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ロボットモデルによるタンパク質の機能発現過程の理解

研究課題

研究課題/領域番号 24560309
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 知能機械学・機械システム
研究機関神奈川工科大学

研究代表者

有川 敬輔  神奈川工科大学, 工学部, 准教授 (50350674)

研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
3,510千円 (直接経費: 2,700千円、間接経費: 810千円)
2014年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2013年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2012年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
キーワードロボット機構 / 蛋白質
研究成果の概要

主鎖構造と線形ばねで粗視化したタンパク質モデルをロボット機構と見なし,このモデルから機能発現過程の理解に有用な情報を引き出すための解析手法を考案した.これらは静的釣合状態にある外力に対する応答解析が基本となっているが,中でも,形状機構性解析と呼ぶ形状の持つ機構的性質を抽出するための解析が有効である.並列計算,再利用計算等の機能を備えた計算フレームワークを開発し,様々な系について解析を行った結果,形状機構性を含む広義のコンプライアンス特性,特に,相互作用によって生じる同特性の変動を通して機能発現過程の理解に有用な情報が得られることが分かった.

報告書

(4件)
  • 2014 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2013 実施状況報告書
  • 2012 実施状況報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2015 2014 2013 2012

すべて 学会発表 (6件)

  • [学会発表] Analyzing Motion Properties of Proteins Affected by Localized Structures from a Robot Kinematics Perspective2015

    • 著者名/発表者名
      Keisuke Arikawa
    • 学会等名
      2015 ASME, IDETC, 39th Mechanisms and Robotics Conference
    • 発表場所
      Boston (USA)
    • 年月日
      2015-08-02 – 2015-08-05
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] タンパク質の構造コンプライアンス解析手法の改良2014

    • 著者名/発表者名
      有川 敬輔
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)
    • 年月日
      2014-09-25 – 2014-09-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Extension of the Kinematics-based Method for Predicting the Motion of Proteins2014

    • 著者名/発表者名
      Keisuke Arikawa
    • 学会等名
      2014 ASME, IDETC, 38th Mechanisms and Robotics Conference
    • 発表場所
      Buffalo (USA)
    • 年月日
      2014-08-17 – 2014-08-20
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] タンパク質の構造コンプライアンス特性の計算2013

    • 著者名/発表者名
      有川敬輔
    • 学会等名
      第51回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      国立京都国際会館
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] A Computational Framework for Predicting the Motions of a Protein System from a Robot Kinematics Viewpoint2013

    • 著者名/発表者名
      Keisuke Arikawa
    • 学会等名
      2013 ASME, IDETC, 37th Mechanisms and Robotics Conference
    • 発表場所
      Oregon (USA)
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] ロボット機構の運動学に基づくタンパク質の内部運動解析2012

    • 著者名/発表者名
      有川 敬輔
    • 学会等名
      第50回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      名古屋大学(愛知県)
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書

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公開日: 2013-05-31   更新日: 2019-07-29  

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