乳がん細胞におけるＥＭＴ制御因子のシストローム解析

• 研究課題/領域番号: 24501311
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 腫瘍生物学
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 鯉沼 代造 東京大学, 医学(系)研究科(研究院), 准教授 (80375071)
• 研究期間 (年度): 2012-04-01 – 2015-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2014年度)
• 配分額: 5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円); 2014年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2013年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円); 2012年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
• キーワード: FAIRE-seq / シグナル伝達 / EMT / 乳がん / TGF-beta / ZEB1 / アポトーシス / ゲノム / 癌 / 転写因子 / lncRNA / lincRNA / FAIRE / RNA-seq / オープンクロマチン / TGF-β

研究成果の概要

本研究では乳腺上皮細胞の上皮間葉転換EMTにおける遺伝子発現変化を次世代シーケンサーを用いたRNA-seqにより解析するとともに、オープンクロマチン領域の変化につきFAIRE-seqを用いてデータ取得を行った。その結果発現変動を受けるnon coding RNAなどの新規転写産物を同定した。このうちlncRNA-Smad7の抗アポトーシス作用を見いだした。また乳腺上皮細胞に恒常活性RASを発現させTGF-βによりEMTを起こす細胞ではオープンクロマチン領域に違いが生じることを見出した。

研究成果

• [雑誌論文] The Arkadia-ESRP2 axis suppresses tumor progression: Analyses in clear cell renal cell carcinoma (2015)
  • 著者名/発表者名: Mizutani A, Koinuma D, Seimiya H and Miyazono K.
  • 雑誌名: Oncogene 巻: 印刷中
  • 査読あり / オープンアクセスとしている / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Transforming growth factor-β-induced lncRNA-Smad7 inhibits apoptosis of mouse breast cancer JygMC(A) cells. (2014)
  • 著者名/発表者名: Arase M, Horiguchi K, Ehata S, Morikawa M, Tsutsumi S, Aburatani H, Miyazono K, Koinuma D.
  • 雑誌名: Cancer Sci. 巻: 105 ページ: 974-82
  • DOI: 10.1111/cas.12454
  • 査読あり / オープンアクセスとしている / 謝辞記載あり
• [学会発表] Identification of Smad regulatory factors through integrated analysis of ChIP-seq data (2015)
  • 著者名/発表者名: Koinuma D.
  • 学会等名: Joint International Symposium on TGF-β Family and Cancer : Signal Network in Tumor Microenvironment
  • 発表場所: つくば
  • 年月日: 2015-01-12 – 2015-01-13
  • 招待講演
• [学会発表] FAIRE-seq analysis of TGF-β-induced EMT in mouse mammary gland epithelial cells (2015)
  • 著者名/発表者名: Arase M, Koinuma D, Isogaya K, Mizutani A, Tsutsumi S, Aburatani H, Miyazono K.
  • 学会等名: Joint International Symposium on TGF-β Family and Cancer : Signal Network in Tumor Microenvironment
  • 発表場所: つくば
  • 年月日: 2015-01-12 – 2015-01-13
• [学会発表] Arkadiaによるスプライシング制御因子ESRP2の機能制御 (2014)
  • 著者名/発表者名: 水谷アンナ、鯉沼代造、宮園浩平
  • 学会等名: 第87回日本生化学会大会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2014-10-15 – 2014-10-18
• [学会発表] TGF-β誘導性long non-coding RNA-Smad7はマウス乳がん細胞のアポトーシスを抑制する (2014)
  • 著者名/発表者名: 荒瀬麻友、堀口華奈、江幡正悟、森川真大、堤 修一、油谷浩幸、宮園浩平、鯉沼代造
  • 学会等名: 第87回日本生化学会大会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2014-10-15 – 2014-10-18
• [学会発表] Regulation of EMT and related phenotypes by TGF-β in cancer cells (2014)
  • 著者名/発表者名: Koinuma D, Isogaya K, Sakurai T, Kawasaki N, Ehata S, Tsutsumi S, Saito A, Miyazawa K, Aburatani H, Miyazono K.
  • 学会等名: 第73回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2014-09-25 – 2014-09-27
  • 招待講演
• [学会発表] TGF-β誘導性long non-coding RNA-Smad7はマウス乳がん細胞のアポトーシスを抑制する (2014)
  • 著者名/発表者名: 荒瀬麻友、江幡正悟、堤 修一、油谷浩幸、宮園浩平、鯉沼代造
  • 学会等名: 第73回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2014-09-25 – 2014-09-27
• [学会発表] E3リガーゼArkadiaによるスプライシング制御因子ESRP2の機能制御 (2014)
  • 著者名/発表者名: 水谷アンナ、鯉沼代造、宮園浩平
  • 学会等名: 平成26年度 がん若手研究者ワークショップ
  • 発表場所: 茅野
  • 年月日: 2014-09-03 – 2014-09-06
• [学会発表] Transforming growth factor-β-inducedlong non-coding RNA-Smad7 inhibits apoptosis of mouse breast cancer cells (2014)
  • 著者名/発表者名: 荒瀬麻友、堀口華奈、江幡正悟、森川真大、堤 修一、油谷浩幸、宮園浩平、鯉沼代造
  • 学会等名: 第14回東京大学生命科学ネットワークシンポジウム
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2014-04-26
• [学会発表] Transforming growth factor-β-induced long non-coding RNA-Smad7 inhibits apoptosis of mouse breast cancer cells (2014)
  • 著者名/発表者名: 荒瀬 麻友、堀口 華奈、江幡 正悟、森川 真大、堤 修一、油谷 浩幸、宮園 浩平、鯉沼 代造
  • 学会等名: 第14回東京大学生命科学シンポジウム
  • 発表場所: 東京都文京区