

      10.1111/j.1439-0523.2012.02000.x

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] ナシ果実成熟期の ACC 合成酵素遺伝子 (PpACS1) のプロモーター領域のメチル化解析2015

    • 著者名/発表者名
      板井章浩
    • 学会等名
      植物化学調節学会
    • 発表場所
      東京大学
    • 年月日
      2015-10-23
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] ナシブラウンスポット病罹病性遺伝子座のマッピング2015

    • 著者名/発表者名
      友松康一
    • 学会等名
      園芸学会
    • 発表場所
      徳島大学
    • 年月日
      2015-09-26
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] セイヨウナシACC合成酵素遺伝子(PcACS1)の低温誘導性発現メカニズムの解析2015

    • 著者名/発表者名
      藤井美希
    • 学会等名
      園芸学会
    • 発表場所
      徳島大学
    • 年月日
      2015-09-26
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] ニホンナシの収穫期に関連するDNAマーカーの検証2015

    • 著者名/発表者名
      西尾聡悟
    • 学会等名
      園芸学会
    • 発表場所
      千葉大学
    • 年月日
      2015-03-28 – 2015-03-29
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ニホンナシ品種の糖組成およびSSR多型による遺伝的類縁関係の評価2015

    • 著者名/発表者名
      小仁所邦彦
    • 学会等名
      園芸学会
    • 発表場所
      千葉大学
    • 年月日
      2015-03-28 – 2015-03-29
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ナシACC合成酵素遺伝子(PpACS1)のプロモーター領域におけるメチル化解析および核タンパク質との 相互作用解析2015

    • 著者名/発表者名
      藤井美希
    • 学会等名
      園芸学会
    • 発表場所
      千葉大学
    • 年月日
      2015-03-28 – 2015-03-29
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ナシACC合成酵素(PpACS1)のプロモーター領域のメチル化解析2014

    • 著者名/発表者名
      藤井美希
    • 学会等名
      園芸学会
    • 発表場所
      佐賀大学
    • 年月日
      2014-09-27 – 2014-09-29
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 最適な両親組合せを決定するゲノムワイド予測-ニホンナシでの検証-2014

    • 著者名/発表者名
      山本俊哉
    • 学会等名
      園芸学会
    • 発表場所
      佐賀大学
    • 年月日
      2014-09-27 – 2014-09-29
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Transcriptome analysis reveals the role of plant hormones in pear fruit set.2014

    • 著者名/発表者名
      Itai A.
    • 学会等名
      XII International Pear Symposium
    • 発表場所
      Leuven University, Belgium
    • 年月日
      2014-07-14 – 2014-07-18
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Starch degradation after harvest in ‘La France’ pears.2014

    • 著者名/発表者名
      Murayama H.
    • 学会等名
      XII International Pear Symposium
    • 発表場所
      Leuven University, Belgium
    • 年月日
      2014-07-14 – 2014-07-18
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 次世代シーケンサーを用いたトランスクリプトーム解析によるナシ着果制御機構の解明2014

    • 著者名/発表者名
      森下恭行
    • 学会等名
      園芸学会
    • 発表場所
      筑波大学
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] セイヨウナシ‘ラ・フランス’の果肉における成長ステージ別マイクロアレイ解析2013

    • 著者名/発表者名
      奈島賢児
    • 学会等名
      園芸学会
    • 発表場所
      岩手大学
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ニホンナシ果実成熟期に発現変動するbHLH遺伝子の研究2013

    • 著者名/発表者名
      滋田徳美
    • 学会等名
      園芸学会
    • 発表場所
      岩手大学
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ニホンナシ黒斑病罹病性遺伝子近傍領域の塩基配列決定2013

    • 著者名/発表者名
      寺上伸吾
    • 学会等名
      園芸学会
    • 発表場所
      岩手大学
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 気候変動に対応した果樹育種2013

    • 著者名/発表者名
      山本俊哉
    • 学会等名
      育種学会
    • 発表場所
      鹿児島大学
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] セイヨウナシミクルマス・ネリスにおける樹上成熟と追熟の相2012

    • 著者名/発表者名
      小飯塚紗希
    • 学会等名
      園芸学会
    • 発表場所
      福井県立大学
    • 年月日
      2012-09-23
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] マイクロアレイ解析によるGA誘導性ナシ単為結果関連遺伝子の探索2012

    • 著者名/発表者名
      板井章浩
    • 学会等名
      園芸学会
    • 発表場所
      福井県立大学
    • 年月日
      2012-09-22
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 寺上伸吾ナシの連鎖地図XVIII.SNPアレイを用いたニホンナシ高密度連鎖2012

    • 著者名/発表者名
      寺上伸吾
    • 学会等名
      園芸学会
    • 発表場所
      福井県立大学
    • 年月日
      2012-09-22
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] RNAseq情報から作成した55,000グローブを用いた枝変わり大果変異セイヨウナシのトランスクリプトーム解析 第一報 : 開花前の花床におけるトランスクリプトーム解析2012

    • 著者名/発表者名
      加藤茉莉
    • 学会等名
      園芸学会
    • 発表場所
      福井県立大学
    • 年月日
      2012-09-22
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] セイヨウナシ'ラ・フランス'果実における収穫後のデンプンの消失に関する研究2012

    • 著者名/発表者名
      村山秀樹
    • 学会等名
      園芸学会
    • 発表場所
      東京農工大学
    • 年月日
      2012-03-23
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 落葉果樹のDNAマーカー、分子育種、ゲノム育種に関する研究

    • 著者名/発表者名
      山本俊哉
    • 学会等名
      第52回ガンマーフィールドシンポジウム
    • 発表場所
      農業生物資源研究所
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [図書] Abiotic Stress Biology in Horticultural Plants.2015

    • 著者名/発表者名
      Itai A.
    • 総ページ数
      220
    • 出版者
      Springer
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [図書] 果樹園芸学2015

    • 著者名/発表者名
      板井章浩
    • 総ページ数
      224
    • 出版者
      朝倉書店
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書

URL: 

公開日: 2012-04-24   更新日: 2019-07-29  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi