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ラボディスクによるハイスループット単一細胞遺伝子発現解析

研究課題

研究課題/領域番号 24510171
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 マイクロ・ナノデバイス
研究機関創価大学

研究代表者

久保 いづみ  創価大学, 工学部, 教授 (40214986)

研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2014年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2013年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2012年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
キーワード単一細胞 / 発現遺伝子 / ラボディスク / Hot cell-direct RT-PCR / 発現遺伝子解析 / Jurkat Cell / Hot Cell-direct RT-PCR / 検出
研究成果の概要

蛍光顕微鏡で細胞が単離されたラボディスクのチャンバーの蛍光を測定することによってRT-PCRに伴う蛍光強度変化の正確な測定ができた。発現量の比較をβ-actinで標準化して比較するために各プライマーの濃度を0.2 μM、β-actin のTAMRAプローブ濃度と発現量を比較する遺伝子のFAMプローブの濃度比は1:2が適切だった。この条件でGAPDHでは蛍光強度比が最大3.8、β-actinで最大3.7とGAPDHとβ-actinがより近い値になった。CD95, IL-2, p65について相対蛍光強度比はそれぞれ最大3.4, 3.8, 2.3であり、発現量の違いを評価できることが示唆された。

報告書

(4件)
  • 2014 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2013 実施状況報告書
  • 2012 実施状況報告書
  • 研究成果

    (32件)

すべて 2015 2014 2013 2012 その他

すべて 雑誌論文 (8件) (うち査読あり 6件、 謝辞記載あり 3件) 学会発表 (21件) (うち招待講演 4件) 図書 (2件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Development of a Detection System for Expressed Genes in Isolated Single Cells.2014

    • 著者名/発表者名
      S. Furutani, N. Shozen, H. Nagai, Y. Aoyama, I. Kubo,
    • 雑誌名

      Sensors and Materials

      巻: 26(8) ページ: 623-625

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Microfluidic Devices for Enzyme-linked Immunosorbent Assay (ELISA) and Its Application to Bisphenol A Sensing.2014

    • 著者名/発表者名
      I. Kubo, T. Kanamatsu, S Furutan
    • 雑誌名

      Sensors and Materials

      巻: 26(8) ページ: 615-621

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Fluorescence Sensing of the Interaction between Biomembranes with Different Lipid Composition and Endocrine Disrupting Chemicals2014

    • 著者名/発表者名
      Y. Nakane and I. Kubo
    • 雑誌名

      Materials

      巻: 7 号: 1 ページ: 170-179

    • DOI

      10.3390/ma7010170

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書 2013 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Fluorescence Sensing of the Interaction Between Environmental Chemicals and Model Biomembranes2014

    • 著者名/発表者名
      Y. Nakane and I. Kubo
    • 雑誌名

      Chemical Sensors

      巻: 30 supB ページ: 91-93

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [雑誌論文] Peroxidase Activity of G-Quadruplex Hemin-Binding DNA Aptamers Determined by Electrochemical Measuremen2013

    • 著者名/発表者名
      I. Kubo, T. Eguchi, Y. Hoshino, M. Liu, H. Abe and Y. Ito
    • 雑誌名

      ECS Transactions

      巻: 50 (28) ページ: 1-7

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Study on ELISA Condition to detect AFP Using Microfluidic Disc2013

    • 著者名/発表者名
      T. Saito, S. Furutani, I. Kubo
    • 雑誌名

      Chemical Sensors

      巻: 29, Suppl. A, ページ: 141-143

    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Detection of expressed gene in isolated single cells in microchambers by a novel hot cell-direct RT-PCR method2012

    • 著者名/発表者名
      Shunsuke Furutani
    • 雑誌名

      Analyst

      巻: 137 号: 13 ページ: 2951-2957

    • DOI

      10.1039/c2an15866c

    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Characteristics of Molecularly Imprinted Polymer(MIP) Thin Layer for Bisphenol A and Response of the MIP-Modified Sensor2012

    • 著者名/発表者名
      Izumi Kubo、Nobuyuki Yokota、Yusuke Fuchiwaki、Yuko Nakane
    • 雑誌名

      ISRN Materials Science

      巻: Vol.2012 ページ: 6-6

    • DOI

      10.5402/2012/861643

    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] インスリン結合DNAアプタマーを利用した電気化学的インスリンセンサ2015

    • 著者名/発表者名
      久保いづみ,江口大河
    • 学会等名
      電気化学会第82回大会
    • 発表場所
      横浜国立大学
    • 年月日
      2015-03-12 – 2015-03-15
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Entrapment of Salmonella in cup like trap and immunostaining2014

    • 著者名/発表者名
      Hiromi Hashimoto, Shunsuke Furutani, and Izumi Kubo
    • 学会等名
      Bio4Apps2014 Conference
    • 発表場所
      Shanghai (China)
    • 年月日
      2014-11-17 – 2014-11-19
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Rapid detection of Salmonella enterica in chicken by PCR on a Compact disc (CD)-shaped microfluidic device2014

    • 著者名/発表者名
      Mitsustoshi Kajiya, Shunsuke Furutani, Naoki Shozen, Hidenori Nagai, and Izumi Kubo
    • 学会等名
      Bio4Apps2014 Conference
    • 発表場所
      Shanghai (China)
    • 年月日
      2014-11-17 – 2014-11-19
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Bisphenol A Sensing in Rat Serum on a Microfluidic Device Based on ELISA2014

    • 著者名/発表者名
      Izumi Kubo, Shunsuke Furutani, Naoki Shozen
    • 学会等名
      Bio4Apps2014 Conference
    • 発表場所
      Shanghai (China)
    • 年月日
      2014-11-17 – 2014-11-19
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] マイクロ流体を用いたディスクとハイスループットPCR顕微鏡を用いた極限環境微生物叢解析の基礎研究2014

