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プロテオグリカンの共通四糖橋渡し構造および糖鎖結合部位の一斉解析

研究課題

研究課題/領域番号 24550089
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 分析化学
研究機関北海道大学

研究代表者

古川 潤一  北海道大学, 先端生命科学研究科(研究院), 特任助教 (30374193)

研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
5,460千円 (直接経費: 4,200千円、間接経費: 1,260千円)
2014年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2013年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2012年度: 3,250千円 (直接経費: 2,500千円、間接経費: 750千円)
キーワードプロテオグリカン / グライコミクス / β脱離反応 / グリコサミノグリカン / 分析化学 / ピラゾロン / マイクロ波 / O結合型糖鎖
研究成果の概要

本研究ではピラゾロン試薬共存下でのβ脱離反応を利用した糖鎖および脱修飾化ペプチド解析法の基盤技術を発展させ、「プロテオグリカンの共通四糖橋渡し構造および糖鎖結合部位の一斉解析法」の開発を目的として研究を遂行した。まず、マイクロ波支援BEP反応を検討し、糖タンパク質からのO結合型糖鎖の切断およびピラゾロン試薬による標識効率が向上し、反応条件の最適化を行うことで、これまで16時間必要とした反応が2時間で完了した。また、ペプチドグリコサミノグリカンのエンリッチ法およびグライコブロッティング法と併用することでプロテオグリカンの共通四糖橋渡し構造、GAG二糖構造、および糖鎖結合部位の同定法を確立した。

報告書

(4件)
  • 2014 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2013 実施状況報告書
  • 2012 実施状況報告書
  • 研究成果

    (18件)

すべて 2015 2014 2013 2012

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (10件) 図書 (1件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] Comprehensive glycomics of a multistep human brain tumor model reveals specific glycosylation patterns related to malignancy2015

    • 著者名/発表者名
      Jun-ichi Furukawa,, Masumi Tsuda, Kazue Okada, Taichi Kimura, Jinhua Piao, Shinya Tanaka, and Yasuro Shinohara
    • 雑誌名

      Plos one

      巻: in press

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 総合グライコミクスで細胞を記述する2015

    • 著者名/発表者名
      古川 潤一、篠原 康郎
    • 雑誌名

      化学と生物

      巻: 掲載予定

    • NAID

      130005405131

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [雑誌論文] 糖タンパク質および糖脂質の糖鎖の新たな解析手法の開発-ウシ乳グライコーム解析への応用-2014

    • 著者名/発表者名
      古川 潤一、岡田 和恵、篠原 康郎
    • 雑誌名

      応用糖質科学

      巻: 4 ページ: 295-301

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [雑誌論文] Total Cellular Glycomics: A Glycomic Approach to Describe Cells and Streamline the Discovery Process for Cellular Biomarkers2013

    • 著者名/発表者名
      Shinohara Y, Fujitani N, Furukawa J
    • 雑誌名

      Trends glycosci. Glycotechnol

      巻: 25 ページ: 103-116

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Total cellular glycomics allows characterizing cells and streamlining the discovery process for cellular biomarkers2013

    • 著者名/発表者名
      Fujitani, N., Furukawa, J., 他10名
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

      巻: 110 号: 6 ページ: 2105-2110

    • DOI

      10.1073/pnas.1214233110

    • NAID

      120005326735

    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Recent advances in cellular glycomic analyses2013

    • 著者名/発表者名
      Furukawa, J., Fujitani, N., Shinohara, Y.
    • 雑誌名

      Biomolecules

      巻: 3 号: 1 ページ: 198-225

    • DOI

      10.3390/biom3010198

    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] マイクロ波支援ピラゾロン共存下β脱離反応によるO結合型糖鎖の解析2014

    • 著者名/発表者名
      古川 潤一
    • 学会等名
      第5回 グライコバイオロジクス研究会
    • 発表場所
      臨床 研究情報センター(兵庫県、神戸市)
    • 年月日
      2014-11-01
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] パラフィン包埋サンプルの複合糖質糖鎖の定量解析2014

