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伊達政宗の遣欧使節の末裔といわれるスペイン「ハポン」姓の人々のゲノムワイド解析

研究課題

研究課題/領域番号 24405017
研究種目

基盤研究(B)

配分区分一部基金
応募区分海外学術
研究分野 自然人類学
研究機関名古屋大学

研究代表者

山本 敏充  名古屋大学, 医学(系)研究科(研究院), 准教授 (50260592)

研究分担者 斎藤 成也  国立遺伝学研究所, 集団遺伝学系, 教授 (30192587)
連携研究者 徳永 勝士  東京大学, 大学院医学系研究科, 教授 (40163977)
研究協力者 布施 昇男 (長崎 正朗)  
河合 洋介  
カラセド アンジェル  
研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
17,420千円 (直接経費: 13,400千円、間接経費: 4,020千円)
2015年度: 3,640千円 (直接経費: 2,800千円、間接経費: 840千円)
2014年度: 4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円)
2013年度: 4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円)
2012年度: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
キーワードハポン姓 / 日本人 / スペイン / ゲノムワイド / SNP解析 / Yハプロタイプ / ゲノム / ゲノム解析 / Y-STRs / コリア・デル・リオ / 遣欧使節
研究成果の概要

スペインのコリア・デル・リオ市内及び周辺に住んでいる約800名の「ハポン」姓を名乗る人々のうち、DNA解析希望者男性50名、女性51名から血液試料を採取した。スペインでDNA抽出され、匿名化後、日本で、男性DNA試料について、Y染色体上のSTRsのハプロタイプ解析を行った。また、全てのDNA試料について、ジャポニカ・アレイと呼ばれる日本人に特化された約66万個のゲノムワイドなSNPs解析を行った。その結果、日本人に由来すると考えられるY-STRハプロタイプは観察されず、また、ゲノムワイドなSNP解析からも日本人に由来すると考えられる結果が得られなかった。今後、新しい手法による解析が期待される。

報告書

(6件)
  • 2016 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 2012 実績報告書
  • 研究成果

    (34件)

すべて 2015 2014 2013 2012 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (14件) (うち査読あり 10件、 謝辞記載あり 1件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (18件) (うち国際学会 4件、 招待講演 1件) 図書 (1件)

  • [国際共同研究] サンティアゴ・デ・コンポステーラ大学ゲノム解析センター(スペイン)

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [雑誌論文] Potential statistical differentiation between Japanese and Korean populations with about 100 STRs2015

    • 著者名/発表者名
      Toshimichi Yamamotoa, Yuuji Hiroshige, Hisae Ogawa, Takashi Yoshimoto, Shuhei Mano
    • 雑誌名

      Forensic Science International: Genetics Supplement Series

      巻: 5 ページ: e348-e349

    • DOI

      10.1016/j.fsigss.2015.09.138

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 日本人と近隣ヒト集団における多座位STRsによる遺伝統計学的判別法の検討(第1報)2015

    • 著者名/発表者名
      山本敏充,廣重優二,小川久恵,吉本高士,間野修平
    • 雑誌名

      DNA多型

      巻: 23 ページ: 128-130

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [雑誌論文] Species specificities among primates probed with commercially available fluorescence-based multiplex PCR typing kits2015

    • 著者名/発表者名
      Yuuji Hiroshige, Hiroyuki Ohtaki, Takashi Yoshimoto, Hisae Ogawa, Akira Ishii, Toshimichi Yamamoto
    • 雑誌名

      Legal Medicine

      巻: 17 号: 5 ページ: 326-333

    • DOI

      10.1016/j.legalmed.2015.03.006

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Identification of causative pregnancy of gestational trophoblastic neoplasia diagnosed during pregnancy by short tandem repeat analysis.2014

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto E, Niimi K, Shinjo K, Yamamoto T, Fukunaga M, Kikkawa F.
    • 雑誌名

      Gynecol Oncol Case Rep.

      巻: 18 ページ: 3-6

    • DOI

      10.1016/j.gynor.2014.04.001

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Revertant Mutation Releases Confined Lethal Mutation, Opening Pandora' s Box : A Novel Genetic Pathogenesis2014

    • 著者名/発表者名
      Ogawa Y, Takeichi T, Kono M, Hamajima N, Yamamoto T, Sugiura K, Akiyama M
    • 雑誌名

      PLoS Genet

      巻: 10(5) 号: 5 ページ: e1004276-e1004276

    • DOI

      10.1371/journal.pgen.1004276

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Ovarian mucinous tumors arising from mature cystic teratomas--a molecular genetic approach for understanding the cellular origin.2014

    • 著者名/発表者名
      Fujii K, Yamashita Y, Yamamoto T, Takahashi K, Hashimoto K, Miyata T, Kawai K, Kikkawa F, Toyokuni S, Nagasaka T
    • 雑誌名

