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魚類の温度適応に関わる分子ネットワークの探索

研究課題

研究課題/領域番号 24380113
研究種目

基盤研究(B)

配分区分一部基金
応募区分一般
研究分野 水産化学
研究機関北里大学

研究代表者

渡部 終五  北里大学, 海洋生命科学部, 教授 (40111489)

研究協力者 池田 大介  北里大学, 海洋生命科学部, 講師
水澤 奈々美  北里大学, 海洋生命科学部, 博士研究員
研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
17,940千円 (直接経費: 13,800千円、間接経費: 4,140千円)
2014年度: 5,460千円 (直接経費: 4,200千円、間接経費: 1,260千円)
2013年度: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円)
2012年度: 6,890千円 (直接経費: 5,300千円、間接経費: 1,590千円)
キーワード温度馴化 / ミオシン / 分子ネットワーク / 転写産物 / 次世代シーケンサ / メダカ / 転写因子 / 遺伝子発現 / 温度適応
研究成果の概要

魚類の温度適応に関わる分子ネットワークの探索を目的に、メダカを24℃で馴致した後、10℃および30℃の水槽に移し、30日以上飼育(馴化)した。変化前、変化直後、馴化後のメダカより筋肉および脳を採取し、全RNA抽出およびmRNA精製を行った。次世代シーケンサを用いた転写産物の網羅的解析を行った結果、10℃および30℃馴化メダカ間で筋肉および脳において、それぞれ31および20遺伝子に馴化温度依存的な発現変動が認められた。筋組織で発現変動がみられた31遺伝子中、熱ショックタンパク質およびE3ユビキチンリガーゼ遺伝子などは温度変化直後から発現量が変化していた。

報告書

(4件)
  • 2014 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2013 実績報告書
  • 2012 実績報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2015 2014 2013 2012

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (5件)

  • [雑誌論文] Regulation of gene expression mediating indeterminate muscle growth in teleosts.2015

    • 著者名/発表者名
      A. K. Shakur Ahammad, Shigeharu Kinoshita, Md. Asaduzzaman, Shuichi Asakawa and Shugo Watabe
    • 雑誌名

      Mech. Development

      巻: in press ページ: 53-65

    • DOI

      10.1016/j.mod.2015.02.006

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Effects of short-term cold acclimation on FoF1-ATPase activity in skeletal muscle of red seabream Pagrus major (Temminck & Schlegel).2014

    • 著者名/発表者名
      Kaneko G, Sawada A, Ushio H, Watabe S.
    • 雑誌名

      Aquaculture Res

      巻: 未定 ページ: 1-4

    • DOI

      10.1111/are.12132

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書 2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Lampreys have a single gene cluster for the fast skeletal myosin heavy chain gene family2013

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Ikeda, Yosuke Ono, Shigeki Hirano, Nobuhiro Kan-no and Shugo Watabe
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 8 号: 12 ページ: e85500-e85500

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0085500

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Global gene expression analysis of gill tissues from normal and thermally selected strains of rainbow trout.2012

    • 著者名/発表者名
      Tan, et al.
    • 雑誌名

      Fish. Sci

      巻: 78 ページ: 1041-1049

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 急激に水温変動させたメダカの筋肉のRNA-seq解析2015

    • 著者名/発表者名
      水澤奈々美・加賀谷禎子・牛島玲奈・池田大介・小山寛喜・陳 盈光・浅川修一・安元 剛・神保 充・菅野信弘・渡部終五
    • 学会等名
      平成27年度日本水産学会春季大会
    • 発表場所
      東京海洋大学 品川キャンパス
    • 年月日
      2015-03-27 – 2015-03-31
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] シーラカンス速筋型ミオシン重鎖遺伝子の機能解析2014

    • 著者名/発表者名
      池田大介・菅野信弘・渡部終五
    • 学会等名
      平成26年度日本水産学会秋季大会
    • 発表場所
      九州大学 箱崎キャンパス
    • 年月日
      2014-09-19 – 2014-09-22
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] メダカの温度馴化で発現変動する遺伝子転写産物の同定2014

    • 著者名/発表者名
      池田大介・小山寛喜・菅野信弘・陳 盈光・浅川修一・安元 剛・神保 充・渡部終五
    • 学会等名
      平成26年度日本水産学会春季大会
    • 発表場所
      北海道大学函館キャンパス
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 温度依存的に発現するメダカ遺伝子転写産物の網羅的解析2013

    • 著者名/発表者名
      渡部終五, ら
    • 学会等名
      平成25年度日本水産学会春季大会
    • 発表場所
      東京海洋大学品川キャンパス
    • 年月日
      2013-03-28
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 次世代シーケンサおよびゲノムデータベースを利用したメダカの温度馴化で発現変動する遺伝子転写産物の網羅的解析2013

    • 著者名/発表者名
      池田大介・小山寛喜・菅野信弘・陳 盈光・浅川修一・安元 剛・神保 充・渡部終五
    • 学会等名
      平成25年度日本水産学会秋季大会
    • 発表場所
      三重大学
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書

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公開日: 2012-04-24   更新日: 2019-07-29  

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