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野生ハツカネズミの歴史的拡散の時空間把握と局所適応遺伝子の探索

研究課題

研究課題/領域番号 24405013
研究種目

基盤研究(B)

配分区分一部基金
応募区分海外学術
研究分野 生物多様性・分類
研究機関北海道大学

研究代表者

鈴木 仁  北海道大学, 地球環境科学研究科(研究院), 教授 (40179239)

研究分担者 佐藤 淳 (佐藤 惇)  福山大学, 生命工学部, 准教授 (80399162)
研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
16,250千円 (直接経費: 12,500千円、間接経費: 3,750千円)
2015年度: 3,250千円 (直接経費: 2,500千円、間接経費: 750千円)
2014年度: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2013年度: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2012年度: 4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円)
キーワードハツカネズミ / ヒト随伴動物 / 選択的スイープ / 自然選択 / 毛色関連遺伝子 / ハプロタイプ構造解析 / アジア農耕史 / 二次的接触 / 環境適応 / 毛色多型 / 先史時代人類農耕史 / ミトコンドリアDNA / Mc1r / Asip / 系統地理学 / 人為的拡散 / 選択的一掃 / 日本列島 / 系統地理 / 毛色変異 / 野生ハツカネズミ / 味覚受容体遺伝子 / 局所適応 / ミトコンドリアDNA / 日本人の起源 / 有史以前農業の展開 / cytochrome b gene / control region
研究成果の概要

私たちはハツカネズミ(Mus musculus)の進化史理解のため、第8染色体上の毛色関連遺伝子Mc1rを含む近隣7遺伝子のハプロタイプ構造の解析を行った。その結果、3亜種グループの中東・インドにおける自然分布域を特定するとともに、インド亜大陸内の亜種castaneusが空間的に2系統存在することを明らかにした。また、歴史的放散前に亜種内、亜種間の遺伝的交流が存在したことも判明した。さらに。この遺伝子領域のうち、Mc1rにおいて塩基多様性のレベルの著しい低下があり、選択的スイープ現象の存在が示唆され、Mc1r遺伝子への自然淘汰の関与があったと考えられた。

報告書

(5件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 2012 実績報告書
  • 研究成果

    (33件)

すべて 2015 2014 2013 2012 その他

すべて 国際共同研究 (6件) 雑誌論文 (13件) (うち国際共著 3件、 査読あり 13件、 オープンアクセス 5件、 謝辞記載あり 4件) 学会発表 (12件) (うち国際学会 2件、 招待講演 1件) 図書 (2件)

  • [国際共同研究] ヤンゴン大学/パテイン大学/ミャンマー獣医科大学(ミャンマー)

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [国際共同研究] チンバサ動植物公園(マダガスカル)

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [国際共同研究] ウラジオストク州立大学/生物土壌学研究所(ロシア連邦)

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [国際共同研究] インドネシアLIPI科学研究所(インドネシア)

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [国際共同研究] ローザンヌ大学(スイス)

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [国際共同研究]

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [雑誌論文] Tracing the eastward dispersal of the house mouse, Mus musculus.2015

    • 著者名/発表者名
      Suzuki H, Yakimenko V, Usuda D, Frisman F.
    • 雑誌名

      Genes and Environment

      巻: 37 号: 1 ページ: 20-20

    • DOI

      10.1186/s41021-015-0013-9

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Molecular phylogenetic characterization of common murine rodents from Manipur, Northeast India2015

    • 著者名/発表者名
      Chingangbam DS,Laishram JM, Suzuki H
    • 雑誌名

      Genes & Genetic Systems

      巻: 90 号: 1 ページ: 21-30

    • DOI

      10.1266/ggs.90.21

    • NAID

      130005083381

    • ISSN
      1341-7568, 1880-5779
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Estimating the molecular evolutionary rates of mitochondrial genes referring to Quaternary Ice Age events with inferred population expansions and dispersals in Japanese Apodemus.2015

    • 著者名/発表者名
      Suzuki Y, Tomozawa M, Koizumi Y, Tsuchiya K, Suzuki H
    • 雑誌名

      BMC Evolutionary Biology

      巻: 15 号: 1 ページ: 187-187

    • DOI

      10.1186/s12862-015-0463-5

    • NAID

      120005663129

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Ancient onset of geographical divergence, interpopulation genetic exchange, and natural selection on the Mc1r coat-colour gene in the house mouse (Mus musculus).2015

    • 著者名/発表者名
      Sayaka Kodama, Mitsuo Nunome, Kazuo Moriwaki, Hitoshi Suzuki
    • 雑誌名

      Biological Journal of the Linnean Society

      巻: 114 号: 4 ページ: 778-794

    • DOI

      10.1111/bij.12471

    • NAID

      120005743054

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Effect of founding events on coat colour polymorphism of Apodemus speciosus (Rodentia: Muridae) on the Izu Islands.2014