      Hum Pathol

      巻: 45 号: 4 ページ: 717-724

    • DOI

      10.1016/j.humpath.2013.10.031

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書 2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 5地域のモンゴル人におけるYハプログループ及びY-STRsハプロタイプ解析並びに日本人との比較2014

    • 著者名/発表者名
      山本敏充,廣重優二,小川久恵,吉本高士
    • 雑誌名

      DNA多型

      巻: 22 ページ: 105-108

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [雑誌論文] Y-chromosome lineage in five regional Mongolian populations2013

    • 著者名/発表者名
      Toshimichi Yamamoto, Tomoki Senda, Daiki Horiba, Masayoshi Sakuma, Yuuka Kawaguchi, Yuuichi Kano
    • 雑誌名

      Forensic Science International: Genetics Supplement Series

      巻: 4 号: 1 ページ: e260-e261

    • DOI

      10.1016/j.fsigss.2013.10.133

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 自然脱落毛からのSTR型検出のための判定基準2013

    • 著者名/発表者名
      廣重優二,山本敏充,吉本高士,石井晃
    • 雑誌名

      日本法科学技術学会誌

      巻: 18 ページ: 97-111

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] モンゴルの2地域ヒト集団におけるYハプログループ解析2013

    • 著者名/発表者名
      廣重優二,山本敏充,吉本高士
    • 雑誌名

      DNA多型

      巻: 21 ページ: 127-129

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [雑誌論文] Autosomal and Y-chromosomal STR markers reveal a close relationship between Hokkaido Ainu and Ryukyu islanders2012

    • 著者名/発表者名
      K. Koganebuchi, T. Katsumura, S. Nakagome, H. Ishida, S. Kawamura, H. Oota
    • 雑誌名

      Anthropological Science

      巻: 120 号: 3 ページ: 199-208

    • DOI

      10.1537/ase.120322

    • NAID

      10031145903

    • ISSN
      0918-7960, 1348-8570
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The history of human populations in the Japanese Archipelago inferred from genome-wide SNP data with a special reference to the Ainu and the Ryukyuan Populations.2012

    • 著者名/発表者名
      Jinam T, Nishida N, Hirai M, Kawamura S, Oota H, Umetsu K, Kimura R, Ohashi J, Tajima A, Yamamoto T, Tanabe H, Mano S, Suto Y, Kaname T, Naritomi K, Yanagi K, Niikawa N, Omoto K. Saitou N
    • 雑誌名

      Journal of Human Genetics

      巻: 57巻 号: 12 ページ: 787-79

    • DOI

      10.1038/jhg.2012.114

    • NAID

      10031145887

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A case report of placental mesenchymal dysplasia with an increased VEGF-D expression2012

    • 著者名/発表者名
      Tomomi Kotani
    • 雑誌名

      Placenta

      巻: 33 ページ: 888-891

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 南米コロンビアのWayu族から採取されたDNAにおける家系調査2012

    • 著者名/発表者名
      山本敏充
    • 雑誌名

      DNA多型

      巻: 20 ページ: 207-210

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] インドネシアにおける“Midi-6”のアレル頻度分布及び他のヒト集団との比較2015

    • 著者名/発表者名
      山本敏充,廣重優二,小川久恵,吉本高士,石井晃,Tuntas Dhanardhono
    • 学会等名
      日本DNA多型学会第24回学術集会
    • 発表場所
      岡山大学創立五十周年記念館(岡山県・岡山市)
    • 年月日
      2015-11-19
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 105 座位のSTRs による日本人と近隣ヒト集団間の遺伝的異質性2015

    • 著者名/発表者名
      山本敏充,佃康司,間野修平
    • 学会等名
      第69回日本人類学会大会
    • 発表場所
      産業技術総合研究所臨海副都心センター別館(東京都・江東区)
    • 年月日
      2015-10-10
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Analysis on Y-STRs and Y haplogroups in Indonesia2015

    • 著者名/発表者名
      Toshimichi Yamamoto, Akira Shirakawa, Tuntas Dhanardhono
    • 学会等名
      7th European Association of Forensic Science Conference 2015
    • 発表場所
      プラハ,チェコ
    • 年月日
      2015-09-06
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Potential statistical differentiation between Japanese and Korean populations with about 100 STRs2015

    • 著者名/発表者名
      Toshimichi Yamamoto, Yuuji Hiroshige, Hisae Ogawa, Takashi Yoshimoto, Shuhei Mano
    • 学会等名
      26th International Congress 2015 of the International Society of Forensic Genetics
    • 発表場所
      クラクフ,ポーランド
    • 年月日
      2015-08-31
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 日本人における257座位の4塩基リピートSTRsのアレル頻度及び統計学的解析2015