    • 著者名/発表者名
      横田育子、岡田和恵、朴錦花、古川潤一、篠原康郎
    • 学会等名
      日本生化学会
    • 発表場所
      国立京都国際会館(京都府、京都市)
    • 年月日
      2014-10-15 – 2014-10-18
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Glycomic analysis of human astrocytes establishes causal relationships between altered glycosylation and deregulated cellular pathways2014

    • 著者名/発表者名
      Jun-ichi Furukawa, Masumi Tsuda, Kazue Okada, Taichi Kimura, Jinhua Piao, Shinya Tanaka, Yasuro Shinohara
    • 学会等名
      第12回未来創薬・医療イノベーション拠点形成国際シンポジウム
    • 発表場所
      北海道大学(北海道、札幌市)
    • 年月日
      2014-09-04 – 2014-09-05
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ES/iPS細胞の糖鎖の網羅的解析2014

    • 著者名/発表者名
      古川潤一、藤谷直樹、荒木香、岡田和恵、朴錦花、藤岡剛、中村幸夫、篠原康郎
    • 学会等名
      日本糖質学会
    • 発表場所
      名古屋大学(愛知県、名古屋市)
    • 年月日
      2014-08-10 – 2014-08-12
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] マイクロ波支援ピラゾロン共存下β脱離反応による血清およびパラフィン包埋組織からのO結合型糖鎖の解析2014

    • 著者名/発表者名
      朴錦花、岡田和恵、古川潤一、篠原康郎
    • 学会等名
      日本糖質学会
    • 発表場所
      名古屋大学(愛知県、名古屋市)
    • 年月日
      2014-08-10 – 2014-08-12
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ピラゾロン共存下マイクロ波支援β脱離反応による迅速なO結合型糖鎖の解析法2013

    • 著者名/発表者名
      古川潤一
    • 学会等名
      日本生化学会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] マイクロ波放射を用いたピラゾロン共存下β脱離反応による迅速なO結合型糖鎖の解析法2013

    • 著者名/発表者名
      古川潤一
    • 学会等名
      日本糖質学会
    • 発表場所
      大阪国際交流センター(大阪市)
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] ピラゾロン誘導体共存下β脱離反応に基づく幹細胞のO-結合型糖鎖の解析2013

    • 著者名/発表者名
      古川 潤一・藤谷 直樹・朴 錦花・篠原 康郎
    • 学会等名
      日本化学会
    • 発表場所
      立命館大学(滋賀)
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] ピラゾロン試薬共存下β脱離反応による細胞O結合型糖鎖の定量解析2012

    • 著者名/発表者名
      古川潤一、朴錦花、藤谷直樹、荒木香代、坂入信夫、篠原康郎
    • 学会等名
      日本糖質学会
    • 発表場所
      鹿児島市民文化ホール(鹿児島)
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] ピラゾロン試薬共存下β脱離反応に基づくO結合型糖鎖の新規解析法2012

    • 著者名/発表者名
      古川潤一、藤谷直樹、朴錦花、荒木香代、山田修平、坂入信夫、菅原一幸、篠原康郎
    • 学会等名
      日本生化学会
    • 発表場所
      福岡国際会議場・マリンメッセ福岡(福岡)
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [図書] Methods Mol Biol.2014

    • 著者名/発表者名
      Shinohara Y, Furukawa J
    • 総ページ数
      613
    • 出版者
      Springer Protocols
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [産業財産権] 修飾基を遊離し、標識するための方法及びその方法のためのキット、修飾基の解析方法及び解析するためのキット、並びに遊離糖鎖の標識方法2013

    • 発明者名
      篠原康郎、古川潤一
    • 権利者名
      北海道大学
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2013-05-31
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書

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公開日: 2013-05-31   更新日: 2019-07-29  

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