    • 著者名/発表者名
      Morihiko Tomozawa, Mitsuo Nunome, Hitoshi Suzuki, Hirotake Ono
    • 雑誌名

      Biological Journal of the Linnean Society

      巻: 113 号: 2 ページ: 522-535

    • DOI

      10.1111/bij.12348

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular Genetic Evidence for the Place of Origin of the Pacific Rat, Rattus exulans..2014

    • 著者名/発表者名
      Vicki Thomson, Ken P Aplin, Alan Cooper, Susan Hisheh, Hitoshi Suzuki, Ibnu Maryanto, Grace Yap, Stephen C Donnellan
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 9 号: 3 ページ: 1-12

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0091356

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書 2013 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Lack of association between winter coat colour and genetic population structure in the Japanese hare, Lepus brachyurus (Lagomorpha : Leporidae)2014

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Nunome, Gohta Kinoshita, Morihiko Tomozawa, Harumi Torii, Rikyu Matsuki, Fumio Yamada, Yoichi Matsuda, Hitoshi Suzuki
    • 雑誌名

      Biological Journal of the Linnean Society

      巻: 111 号: 4 ページ: 461-776

    • DOI

      10.1111/bij.12245

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Distinct genetic characteristics of Sri Lankan <i>Rattus</i> and <i>Bandicota</i> (Murinae, Rodentia) inferred from mitochondrial and nuclear markers2014

    • 著者名/発表者名
      Shumpei P Yasuda, Chandika D Gamage, Nobuo Koizumi, Sanae Nishio, Rie Isozumi, Kenta Shimizu, Takaaki Koma, Takako Amada, Hitoshi Suzuki, Kumiko Yoshimatsu, Jiro Arikawa
    • 雑誌名

      Genes & Genetic Systems

      巻: 89 号: 2 ページ: 71-80

    • DOI

      10.1266/ggs.89.71

    • NAID

      130004687232

    • ISSN
      1341-7568, 1880-5779
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular phylogeny of East and Southeast Asian fossorial moles (Eulipotyphla, Talpidae).2014

    • 著者名/発表者名
      Shinohara, A., Kawada, S., Son, N. T., Koshimoto, C., Endo, H., Can, D. N. and Suzuki, H.
    • 雑誌名

      Journal of Mammalogy

      巻: 95 号: 3 ページ: 455-466

    • DOI

      10.1644/13-mamm-a-135

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Lack of association between winter coat colour and genetic population structure in the Japanese hare, Lepus brachyurus (Lagomorpha: Leporidae).2014

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Nunome, Gohta Kinoshita, Morihiko Tomozawa, Harumi Torii, Rikyu Matsuki, Fumio Yamada, Yoichi Matsuda, Hitoshi Suzuki
    • 雑誌名

      Biological Journal of the Linnean Society

      巻: 111 号: 4 ページ: 461-776

    • DOI

      10.5635/ased.2013.29.4.267

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Selection of Rodent Species Appropriate for mtDNA Transfer to Generate Transmitochondrial Mito-Mice Expressing Mitochondrial Respiration Defects2014

    • 著者名/発表者名
      Shunkei Enoki, Akinori Shimizu, Chisato Hayashi, Hirotake Imanishi, Osamu Hashizume, Kazuyuki Mekada, Hitoshi Suzuki, Tetsuo Hashimoto, Kazuto Nakada, Jun-Ichi Hayashi
    • 雑誌名

      Experimental Animals

      巻: 63 号: 1 ページ: 21-30

    • DOI

      10.1538/expanim.63.21

    • NAID

      130003391604

    • ISSN
      0007-5124, 1341-1357, 1881-7122
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Evolutionary and dispersal history of Eurasian house mice Mus musculus clarified by more extensive geographic sampling of mitochondrial DNA..2013

    • 著者名/発表者名
      H Suzuki, M Nunome, G Kinoshita, K P Aplin, P Vogel, A P Kryukov, M-L Jin, S-H Han, I Maryanto, K Tsuchiya, H Ikeda, T Shiroishi, H Yonekawa, K Moriwaki
    • 雑誌名

      Heredity

      巻: 111 号: 5 ページ: 375-390

    • DOI

      10.1038/hdy.2013.60

    • NAID

      120005427739

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Evolutionary and phylogeographic views on <i>Mc1r</i> and <i>Asip</i> variation in mammals2013

    • 著者名/発表者名
      Hitoshi Suzuki
    • 雑誌名

      Genes & Genetic Systems

      巻: 88 号: 3 ページ: 155-164

    • DOI

      10.1266/ggs.88.155

    • NAID

      10031194255

    • ISSN
      1341-7568, 1880-5779
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] The long journey of the house mouse (Mus musculus) to the Japanese Islands2015