    • 著者名/発表者名
      内田健一,小椋功太郎,古谷俊介,久保いづみ,伊藤佑子
    • 学会等名
      第15回極限環境生物学会年会
    • 発表場所
      名護
    • 年月日
      2014-11-03 – 2014-11-05
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Gene detection based on direct PCR of the gene in isolated single cells on a microfluidic device2014

    • 著者名/発表者名
      Izumi Kubo
    • 学会等名
      EMN Summer Seminar
    • 発表場所
      Cancun (Mexico)
    • 年月日
      2014-06-10 – 2014-06-13
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Hot cell-direct RT-PCR法による単一細胞発現遺伝子検出法の検討2013

    • 著者名/発表者名
      聖前直樹,古谷俊介,青山由利,久保いづみ
    • 学会等名
      日本化学化学会春季年会
    • 発表場所
      滋賀
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] 細胞単離ディスク上での単一細胞発現遺伝子検出システムの開発2013

    • 著者名/発表者名
      古谷俊介,聖前直樹,永井秀典,青山由利,久保いづみ
    • 学会等名
      電気化学会第80回大会
    • 発表場所
      仙台
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] CD型細胞単離デバイス上での 単一細胞発現遺伝子検出システムの開発2012

    • 著者名/発表者名
      古谷俊介、永井秀典、青山由利、久保いづみ
    • 学会等名
      第6回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      札幌
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] マイクロ流体ディスクを用いたα-fetoprotein(AFP)検出法の改良2012

    • 著者名/発表者名
      齋藤 翼, 古谷 俊介, 久保いづみ
    • 学会等名
      第6回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      札幌
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] 細胞単離ディスクを用いたBacillus cereus特異遺伝子の迅速同定法の検討2012

    • 著者名/発表者名
      新井 一幸,古谷 俊介,岩下 香代子,青山 由利,久保 いづみ
    • 学会等名
      第6回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      札幌
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] Hot Cell-Direct RT-PCRによる単一分離細胞の発現遺伝子検出システムの開発2012

    • 著者名/発表者名
      久保いづみ,古谷 俊介,永井秀典,青山 由利
    • 学会等名
      分析化学会第61年会
    • 発表場所
      金沢
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] Development of the detection system for expressed gene in isolated single cells on Compact Disk (CD)-shaped device2012

    • 著者名/発表者名
      S. Furutani, N. Shozen, H. Nagai, Y. Aoyama, I. Kubo
    • 学会等名
      The First International Symposium on Biofunctional Chemistry
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] Peroxidase Activity of G-Quadruplex hemin-binding DNA Aptsmers determined by electrochemical measurement2012

    • 著者名/発表者名
      I. Kubo, Y. Hoshino, M. Liu, H.Abe, Y. Ito
    • 学会等名
      PRiME 2012
    • 発表場所
      Honolulu
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Direct PCR of isolated single cells on a microfluidic device for the Genomic quantification2012

    • 著者名/発表者名
      I.Kubo
    • 学会等名
      Genomic research Asia
    • 発表場所
      Daejeon (Korea)
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 細胞単離ディスクを用いた単一細胞の発現遺伝子の評価

    • 著者名/発表者名
      聖前 直樹,古谷 俊介,青山 由利,久保 いづみ,
    • 学会等名
      第7回 バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      名古屋
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] 細胞単離ディスク中でのPCRによる食肉中のサルモネラ菌の迅速検出

    • 著者名/発表者名
      鍜治屋 光俊,古谷 俊介,聖前 直樹,永井 秀典,久保 いづみ
    • 学会等名
      第34回食品微生物学会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] Analysis of gene expression using a microfluidic disc for single cell isolation, Bio4Apps2013 Conference

    • 著者名/発表者名
      Naoki Shozen, Shunsuke Furutani, Yuri Aoyama, and Izumi Kubo
    • 学会等名
      Bio4Apps2013
    • 発表場所
      Tokyo
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] Hot cell-direct PCR of isolated single cells on a microfluidic device for genomic quantification

    • 著者名/発表者名
      Izumi Kubo, Naoki Shozen, Shunsuke Furutani
    • 学会等名
      Bio4Apps2013
    • 発表場所
      Tokyo
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] Gene Detection and Sensing System in Isolated Single Cells on a Microfluidic Device

    • 著者名/発表者名
      Izumi Kubo, Shunsuke Furutani, Naoki Shozen
    • 学会等名
      The 10th Asian Conference on Chemical Sensors
    • 発表場所
      Chiang Mai (Thailand)
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] Detection of Expressed Genes in Single Jurkat Cells by Hot Cell-direct RT PCR

    • 著者名/発表者名
      Naoki Shozen, Shunsuke Furutani, Yuri Aoyama, and Izumi Kubo
    • 学会等名
      The 10th Asian Conference on Chemical Sensors
    • 発表場所
      Chiang Mai (Thailand)
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [図書] 薄膜評価技術ハンドブック、自己組織化膜2013

    • 著者名/発表者名
      久保いづみ
    • 総ページ数
      620
    • 出版者
      テクノシステム
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [図書] 先端医療に関する医療ニーズ2012

    • 著者名/発表者名
      久保いづみ
    • 総ページ数
      515
    • 出版者
      技術情報協会
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [備考] 創価大学大学院工学研究科 久保研究室

    • URL

      http://home.soka.ac.jp/~kubo/

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書

URL: 

公開日: 2013-05-31   更新日: 2019-07-29  

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