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イントロン長分布の多角的解析によるヒト・スプライシング機構の進化的解明

研究課題

研究課題/領域番号 24510271
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 ゲノム生物学
研究機関藤田保健衛生大学

研究代表者

嶋田 誠  藤田保健衛生大学, 総合医科学研究所, 講師 (00528044)

連携研究者 前田 明  藤田保健衛生大学, 総合医科学研究所, 教授 (50212204)
研究協力者 佐々木 典子 (原口 典子)  藤田保健衛生大学, 総合医科学研究所, 博士研究員 (90546649)
研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円)
2015年度: 130千円 (直接経費: 100千円、間接経費: 30千円)
2014年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2013年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2012年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
キーワードイントロン / スプライシング / 進化 / 遺伝子発現 / 脳 / 選択的スプライシング / 制御機構 / 人類進化 / データーベース / 突然変異 / 潜在的スプライシング部位 / ヒト遺伝子 / データベース
研究成果の概要

ヒト遺伝子のイントロンの中に、従来考えられていなかった65塩基長以下のものを発見し、微小イントロンとして発表した。
実験的な裏付けをもつ転写物配列調査の結果、ヒトで見つかった微小イントロンと起源を共にするイントロンがヒト以外の生物で見つかったのは7微小イントロンであった。それ以外の微小イントロンはヒト以外の転写物配列情報が少ないのみならず、ゲノム配列の面から検討してもイントロン両端を示す配列が近縁種で保存されていない場合が多かった。そのため、微小イントロンの多くは起源が新しいか発現が限定的なものであると考えられる。

報告書

(5件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実施状況報告書
  • 2013 実施状況報告書
  • 2012 実施状況報告書
  • 研究成果

    (17件)

すべて 2015 2014 2013 2012 その他

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 2件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (9件) (うち国際学会 1件、 招待講演 1件) 備考 (5件)

  • [雑誌論文] Identification and Validation of Evolutionarily Conserved Unusually Short Pre-mRNA Introns in the Human Genome2015

    • 著者名/発表者名
      Makoto K. Shimada,Noriko Sasaki-Haraguchi, and Akila Mayeda
    • 雑誌名

      International Journal of Molecular Science

      巻: 16 号: 5 ページ: 10376-10388

    • DOI

      10.3390/ijms160510376

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Identification and Validation of Evolutionarily Conserved Unusually Short Pre-mRNA Introns in the Human Genome2015

    • 著者名/発表者名
      Shimada MK, Sasaki-Haraguchi N, Mayeda, A
    • 雑誌名

      International Journal of Molecular Sciences

      巻: 印刷中

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Mechanistic insights into human pre-mRNA splicing of human ultra-short introns: potential unusual mechanism identifies G-rich introns2012

    • 著者名/発表者名
      Sasaki-Haraguchi N, Shimada MK, Taniguchi I, Ohno M, Mayeda A
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      巻: 423 ページ: 289-294

    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 氏と育ち―遺伝情報の使われ方から人類の知性を考える2015

    • 著者名/発表者名
      嶋田 誠
    • 学会等名
      『知性はどこから来たか ―こころの進化と遺伝―』武蔵野大学 人間科学研究所 シンポジウム
    • 発表場所
      武蔵野大学(お台場)、東京
    • 年月日
      2015-12-04
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ポリグルタミン病発症機序には共通して長いグルタミン反復が要求される過程を含んでいる2015

    • 著者名/発表者名
      嶋田 誠、三本松 良子、山口 由美、山崎 千里、鈴木 善幸、Chakraborty, Ranajit、五條堀 孝、今西 規
    • 学会等名
      日本遺伝学会 第87回大会
    • 発表場所
      東北大学、仙台
    • 年月日
      2015-09-24
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Ultra-short G-rich introns with completely inefficient 5’ and 3’ splice sites are spliced in vivo, but how?2015

    • 著者名/発表者名
      Shimada MK, Sasaki-Haraguchi N, Mayeda A
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Laboratory Meeting “Eukaryotic mRNA processing”
    • 発表場所
      Cold Spring Harbor, NY.
    • 年月日
      2015-08-18
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ヒト微小イントロンは4 種類の進化様式で出現した2014

    • 著者名/発表者名
      (27)嶋田 誠、佐々木(原口) 典子、前田 明
    • 学会等名
      第16回日本RNA学会年会
    • 発表場所
      ウィンクあいち(愛知県名古屋市)
    • 年月日
      2014-07-23 – 2014-07-25
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] 1000 Genomes データを用いた古代人からの流入配列候補の比較2013

    • 著者名/発表者名
      嶋田 誠
    • 学会等名
      NGS現場の会 第3回研究大会
    • 発表場所
      神戸
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] ヒト転写物と多型のデータベース統合による、グルタミン反復配列長大化への進化的解析2013

    • 著者名/発表者名
      嶋田 誠、三本松良子、山崎千里、山口由美、五條堀 孝、今西 規
    • 学会等名
      日本遺伝学会 第85回大会
    • 発表場所
      日吉
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] Analysis of the intron distribution of the human genes implicates the existence of ultra-short introns(ヒト遺伝子のイントロン長分析から明らかになった微小イントロンの存在)2012

    • 著者名/発表者名
      嶋田 誠、佐々木(原口) 典子、前田 明
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      福岡
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] ヒトにおける規格外に短いイントロンの発見とその特徴2012

    • 著者名/発表者名
      嶋田 誠、佐々木(原口) 典子、前田 明
    • 学会等名
      第14回日本RNA学会年会
    • 発表場所
      仙台
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] 外れ値にあたる短さをもつヒト・イントロンの進化的保存性2012

    • 著者名/発表者名
      嶋田 誠、佐々木(原口) 典子、前田 明
    • 学会等名
      日本霊長類学会第28回学術大会
    • 発表場所
      名古屋
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [備考] researchmap (嶋田 誠)

    • URL

      http://researchmap.jp/shimada-mk/?lang=japanese

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [備考] 嶋田 誠の研究に関するホームページ

    • URL

      http://tinyurl.com/shimada-mk/

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [備考] 藤田保健衛生大学 総合医科学研究所 遺伝子発現機構学研究部門 研究内容ページ

    • URL

      http://www.fujita-hu.ac.jp/~gem-1/research.html

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [備考] 藤田保健衛生大学 総合医科学研究所 遺伝子発現機構学研究部門 研究内容ホームページ

    • URL

      http://www.fujita-hu.ac.jp/~gem-1/research.html

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [備考] 嶋田 誠 Reserach Interest Page

    • URL

      http://www.fujita-hu.ac.jp/~mshimada/sub/ShimadaMK/ShimadaSub/res.html

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書

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公開日: 2013-05-31   更新日: 2019-07-29  

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