    • 著者名/発表者名
      Hitoshi Suzuki
    • 学会等名
      The 5th International symposium on Asian Vertebrate Species Diversity (AVIS)
    • 発表場所
      Chulalongkorn University (タイ・バンコク市)
    • 年月日
      2015-12-15
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ミャンマー産ハツカネズミ亜属(subgenus Mus)の地理的分布と多様化機構2015

    • 著者名/発表者名
      鈴木仁、島田朋史、Thida Lay Thwe、 Khin Myat Myat Zaw、片倉賢
    • 学会等名
      日本動物学会第86回大会
    • 発表場所
      朱鷺メッセ(新潟県・新潟市)
    • 年月日
      2015-09-17
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 野生ハツカネズミ(Mus musculus)の毛色とMc1rおよびAsip遺伝子変異の解析2015

    • 著者名/発表者名
      佐久間有希、田中ちひろ、大舘智史城ヶ原貫通、Ranorosoa Marle Claudine、新井智、土屋公幸、鈴木仁
    • 学会等名
      日本動物学会北海道支部第60回大会
    • 発表場所
      北海道大学理学部5号館(北海道・札幌市)
    • 年月日
      2015-08-22
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Colonization History of the House Mouse Mus musculus in East Asia2015

    • 著者名/発表者名
      Hitoshi Suzuki
    • 学会等名
      Vth International Wildlife Management Congress (IWMC)
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道・札幌市)
    • 年月日
      2015-07-26
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ハツカネズミの系統分化におけるミャンマーの空間的役割2014

    • 著者名/発表者名
      鈴木仁、バウム ゾウ、チダ ツオ、片倉賢、土屋公幸
    • 学会等名
      日本遺伝学会第86回大会
    • 発表場所
      長浜バイオ大学(長浜市)
    • 年月日
      2014-09-19
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ハツカネズミ(Mus musculus)における5S ribosomal DNA(5S rDNA)の進化動態2014

    • 著者名/発表者名
      磯部美優・布目三夫・鈴木仁
    • 学会等名
      日本遺伝学会第86回大会
    • 発表場所
      長浜バイオ大学(長浜市)
    • 年月日
      2014-09-18
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 日本列島の南方系ハツカネズミ(CAS subspecies group)系統の起源2012

    • 著者名/発表者名
      桑山崇・布目三夫・森脇和郎鵜・鈴木仁
    • 学会等名
      第84回日本遺伝学会
    • 発表場所
      九州大学(福岡市)
    • 年月日
      2012-09-26
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 北日本における野生ハツカネズミMus musculusの浸透性交雑の検出2012

    • 著者名/発表者名
      桑山崇・布目三夫・森脇和郎鵜・鈴木仁
    • 学会等名
      日本哺乳類学会2012年度大会
    • 発表場所
      麻生大学(相模原市)
    • 年月日
      2012-09-21
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Origin of coat color variation in the black rats in the Japanese Islands2012

    • 著者名/発表者名
      Suzuki H, Sasamori s, Nomi D, NakataK
    • 学会等名
      Second International Sympogium on East Asian Vertebrate Species Diversity
    • 発表場所
      京都大学(京都市)
    • 年月日
      2012-07-29
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 北日本ハツカネズミ野生集団における5S ribosomal DNAの進化的動態

    • 著者名/発表者名
      磯部美優・布目三夫・森脇和郎・鈴木仁
    • 学会等名
      日本遺伝学会
    • 発表場所
      慶應義塾大学(横浜市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ミャンマー産ネズミ亜科4種の分子系統学的把握

    • 著者名/発表者名
      鈴木 仁・ Saw  Bown・ 片倉 賢
    • 学会等名
      日本哺乳類学会
    • 発表場所
      岡山理科大学(岡山市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ヒトが関わるハツカネズミの東アジアにおける分散

    • 著者名/発表者名
      鈴木仁
    • 学会等名
      日本環境変異原学会
    • 発表場所
      岡山コンベンションセンター(岡山市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [図書] Phylogeny and biogeography of the genus Mus in Eurasia In : Macholan M, Baird s, Munclinger p, Pilek J(eds) Evolution of the House Mouse.2012

    • 著者名/発表者名
      Suzuki H. and Aplin K. P.
    • 総ページ数
      526
    • 出版者
      Cambridge University Press
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [図書] Origin and genetic status of Mus musculus molossinus : a typical example for reticulate evolution in the genus Mus. In : Macholan M, Baird S, Munclinger P, Pilek J (eds) Evolution of the House Mouse.2012

    • 著者名/発表者名
      Yonekawa H., Sato J. J., Suzuki H. and Moriwaki K.
    • 総ページ数
      526
    • 出版者
      Cambridge University Press
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書

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公開日: 2012-04-24   更新日: 2022-01-31  

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