    • 著者名/発表者名
      山本敏充,小川久恵,廣重優二,吉本高士,草野麻衣子,財津桂,石井晃
    • 学会等名
      第99次日本法医学会学術全国集会
    • 発表場所
      高知市文化プラザかるぽーと(高知県・高知市)
    • 年月日
      2015-06-11
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Further potential application of autosomal and Y-chromosomal STRs2015

    • 著者名/発表者名
      Toshimichi Yamamoto
    • 学会等名
      2015 International Symposium of Forensic DNA in Law
    • 発表場所
      ソウル,大韓民国
    • 年月日
      2015-03-26
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 日本人と近隣ヒト集団における多座位STRsによる遺伝統計学的判別法の検討(第1報)2014

    • 著者名/発表者名
      山本敏充,小川久恵,廣重優二,吉本高士,間野修平
    • 学会等名
      日本DNA多型学会第23回学術集会
    • 発表場所
      ウインクあいち(愛知県・名古屋市)
    • 年月日
      2014-11-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Population Genetic Study of Six Mini STR ‘Midi-6’ System in Indonesian Population2014

    • 著者名/発表者名
      Tuntas Dhanardhono, Toshimichi Yamamoto, Sigid Kirana, Kunthi Yulianti, Rika Susanti, Erwin Kristanto, Akira Ishii
    • 学会等名
      International Association of Forensic Science 2014
    • 発表場所
      ソウル,大韓民国
    • 年月日
      2014-10-15
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Y-STR haplotype network analysis in Mongolian populations2014

    • 著者名/発表者名
      Toshimichi Yamamoto, Yuuji Hiroshige, Hisae Ogawa, Tomoki Senda, Daiki Horiba, Masatoshi Sakuma, Yuuka Kawaguchi, Yuuichi Kano, Kei Zaitsu, Takashi Yoshimoto, Akira Ishii
    • 学会等名
      9th International Symposium on Advances in Legal Medicine
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡県・福岡市)
    • 年月日
      2014-06-16
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Network analysis for Y-STRs among ethnic minority groups in South America2014

    • 著者名/発表者名
      Toshimichi Yamamoto, Hajime Araki, Masatoshi Sakuma, Yuuka Kawaguchi, Yuuichi Kano, Tomoki Senda, Daiki Horiba, Inaho Danjoh, Yukio Nakamura
    • 学会等名
      English Speaking Working Groups-International Society of Forensic Genetics 2014
    • 発表場所
      アテネ,ギリシャ
    • 年月日
      2014-05-28
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Y-chromosome lineage in five regional Mongolian populations2013

    • 著者名/発表者名
      Toshimichi Yamamoto, Tomoki Senda, Daiki Horiba, Masayoshi Sakuma, Yuuka Kawaguchi, Yuuichi Kano
    • 学会等名
      25th Internation ociety of Forensic Genetics
    • 発表場所
      メルボルン,オーストラリア
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] モンゴルの2地域ヒト集団におけるYハプログループ解析2012

    • 著者名/発表者名
      山本敏充
    • 学会等名
      日本DNA多型学会第21回学術集会
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2012-11-08
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 南米少数民族におけるYハプログループの比較2012

    • 著者名/発表者名
      山本敏充
    • 学会等名
      第66回日本人類学会大会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2012-11-04
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Y-haplogrouping among ethnic minority groups in South America2012

    • 著者名/発表者名
      Toshimichi Yamamoto
    • 学会等名
      DNA in Forensics 2012
    • 発表場所
      Innsbruck, Austria
    • 年月日
      2012-09-07
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 2つの座位で突然変異が観察された親子鑑定の肯定例2012

    • 著者名/発表者名
      山本敏充
    • 学会等名
      第96次日本法医学会全国学術集会
    • 発表場所
      浜松
    • 年月日
      2012-06-08
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] “Midi-6”システムが有効であったパラフィンブロックからの親子鑑定例

    • 著者名/発表者名
      山本敏充,吉本高士,廣重優二,財津桂,石井晃
    • 学会等名
      第97次日本法医学会学術全国集会
    • 発表場所
      ロイトン札幌(札幌市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Network analysis for Y-STRs haplotypes among ethnic minority groups in South America

    • 著者名/発表者名
      山本敏充,檀上稲穂,中村幸夫
    • 学会等名
      第67回日本人類学会大会
    • 発表場所
      国立科学博物館筑波研究施設(つくば市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 5地域のモンゴル人におけるYハプログループ及びY-STRsハプロタイプ解析並びに日本人との比較

    • 著者名/発表者名
      山本敏充,廣重優二,小川久恵,吉本高士
    • 学会等名
      日本DNA多型学会第22回学術集会
    • 発表場所
      仙台市戦災復興記念館(仙台市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [図書] 人種は存在しない2013

    • 著者名/発表者名
      ベルトラン・ジョルダン(監修:山本敏充)
    • 総ページ数
      235
    • 出版者
      中央公論新社
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書

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公開日: 2012-04-24   更新日: 2019-07-29  

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